NLRC4 - NLRC4

NLRC4
Қол жетімді құрылымдар
PDBОртологиялық іздеу: PDBe RCSB
Идентификаторлар
Бүркеншік аттарNLRC4, CARD12, CLAN, CLAN1, CLANA, CLANB, CLANC, CLAND, CLR2.1, IPAF, AIFEC, FCAS4, NLR отбасы, 4-тен тұратын CARD домені, 4-тен тұратын NLR отбасылық CARD домен
Сыртқы жеке куәліктерOMIM: 606831 MGI: 3036243 HomoloGene: 10924 Ген-карталар: NLRC4
Геннің орналасуы (адам)
2-хромосома (адам)
Хр.2-хромосома (адам)[1]
2-хромосома (адам)
NLRC4 үшін геномдық орналасу
NLRC4 үшін геномдық орналасу
Топ2p22.3Бастау32,224,453 bp[1]
Соңы32,265,732 bp[1]
Ортологтар
ТүрлерАдамТышқан
Энтрез
Ансамбль
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001199138
NM_001199139
NM_001302504
NM_021209

NM_001033367

RefSeq (ақуыз)

NP_001186067
NP_001186068
NP_001289433
NP_067032

NP_001028539

Орналасқан жері (UCSC)Chr 2: 32.22 - 32.27 MbХр 17: 74.43 - 74.46 Мб
PubMed іздеу[3][4]
Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеуТінтуірді қарау / өңдеу

NLR отбасылық КАРТА домені бар ақуыз 4 Бұл ақуыз адамдарда кодталған NLRC4 ген.[5][6]

Құрылым

NLRC4 ақуызы сүтқоректілердің түрлерінде жоғары деңгейде сақталады. Бұл гомологияны білдіреді C. elegans Ced4 ақуызы. Онда n-терминал бар КАРТА домен, орталық нуклеотидті байланыстыру /NACHT домен және л-лейцинге бай c-терминалы (LRR ) домен. Ол транскрипциялық ко-активаторды қамтитын NLR ақуыздарының тобына жатады CIITA және канондық қабыну протеині NLRP3. Кесілген мирин NLRC4 осы отбасының алғашқы мүшесі болды, оның кристалдық құрылымы шешілді.[7]

Функция

NLRC4 түзіліс триггерімен жақсы байланысты қабыну. NLRP3-тен айырмашылығы, NLRC4-тің белгілі бір қабынуға тәуелді функциялары, қабыну сатысына тәуелсіз жүзеге асырылуы мүмкін. ASC. Адамның Ced4 гомологтары кіреді APAF1, NOD1 (CARD4), және NOD2 (CARD15). Бұл белоктарда кем дегенде 1 болады N-терминал Карталық домен, содан кейін орталық орналасқан нуклеотидті байланыстырушы домен (NBD немесе NACHT) және а C-терминалы тек қана сүтқоректілерде кездесетін реттеуші домен WD40 қайталанады немесе лейцинге бай қайталанулар (LRR). CARD12 - Ced4 отбасының мүшесі және оны тудыруы мүмкін апоптоз.[6]

Өзара әрекеттесу

NLRC4 көрсетілген өзара әрекеттесу NAIP-мен (бір адамда NAIP бар, бірақ тышқандар кем дегенде 4 ерекше NAIP ақуызын көрсетеді). NAIP / NLRC4 өзара әрекеттесуі лигандтың ерекшелігін анықтай алады.[8] NLRC4 тәуелді қабыну белсенділігі белсендіріледі CASP1.[9] Белгілі бір жағдайларда NLRC4 және NLRP3 бірдей қабыну кешенін иемденуі мүмкін.[10]

Клиникалық маңызы

NLRC4 белсенділендіретін мутациясы бар адамдар ан аутоинфламатикалық жедел қызба, гепатит, өте жоғары сарысудағы ферритин және басқа да ерекшеліктермен сипатталатын синдром Макрофагты белсендіру синдромы (MAS). Кейбір науқастарда өмірге қауіп төндіретін энтероколит дамыды, олар ерте балалық шағында азайды.[11][12] Бұл науқастарда сарысудың созылмалы және кезектен тыс жоғарылауы ИЛ-18 дамыған NLRP3 мутациясы бар науқастардан ерекшеленеді Криопиринмен байланысты мерзімді синдромдар.[11] Үлкен жапондық отбасында салқындатылған есекжемге байланысты әлдеқайда жеңіл ауру болды, ол көбінесе тұқым қуалайтын NLRC4 мутациясының әсерінен болды.[13]

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ а б c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000091106 - Ансамбль, Мамыр 2017
  2. ^ а б c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000039193 - Ансамбль, Мамыр 2017
  3. ^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  4. ^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  5. ^ Geddes BJ, Wang L, Huang WJ, Lavellee M, Manji GA, Brown M, Jurman M, Cao J, Morgenstern J, Merriam S, Glucksmann MA, DiStefano PS, Bertin J (маусым 2001). «Адам CARD12 - бұл апоптозды қоздыратын жаңа CED4 / Apaf-1 отбасы мүшесі». Биохимиялық және биофизикалық зерттеулер. 284 (1): 77–82. дои:10.1006 / bbrc.2001.4928. PMID  11374873.
  6. ^ а б «Entrez Gene: NLRC4 NLR отбасы, 4-тен тұратын CARD домені».
  7. ^ Ху З, Ян С, Лю П, Хуанг З, Ма Р, Чжан С, Ван Р, Чжан Й, Мартинон Ф, Миао Д, Дэн Х, Ван Дж, Чанг Дж, Чай Дж (шілде 2013). «NLRC4 кристалды құрылымы оның автоингибирлеу механизмін көрсетеді». Ғылым. 341 (6142): 172–5. дои:10.1126 / ғылым.1236381. PMID  23765277. S2CID  12360722.
  8. ^ Kofoed EM, Vance RE (қыркүйек 2011). «NAIP арқылы бактериалды лигандтардың туа біткен иммунды тануы қабынудың сипаттамасын анықтайды». Табиғат. 477 (7366): 592–5. дои:10.1038 / табиғат10394. PMC  3184209. PMID  21874021.
  9. ^ Дамиано JS, Оливейра V, Уэльс К, Рид ДжК (шілде 2004). «NACHT домендері арасындағы гетеротиптік өзара әрекеттесу: туа біткен иммундық реакцияларды реттеу салдары». Биохимиялық журнал. 381 (Pt 1): 213-9. дои:10.1042 / BJ20031506. PMC  1133779. PMID  15107016.
  10. ^ Man SM, Hopkins LJ, Nugent E, Cox S, Glück IM, Tourlomousis P, Wright JA, Cicuta P, Monie TP, Bryant CE (мамыр 2014). «Инфламмасоманы белсендіру бір макромолекулалық кешенге NLRC4 және NLRP3 қосарлануын тудырады» (PDF). Америка Құрама Штаттарының Ұлттық Ғылым Академиясының еңбектері. 111 (20): 7403–8. дои:10.1073 / pnas.1402911111. PMC  4034195. PMID  24803432.
  11. ^ а б Канна SW, de Jesus AA, Gouni S, Brooks SR, Marrero B, Liu Y, DiMattia MA, Zaal KJ, Sanchez GA, Kim H, Chapelle D, Plass N, Huang Y, Villarino AV, Biancotto A, Fleisher TA, Duncan JA, O'Shea JJ, Benseler S, Grom A, Deng Z, Laxer RM, Goldbach-Mansky R (қазан 2014). «NLRC4 белсендіретін қабыну мутациясы макрофагтың қайталанатын активтендіру синдромымен аутоинфламмацияны тудырады». Табиғат генетикасы. 46 (10): 1140–6. дои:10.1038 / нг.3089. PMC  4177369. PMID  25217959.
  12. ^ Ромберг Н, Аль Мусави К, Нельсон-Уильямс С, Стиглер А.Л., Лоринг Е, Чой М, Овертон Дж, Мефре Е, Хоха М.К., Хаттнер АЖ, Вест В, Подольцев Н.А., Боггон Т.Дж., Казмиерзак БИ, Лифтон РП (қазан 2014) ). «NLRC4 мутациясы энтероколит пен аутоинфламмация синдромын тудырады». Табиғат генетикасы. 46 (10): 1135–9. дои:10.1038 / нг.3066. PMC  4177367. PMID  25217960.
  13. ^ Китамура А, Сасаки Ю, Абэ Т, Кано Х, Ясутомо К (қараша 2014). «NLRC4-тегі тұқым қуалайтын мутация адам мен тышқандарда аутоинфламенцияны тудырады». Тәжірибелік медицина журналы. 211 (12): 2385–96. дои:10.1084 / jem.20141091. PMC  4235634. PMID  25385754.

Әрі қарай оқу