NLRP1 - NLRP1

NLRP1
PDB 1pn5 EBI.jpg
Қол жетімді құрылымдар
PDBОртологиялық іздеу: PDBe RCSB
Идентификаторлар
Бүркеншік аттарNLRP1, CARD7, CIDED, CLR17.1, DEFCAP, DEFCAP-L / S, NAC, NALP1, PP1044, SLEV1, VAMAS1, NLR тұқымдасы, құрамында пириндік домен, құрамында 1, құрамында NLR отбасылық пириндік домені, құрамында MSPC, AIADK, JRRP
Сыртқы жеке куәліктерOMIM: 606636 MGI: 3582959 HomoloGene: 19080 Ген-карталар: NLRP1
Геннің орналасуы (адам)
17-хромосома (адам)
Хр.17-хромосома (адам)[1]
17-хромосома (адам)
NLRP1 үшін геномдық орналасу
NLRP1 үшін геномдық орналасу
Топ17p13.2Бастау5,499,427 bp[1]
Соңы5,619,424 bp[1]
РНҚ экспрессиясы өрнек
PBB GE NLRP1 210113 с at fs.png

PBB GE NLRP1 211824 x at fs.png

PBB GE NLRP1 211822 с at fs.png
Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Ортологтар
ТүрлерАдамТышқан
Энтрез
Ансамбль
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_033007
NM_001033053
NM_014922
NM_033004
NM_033006

NM_001039680
NM_001040696
NM_001162414

RefSeq (ақуыз)

NP_001028225
NP_055737
NP_127497
NP_127499
NP_127500

NP_001035786
NP_001155886

Орналасқан жері (UCSC)Хр 17: 5.5 - 5.62 МбChr 11: 71.15 - 71.23 Mb
PubMed іздеу[3][4]
Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеуТінтуірді қарау / өңдеу

NLRP1 кодтайды NACHT, LRR, FIIND, CARD домені және PYD домендері бар ақуыз 1 адамдарда.[5][6][7] NLRP1 бірінші болды ақуыз қалыптастыру үшін көрсетілген қабыну.[8] NLRP1 әр түрлі ұяшық түрлері, олар басым қан түзетін. Экспрессия сонымен қатар безді эпителий құрылымдарында байқалады, оның ішкі қабаты жіңішке ішек, асқазан.[9] NLRP1 полиморфизмі CD ішектегі теріден тыс көріністерімен байланысты.[9] Оның ең жоғары көрінісі адамның терісінде анықталды псориаз және in vitiligo. NLRP1 полиморфизмдері табылды қызыл жегі және 1 типті қант диабеті.[10] NLRP1 тінтуірінің нұсқалары N-терминалымен бөлінген кезде белсендірілген протеаза жылы сібір жарасы өлім факторы.[8]

Функция

Бұл ген Ced-4 отбасының мүшесін кодтайды апоптоз белоктар. Ced-отбасы мүшелерінде а caspase жалдау домені (CARD) және олардың негізгі медиаторлары екендігі белгілі бағдарламаланған жасуша өлімі. Кодталған ақуыз нақты N-терминалынан тұрады пирин тәрізді мотив болуы мүмкін ақуыз-ақуыздың өзара әрекеттесуі. NLRP1 ақуызы қатты әсер етеді Каспаза 2 және әлсіз 9-бөлім. Мұның артық көрінісі ген жасушаларда апоптоз тудыратыны көрсетілді. Бірнеше балама түрде біріктірілген Бұл ген үшін ерекше изоформаларды кодтайтын транскрипт нұсқалары табылды, бірақ кейбір нұсқалардың биологиялық жарамдылығы анықталмады.[7]

Іске қосу механизмі

NLRP1 антибактериалды белсенді етеді иммундық жауап. Антибактериалды иммундық жауап шығынын өтейді Киназаның картасы жауап. Адам NLRP1 шығарады, бірақ адам NLRP1 летальды фактормен белсендірілмейді.[8] NLRP1 протеолитикалық бөліну арқылы белсендірілуі мүмкін, нәтижесінде автоматты ингибиторлы PYD жойылады және CASPA доменін босатады, прокаспаза-1-ді каспаза-1 белсенді түрінде қабылдау мен белсендіруге жауапты.[8] Бірақ адамның NLRP1 белсендіру механизмі және функциясы иммунитет анық емес.[8]

Өзара әрекеттесу

NLRP1 көрсетілген өзара әрекеттесу бірге 9-бөлім[11][12] және APAF1.[11]

Тышқандардағы NLRP1 нұсқалары

Тышқандарда үш параллель бар Nlrp1 ген (Nlrp1a, b, c). Nlrp1c бұл псевдоген.[13] NLRP1B тышқаны рецептор-лиганд типті механизммен белсендірілмейді. BALB / c және 129 тінтуірдің кейбір штаммдарының NLRP1B нұсқаларын өлім факторы (LF) белсендіре алады. протеаза. Өлім факторы протеаза шығарады және шығарады Bacillus anthracis, агент сібір жарасы.[14] Қорғаныс антигенімен (ПА) бірге LF екіжақты токсин, өлімге әкелетін токсин түзеді. ҚБ рөлі а қалыптастыру болып табылады транслокация негізгі ұяшыққа LF жеткізетін арна цитозол, мұнда LF иммундық жауапта MAP киназаларын бөлу және инактивациялау арқылы рөл атқарады.[15][16] LF сонымен бірге NLRP1B-ді проксималды тікелей бөледі N-терминал, бұл NLRP1B үшін қажет және жеткілікті қабыну қалыптастыру және CASP1 белсендіру.[17] NLRP1B тәуелділігін белсендіру қабыну жауаптар IL-1β және сияқты механизммен хостты қорғауда пайда болады нейтрофилдер.[18][19] NLRP1B сенсоры ретінде жұмыс істей алады бактериалды протеаздар, иммундық жауаптар арнайы активтендірілген вируленттілік факторлар.[20][21]

NLRP1A-ны, басқа функционалды миринді NLRP1 функционалды паралогын қандай тітіркендіргіштер белсендіруі мүмкін екендігі белгісіз. Зерттеу барысында миссияны күшейту функциясы бар тышқан анықталды мутация NLRP1A-да (Q593P) белсенді қабыну жауаптар. Механизмі жабайы типтегі NLRP1A активациясы түсініксіз.[22]

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ а б c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000091592 - Ансамбль, Мамыр 2017
  2. ^ а б c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000070390 - Ансамбль, Мамыр 2017
  3. ^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  4. ^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  5. ^ Thorpe KL, Abdulla S, Kaufman J, Trowsdale J, Bec S (қазан 1996). «RING3 генінің филогениясы және құрылымы». Иммуногенетика. 44 (5): 391–6. дои:10.1007 / BF02602785. PMID  8781126. S2CID  44613743.
  6. ^ Tschopp J, Martinon F, Burns K (ақпан 2003). «NALPs: қабынуға қатысатын жаңа протеиндер отбасы». Табиғи шолулар. Молекулалық жасуша биологиясы. 4 (2): 95–104. дои:10.1038 / nrm1019. PMID  12563287. S2CID  31417018.
  7. ^ а б «Entrez Gene: NLRP1 NLR отбасы, құрамында пириндік домен 1».
  8. ^ а б c г. e Chavarría-Smith J, Mitchell PS, Ho AM, Daugherty MD, Vance RE (желтоқсан 2016). «Функционалды және эволюциялық талдаулар протеолизді NLRP1 инфламмасомасын белсендірудің жалпы механизмі ретінде анықтайды». PLOS қоздырғыштары. 12 (12): e1006052. дои:10.1371 / journal.ppat.1006052. PMC  5142783. PMID  27926929. CC-BY icon.svg Материал осы дереккөзден көшірілген, ол а Creative Commons Attribution 4.0 Халықаралық лицензиясы.
  9. ^ а б Kummer JA, Broekhuizen R, Everett H, Agostini L, Kuijk L, Martinon F және т.б. (Мамыр 2007). «NALP 1 және 3 инфламмасомды компоненттері қабыну реакциясындағы белгілі бір рөлді көрсететін адам тіндеріндегі айқын, бірақ бөлек экспрессия профильдерін көрсетеді». Гистохимия және цитохимия журналы. 55 (5): 443–52. дои:10.1369 / jhc.6A7101.2006. PMID  17164409.
  10. ^ Grandemange S, Sanchez E, Louis-Plence P, Tran Mau-Them F, Bessis D, Coubes C және т.б. (Шілде 2017). «NLRP1 мутациясымен байланысты жаңа аутоинфламматикалық және аутоиммундық синдром: NAIAD (артрит және дискератозбен NLRP1-мен байланысты аутоинфляция)». Ревматизм аурулары жылнамасы. 76 (7): 1191–1198. дои:10.1136 / annrheumdis-2016-210021. PMID  27965258. S2CID  206852426.
  11. ^ а б Chu ZL, Pio F, Xie Z, Welsh K, Krajewska M, Krajewski S, Godzik A, Reed JC (наурыз, 2001). «Цитохромды с-тәуелді каспазаның активациясына және апоптозға қатысатын Apaf1 апоптосомасының жаңа күшейткіші». Биологиялық химия журналы. 276 (12): 9239–45. дои:10.1074 / jbc.M006309200. PMID  11113115.
  12. ^ Hlaing T, Guo RF, Dilley KA, Loussia JM, Morrish TA, Shi MM, Vincenz C, Ward PA (наурыз 2001). «Молекулалық клондау және DEFCAP-L және -S сипаттамалары, апоптоз ақуыздарының Ced-4 сүтқоректілер тобының жаңа мүшесінің екі изоформасы». Биологиялық химия журналы. 276 (12): 9230–8. дои:10.1074 / jbc.M009853200. PMID  11076957.
  13. ^ Sastalla I, Crown D, Masters SL, McKenzie A, Leppla SH, Moayeri M (наурыз 2013). «Тышқандардағы үш Nlrp1 параллогін транскрипциялық талдау». BMC Genomics. 14 (1): 188. дои:10.1186/1471-2164-14-188. PMC  3641005. PMID  23506131.
  14. ^ Бойден Е.Д., Дитрих ВФ (ақпан 2006). «Nalp1b сібір жарасының өлімге әкелетін токсиніне тінтуірдің макрофагының бейімділігін басқарады». Табиғат генетикасы. 38 (2): 240–4. дои:10.1038 / ng1724. PMID  16429160. S2CID  23316987.
  15. ^ Turk BE (наурыз 2007). «Сібір жарасының уыттарымен хосттың сигнал беру жолдарын манипуляциялау». Биохимиялық журнал. 402 (3): 405–17. дои:10.1042 / BJ20061891. PMID  17313374.
  16. ^ Moayeri M, Leppla SH (желтоқсан 2009). «Сібір жарасының өлімге әкелетін токсині мен ісіну токсинінің жасушалық және жүйелік әсері». Медицинаның молекулалық аспектілері. 30 (6): 439–55. дои:10.1016 / дж.мам.2009.07.003. PMC  2784088. PMID  19638283.
  17. ^ Чаварриа-Смит Дж, Вэнс RE (2013). «NLRP1B протеолитикалық тікелей бөлінуі сібір жарасының летальды факторымен қабыну қабынуын белсендіру үшін қажет және жеткілікті». PLOS қоздырғыштары. 9 (6): e1003452. дои:10.1371 / journal.ppat.1003452. PMC  3688554. PMID  23818853.
  18. ^ Terra JK, Cote CK, Франция B, Дженкинс Ал, Бозуэ Дж.А., Welkos SL, LeVine SM, Bradley KA (қаңтар 2010). «Шеткі: Bacalpus anthracis инфекциясына төзімділік, өлімге әкелетін токсинге сезімтал аллель Nalp1b / Nlrp1b». Иммунология журналы. 184 (1): 17–20. дои:10.4049 / джиммунол.0903114. PMC  2811128. PMID  19949100.
  19. ^ Moayeri M, Crown D, Newman ZL, Okugawa S, Eckhaus M, Cataisson C, Liu S, Sastalla I, Leppla SH (желтоқсан 2010). «Сібір жарасына инфламмасомалық сенсор Nlrp1b тәуелділігі каспаза-1, IL-1 сигнализациясы және нейтрофилдерді қабылдау арқылы жүзеге асырылады». PLOS қоздырғыштары. 6 (12): e1001222. дои:10.1371 / journal.ppat.1001222. PMC  3000361. PMID  21170303.
  20. ^ de Zoete MR, Bouwman LI, Keestra AM, van Putten JP (наурыз 2011). «Толл тәрізді рецепторды микробтық протеазалармен бөлшектеу және белсендіру». Америка Құрама Штаттарының Ұлттық Ғылым Академиясының еңбектері. 108 (12): 4968–73. дои:10.1073 / pnas.1018135108. PMC  3064367. PMID  21383168.
  21. ^ Sarris PF, Duxbury Z, Huh SU, Ma Y, Segonzac C, Sklenar J, Derbyshire P, Cevik V, Rallapalli G, Saucet SB, Wirthmueller L, Menke FL, Sohn KH, Jones JD (мамыр 2015). «Өсімдік иммундық рецепторы WRKY транскрипция факторларына бағытталған патогендік эффектілерді анықтайды». Ұяшық. 161 (5): 1089–1100. дои:10.1016 / j.cell.2015.04.024. PMID  26000484.
  22. ^ Мастерлер SL, Gerlic M, Metcalf D, Preston S, Pellegrini M, O'Donnell JA және т.б. (Желтоқсан 2012). «NLRP1 қабыну белсенділігі гемопоэтический жасушалардың пироптозын тудырады». Иммунитет. 37 (6): 1009–23. дои:10.1016 / j.immuni.2012.08.027. PMC  4275304. PMID  23219391.

Әрі қарай оқу

Сыртқы сілтемелер

  • Сайтында қол жетімді барлық құрылымдық ақпаратқа шолу PDB үшін UniProt: Q9C000 (Құрамында NACHT, LRR және PYD домендері бар белок 1) at PDBe-KB.