LDL рецепторымен байланысты ақуызға байланысты ақуыз - LDL-receptor-related protein-associated protein - Wikipedia

LRPAP1
Protein LRPAP1 PDB 1lre.png
Қол жетімді құрылымдар
PDBОртологиялық іздеу: PDBe RCSB
Идентификаторлар
Бүркеншік аттарLRPAP1, A2MRAP, A2RAP, HBP44, MRAP, MYP23, RAP, альфа-2-MRAP, LDL-рецепторлармен байланысты ақуыз, LDL рецепторларымен байланысты ақуыздар
Сыртқы жеке куәліктерOMIM: 104225 MGI: 96829 HomoloGene: 37612 Ген-карталар: LRPAP1
Геннің орналасуы (адам)
4-хромосома (адам)
Хр.4-хромосома (адам)[1]
4-хромосома (адам)
Genomic location for LRPAP1
Genomic location for LRPAP1
Топ4p16.3Бастау3,503,612 bp[1]
Соңы3,532,446 bp[1]
РНҚ экспрессиясы өрнек
PBB GE LRPAP1 201186 at fs.png
Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Ортологтар
ТүрлерАдамТышқан
Энтрез
Ансамбль
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_002337

NM_013587

RefSeq (ақуыз)

NP_002328

NP_038615

Орналасқан жері (UCSC)Хр 4: 3,5 - 3,53 МбХр 5: 35.09 - 35.11 Мб
PubMed іздеу[3][4]
Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеуТінтуірді қарау / өңдеу
Альфа-2-MRAP_N
PDB 2fyl EBI.jpg
lrp, cr56 қос модулі мен rap-d1 рецепторларымен байланысқан ақуыздың бірінші домені арасындағы кешеннің Haddock моделі.
Идентификаторлар
ТаңбаАльфа-2-MRAP_N
PfamPF06400
InterProIPR009066
SCOP21lre / Ауқымы / SUPFAM
Альфа-2-MRAP_C
PDB 2ftu EBI.jpg
рэптің 3 доменінің шешім құрылымы
Идентификаторлар
ТаңбаАльфа-2-MRAP_C
PfamPF06401
InterProIPR010483

Төмен тығыздықтағы липопротеинді рецепторларға байланысты ақуызға байланысты белок 1 ретінде белгілі LRPAP1 немесе RAP бұл шаперон ақуыз ол адамдарда LRPAP1 кодталған ген.[5][6]

Функция

LRPAP1 белгілі бір мүшелерін сатумен байланысты LDL рецепторы отбасы, оның ішінде LRP1 және LRP2.[7] Бұл гликопротеин бұл байланыстырады альфа-2-макроглобулин рецепторына, сонымен қатар басқа мүшелеріне төмен тығыздықтағы липопротеин рецептор отбасы. Бұл ингибирлеу үшін әрекет етеді міндетті бәріне белгілі лигандтар бұл рецепторларға арналған және рецепторлардың алдын-алуы мүмкін жинақтау және эндоплазмалық тордағы деградация, осылайша молекулалық рөл атқарады шаперон.[8] Ол астында болуы мүмкін нормативтік кальмодулинді бақылау, өйткені ол байланыстыра алады кальмодулин және бол фосфорланған кальмодулинге тәуелді киназа II.

Өзара әрекеттесу

LDL рецепторымен байланысты ақуызға байланысты ақуыз көрсетілген өзара әрекеттесу бірге LRP2.[9][10]

LRPAP1 байланысты мутациялар және аурулар

Липидті метаболиздейтін белоктар сезімталдығын жоғарылатуы мүмкін деменция генетикалық құрамдағы айырмашылықтарға әкеледі.[11] ПТР-шектеу фрагментінің полиморфизм техникасы генотиптеу үшін қолданылады LRPAP1 intron 5 енгізу / жою.[11] Зерттеулер көрсеткендей, DD генотипі және LRPAP генінің * D аллелі дегенеративті деменцияның бақылау тобымен салыстырғанда жиілігін жоғарылатқан және LRPAP1-D аллелі дегенеративті деменцияға деген осалдығын айтарлықтай арттырады.[11] LRPAP1 генотипінде полиморфизм 5 интронға 37 базалық жұп енгізілгендіктен байқалады.[11] Аллельді жою аллельден үлкенірек болса, оны енгізу гель электрофорезі бойынша айырмашылықты анықтауға мүмкіндік береді.[12]LRP LDLR рецепторларымен байланысатын доменнің басылуы LRPAP (LRPAP генінің белоктық өнімі) шамадан тыс экспрессиясына байланысты.[13] LRP LRPL арқылы LRPAP арқылы қорғаныс береді және оның төмен реттелуі LDL және Ab-мен байланысты нейрондық уыттылықтың жоғарылауына ұшырауы мүмкін, өйткені LRP лигандты байланыстыруда және апо-E-байытылған LDL холестерин мен Ab протеині сияқты LRP лигандтарының іштей байланыста болуын қолдайды.[11] Енгізу / жою - бұл LRPAP генінің интроникалық полиморфизмі, LRPAP ақуызының синтезделуіне DD генотипі мен D аллеліне әсер ету, деменцияға ықпал ететін лрп-орта механизмі бола алады.[11] Деменцияға сезімталдықты дамытуда бірнеше ортақ генетикалық платформалар мен DD генотипі немесе LRPAP генінің D аллелі осындай болуы мүмкін.[11] Сонымен, интроникалық полиморфизм ретінде зерттелген 37 а.к. енгізу / жою кезінде бұл LRPAP экспрессиясын реттеу арқылы липидті рецепторлық ақуызға ұмтылмаған іздеу болуы мүмкін немесе LRPAP1-дегі басқа биологиялық маңызы бар полиморфизмге қосымша тепе-теңдікте болуы мүмкін. немесе 4-хромосомадағы іргелес ген.[14] Нәтижелер авторлар жоюға мүмкіндік берген алдыңғы зерттеуге сәйкес келеді аллель жиілігі Альцгеймер ауруының кеш басталған пациенттерінде дементацияланбаған қарттықпен салыстырғанда айтарлықтай жоғары.[14]

Менделік формалары миопия төрт туыстық отбасында анықталды және LRPAP1-де гомозиготалы қысқартылған варианттарды тану үшін зерттелген экзоманы / автозигоманы жүзеге асыратын ықтимал себепті мутациялар.[15] Әсер ету TGF-β LRP1 белсенділігі, шапероны LRPAP1 арқылы кодталған. LRP1-нің айқын жетіспеушілігі және оның реттелуі TGF-β зардап шеккен жеке жасушаларда, белгілі деректер миопия склерасы үшін қайта құрудағы TGF-the маңыздылығына сәйкес келеді және миопия үшін жеке адамдарда жиіліктің жоғарылауы Марфан синдромы реттелетін TGF-β сигнал беру сипаттамаларына ие.[16] Қалыпты ақуыздың болмауын талдау LRPAP1 мутациясы бар зардап шеккен адамдар үшін иммуноблотпен жүргізіліп, мутацияны анықтайды LRPAP1 функциялардың жоғалу ықтималдығы.[15] Кодтау (Төмен тығыздықтағы липопротеиндік рецепторларға байланысты ақуыздармен байланысқан ақуыз 1) LRPAP - бұл көбінесе экспрессияланған ген және липопротеидтермен байланысты белоктарды қорғайтын және шаперон деп санайтын 357 аминқышқыл ақуызы. LRP1 және LRP2.[17][18] LRPAP1 тапшылығына әкелетін зерттеу ұсынған модель LRP1 бұл TGF-β реттелуінің бұзылуына жауап берді және көздің дамуында қалыптан тыс ЭКМ қайта құруды тудыруы мүмкін.[15] Осьтік ұзындықты ұлғайтуды қадағалау ерекше белгілерінің бірі болды Марфан синдромы сонымен қатар TGF-β моделін қолдады.[19][20] Сондықтан, ECM қайта құрудан бұрын басталған терапевтік стратегияға жауап беретін миопиясы бар адамдар LRPAP1 байланысты миопиямен ауыратын адамдар үшін тәсіл ретінде қарастырылуы мүмкін.[15]

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ а б c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000163956 - Ансамбль, Мамыр 2017
  2. ^ а б c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000029103 - Ансамбль, Мамыр 2017
  3. ^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  4. ^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  5. ^ Strickland DK, Ashcom JD, Williams S, Battey F, Behre E, McTigue K, Battey JF, Argraves WS (шілде 1991). «Альфа-2-макроглобулинді рецепторлармен байланысты ақуыздың алғашқы құрылымы. Гейманн нефрит антигенінің адам гомологы». Биологиялық химия журналы. 266 (20): 13364–9. PMID  1712782.
  6. ^ Korenberg JR, Argraves KM, Chen XN, Tran H, Strickland DK, Argraves WS (шілде 1994). «LDL рецепторлары отбасы мүшесі гликопротеин 330 (LRP2) және оған байланысты ақуыз RAP (LRPAP1) үшін адам гендерінің хромосомалық оқшаулануы». Геномика. 22 (1): 88–93. дои:10.1006 / geno.1994.1348. PMID  7959795.
  7. ^ «Entrez Gene: LRPAP1 тығыздығы төмен липопротеинді рецепторларға байланысты ақуыз 1 байланысты ақуыз».
  8. ^ Nielsen PR, Ellgaard L, Etzerodt M, Thogersen HC, Poulsen FM (шілде 1997). «Альфа2-макроглобулинді рецепторлармен байланысты ақуыздың N-терминал аймағының ерітінді құрылымы». Америка Құрама Штаттарының Ұлттық Ғылым Академиясының еңбектері. 94 (14): 7521–5. дои:10.1073 / pnas.94.14.7521. PMC  23854. PMID  9207124.
  9. ^ Лу Х, McQuistan T, Орландо, RA, Фаркхар МГ (сәуір 2002). «GAIP, GIPC және Galphai3 проксимальды түтікшелі жасушалардың эндоциттік бөлімдерінде шоғырланған: мегалина қызметін реттеудегі болжамды рөл». Американдық нефрология қоғамының журналы. 13 (4): 918–27. PMID  11912251.
  10. ^ Орландо Р.А., Фаркхар МГ (сәуір 1994). «Рецепторлармен байланысты ақуыздың (RAP) функционалдық аймақтары». Америка Құрама Штаттарының Ұлттық Ғылым Академиясының еңбектері. 91 (8): 3161–5. дои:10.1073 / pnas.91.8.3161. PMC  43535. PMID  7512726.
  11. ^ а б c г. e f ж Pandey P, Pradhan S, Mittal B (2008). «LRP-мен байланысты ақуызды ген (LRPAP1) және дегенеративті деменцияға бейімділік». Гендер, ми және мінез-құлық. 7 (8): 943–950. дои:10.1111 / j.1601-183X.2008.00436.x. PMID  18721259. S2CID  19207648.
  12. ^ Pandey P, Pradhan S, Mittal B (2008). «LRP-мен байланысты ақуызды ген (LRPAP1) және дегенеративті деменцияға бейімділік». Гендер, ми және мінез-құлық. 7 (8): 943–50. дои:10.1111 / j.1601-183X.2008.00436.x. PMID  18721259. S2CID  19207648.
  13. ^ Willnow TE, Sheng Z, Ishibashi S, Herz J (1994). «Рецепторлар антагонистінің гендердің ауысуы арқылы бауыр хиломикронының қалдықтарын сіңіруді тежеу». Ғылым. 264 (5164): 1471–4. дои:10.1126 / ғылым.7515194. PMID  7515194.
  14. ^ а б Sánchez L, Alvarez V, González P, González I, Alvarez R, Coto E (2001). «LRP-мен байланысты ақуыз генінің (LRPAP1) өзгеруі кеш басталған Альцгеймер ауруымен байланысты». Американдық медициналық генетика журналы. 105 (1): 76–8. дои:10.1002 / 1096-8628 (20010108) 105: 1 <76 :: aid-ajmg1066> 3.3.co; 2-i. PMID  11425005.
  15. ^ а б c г. Aldahmesh MA, Khan AO, Alkuraya H, Adly N, Anazi S, Al-Saleh AA, Mohamed JY, Hijazi H, Prabakaran S, Tacke M, Al-Khrashi A, Hashem M, Reinheckel T, Assiri A, Alkuraya FS (2013) -08-08). «LRPAP1-тегі мутациялар адамдағы ауыр миопиямен байланысты». Am J Hum Genet. 93 (2): 313–20. дои:10.1016 / j.ajhg.2013.06.002. PMC  3738831. PMID  23830514.
  16. ^ Aldahmesh MA, Khan AO, Alkuraya H, Adly N, Anazi S, Al-Saleh AA, Mohamed JY, Hijazi H, Prabakaran S, Tacke M, Al-Khrashi A, Hashem M, Reinheckel T, Assiri A, Alkuraya FS (2013) ). «LRPAP1 мутациясы адамның ауыр миопиясымен байланысты». Американдық генетика журналы. 93 (2): 313–20. дои:10.1016 / j.ajhg.2013.06.002. PMC  3738831. PMID  23830514.
  17. ^ Willnow TE, Armstrong SA, Hammer RE, Herz J (1995). «Төмен тығыздықтағы липопротеинді рецепторлармен байланысты ақуыздың функционалды экспрессиясы рецепторлармен байланысты протеинмен басқарылады». Америка Құрама Штаттарының Ұлттық Ғылым Академиясының еңбектері. 92 (10): 4537–41. дои:10.1073 / pnas.92.10.4537. PMC  41979. PMID  7538675.
  18. ^ Уиллнов Т.Е., Рольман А, Хортон Дж, Отани Х, Браун Дж.Р., Хаммер Р.Е., Герц Дж (1996). «RAP, мамандандырылған шаперон, LDL рецепторларымен байланысты эндоциттік рецепторлардың лигандпен туындаған ER-дің тоқырауын және деградациясын болдырмайды». EMBO журналы. 15 (11): 2632–9. дои:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00623.x. PMC  450198. PMID  8654360.
  19. ^ Loeys BL, Dietz HC, Braverman AC, Callewaert BL, De Backer J, Devereux RB, Hilhorst-Hofstee Y, Jondeau G, Faivre L, Milewicz DM, Pyeritz RE, Sponseller PD, Wordsworth P, De Paepe AM (2010). «Марфан синдромының қайта қаралған Гент нозологиясы». Медициналық генетика журналы. 47 (7): 476–85. дои:10.1136 / jmg.2009.072785. hdl:1854 / LU-1013955. PMID  20591885. S2CID  13895128.
  20. ^ Брук Б.С., Хабаши Дж.П., судья Д.П., Пател Н, Лойс Б, Диетс ХС (2008). «Ангиотензин II блокадасы және Марфан синдромындағы аорта-тамыр кеңеюі». Жаңа Англия медицинасы журналы. 358 (26): 2787–95. дои:10.1056 / NEJMoa0706585. PMC  2692965. PMID  18579813.

Әрі қарай оқу

Сыртқы сілтемелер

Бұл мақалада көпшілікке арналған мәтін енгізілген Pfam және InterPro: IPR010483