VRK1 - VRK1

VRK1
Қол жетімді құрылымдар
PDB	Ортологиялық іздеу: PDBe RCSB
PDB идентификатор кодтарының тізімі
	2KTY, 2ҚҰЛ, 2LAV, 2RSV, 3OP5
Идентификаторлар
Бүркеншік аттар	VRK1, PCH1, PCH1A, вакцинияға байланысты киназа 1, VRK серин / треонинкиназа 1
Сыртқы жеке куәліктер	OMIM: 602168 MGI: 1261847 HomoloGene: 2541 Ген-карталар: VRK1
Геннің орналасуы (адам)
Хр.	14-хромосома (адам)
Соңы	96,931,722 bp
Геннің орналасуы (тышқан)
Хр.	12-хромосома (тышқан)
Соңы	106,077,426 bp
РНҚ экспрессиясы өрнек
	Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Гендік онтология
Молекулалық функция	• трансфераза белсенділігі; • нуклеотидті байланыстыру; • ақуыздың киназа белсенділігі; • киназа белсенділігі; • нуклеосомалық гистонмен байланысуы; • белок серин / треонинкиназа белсенділігі; • GO: 0001948 ақуыздармен байланысуы; • гистон киназа белсенділігі (H3-T3 спецификалық); • гистон киназа белсенділігі (H3-S10 спецификалық); • ATP байланысы; • ақуыздың киназамен байланысуы;
Ұялы компонент	• шпиндель; • нуклеоплазма; • ядро; • Гольджи стегі; • цитоскелет; • жасуша ядросы; • цитоплазма; • цитозол;
Биологиялық процесс	• фосфорлану; • гистон H3-S10 фосфорлану; • гистон H3-T3 фосфорлануы; • жасушалардың бөлінуі; • ақуызды фосфорлану; • митотикалық ядролық конвертті бөлшектеу; • жасушалық цикл; • митотикалық ядролық конвертті қайта құрастыру; • Гольджиді бөлшектеу; • жасуша пішінін реттеу; • автофосфорлану; • пептидил-серинді фосфорлану; • пептидил-треонинді фосфорлану;
	Дереккөздер:Амиго / QuickGO
Ортологтар
	7443
	22367
	ENSG00000100749
	ENSMUSG00000021115
	Q99986
	Q80X41
	NM_003384
NM_001029843; NM_001029844; NM_011705; NM_001364365; NM_001364367;
	NM_001364368
	NP_003375
NP_001025014; NP_001025015; NP_035835; NP_001351294; NP_001351296;
	NP_001351297
	Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеу	Тінтуірді қарау / өңдеу

Адамға вакциниямен байланысты киназ протеинінің PDB кіруінің мультфильм схемасы 6bru

Серин / треонин-протеин киназасы VRK1 болып табылады фермент адамдарда кодталған VRK1 ген.^[5]^[6]

Бұл ген вакциниямен байланысты киназа (VRK) отбасының мүшесін кодтайды серин / треонин протеинкиназалары. Бұл ген адамда кеңінен көрінеді тіндер және белсенді түрде экспрессияны арттырды бөлінетін жасушалар, мысалы, аталық безде, тимуста, ұрықтың бауыры мен карциномада. Оның протеині локализацияланған ядро және транскрипциялық белсенді заттың тұрақтылығы мен ядролық жинақталуына ықпал ететіні көрсетілген p53 молекула және, in vitro, р53-тің Thr18 фосфорилденуі және р53-тің барлығын азайту үшін. Демек, бұл ген реттелуі мүмкін жасушалардың көбеюі. Бұл ақуыз гистонды, казеинді және транскрипция факторларын фосфорлайды ATF2 (транскрипция коэффициенті 2) және C-жүн.^[6]

Әдебиеттер тізімі

^ ^а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000100749 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000021115 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ Nezu J, Oku A, Jones MH, Shimane M (ақпан 1998). «В1 вакциния вирусына B1R киназа құрылымымен ұқсастығы бар VRK1 және VRK2 адамның жаңа серин / треонинкиназаларын анықтау». Геномика. 45 (2): 327–31. дои:10.1006 / geno.1997.4938. PMID 9344656.
^ ^а ^б «Entrez Gene: VRK1 вакцинасына байланысты киназ 1».

Әрі қарай оқу

Sugimoto J, Yamauchi T, Hatakeyama T, Isobe M (1999). «Адамның VRK1 локусындағы полиморфты ОА қайталану дәйектілігін оқшаулау және картаға түсіру». Дж. Хум. Генет. 44 (2): 133–4. дои:10.1007 / s100380050127. PMID 10083742.
Саид М, Ким СО, Салх Б.С. және т.б. (2000). «C38 митогенмен белсендірілген ақуыз киназасымен тікелей әрекеттесу арқылы протеинкиназа CK2-нің стресстен туындаған активациясы». Дж.Биол. Хим. 275 (22): 16569–73. дои:10.1074 / jbc.M000312200. PMID 10747897.
Лопес-Борхес С, Лазо, Пенсилвания (2000). «Адамның вакциниямен байланысты киназасы 1 (VRK1) p53 ісік супрессоры ақуызының mdm-2 байланыс орнында треонин-18 фосфорлайды». Онкоген. 19 (32): 3656–64. дои:10.1038 / sj.onc.1203709. PMID 10951572.
Latonen L, Taya Y, Laiho M (2001). «Ультрафиолет сәулеленуі р53 реакциясының дозаға тәуелді реттелуін тудырады және адамның фибробласттарындағы р53-HDM2 өзара әрекеттесуін модуляциялайды». Онкоген. 20 (46): 6784–93. дои:10.1038 / sj.onc.1204883. PMID 11709713.
Barcia R, López-Borges S, Vega FM, Lazo PA (2002). «Адамның вакциниямен байланысты киназа 1 әсерінен р53 фосфорлануының кинетикалық қасиеттері». Арка. Биохимия. Биофиз. 399 (1): 1–5. дои:10.1006 / abbi.2001.2746. PMID 11883897.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH және т.б. (2003). «Адам мен тышқанның 15000-нан астам толық ұзындықтағы кДНҚ тізбектерінің генерациясы және алғашқы талдауы». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 99 (26): 16899–903. дои:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Nichols RJ, Traktman P (2004). «Сүтқоректілерге жататын киназалар тобына жататын үш паралогиялық мүшенің сипаттамасы». Дж.Биол. Хим. 279 (9): 7934–46. дои:10.1074 / jbc.M310813200. PMID 14645249.
Бойл К.А., Трактман П (2004). «Сүтқоректілердің протеин киназаларының жаңа отбасының мүшелері В1 киназада ақаулы вакциния вирусы ц-мутантының ДНҚ-теріс фенотипін толықтырады». Дж. Вирол. 78 (4): 1992–2005. дои:10.1128 / JVI.78.4.1992-2005.2004. PMC 369515. PMID 14747564.
Sevilla A, Santos CR, Vega FM, Lazo PA (2004). «Адамның вакциниямен байланысты киназасы 1 (VRK1) ATF2 транскрипциялық белсенділігін Thr-73 және Ser-62-де жаңа фосфорлану жолымен белсендіреді және JNK-мен ынтымақтастықта болады». Дж.Биол. Хим. 279 (26): 27458–65. дои:10.1074 / jbc.M401009200. PMID 15105425.
Sevilla A, Santos CR, Barcia R және т.б. (2004). «адамның вакцинияға байланысты киназа 1 (VRK1) арқылы с-Jun фосфорлануы және оның c-Jun (JNK) N-терминал киназасымен ынтымақтастығы» (PDF). Онкоген. 23 (55): 8950–8. дои:10.1038 / sj.onc.1208015. PMID 15378002.
Герхард Д.С., Вагнер Л, Фейнголд Е.А. және т.б. (2004). «NIH толық ұзындықтағы cDNA жобасының мәртебесі, сапасы және кеңеюі: Сүтқоректілер гендерінің коллекциясы (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121-7. дои:10.1101 / гр.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Vega FM, Sevilla A, Lazo PA (2005). «p53 Адамның вакцинияға байланысты киназа 1 әсерінен тұрақтануы және жинақталуы». Мол. Ұяшық. Биол. 24 (23): 10366–80. дои:10.1128 / MCB.24.23.10366-10380.2004. PMC 529057. PMID 15542844.
Андерсен JS, Лам YW, Leung AK және т.б. (2005). «Ядролық протеом динамикасы». Табиғат. 433 (7021): 77–83. дои:10.1038 / табиғат03207. PMID 15635413.
Santos CR, Rodríguez-Pinilla M, Vega FM және т.б. (2006). «VRK1 бас және мойын қабыршақтарындағы пролиферация фенотипі аясында сигналдық жол». Мол. Қатерлі ісік ауруы. 4 (3): 177–85. дои:10.1158 / 1541-7786.MCR-05-0212. PMID 16547155.
Valbuena A, Vega FM, Blanco S, Lazo PA (2006). «p53 жаңа ауторегуляторлық цикл құра отырып, оның вакцинамен байланысты киназа 1-ді реттейді». Мол. Ұяшық. Биол. 26 (13): 4782–93. дои:10.1128 / MCB.00069-06. PMC 1489172. PMID 16782868.
Вальбуена А, Лопес-Санчес I, Вега ФМ және т.б. (2007). «Адамның вакциниямен байланысты киназасы 1-де (VRK1) доминантты эпитопты анықтау және әртүрлі жасушаішілік субпопуляцияларды анықтау». Арка. Биохимия. Биофиз. 465 (1): 219–26. дои:10.1016 / j.abb.2007.06.005. PMID 17617371.

Бұл мақала а ген қосулы адамның хромосомасы 14 Бұл бұта. Сіз Уикипедияға көмектесе аласыз оны кеңейту.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000100749 - Ансамбль, Мамыр 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000021115 - Ансамбль, Мамыр 2017

[3] «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[4] «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[pmid9344656-5] Nezu J, Oku A, Jones MH, Shimane M (ақпан 1998). «В1 вакциния вирусына B1R киназа құрылымымен ұқсастығы бар VRK1 және VRK2 адамның жаңа серин / треонинкиназаларын анықтау». Геномика. 45 (2): 327–31. дои:10.1006 / geno.1997.4938. PMID 9344656.

[entrez-6] а ^б «Entrez Gene: VRK1 вакцинасына байланысты киназ 1».

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]