KCNJ4 - KCNJ4

KCNJ4
Қол жетімді құрылымдар
PDB	Ортологиялық іздеу: PDBe RCSB
PDB идентификатор кодтарының тізімі
	3GJ9
Идентификаторлар
Бүркеншік аттар	KCNJ4, HIR, HIRK2, HRK1, IRK-3, IRK3, Kir2.3, калий кернеуі бар арна ішкі отбасы J мүшесі 4, калий ішке қарай түзететін арна ішкі семьясы J мүшесі 4
Сыртқы жеке куәліктер	OMIM: 600504 MGI: 104743 HomoloGene: 3653 Ген-карталар: KCNJ4
Геннің орналасуы (адам)
Хр.	22-хромосома (адам)
Соңы	38,455,199 bp
Геннің орналасуы (тышқан)
Хр.	15-хромосома (тышқан)
Соңы	79,505,241 bp
РНҚ экспрессиясы өрнек
	; ;
	Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Гендік онтология
Молекулалық функция	• GO: 0001948 ақуыздармен байланысуы; • иондық каналдың кернеулі белсенділігі; • PDZ доменін байланыстыру; • ішке түзеткіш калий каналының белсенділігі; • G-ақуызы ішке бағытталған түзеткіш калий каналының белсенділігі;
Ұялы компонент	• синапс; • цитоплазмалық көпіршік қабығы; • калий каналы кешені; • жасушалық түйісу; • мембрананың ажырамас компоненті; • мембрана; • цитоплазмалық көпіршік; • плазмалық базолитті мембрана; • постсинапстық мембрана; • жасуша қабығы;
Биологиялық процесс	• иондық трансмембраналық тасымалдауды реттеу; • ионды тасымалдау; • калий ионының тасымалы; • плазмалық мембрана арқылы калий ионын импорттау; • жүрек өткізгіштігі;
	Дереккөздер:Амиго / QuickGO
Ортологтар
	3761
	16520
	ENSG00000168135
	ENSMUSG00000044216
	P48050
	P52189
	NM_152868; NM_004981
	NM_008427
	NP_004972; NP_690607
	жоқ
	Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеу	Тінтуірді қарау / өңдеу

Калий ішке-түзеткіш арна, ішкі семья, мүше 4, сондай-ақ KCNJ4 немесе Қ_ир2.3, адам ген.^[5]

Функция

Жүйке жүйесінде бірнеше түрлі калий каналдары электрлік сигнализацияға қатысатыны белгілі. Бір класс деполяризациямен белсендіріледі, ал екінші класс олай емес. Соңғылары іштей түзілетін K + каналдары деп аталады және олар калийдің клеткадан емес, оның жасушаға ағуына мүмкіндік беру үрдісіне ие. Калий ионының өткізгіштігіндегі бұл асимметрия бұлшықет жасушалары мен нейрондардың қозғыштығында шешуші рөл атқарады. Бұл генмен кодталған ақуыз интегралды мембраналық ақуыз және ішке түзеткіш калий каналы тұқымдасының мүшесі болып табылады. Кодталған ақуыз осы ақуыздар тобының басқа мүшелерімен салыстырғанда аз унитарлық өткізгіштікке ие. Бұл ген үшін бір протеинді кодтайтын екі транскрипция нұсқасы табылды.^[5]

Өзара әрекеттесу

KCNJ4 көрсетілген өзара әрекеттесу бірге:

CASK,^[6]^[7]
DLG1^[6]^[7]^[8]
DLG4,^[7]^[9]^[10]
LIN7B,^[11] және
LIN7C.^[6]^[7]

Сондай-ақ қараңыз

Ішке-түзеткіш калий ионының арнасы

Әдебиеттер тізімі

^ ^а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000168135 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000044216 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ ^а ^б «Entrez Gene: KCNJ4 калий ішке-түзеткіш канал, J-отбасы, 4 мүше».
^ ^а ^б ^c Leonoudakis D, Conti LR, Anderson S, Radeke CM, McGuire LM, Adams ME, Froehner SC, Yates JR, Vandenberg CA (мамыр 2004). «Ішке түзеткіш калий каналының (Kir2.x) байланысқан ақуыздарының протеомиялық анализімен анықталған ақуыздар айналымы және зәкір кешендері». Дж.Биол. Хим. 279 (21): 22331–46. дои:10.1074 / jbc.M400285200. PMID 15024025.
^ ^а ^б ^c ^г. Leonoudakis D, Conti LR, Radeke CM, McGuire LM, Vandenberg CA (сәуір 2004). «SAP97, CASK, Veli және Mint1-ден тұратын көп протеиндер айналымы кешені ішке бағытталған калий калий каналдарымен байланысты». Дж.Биол. Хим. 279 (18): 19051–63. дои:10.1074 / jbc.M400284200. PMID 14960569.
^ Leonoudakis D, Mailliard W, Wingerd K, Clegg D, Vandenberg C (наурыз 2001). «Kir2.2 түзеткіш калий каналы синапспен байланысты SAP97 ақуызымен байланысты». J. Cell Sci. 114 (Pt 5): 987-98. PMID 11181181.
^ Nehring RB, Wischmeyer E, Döring F, Veh RW, Sheng M, Karschin A (қаңтар 2000). «PSD-95 / SAP90 тұқымдасының PDZ ақуыздарымен дифференциалды түрде жұптасатын K (+) каналдарын ішке түзететін». Дж.Нейросчи. 20 (1): 156–62. дои:10.1523 / JNEUROSCI.20-01-00156.2000. PMC 6774109. PMID 10627592.
^ Inanobe A, Fujita A, Ito M, Tomoike H, Inageda K, Kurachi Y (маусым 2002). «Kir2.3 ішкі түзеткіші қоздырғыш синапстардың постсинаптикалық мембранасында локализацияланған». Am. J. Physiol., Жасуша Physiol. 282 (6): C1396-403. дои:10.1152 / ajpcell.00615.2001. PMID 11997254.
^ Олсен О, Лю Х, Уэйд Дж.Б., Мерот Дж, Веллинг ПА (қаңтар 2002). «Kir 2.3 каналының базолитті мембраналық экспрессиясы Lin-7 / CASK кешенімен PDZ өзара әрекеттесуімен үйлеседі». Am. J. Physiol., Жасуша Physiol. 282 (1): C183-95. дои:10.1152 / ajpcell.00249.2001. PMID 11742811.

Әрі қарай оқу

Kubo Y, Adelman JP, Clapham DE, Jan LY, Karschin A, Kurachi Y, Lazdunski M, Nichols CG, Seino S, Vandenberg CA (2006). «Халықаралық фармакология одағы. LIV. Ішкі ректификациялық калий арналарының номенклатурасы және молекулалық байланыстары». Фармакол. Аян. 57 (4): 509–26. дои:10.1124 / пр.57.4.11. PMID 16382105.
Budarf ML, Périer F, Barnoski BL, Bell CJ, Vandenberg CA (1995). «Адамның гипокампальды ішке қарай түзеткіш калий каналының (HIR) генін 22q13.1-ге тағайындау». Геномика. 26 (3): 625–9. дои:10.1016 / 0888-7543 (95) 80189-S. PMID 7607694.
Périer F, Radeke CM, Vandenberg CA (1994). «Адамның гиппокампусынан ішке қарай түзілетін калий арнасының кіші өткізгіштігінің алғашқы құрылымы және сипаттамасы». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 91 (13): 6240–4. дои:10.1073 / pnas.91.13.6240. PMC 44174. PMID 8016146.
Tang W, Yang XC (1994). «Адам миының жаңа түзеткіш калий арнасын клондау және оның Ксенопус ооциттеріндегі функционалды көрінісі». FEBS Lett. 348 (3): 239–43. дои:10.1016/0014-5793(94)00612-1. PMID 8034048.
Махина Е.Н., Келли А.Ж., Лопатин А.Н., Мерсер Р.В., Николс К.Г. (1994). «Калийдің жаңа түзеткіші бар мидың клондау және экспрессиясы». Дж.Биол. Хим. 269 (32): 20468–74. PMID 8051145.
Коэн Н.А., Бренман Дж.Е., Снайдер SH, Бредт Д.С. (1996). «Kir 2.3 түзеткіштің Kir 2.3 каналының PSD-95-пен байланысы ақуыз киназасы А фосфорлануымен реттеледі». Нейрон. 17 (4): 759–67. дои:10.1016 / S0896-6273 (00) 80207-X. PMID 8893032.
Коэн Н.А., Ша Q, Махина Е.Н., Лопатин А.Н., Линдер М.Е., Снайдер Ш., Николс CG (1997). «G-ақуызды бетагамма суббірліктері арқылы ішке түзеткіш калий каналының (Kir2.3) тежелуі». Дж.Биол. Хим. 271 (50): 32301–5. дои:10.1074 / jbc.271.50.32301. PMID 8943291.
Чжу Г, Ку З, Цуй Н, Цзян С (1999). «Треонин 53 кезіндегі ақуызды протеинкиназа С фосфорлануымен Kir2.3 белсенділігін басу». Дж.Биол. Хим. 274 (17): 11643–6. дои:10.1074 / jbc.274.17.11643. PMID 10206975.
Куршнер С, Юдзаки М (1999). «Нейрондық интерлейкин-16 (NIL-16): қос функционалды PDZ домен ақуызы». Дж.Нейросчи. 19 (18): 7770–80. дои:10.1523 / JNEUROSCI.19-18-07770.1999. PMC 6782450. PMID 10479680.
Dunham I, Shimizu N, Roe BA, Chissoe S, Hunt AR, Collins JE, Bruskiewich R, Beare DM, Clamp M, Smink LJ, Ainscough R, Almeida JP, Babbeding A, Bagguley C, Bailey J, Barlow K, Bates KN , Beasley O, Bird CP, Blakey S, Bridgeman AM, Buck D, Burgess J, Burrill WD, O'Brien KP (1999). «Адамның 22-хромосомасының ДНҚ тізбегі». Табиғат. 402 (6761): 489–95. дои:10.1038/990031. PMID 10591208.
Nehring RB, Wischmeyer E, Döring F, Veh RW, Sheng M, Karschin A (2000). «PSD-95 / SAP90 тұқымдасының PDZ ақуыздарымен дифференциалды түрде жұптасатын K (+) каналдарын ішке түзететін». Дж.Нейросчи. 20 (1): 156–62. дои:10.1523 / JNEUROSCI.20-01-00156.2000. PMC 6774109. PMID 10627592.
Leonoudakis D, Mailliard W, Wingerd K, Clegg D, Vandenberg C (2001). «Kir2.2 түзеткіш калий каналы синапспен байланысты SAP97 ақуызымен байланысты». J. Cell Sci. 114 (Pt 5): 987-98. PMID 11181181.
Лю Ю, Лю Д, Хит Л, Мейерс Д.М., Крафте Д.С., Вагонер П.К., Силвия СП, Ю В, Карран ME (2001). «Арахидон қышқылымен ішке түзетілетін калий арнасын тікелей активтендіру». Мол. Фармакол. 59 (5): 1061–8. дои:10.1124 / mol.59.5.1061. PMID 11306688.
Perillan PR, Chen M, Potts EA, Simard JM (2002). «Өсу факторын-бета 1 түрлендіруі ересек егеуқұйрықтың миынан реактивті астроциттердегі фосфолипаза С және ақуыз киназа С-дельта арқылы K2 түзеткіш K + арналарын реттейді». Дж.Биол. Хим. 277 (3): 1974–80. дои:10.1074 / jbc.M107984200. PMID 11713246.
Олсен О, Лю Х, Уэйд Дж.Б., Мерот Дж, Веллинг П.А. (2002). «Kir 2.3 каналының базолитті мембраналық экспрессиясы Lin-7 / CASK кешенімен PDZ өзара әрекеттесуімен үйлеседі». Am. J. Physiol., Жасуша Physiol. 282 (1): C183-95. дои:10.1152 / ajpcell.00249.2001. PMID 11742811.
Inanobe A, Fujita A, Ito M, Tomoike H, Inageda K, Kurachi Y (2002). «Kir2.3 ішкі түзеткіші қоздырғыш синапстардың постсинаптикалық мембранасында локализацияланған». Am. J. Physiol., Жасуша Physiol. 282 (6): C1396-403. дои:10.1152 / ajpcell.00615.2001. PMID 11997254.
Preisig-Müller R, Schlichthörl G, Goerge T, Heinen S, Brüggemann A, Rajan S, Derst C, Veh RW, Daut J (2002). «Kir2.x калий каналдарының гетеромеризациясы Андерсен синдромының фенотипіне ықпал етеді». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 99 (11): 7774–9. дои:10.1073 / pnas.102609499. PMC 124349. PMID 12032359.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, Derge JG, Klausner RD, Collins FS, Wagner L, Shenmen CM, Schuler GD, Altschul SF, Zeeberg B, Buetow KH, Schaefer CF, Bhat NK, Hopkins RF, Jordan H, Mur T , Max SI, Wang J, Hsieh F, Diatchenko L, Marusina K, Farmer AA, Rubin GM, Hong L, Stapleton M, Soares MB, Bonaldo MF, Casavant TL, Scheetz TE, Brown Brown MJ, Usdin TB, Toshiyuki S, Carninci P, Prange C, Raha SS, Loquellano NA, Peters GJ, Abramson RD, Mullahy SJ, Bosak SA, McEwan PJ, McKernan KJ, Malek JA, Gunaratne PH, Richards S, Worley KC, Hale S, Garcia AM, Gay LJ, Hulyk SW, Villalon DK, Muzny DM, Sodergren EJ, Lu X, Gibbs RA, Fahey J, Helton E, Ketteman M, Madan A, Rodrigues S, Sanchez A, Whiting M, Madan A, Young AC, Шевченко Ю, Буффард Г.Г. , Blakesley RW, Touchman JW, Green ED, Dickson MC, Rodriguez AC, Grimwood J, Schmutz J, Myers RM, Butterfield YS, Krzywinski MI, Skalska U, Smailus DE, Schnerch A, Schein JE, Jones SJ, Marra MA (2003) ). «Адам мен тышқанның 15000-нан астам толық ұзындықтағы кДНҚ тізбектерінің генерациясы және алғашқы талдауы». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 99 (26): 16899–903. дои:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Leonoudakis D, Conti LR, Radeke CM, McGuire LM, Vandenberg CA (2004). «SAP97, CASK, Veli және Mint1-ден тұратын көп протеиндер айналымы кешені ішке бағытталған калий калий каналдарымен байланысты». Дж.Биол. Хим. 279 (18): 19051–63. дои:10.1074 / jbc.M400284200. PMID 14960569.
Leonoudakis D, Conti LR, Anderson S, Radeke CM, McGuire LM, Adams ME, Froehner SC, Yates JR, Vandenberg CA (2004). «Ішке түзеткіш калий каналының (Kir2.x) байланысқан ақуыздарының протеомиялық анализімен анықталған ақуыздар айналымы және зәкір кешендері». Дж.Биол. Хим. 279 (21): 22331–46. дои:10.1074 / jbc.M400285200. PMID 15024025.

Сыртқы сілтемелер

KCNJ4 + ақуыз, + адам АҚШ ұлттық медицина кітапханасында Медициналық тақырып айдарлары (MeSH)

Бұл мақалада Америка Құрама Штаттарының Ұлттық медицина кітапханасы, ол қоғамдық домен.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000168135 - Ансамбль, Мамыр 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000044216 - Ансамбль, Мамыр 2017

[3] «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[4] «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[entrez-5] а ^б «Entrez Gene: KCNJ4 калий ішке-түзеткіш канал, J-отбасы, 4 мүше».

[pmid15024025-6] а ^б ^c Leonoudakis D, Conti LR, Anderson S, Radeke CM, McGuire LM, Adams ME, Froehner SC, Yates JR, Vandenberg CA (мамыр 2004). «Ішке түзеткіш калий каналының (Kir2.x) байланысқан ақуыздарының протеомиялық анализімен анықталған ақуыздар айналымы және зәкір кешендері». Дж.Биол. Хим. 279 (21): 22331–46. дои:10.1074 / jbc.M400285200. PMID 15024025.

[pmid14960569-7] а ^б ^c ^г. Leonoudakis D, Conti LR, Radeke CM, McGuire LM, Vandenberg CA (сәуір 2004). «SAP97, CASK, Veli және Mint1-ден тұратын көп протеиндер айналымы кешені ішке бағытталған калий калий каналдарымен байланысты». Дж.Биол. Хим. 279 (18): 19051–63. дои:10.1074 / jbc.M400284200. PMID 14960569.

[pmid11181181-8] Leonoudakis D, Mailliard W, Wingerd K, Clegg D, Vandenberg C (наурыз 2001). «Kir2.2 түзеткіш калий каналы синапспен байланысты SAP97 ақуызымен байланысты». J. Cell Sci. 114 (Pt 5): 987-98. PMID 11181181.

[pmid10627592-9] Nehring RB, Wischmeyer E, Döring F, Veh RW, Sheng M, Karschin A (қаңтар 2000). «PSD-95 / SAP90 тұқымдасының PDZ ақуыздарымен дифференциалды түрде жұптасатын K (+) каналдарын ішке түзететін». Дж.Нейросчи. 20 (1): 156–62. дои:10.1523 / JNEUROSCI.20-01-00156.2000. PMC 6774109. PMID 10627592.

[pmid11997254-10] Inanobe A, Fujita A, Ito M, Tomoike H, Inageda K, Kurachi Y (маусым 2002). «Kir2.3 ішкі түзеткіші қоздырғыш синапстардың постсинаптикалық мембранасында локализацияланған». Am. J. Physiol., Жасуша Physiol. 282 (6): C1396-403. дои:10.1152 / ajpcell.00615.2001. PMID 11997254.

[pmid11742811-11] Олсен О, Лю Х, Уэйд Дж.Б., Мерот Дж, Веллинг ПА (қаңтар 2002). «Kir 2.3 каналының базолитті мембраналық экспрессиясы Lin-7 / CASK кешенімен PDZ өзара әрекеттесуімен үйлеседі». Am. J. Physiol., Жасуша Physiol. 282 (1): C183-95. дои:10.1152 / ajpcell.00249.2001. PMID 11742811.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]