SMARCC1 - SMARCC1

SMARCC1
Қол жетімді құрылымдар
PDB	Ортологиялық іздеу: PDBe RCSB
PDB идентификатор кодтарының тізімі
	2ЮС
Идентификаторлар
Бүркеншік аттар	SMARCC1, BAF155, CRACC1, Rsc8, SRG3, SWI3, SWI / SNF байланысты, матрицамен байланысқан, хроматиннің субфамилиясы c мүшесінің актинге тәуелді реттегіші
Сыртқы жеке куәліктер	OMIM: 601732 MGI: 1203524 HomoloGene: 68296 Ген-карталар: SMARCC1
Геннің орналасуы (адам)
Хр.	3-хромосома (адам)
Соңы	47,782,106 bp
Геннің орналасуы (тышқан)
Хр.	9-хромосома (тышқан)
Соңы	110,240,178 bp
РНҚ экспрессиясы өрнек
	; ; ; ;
	Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Гендік онтология
Молекулалық функция	• GO: 0000980 РНҚ-полимераза II цис-реттеуші аймақ реттілігінің спецификалық ДНҚ-мен байланысы; • ДНҚ байланыстыру; • ақуызды N-терминалмен байланыстыру; • GO: 0001105 транскрипция коактиваторының қызметі; • хроматинді байланыстыру; • GO: 0001948 ақуыздармен байланысуы; • нуклеосомалық ДНҚ-мен байланысуы; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 ДНҚ-мен байланысатын транскрипция факторының белсенділігі, II-РНҚ-полимераза; • гистонды байланыстыру;
Ұялы компонент	• nBAF кешені; • SWI / SNF кешені; • жасушаішілік; • нуклеоплазма; • XY денесі; • npBAF кешені; • ядролық хроматин; • жасуша ядросы; • цитоплазма; • макромолекулалық кешен;
Биологиялық процесс	• хроматинді қайта құру; • инсулин рецепторларының сигнал беру жолы; • транскрипцияны реттеу, ДНҚ-шаблонмен; • РНҚ-полимераза II промоторынан транскрипцияны реттеу; • простата безінің дамуы; • транскрипция, ДНҚ-шаблонмен; • жүйке жүйесінің дамуы; • АТФ-ге тәуелді хроматинді қайта құру; • транскрипцияның оң реттелуі, ДНҚ-шаблонмен; • нуклеосоманы бөлшектеу; • протеазомдық убивитинге тәуелді протеиндік катаболикалық процестің теріс реттелуі; • жануарлар мүшелерінің морфогенезі; • РНҚ-полимераза II промоторынан транскрипцияның оң реттелуі; • ковалентті хроматин модификациясы; • хроматинді ұйымдастыру;
	Дереккөздер:Амиго / QuickGO
Ортологтар
	6599
	20588
	ENSG00000173473
	ENSMUSG00000032481
	Q92922; Q58EY4
	P97496
	NM_003074
	NM_009211
	NP_003065; NP_003065.3
	NP_033237
	Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеу	Тінтуірді қарау / өңдеу

SWI / SNF кешенді SMARCC1 суббірлігі Бұл ақуыз адамдарда кодталған SMARCC1 ген.^[5]^[6]

Функция

Бұл генмен кодталған ақуыз - мүшесі SWI / SNF мүшелері көрсететін белоктар отбасы геликаза және ATPase белгілі бір гендердің транскрипциясын осы гендердің айналасындағы хроматин құрылымын өзгерту арқылы реттейді деп саналатын белсенділіктер. Кодталған ақуыз үлкен АТФ-тәуелділіктің бөлігі болып табылады хроматинді қайта құру SWI / SNF күрделі және болжамды қамтиды лейцинді найзағай көпшілікке тән мотив транскрипция факторлары.^[6]

Өзара әрекеттесу

SMARCC1 көрсетілген өзара әрекеттесу бірге:

Әдебиеттер тізімі

^ ^а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000173473 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000032481 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ Ван В, Сюэ Ю, Чжоу С, Куо А, Кэрнс BR, Crabtree GR (қараша 1996). «Сүтқоректілердің SWI / SNF кешендерінің әртүрлілігі және мамандануы». Genes Dev. 10 (17): 2117–30. дои:10.1101 / gad.10.17.2117. PMID 8804307.
^ ^а ^б «Entrez Gene: SMARCC1 SWI / SNF байланысты, матрицаға байланысты, хроматиннің актинге тәуелді реттегіші, с отбасы, 1 мүшесі».
^ Китагава Х, Фуджики Р, Йошимура К, Мезаки Ю, Уэмацу Ю, Мацуи Д, Огава С, Унно К, Окубо М, Токита А, Накагава Т, Ито Т, Ишими Ю, Нагасава Х, Мацумото Т, Янагисава Дж, Като С. (Маусым 2003). «WINAC хроматинді қайта құру кешені ядролық рецепторды промоторларға бағыттайды және Уильямс синдромында нашарлайды». Ұяшық. 113 (7): 905–17. дои:10.1016 / s0092-8674 (03) 00436-7. PMID 12837248.
^ ^а ^б Кузьмичев А, Чжан Ю, Эрджумент-Бромаж Н, Темпст П, Рейнберг Д (ақпан 2002). «P33 (ING1) ісік супрессоры үміткердің өсуін реттеудегі Sin3-гистон деацетилаза кешенінің рөлі». Мол. Ұяшық. Биол. 22 (3): 835–48. дои:10.1128 / mcb.22.3.835-848.2002. PMC 133546. PMID 11784859.
^ ^а ^б ^c ^г. Sif S, Saurin AJ, Imbalzano AN, Kingston RE (наурыз 2001). «Құрамында mSin3A бар Brg1 және hBrm хроматинді қайта құру кешендерін тазарту және сипаттамасы». Genes Dev. 15 (5): 603–18. дои:10.1101 / gad.872801. PMC 312641. PMID 11238380.
^ ^а ^б ^c Ванг В, Котэ Дж, Сюэ Ю, Чжоу С, Хавари П.А., Биггар СР, Мучардт С, Калпана Г.В., Гофф СП, Янив М, Workman JL, Crabtree GR (қазан 1996). «Сүтқоректілердің SWI-SNF кешенін тазарту және биохимиялық гетерогендігі». EMBO J. 15 (19): 5370–82. дои:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00921.x. PMC 452280. PMID 8895581.
^ Otsuki T, Furukawa Y, Ikeda K, Endo H, Yamashita T, Shinohara A, Iwamatsu A, Ozawa K, Liu JM (қараша 2001). «Fanconi анемия ақуызы, FANCA, адамның SWI / SNF кешенінің компоненті BRG1-мен байланысады». Хум. Мол. Генет. 10 (23): 2651–60. дои:10.1093 / hmg / 10.23.2651. PMID 11726552.
^ Чжао К, Ванг В, Рандо ОЖ, Сюэ Ю, Свидерек К, Куо А, Crabtree GR (қараша 1998). «SWI / SNF тәрізді BAF кешенінің T және лимфоциттер рецепторларының сигналынан кейін хроматинмен жылдам және фосфоинозитолға тәуелділігі». Ұяшық. 95 (5): 625–36. дои:10.1016 / s0092-8674 (00) 81633-5. PMID 9845365. S2CID 3184211.

Әрі қарай оқу

Боналдо М.Ф., Леннон Г, Соареш М.Б (1997). «Нормалдау және азайту: гендердің ашылуын жеңілдетудің екі тәсілі». Genome Res. 6 (9): 791–806. дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID 8889548.
Ванг В, Котэ Дж, Сюэ Ю, Чжоу С, Хавари П.А., Биггар СР, Мучардт С, Калпана Г.В., Гофф СП, Янив М, Workman JL, Crabtree GR (1996). «Сүтқоректілердің SWI-SNF кешенін тазарту және биохимиялық гетерогендігі». EMBO J. 15 (19): 5370–82. дои:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00921.x. PMC 452280. PMID 8895581.
Fryer CJ, Archer TK (1998). «Глюкокортикоидты рецептормен хроматинді қайта құруға BRG1 кешені қажет». Табиғат. 393 (6680): 88–91. дои:10.1038/30032. PMID 9590696. S2CID 2208522.
Ring HZ, Vameghi-Meyers V, Wang W, Crabtree GR, Francke U (1998). «Адам геномында SWI / SNF-пен байланысты, матрицамен байланысты, хроматин (SMARC) гендерінің актинге тәуелді реттеушісі бес дисперсті». Геномика. 51 (1): 140–3. дои:10.1006 / geno.1998.5343. PMID 9693044.
Cho H, Orphanides G, Sun X, Yang XJ, Ogryzko V, Lees E, Nakatani Y, Reinberg D (1998). «Хроматин құрылымын өзгертетін факторлардан тұратын адамның РНК-полимераза II кешені». Мол. Ұяшық. Биол. 18 (9): 5355–63. дои:10.1128 / MCB.18.9.5355. PMC 109120. PMID 9710619.
Sif S, Stukenberg PT, Kirschner MW, Kingston RE (1998). «Адамның SWI / SNF хроматинді қайта құру кешенінің митоздық инактивациясы». Genes Dev. 12 (18): 2842–51. дои:10.1101 / gad.12.18.2842. PMC 317164. PMID 9744861.
Шанахан Ф, Сегеззи В, Парри Д, Махони Д, Лис Е (1999). «Cyclin E BAF155 және BRG1, сүтқоректілердің SWI-SNF кешенінің құрамдас бөліктерімен байланысады және BRG1 өсімді қамауға алу қабілетін өзгертеді». Мол. Ұяшық. Биол. 19 (2): 1460–9. дои:10.1128 / mcb.19.2.1460. PMC 116074. PMID 9891079.
Phelan ML, Sif S, Narlikar GJ, Kingston RE (1999). «SWI / SNF суббірліктерінен хроматинді қайта құрудың негізгі кешенін қалпына келтіру». Мол. Ұяшық. 3 (2): 247–53. дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80315-9. PMID 10078207.
Kowenz-Leutz E, Leutz A (2000). «C / EBP бета изоформасы миелоидты гендерді белсендіру үшін SWI / SNF кешенін алады». Мол. Ұяшық. 4 (5): 735–43. дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80384-6. PMID 10619021.
Bochar DA, Wang L, Beniya H, Kinev A, Xue Y, Lane WS, Wang W, Kashanchi F, Shiekhattar R (2000). «BRCA1 адамның SWI / SNF-ке қатысты кешенімен байланысты: хроматинді қайта құруды сүт безі қатерлі ісігіне байланыстыру». Ұяшық. 102 (2): 257–65. дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 00030-1. PMID 10943845. S2CID 6500100.
Кадам S, McAlpine GS, Phelan ML, Kingston RE, Jones KA, Emerson BM (2000). «Рекомбинантты сүтқоректілердің SWI / SNF суббірліктерінің функционалды селективтілігі». Genes Dev. 14 (19): 2441–51. дои:10.1101 / gad.828000. PMC 316972. PMID 11018012.
Xue Y, Canman JC, Lee CS, Nie Z, Yang D, Moreno GT, Young MK, Salmon ED, Wang W (2001). «Адамның SWI / SNF-B хроматинді қайта құру кешені Rsc ашытқысына байланысты және митоздық хромосомалардың кинетохорларында орналасады». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 97 (24): 13015–20. дои:10.1073 / pnas.240208597. PMC 27170. PMID 11078522.
Sif S, Saurin AJ, Imbalzano AN, Kingston RE (2001). «Құрамында mSin3A бар Brg1 және hBrm хроматинді қайта құру кешендерін тазарту және сипаттамасы». Genes Dev. 15 (5): 603–18. дои:10.1101 / gad.872801. PMC 312641. PMID 11238380.
Otsuki T, Furukawa Y, Ikeda K, Endo H, Yamashita T, Shinohara A, Iwamatsu A, Ozawa K, Liu JM (2002). «Fanconi анемия ақуызы, FANCA, адамның SWI / SNF кешенінің компоненті BRG1-мен байланысады». Хум. Мол. Генет. 10 (23): 2651–60. дои:10.1093 / hmg / 10.23.2651. PMID 11726552.
Като Х, Тьернберг А, Чжан В, Крутчинский А.Н., Ан В, Такэути Т, Охцуки Ю, Сугано С, де Брюйн Д.Р., Чаит Б.Т., Роедер РГ (2002). «SYT адамның SNF / SWI кешендерімен байланысады және оның синхрондық серіктесі SSX1-нің C-терминалы аймағын гистонға бағыттайды». Дж.Биол. Хим. 277 (7): 5498–505. дои:10.1074 / jbc.M108702200. PMID 11734557.
Nie Z, Yan Z, Chen EH, Sechi S, Ling C, Zhou S, Xue Y, Yang D, Murray D, Kanakubo E, Cleary ML, Wang W (2003). «SWI / SNF хроматинді қайта құрудың жаңа кешендерінің құрамында лейкемия хромосомалық транслокацияның аралас тектес серіктесі бар». Мол. Ұяшық. Биол. 23 (8): 2942–52. дои:10.1128 / MCB.23.8.2942-2952.2003. PMC 152562. PMID 12665591.
Китагава Х, Фуджики Р, Йошимура К, Мезаки Ю, Уэмацу Ю, Мацуи Д, Огава С, Унно К, Окубо М, Токита А, Накагава Т, Ито Т, Ишими Ю, Нагасава Х, Мацумото Т, Янагисава Дж, Като С. (2003). «WINAC хроматинді қайта құру кешені ядролық рецепторды промоторларға бағыттайды және Уильямс синдромында нашарлайды». Ұяшық. 113 (7): 905–17. дои:10.1016 / S0092-8674 (03) 00436-7. PMID 12837248.
Hsiao PW, Fryer CJ, Trotter KW, Wang W, Archer TK (2003). «BAF60a ядролық рецепторлар мен транзактивацияға арналған BRG1 хроматинді қайта құру кешені арасындағы сыни өзара әрекеттесуге көмектеседі». Мол. Ұяшық. Биол. 23 (17): 6210–20. дои:10.1128 / MCB.23.17.6210-6220.2003 ж. PMC 180928. PMID 12917342.

Сыртқы сілтемелер

FactorBook BAF155

Бұл мақала а ген қосулы адамның хромосомасы 3 Бұл бұта. Сіз Уикипедияға көмектесе аласыз оны кеңейту.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000173473 - Ансамбль, Мамыр 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000032481 - Ансамбль, Мамыр 2017

[3] «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[4] «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[pmid8804307-5] Ван В, Сюэ Ю, Чжоу С, Куо А, Кэрнс BR, Crabtree GR (қараша 1996). «Сүтқоректілердің SWI / SNF кешендерінің әртүрлілігі және мамандануы». Genes Dev. 10 (17): 2117–30. дои:10.1101 / gad.10.17.2117. PMID 8804307.

[entrez-6] а ^б «Entrez Gene: SMARCC1 SWI / SNF байланысты, матрицаға байланысты, хроматиннің актинге тәуелді реттегіші, с отбасы, 1 мүшесі».

[pmid12837248-7] Китагава Х, Фуджики Р, Йошимура К, Мезаки Ю, Уэмацу Ю, Мацуи Д, Огава С, Унно К, Окубо М, Токита А, Накагава Т, Ито Т, Ишими Ю, Нагасава Х, Мацумото Т, Янагисава Дж, Като С. (Маусым 2003). «WINAC хроматинді қайта құру кешені ядролық рецепторды промоторларға бағыттайды және Уильямс синдромында нашарлайды». Ұяшық. 113 (7): 905–17. дои:10.1016 / s0092-8674 (03) 00436-7. PMID 12837248.

[pmid11784859-8] а ^б Кузьмичев А, Чжан Ю, Эрджумент-Бромаж Н, Темпст П, Рейнберг Д (ақпан 2002). «P33 (ING1) ісік супрессоры үміткердің өсуін реттеудегі Sin3-гистон деацетилаза кешенінің рөлі». Мол. Ұяшық. Биол. 22 (3): 835–48. дои:10.1128 / mcb.22.3.835-848.2002. PMC 133546. PMID 11784859.

[pmid11238380-9] а ^б ^c ^г. Sif S, Saurin AJ, Imbalzano AN, Kingston RE (наурыз 2001). «Құрамында mSin3A бар Brg1 және hBrm хроматинді қайта құру кешендерін тазарту және сипаттамасы». Genes Dev. 15 (5): 603–18. дои:10.1101 / gad.872801. PMC 312641. PMID 11238380.

[pmid8895581-10] а ^б ^c Ванг В, Котэ Дж, Сюэ Ю, Чжоу С, Хавари П.А., Биггар СР, Мучардт С, Калпана Г.В., Гофф СП, Янив М, Workman JL, Crabtree GR (қазан 1996). «Сүтқоректілердің SWI-SNF кешенін тазарту және биохимиялық гетерогендігі». EMBO J. 15 (19): 5370–82. дои:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00921.x. PMC 452280. PMID 8895581.

[pmid11726552-11] Otsuki T, Furukawa Y, Ikeda K, Endo H, Yamashita T, Shinohara A, Iwamatsu A, Ozawa K, Liu JM (қараша 2001). «Fanconi анемия ақуызы, FANCA, адамның SWI / SNF кешенінің компоненті BRG1-мен байланысады». Хум. Мол. Генет. 10 (23): 2651–60. дои:10.1093 / hmg / 10.23.2651. PMID 11726552.

[pmid9845365-12] Чжао К, Ванг В, Рандо ОЖ, Сюэ Ю, Свидерек К, Куо А, Crabtree GR (қараша 1998). «SWI / SNF тәрізді BAF кешенінің T және лимфоциттер рецепторларының сигналынан кейін хроматинмен жылдам және фосфоинозитолға тәуелділігі». Ұяшық. 95 (5): 625–36. дои:10.1016 / s0092-8674 (00) 81633-5. PMID 9845365. S2CID 3184211.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]