Рестрикциялық ферменттерді кесу учаскелерінің тізімі: Bsp – Bss - List of restriction enzyme cutting sites: Bsp–Bss - Wikipedia

Негізгі мақалалар: Рестрикциялық ферменттерді кесу алаңдарының тізімі және Рестрикциялық фермент
Аңыз нуклеобазалар
КодНуклеотид ұсынылған
AАденин (A)
CЦитозин (C)
GГуанин (G)
ТТимин (T)
NA, C, G немесе T
МA немесе C
RA немесе G
WA немесе T
YC немесе T
SC немесе G
ҚG немесе T
HA, C немесе T
BC, G немесе T
VA, C немесе G
Д.A, G немесе T


Бұл мақалада атаулары Bsp-ден Bss-ге дейін басталатын ең көп зерттелген шектеу ферменттерінің тізімі бар. Онда шамамен 180 ферменттер бар.

Келесі ақпарат беріледі:

  • Фермент: Қабылданған атауы молекула, халықаралық деңгейде қабылданды номенклатура[1][2], және библиографиялық сілтемелер. (Қосымша оқу: «бөлімін қараңыз»Номенклатура «мақалада»Рестрикциялық фермент ".)
  • PDB коды: Ақуыздың құрылымын анықтау үшін қолданылатын код PDB ақуыз құрылымдарының мәліметтер базасы. Ақуыздың 3D атомдық құрылымы оның әсер ету механизмінің жақын бөлшектерін түсіну үшін өте құнды ақпарат береді[3][4].
  • Дереккөз: Ферментті табиғи түрде өндіретін организм.
  • Тану реттілігі: Ферментпен танылған және ол арнайы байланысатын ДНҚ тізбегі.
  • Кесу: Кесу орны және кесілген жердің ДНҚ өнімдері. The тану реттілігі және кесу орны әдетте сәйкес келеді, бірақ кейде кесу орны тану орнынан ондаған нуклеотидтерде болуы мүмкін[5][6].
  • Изосизизомерлер және неосхизомерлер: Ан изошизомер болып табылады фермент дәл сол сияқты кезектеседі. A неошизомер - бұл басқа тізбекті білетін, бірақ басқаша кесетін изосизомердің ерекше түрі. Әрбір фермент үшін ең көп таралған 8-10 изохизомердің ең көп саны көрсетілген, бірақ одан да көп болуы мүмкін. Неошизомерлер қою және жасыл түсті қаріппен көрсетілген (мысалы: BamHI). Қашан «Ешқандай қосылмаған күн«көрсетілген күні, бұл анықталған кесу орны бар мәліметтер базасында тіркелген изосизомер жоқ дегенді білдіреді. Ақ шрифтпен және сұр фонмен көрсетілген изосизомерлер ағымдағы тізімдерде жоқ ферменттерге сәйкес келеді:
тізімде жоқ ферменттегідей: EcoR70I 


Толық тізімді шарлау

Шектеу ферменттері

Bsp

ФерментPDB кодыДереккөзТану реттілігіКесуИзосизомерлер
Bsp6IBacillus sp. RFL6 5 'GCNGC
3 'CGNCG 		5 '--- МК   NGC --- 3 '
3 '--- CGN   CG --- 5 '
Bsp13IBacillus sp. 13 5 'TCCGGA
3 'AGGCCT 		5 '--- Т   CCGGA --- 3 '
3 '--- AGGCC   T --- 5 ' 		AccIII, BbvAIII, BlfI, BsiMI, BspMII, Bsu23I, Kpn2I, PinBII
Bsp19IBacillus sp. 19 5 'CCATGG
3 'GGTACC 		5 '--- С   CATGG --- 3 '
3 '--- GGTAC   C --- 5 '
Bsp24IBacillus sp. 24 5 'GACN6TGG
3 'CTGN6ACC 		5 '--- GACN6TGGN6NNNNNN   --- 3'
3 '--- CTGN6ACCN6N   NNNNN --- 5 '
Bsp50IBacillus sp. RFL50 5 'CGCG
3 'GCGC 		5 '--- CG   CG --- 3 '
3 '--- МК   GC --- 5 ' 		BceBI, Bsh1236I, BstFNI, BstUI, Bsu1532I, FalII, FnuDII, MvnI, ThaI
Bsp63IBacillus sphaericus 63 5 'CTGCAG
3 'GACGTC 		5 '--- CTGCA   G --- 3 '
3 '--- Г.   ACGTC --- 5 ' 		AjoI, Asp713I, BloHII, MhaAI, Pfl21I, PstI, SalPI, SflI, Sst12I, YenI
Bsp67IBacillus sphaericus 67 5 'GATC
3 'CTAG 		5' ---   GATC --- 3 '
3 '--- CTAG   --- 5' 		AspMDI, Bsp143I, BspJI, BtKII, DpnII, LlaAI, NlaII, SsiBI
Bsp68IBacillus sp. RFL68 5 'TCGCGA
3 'AGCGCT 		5 '--- TCG   CGA --- 3 '
3 '--- AGC   GCT --- 5 ' 		NruI
Bsp98IBacillus sp. RFL98 5 'GGATCC
3 'CCTAGG 		5 '--- Г.   GATCC --- 3 '
3 '--- CCTAG   G --- 5 ' 		AccEBI, AliI, BamHI, BnaI, BstI, CelI, OkrAI, NspSAIV, Pfl8I, SurI
Bsp105IBacillus sphaericus 105 5 'GATC
3 'CTAG 		5' ---   GATC --- 3 '
3 '--- CTAG   --- 5' 		Bfi57I, Bsp143I, BspJI, BtKII, DpnII, LlaAI, NlaII, SsiBI
Bsp106IBacillus sphaericus 106 5 'ATCGAT
3 'TAGCTA 		5 '--- AT   CGAT --- 3 '
3 '--- TAGC   TA --- 5 ' 		BbvAII, Bci29I, BciBI, BcmI, BspOVII, BstNZ169I, Rme21I
Bsp119IBacillus sp. RFL119 5 'TTCGAA
3 'AAGCTT 		5 '--- ТТ   CGAA --- 3 '
3 '--- AAGC   TT --- 5 ' 		AcpI, Bim19I, Bpu14I, BspT104I, Csp45I, FspII, NspV, SspRFI
Bsp120IBacillus sp. RFL120 5 'GGGCCC
3 'CCCGGG 		5 '--- Г.   GGCCC --- 3 '
3 '--- CCCGG   G --- 5 ' 		Апа, PpeI, PspOMI
Bsp123IBacillus sp. 123 5 'CGCG
3 'GCGC 		5 '--- CG   CG --- 3 '
3 '--- МК   GC --- 5 ' 		BceBI, Bsh1236I, BstFNI, BstUI, BtkI, Csp68KVI, FnuDII, MvnI, ThaI
Bsp143IBacillus sp. RFL143 5 'GATC
3 'CTAG 		5' ---   GATC --- 3 '
3 '--- CTAG   --- 5' 		Bce243I, Bsp105I, BspFI, БстКТИ, CpfI, HacI, NdeII, Sth368I, Sau3AI
Bsp143IIBacillus sp. RFL143 5 'RGCGCY
3 'YCGCGR 		5 '--- RGCGC   Y --- 3 '
3 '--- Y   CGCGR --- 5 '
AccB2I, BfoI, Bme142I, BstH2I,
ХэІ, LpnI
Bsp211IBacillus sphaericus 211 5 'GGCC
3 'CCGG 		5 '--- GG   CC --- 3 '
3 '--- CC   GG --- 5 '
Bsp423IBacillus sp. 423 5 'GCAGC
3 'CGTCG 		5 '--- GCAGCN7N   NNNN --- 3 '
3 '--- CGTCGN7NNNNN   --- 5' 		AlwXI, BbvI, BseKI, BseXI, Bst12I, Bst71I, BstV1I
Bsp519IBacillus sp. 519 5 'GRGCYC
3 'CYCGRG 		5 '--- GRGCY   C --- 3 '
3 '--- С   YCGRG --- 5 '
Bsp1286IBacillus sphaericus 5 'GDGCHC
3 'CHCGDG 		5 '--- GDGCH   C --- 3 '
3 '--- С   HCGDG --- 5 ' 		AocII, BmyI, BsoCI, Bsp1286I, BspLS2I, NspII, SduI
Bsp1407IBacillus stearothermophilus RFL1407 5 'TGTACA
3 'ACATGT 		5 '--- Т   GTACA --- 3 '
3 '--- ACATG   T --- 5 '
AauI, BsmRI, BsrGI, BstAUI,
Ssp4800I, SspBI
Bsp1720IBacillus sp. 1720 5 'GCTNAGC
3 'CGANTCG 		5 '--- МК   TNAGC --- 3 '
3 '--- CGANT   CG --- 5 '
Bsp1894IBacillus sphaericus 1894 5 'GGNCC
3 'CCNGG 		5 '--- Г.   GNCC --- 3 '
3 '--- CCNG   G --- 5 ' 		AspS9I, Bac36I, BavBII, BshKI, BspBII, CcuI, MaeK81II, Pde12I
Bsp2095IBacillus sphaericus 2095 5 'GATC
3 'CTAG 		5' ---   GATC --- 3 '
3 '--- CTAG   --- 5' 		Bfi57I, Bsp143I, BspKT6I, BtkII, DpnII, LlaAI, NlaII, SsiBI
Bsp4009IBacillus sp. 4009 5 'GGATCC
3 'CCTAGG 		5 '--- Г.   GATCC --- 3 '
3 '--- CCTAG   G --- 5 ' 		AccEBI, AliI, ApaCI, BamHI, BstI, CelI, OkrAI, Pfl8I, RspLKII, SurI
BspAIBacillus sphaericus JL4B 5 'GATC
3 'CTAG 		5' ---   GATC --- 3 '
3 '--- CTAG   --- 5' 		Bfi57I, Bsp2095I, BspKT6I, BtkII, DpnII, LlaAI, NlaII, SsiBI
BspA2IBacillus sp. A2 5 'CCTAGG
3 'GGATCC 		5 '--- С   CTAGG --- 3 '
3 '--- GGATC   C --- 5 ' 		AspA2I, AvrII, AvrBII, BlnI, XmaJI
Bsp153AIBacillus sp. 153А 5 'CAGCTG
3 'GTCGAC 		5 '--- CAG   CTG --- 3 '
3 '--- GTC   GAC --- 5 '
BspAAIBacillus sp. АА 5 'CTCGAG
3 'GAGCTC 		5 '--- С   TCGAG --- 3 '
3 '--- GAGCT   C --- 5 ' 		AbrI, BluI, BstVI, PanI, SauLPII, Ғылыми жұмыс, SlaI, StrI, TliI
BspAAIIBacillus sp. АА 5 'TCTAGA
3 'AGATCT 		5 '--- Т   CTAGA --- 3 '
3 '--- AGATC   T --- 5 '
BspAAIIIBacillus sp. АА 5 'GGATCC
3 'CCTAGG 		5 '--- Г.   GATCC --- 3 '
3 '--- CCTAG   G --- 5 ' 		AccEBI, AliI, ApaCI, AsiI, BamHI, Bce751I, Pfl8I, RspLKII, SolI
BspANIBacillus sp. AN 5 'GGCC
3 'CCGG 		5 '--- GG   CC --- 3 '
3 '--- CC   GG --- 5 '
BspBIBacillus sphaericus JL14 5 'CTGCAG
3 'GACGTC 		5 '--- CTGCA   G --- 3 '
3 '--- Г.   ACGTC --- 5 ' 		AjoI, ApiI, Asp713I, BloHII, CfrA4I, Pfl21I, PstI, SalPI, Sst12I, YenI
BspBIIBacillus sphaericus JL14 5 'GGNCC
3 'CCNGG 		5 '--- Г.   GNCC --- 3 '
3 '--- CCNG   G --- 5 ' 		AsuI, Bac36I, BavBII, BshKI, BspF4I, CcuI, MaeK81II, PspPI
BspBRIBacillus sp. 5 'GGCC
3 'CCGG 		5 '--- GG   CC --- 3 '
3 '--- CC   GG --- 5 '
BspBS31IBacillus sp. BS31 5 'GAAGAC
3 'CTTCTG 		5 '--- GAAGACNN   NNNN --- 3 '
3 '--- CTTCTGNNNNNN   --- 5'
BspCIBacillus sp. C1 5 'CGATCG
3 'GCTAGC 		5 '--- CGAT   CG --- 3 '
3 '--- МК   TAGC --- 5 ' 		Afa16RI, Afa22MI, EagBI, ErhB9I, NblI, Psu161I, RshI, XorII
BspCNIBacillus sp. 1310 5 'CTCAG
3 'GAGTC 		5 '--- CTCAGN6NNN   --- 3'
3 '--- GAGTCN6N   NN --- 5 '
BspDIBacillus sp. 5 'ATCGAT
3 'TAGCTA 		5 '--- AT   CGAT --- 3 '
3 '--- TAGC   TA --- 5 ' 		AagI, BanIII, BavCI, Bsa29I, BseCI, Bsu15I, BsuTUI, ClaI, ZhoI
BspD6I [7][8]2P14Bacillus sp. D6 5 'GACTC
3 'CTGAG 		5 '--- GACTCNNNN   NN --- 3 '
3 '--- CTGAGNNNNNN   --- 5'
BspEIBacillus sp. 5 'TCCGGA
3 'AGGCCT 		5 '--- Т   CCGGA --- 3 '
3 '--- AGGCC   T --- 5 ' 		AccIII, BlfI, BsiMI, Bsp13I, BspMII, CauB3I, MroI, PinBII
BspFIBacillus sp. 5 'GATC
3 'CTAG 		5' ---   GATC --- 3 '
3 '--- CTAG   --- 5' 		Bfi57I, Bsp2095I, BspKT6I, BtkII, DpnII, LlaAI, NlaII, SsiBI
BspF4IBacillus sp. F4 5 'GGNCC
3 'CCNGG 		5 '--- Г.   GNCC --- 3 '
3 '--- CCNG   G --- 5 ' 		AsuI, Bac36I, BavBII, BsiZI, BspBII, CcuI, MaeK81II, PspPI
BspHIBacillus sp. H3 5 'TCATGA
3 'БАЙЛАНЫС 		5 '--- Т   CATGA --- 3 '
3 '--- AGTAC   T --- 5 '
BspIS4IBacillus sp. IS4 5 'GAAGAC
3 'CTTCTG 		5 '--- GAAGACNN   NNNN --- 3 '
3 '--- CTTCTGNNNNNN   --- 5'
BspJIBacillus sp. 5 'GATC
3 'CTAG 		5' ---   GATC --- 3 '
3 '--- CTAG   --- 5' 		BfuCI, Bsp2095I, BspKT6I, BtkII, DpnII, LlaAI, NmeCI, SsiAI
BspJIIBacillus sp. 5 'ATCGAT
3 'TAGCTA 		5 '--- AT   CGAT --- 3 '
3 '--- TAGC   TA --- 5 ' 		Bsa29I, BseCI, Bsp106I, BspDI, BspOVII, BspXI, BspZEI
BspKIBacillus sp. Қ 5 'GGCC
3 'CCGG 		5 '--- GG   CC --- 3 '
3 '--- CC   GG --- 5 '
BspKT5IBacillus sp. 5 'CTGAAG
3 'GACTTC 		5 '--- CTGAAGN12NNNN   --- 3'
3 '--- GACTTCN12NN   NN --- 5 '
BspKT6IBacillus sp. KT6 5 'GATC
3 'CTAG 		5 '--- GAT   C --- 3 '
3 '--- С   TAG --- 5 ' 		BfuCI, Bsp2095I, Bst19II, БстКТИ, DpnII, LlaAI, NmeCI, SsiAI
BspKT8IBacillus sp. KT8 5 'AAGCTT
3 'TTCGAA 		5 '--- A   AGCTT --- 3 '
3 '--- TTCGA   A --- 5 '
BspLIBacillus sp. RJ3-212 5 'GGNNCC
3 'CCNNGG 		5 '--- GGN   NCC --- 3 '
3 '--- CCN   NGG --- 5 '
AspNI, BscBI, BmiI, NlaIV,
PspN4I
BspLAIBacillus sp. LA 5 'GCGC
3 'CGCG 		5 '--- GCG   C --- 3 '
3 '--- С   GCG --- 5 ' 		AspLEI, BstHHI, CfoI, FnuDIII, HhaI, Hin6I, HinP1I, HsoI, HspAI, SciNI
BspLAIIBacillus sp. LA 5 'TTCGAA
3 'AAGCTT 		5 '--- ТТ   CGAA --- 3 '
3 '--- AAGC   TT --- 5 '
BspLAIIIBacillus sp. LA 5 'AAGCTT
3 'TTCGAA 		5 '--- A   AGCTT --- 3 '
3 '--- TTCGA   A --- 5 '
BspLS2IBacillus sp. LS2 5 'GDGCHC
3 'CHCGDG 		5 '--- GDGCH   C --- 3 '
3 '--- С   HCGDG --- 5 ' 		AocII, BmyI, BsoCI, BspLS2I, MhlI, NspII, SduI
BspLU4IBacillus sp. LU4 5 'CYCGRG
3 'GRGCYC 		5 '--- С   YCGRG --- 3 '
3 '--- GRGCY   C --- 5 ' 		Ama87I, AvaI, Bse15I, BsoBI, BstSI, NspIII, NspSAI, OfoI
BspLU11IBacillus sp. LU11 5 'ACATGT
3 'TGTACA 		5 '--- A   CATGT --- 3 '
3 '--- TGTAC   A --- 5 '
BspLU11IIIBacillus sp. LU11 5 'GGGAC
3 'CCCTG 		5 '--- GGGACN8NN   NNNN --- 3 '
3 '--- CCCTGN8NNNNNN   --- 5'
BspMIBacillus sp. М 5 'ACCTGC
3 'TGGACG 		5 '--- ACCTGCNNNN   NNNN --- 3 '
3 '--- TGGACGNNNNNNNN   --- 5' 		Acc36I, BfuAI, BveI
BspMIIBacillus sp. М 5 'TCCGGA
3 'AGGCCT 		5 '--- Т   CCGGA --- 3 '
3 '--- AGGCC   T --- 5 ' 		AccIII, BbvAIII, BlfI, BsiMI, BspEI, Bsu23I, CauB3I, MroI
BspM39IBacillus sp. M39 5 'CAGCTG
3 'GTCGAC 		5 '--- CAG   CTG --- 3 '
3 '--- GTC   GAC --- 5 '
BspM90IBacillus sp. M90 5 'GTATAC
3 'CATATG 		5 '--- GTA   TAC --- 3 '
3 '--- CAT   ATG --- 5 '
BspMAIBacillus stearothermophilus MA 5 'CTGCAG
3 'GACGTC 		5 '--- CTGCA   G --- 3 '
3 '--- Г.   ACGTC --- 5 ' 		AjoI, Asp713I, BloHII, PaePI, Psp23I, PstI, SalPI, Sst12I, YenI
BspMKIBacillus sp. MKI 5 'GTCGAC
3 'CAGCTG 		5 '--- Г.   TCGAC --- 3 '
3 '--- CAGCT   G --- 5 '
BspNIBacillus sp. N 5 'CCWGG
3 'GGWCC 		5 '--- CC   WGG --- 3 '
3 '--- GGW   CC --- 5 ' 		AglI, BseBI, Bse17I, Bst2I, CbrI, CthII, EcoRII, MvaI, SspAI, TaqXI
BspO4IBacillus sp. O-4 5 'CAGCTG
3 'GTCGAC 		5 '--- CAG   CTG --- 3 '
3 '--- GTC   GAC --- 5 '
BspOVIBacillus sp. OV 5 'GACN5GTC
3 'CTGN5CAG 		5 '--- GACNNN   NNGTC --- 3 '
3 '--- CTGNN   NNNCAG --- 5 '
AhdI, AspEI, BmeRI, DriI,
Eam1105I, EclHKI, NruGI
BspOVIIBacillus sp. OV 5 'ATCGAT
3 'TAGCTA 		5 '--- AT   CGAT --- 3 '
3 '--- TAGC   TA --- 5 ' 		BanIII, BavCI, BciBI, BcmI, Bli86I, BliRI, BspJII, BstNZ169I, SpmI
BspPIBacillus sp. г 1-34 5 'GGATC
3 'CCTAG 		5 '--- GGATCNNNN   N --- 3 '
3 '--- CCTAGNNNNN   --- 5'
AclWI, AlwI, BinI, BsrWI, 
BstH9I, Bst31TI, Bth617I, EacI
BspRIBacillus sphaericus R 5 'GGCC
3 'CCGG 		5 '--- GG   CC --- 3 '
3 '--- CC   GG --- 5 '
BspR7IBacillus sp. R7 5 'CCTNAGG
3 'GGANTCC 		5 '--- CC   TNAGG --- 3 '
3 '--- GGANT   CC --- 5 ' 		AocI, AxyI, Bse21I, Bsu36I, Eco81I, MstII, SauI, SshAI
BspST5IBacillus sp. ST5 5 'GCATC
3 'CGTAG 		5 '--- GCATCN4N   NNNN --- 3 '
3 '--- CGTAGN4NNNNN   --- 5'
BspTIBacillus sp. RFL1265 5 'CTTAAG
3 'GAATTC 		5 '--- С   TTAAG --- 3 '
3 '--- GAATT   C --- 5 ' 		AflII
BspT104IBacillus sp. T104 5 'TTCGAA
3 'AAGCTT 		5 '--- ТТ   CGAA --- 3 '
3 '--- AAGC   TT --- 5 ' 		AcpI, Bim19I, Bpu14I, BstBI, Csp45I, LspI, NspV, SspRFI
BspT107IBacillus sp. T107 5 'GGYRCC
3 'CCRYGG 		5 '--- Г.   GYRCC --- 3 '
3 '--- CCRYG   G --- 5 ' 		AccB1I, BanI, BbvBI, Eco64I, HgiCI, HgiHI, MspB4I, PfaAI
BspTNIBacillus sp. TN 5 'GGTCTC
3 'CCAGAG 		5 '--- GGTCTCN   NNNN --- 3 '
3 '--- CCAGAGNNNNN   --- 5'
BspTS514IBacillus sp. TS514 5 'GAAGAC
3 'CTTCTG 		5 '--- GAAGACNN   NNNN --- 3 '
3 '--- CTTCTGNNNNNN   --- 5'
BspWIBacillus sp. 3456 5 'GCN7GC
3 'CGN7CG 		5 '--- GCNNNNN   NNGC --- 3 '
3 '--- CGNN   NNNNNCG --- 5 '
BspXIBacillus sphaericus X 5 'ATCGAT
3 'TAGCTA 		5 '--- AT   CGAT --- 3 '
3 '--- TAGC   TA --- 5 ' 		BliAI, BliRI, BscI, Bst28I, Bsu15I, LcaI, PgaI, Ssp27144I, ZhoI
BspXIIBacillus sphaericus X 5 'TGATCA
3 'ACTAGT 		5 '--- Т   GATCA --- 3 '
3 '--- ACTAG   T --- 5 '
Аба, BclI, BsiQI,
BstT7I, FbaI, Ksp22I, ParI 
BspZEIBacillus sp. ZE 5 'ATCGAT
3 'TAGCTA 		5 '--- AT   CGAT --- 3 '
3 '--- TAGC   TA --- 5 ' 		Bsa29I, BseCI, BspDI, BspXI, Bst28I, BstNZ169I, BsuTUI, LplI
Бұл тізім толық емес; Сіз көмектесе аласыз жетіспейтін заттарды қосу бірге сенімді көздер.

Bsr - Bss

ФерментPDB кодыДереккөзТану реттілігіКесуИзосизомерлер
БсрИBacillus stearothermophilus 5 'ACTGG
3 'TGACC 		5 '--- ACTGGN   --- 3'
3 '--- TGAC   CN --- 5 '
БсрАИBacillus stearothermophilus CPW7 5 'GGWCC
3 'CCWGG 		5 '--- Г.   GWCC --- 3 '
3 '--- CCWG   G --- 5 ' 		BamNxI, BcuAI, Csp68KI, Eco47I, FssI, HgiCII, HgiJI, SinI
BsrBIBacillus stearothermophilus CPW193 5 'CCGCTC
3 'GGCGAG 		5 '--- CCG   CTC --- 3 '
3 '--- GGC   GAG --- 5 ' 		AccBSI, BstD102I, Bst31NI, MbiI
BsrBRIBacillus stearothermophilus BR 5 'GATN4ATC
3 'CTAN4TAG 		5 '--- ГАТНН   NNATC --- 3 '
3 '--- CTANN   NNTAG --- 5 '
BsrDIBacillus stearothermophilus D70 5 'GCAATG
3 'CGTTAC 		5 '--- GCAATGNN   --- 3'
3 '--- CGTTAC   NN --- 5 '
BsrFIBacillus stearothermophilus CPW16 5 'RCCGGY
3 'YGGCCR 		5 '--- R   CCGGY --- 3 '
3 '--- YGGCC   R --- 5 '
БсрГИBacillus stearothermophilus GR75 5 'TGTACA
3 'ACATGT 		5 '--- Т   GTACA --- 3 '
3 '--- ACATG   T --- 5 '
AauI, BsmRI, Bsp1407I, BstAUI,
Ssp4800I, SspBI
BsrSIBacillus stearothermophilus CPW19 5 'ACTGG
3 'TGACC 		5 '--- ACTGGN   --- 3'
3 '--- TGAC   CN --- 5 '
BssAIBacillus sp. 5 'RCCGGY
3 'YGGCCR 		5 '--- R   CCGGY --- 3 '
3 '--- YGGCC   R --- 5 '
BssECIBacillus stearothermophilus EC 5 'CCNNGG
3 'GGNNCC 		5 '--- С   CNNGG --- 3 '
3 '--- GGNNC   C --- 5 '
BssHIBacillus stearothermophilus H3 5 'CTCGAG
3 'GAGCTC 		5 '--- С   TCGAG --- 3 '
3 '--- GAGCT   C --- 5 ' 		AbrI, BluI, BstVI, PanI, SauLPII, Ғылыми жұмыс, SlaI, StrI, TliI
BssHIIBacillus stearothermophilus H3 5 'GCGCGC
3 'CGCGCG 		5 '--- Г.   CGCGC --- 3 '
3 '--- CGCGC   G --- 5 '
BssIMIBacillus stearothermophilus IM 5 'GGGTC
3 'CCCAG 		5 '--- GG   GTC --- 3 '
3 '--- CCCAG   --- 5'
BssKIBacillus stearothermophilus TBI 5 'CCNGG
3 'GGNCC 		5' ---   CCNGG --- 3 '
3 '--- GGNCC   --- 5'
BssNAIBacillus stearothermophilus NA 5 'GTATAC
3 'CATATG 		5 '--- GTA   TAC --- 3 '
3 '--- CAT   ATG --- 5 '
BssNIBacillus sphaericus КТН 5 'GRCGYC
3 'CYGCRG 		5 '--- GR   CGYC --- 3 '
3 '--- CYGC   RG --- 5 ' 		AcyI, AhaII, AosII, AstWI, AsuIII, BsaHI, HgiI, Hsp92I, Msp17I
BssSIBacillus stearothermophilus S719 5 'CACGAG
3 'GTGCTC 		5 '--- С   ACGAG --- 3 '
3 '--- GTGCT   C --- 5 '
BssT1IBacillus stearothermophilus T1 5 'CCWWGG
3 'GGWWCC 		5 '--- С   CWWGG --- 3 '
3 '--- GGWWC   C --- 5 '
Бұл тізім толық емес; Сіз көмектесе аласыз жетіспейтін заттарды қосу бірге сенімді көздер.

Ескертулер

  1. ^ Smith HO, Nathans D (желтоқсан 1973). «Хат: бактериалды иелерді модификациялау және рестрикциялау жүйелері мен олардың ферменттеріне арналған ұсынылған номенклатура». Дж.Мол. Биол. 81 (3): 419–23. дои:10.1016/0022-2836(73)90152-6. PMID  4588280.
  2. ^ Робертс Р.Ж., Белфорт М, Бестор Т, Багват А.С., Бикл ТА, Битинайт Дж, Блументал Р.М., Дегтярев С.К., Драйден Д.Т., Дибвиг К, Фирман К, Громова Э.С., Гумпорт Р.И., Халлфорд С.Е., Хаттман С, Хейтман Дж, Хорнби Д.П. , Janulaitis A, Jeltsch A, Josephsen J, Kiss A, Klaenhammer TR, Kobayashi I, Kong H, Krüger DH, S жетіспейтін, Marinus MG, Miyahara M, Morgan RD, Murray NE, Nagaraja V, Piekarowicz, Pingoud A, Raleigh E, Rao DN, Reich N, Repin VE, Selker EU, Shaw PC, Stein DC, Stoddard BL, Szybalski W, Trautner TA, Van Etten JL, Vitor JM, Wilson GG, Xu SY (сәуір, 2003). «Рестриктикалық ферменттер, ДНҚ метилтрансферазалар, гоминг эндонуклеазалар және олардың гендері үшін номенклатура». Нуклеин қышқылдары. 31 (7): 1805–12. дои:10.1093 / nar / gkg274. PMC  152790. PMID  12654995.
  3. ^ Джереми М.Б., Джон Л.Т., Люберт С (2002). «3. Ақуыздың құрылымы және қызметі». Биохимия. Сан-Франциско: В. Х. Фриман. ISBN  0-7167-4684-0.
  4. ^ Анфинсен С.Б. (1973). «Протеин тізбектерінің бүктелуін басқаратын принциптер». Ғылым. 181 (4096): 223–30. дои:10.1126 / ғылым.181.4096.223. PMID  4124164.
  5. ^ Кесслер С, Манта V (тамыз 1990). «Шектеу эндонуклеазаларының және ДНҚ модификациясының метилтрансферазаларының ерекшелігі (шолу 3)». Джин. 92 (1–2): 1–248. дои:10.1016 / 0378-1119 (90) 90486-B. PMID  2172084.
  6. ^ Pingoud A, Jeltsch A (қыркүйек 2001). «II типті рестрикциялық эндонуклеаздардың құрылымы мен қызметі». Нуклеин қышқылдары. 29 (18): 3705–27. дои:10.1093 / нар / 29.18.3705. PMC  55916. PMID  11557805.
  7. ^ Качалова Г.С., Рогулин Е.А., Юнусова А.К., Артюх Р.И., Перевязова Т.А., Матвиенко Н.И., Железная Л.А., Бартуник HD (желтоқсан 2008 ж.). «Гиперодимериялық типті IIS рестрикциялық эндонуклеазаның құрылымдық талдауы. R.BspD6I мономерлі учаскеге спецификалық никаза мен каталитикалық суббірлік арасындағы кешен ретінде әрекет етеді». Дж Мол Биол. 384 (2): 489–502. дои:10.1016 / j.jmb.2008.09.033. PMID  18835275.
  8. ^ Качалова Г.С., Рогулин Е.А., Юнусова А.К., Артюх Р.И., Перевязова Т.А., Матвиенко Н.И., Железная Л.А., Бартуник HD (қыркүйек 2007 ж.). «R.BspD6I гетеродимериялық шектеу эндонуклеазасының кіші суббірлігінің кристалдануы және алдын-ала рентген-дифракциялық анализі». Acta Crystallogr F. 63 (Pt 9): 795-7. дои:10.1107 / S174430910704016X. PMC  2376331. PMID  17768358.