Рестрикциялық ферменттерді кесу алаңдарының тізімі: Ba – Bc - List of restriction enzyme cutting sites: Ba–Bc - Wikipedia

Негізгі мақалалар: Рестрикциялық ферменттерді кесу алаңдарының тізімі және Рестрикциялық фермент
Аңыз нуклеобазалар
КодНуклеотид ұсынылған
AАденин (A)
CЦитозин (C)
GГуанин (G)
ТТимин (T)
NA, C, G немесе T
МA немесе C
RA немесе G
WA немесе T
YC немесе T
SC немесе G
ҚG немесе T
HA, C немесе T
BC, G немесе T
VA, C немесе G
Д.A, G немесе T


Бұл мақалада атаулары Ba-дан Bc қоса алғанда басталатын ең көп зерттелген шектеу ферменттерінің тізімі бар. Онда шамамен 120 ферменттер бар.

Келесі ақпарат беріледі:

  • Фермент: Қабылданған атауы молекула, халықаралық деңгейде қабылданды номенклатура[1][2], және библиографиялық сілтемелер. (Қосымша оқыңыз: «бөлімін қараңыз»Номенклатура «мақалада»Рестрикциялық фермент ".)
  • PDB коды: Ақуыздың құрылымын анықтау үшін қолданылатын код PDB ақуыз құрылымдарының мәліметтер базасы. Ақуыздың 3D атомдық құрылымы оның әсер ету механизмінің жақын бөлшектерін түсіну үшін өте құнды ақпарат береді[3][4].
  • Дереккөз: Ферментті табиғи түрде өндіретін организм.
  • Тану реттілігі: Ферментпен танылған және ол арнайы байланысатын ДНҚ тізбегі.
  • Кесу: Кесу орны және кесілген жердің ДНҚ өнімдері. The тану реттілігі және кесу орны әдетте сәйкес келеді, бірақ кейде кесу орны тану орнынан ондаған нуклеотидтерде болуы мүмкін[5][6].
  • Изосизизомерлер және неосхизомерлер: Ан изошизомер болып табылады фермент дәл сол сияқты кезектеседі. A неошизомер - бұл басқа тізбекті білетін, бірақ басқаша кесетін изосизомердің ерекше түрі. Әрбір фермент үшін ең көп таралған 8-10 изохизомердің ең көп саны көрсетілген, бірақ одан да көп болуы мүмкін. Неошизомерлер қою және жасыл түсті қаріппен көрсетілген (мысалы: BamHI). Қашан «Ешқайсысы қосылмаған күн«көрсетілген күні, бұл анықталған кесу орны бар мәліметтер базасында тіркелген изосизомер жоқ дегенді білдіреді. Ақ шрифтпен және сұр фонмен көрсетілген изосизомерлер ағымдағы тізімдерде жоқ ферменттерге сәйкес келеді:
тізімде жоқ ферменттегідей: EcoR70I 


Толық тізімді шарлау

Шектеу ферменттері

Ba - б.з.д.

ФерментPDB кодыДереккөзТану реттілігіКесуИзосизомерлер
Bac36IBacillus alcalophilus 36 5 'GGNCC
3 'CCNGG 		5 '--- Г.   GNCC --- 3 '
3 '--- CCNG   G --- 5 ' 		AspS9I, AvcI, BavAII, Bce22I, Bsp1894I, Bsu54I, FmuI, NspIV
BaeI [7]Bacillus sphaericus 5 'ACN4GTAYC
3 'TGN4CATYG 		5 '--- ACN4GTAYCN6NNNNNN   --- 3'
3 '--- TGN4CATYGN6N   NNNNN --- 5 ' 		 - 2010 жылдың мамырында жоқ -
БалИ [8][9]Brevibacterium albidum 5 'TGGCCA
3 'ACCGGT 		5 '--- TGG   CCA --- 3 '
3 '--- ACC   GGT --- 5 '
Bal228IBacillus alcalophilus 228 5 'GGNCC
3 'CCNGG 		5 '--- Г.   GNCC --- 3 '
3 '--- CCNG   G --- 5 ' 		AspS9I, AvcI, BavAII, BshKI, Bsp1894I, Bsu54I, FmuI, NspIV
BamHI [10][11][12][13][14][15][16][17][18][19][20]

[21][22][23][24][25][26][27][28][29][30]		1БАМBacillus amyliliquefaciens H 5 'GGATCC
3 'CCTAGG 		5 '--- Г.   GATCC --- 3 '
3 '--- CCTAG   G --- 5 ' 		AccEBI, AliI, ApaCI, AsiI, Bce751I, Bsp98I, Bsp4009I, BspAAIII, CelI, Nsp29132II, NspSAIV, SolI, SurI
BamNIIBacillus amyliliquefaciens N 5 'GGWCC
3 'CCWGG 		5 '--- Г.   GWCC --- 3 '
3 '--- CCWG   G --- 5 ' 		BcuAI, BsrAI, CauI, EagMI, FdiI, HgiCII, HgiJI, SinI
BanI [31][32]Bacillus aneurinolyticus 5 'GGYRCC
3 'CCRYGG 		5 '--- Г.   GYRCC --- 3 '
3 '--- CCRYG   G --- 5 ' 		AccB1I, BbvBI, BspT107I, Eco64I, HgiCI, HgiHI, MspB4I, PfaAI
BanII [12][31]Bacillus aneurinolyticus 5 'GRGCYC
3 'CYCGRG 		5 '--- GRGCY   C --- 3 '
3 '--- С   YCGRG --- 5 '
БанIII [31]Bacillus aneurinolyticus 5 'ATCGAT
3 'TAGCTA 		5 '--- AT   CGAT --- 3 '
3 '--- TAGC   TA --- 5 ' 		AagI, BavCI, Bsa29I, BseCI, BspDI, Bsu15I, BsuTUI, ClaI
BanAIBacillus anthracis 5 'GGCC
3 'CCGG 		5 '--- GG   CC --- 3 '
3 '--- CC   GG --- 5 '
БасИBacillus sp. 5 'CCAN5TGG
3 'GGTN5ACC 		5 '--- CCANNNN   NTGG --- 3 '
3 '--- GGTN   NNNNACC --- 5 ' 		AccB7I, AcpII, Asp10HII, Esp1396I, PflBI, PflMI, Van91I
BauIBacillus aquaemaris RFL1 5 'CACGAG
3 'GTGCTC 		5 '--- С   ACGAG --- 3 '
3 '--- GTGCT   C --- 5 '
БавИBacillus alvei 5 'CAGCTG
3 'GTCGAC 		5 '--- CAG   CTG --- 3 '
3 '--- GTC   GAC --- 5 '
BavAIBacillus alvei A 5 'CAGCTG
3 'GTCGAC 		5 '--- CAG   CTG --- 3 '
3 '--- GTC   GAC --- 5 '
BavAIIBacillus alvei A 5 'GGNCC
3 'CCNGG 		5 '--- Г.   GNCC --- 3 '
3 '--- CCNG   G --- 5 ' 		AspS9I, AvcI, BavBII, BshKI, Bsp1894I, Bsu54I, FmuI, NspIV
BavBIBacillus alvei B 5 'CAGCTG
3 'GTCGAC 		5 '--- CAG   CTG --- 3 '
3 '--- GTC   GAC --- 5 '
BavBIIBacillus alvei B 5 'GGNCC
3 'CCNGG 		5 '--- Г.   GNCC --- 3 '
3 '--- CCNG   G --- 5 ' 		AspS9I, Bac36I, BavAII, BshKI, BspBII, Bsu54I, FmuI, Pde12I
BavCIBacillus alvei C 5 'ATCGAT
3 'TAGCTA 		5 '--- AT   CGAT --- 3 '
3 '--- TAGC   TA --- 5 ' 		AagI, BanIII, Bsa29I, BseCI, BspDI, Bsu15I, BsuTUI, ClaI
BbeI [33]Bifidobacterium breve YIT4006 5 'GGCGCC
3 'CCGCGG 		5 '--- GGCGC   C --- 3 '
3 '--- С   CGCGG --- 5 '
BbiIIBifidobacterium bifidum YIT4007 5 'GRCGYC
3 'CYGCRG 		5 '--- GR   CGYC --- 3 '
3 '--- CYGC   RG --- 5 ' 		AcyI, AhaII, BbiII, HgiHII, Hin1I, Hsp92I, Msp17I, PamII
Bbi24IBifidobacterium bifidum S-24 5 'ACGCGT
3 'TGCGCA 		5 '--- A   CGCGT --- 3 '
3 '--- TGCGC   A --- 5 '
BbrIBordetella bronchiseptica 4994 5 'AAGCTT
3 'TTCGAA 		5 '--- A   AGCTT --- 3 '
3 '--- TTCGA   A --- 5 '
Bbr7IBacillus brevis 7 5 'GAAGAC
3 'CTTCTG 		5 '--- ГААГАКН6N   NNNNN --- 3 '
3 '--- CTTCTGN6NNNNNN   --- 5'
BbrPI [34][35]Bacillus brevis 5 'CACGTG
3 'GTGCAC 		5 '--- CAC   GTG --- 3 '
3 '--- GTG   CAC --- 5 ' 		AcvI, BcoAI, Eco72I, PmaCI, PmlI, PspCI
BbsI [36]Bacillus laterosporus 5 'GAAGAC
3 'CTTCTG 		5 '--- GAAGACNN   NNNN --- 3 '
3 '--- CTTCTGNNNNNN   --- 5'
BbuI [37]Bacillus circulans 5 'GCATGC
3 'CGTACG 		5 '--- GCATG   C --- 3 '
3 '--- С   GTACG --- 5 '
BvvI [38][39]Bacillus brevis 5 'GCAGC
3 'CGTCG 		5 '--- GCAGCN7N   NNNN --- 3 '
3 '--- CGTCGN7NNNNN   --- 5' 		AlwXI, BseKI, BseXI, Bsp423I, Bst12I, Bst71I, BstV1I
BvvII [40]Bacillus brevis 80 5 'GAAGAC
3 'CTTCTG 		5 '--- GAAGACNN   NNNN --- 3 '
3 '--- CTTCTGNNNNNN   --- 5'
Bvv12I [41]Bacillus brevis 12 5 'GWGCWC
3 'CWCGWG 		5 '--- GWGCW   C --- 3 '
3 '--- С   WCGWG --- 5 '
Alw21I, AspHI, Bsh45I, BsiHKAI,
HgiAI, HpyF46II, MspV281I
Bbv16IIBacillus brevis 16 5 'GAAGAC
3 'CTTCTG 		5 '--- GAAGACNN   NNNN --- 3 '
3 '--- CTTCTGNNNNNN   --- 5'
BvvAIBacillus brevis A 5 'GAAN4TTC
3 'CTTN4AAG 		5 '--- ГАНН   NNTTC --- 3 '
3 '--- CTTNN   NNAAG --- 5 ' 		Asp700I, MroXI, PdmI, XmnI
BvvAIIBacillus brevis A 5 'ATCGAT
3 'TAGCTA 		5 '--- AT   CGAT --- 3 '
3 '--- TAGC   TA --- 5 ' 		BavCI, Bci29I, Bli86I, BseCI, BspZEI, Bsu15I, ClaI, Rme21I
BbvAIIIBacillus brevis A 5 'TCCGGA
3 'AGGCCT 		5 '--- Т   CCGGA --- 3 '
3 '--- AGGCC   T --- 5 ' 		AccIII, Aor13HI, BlfI, BseAI, Bsp13I, BspEI, Bsu23I, Kpn2I
BbvBIBacillus brevis B 5 'GGYRCC
3 'CCRYGG 		5 '--- Г.   GYRCC --- 3 '
3 '--- CCRYG   G --- 5 ' 		BanI, BshNI, BspT107I, Eco64I, HgiCI, HgiHI, MspB4I, PfaAI
BvvCI [42]Bacillus brevis 5 'CCTCAGC
3 'GGAGTCG 		5 '--- CC   TCAGC --- 3 '
3 '--- GGAGT   CG --- 5 ' 		AbeI
Bca77IBacillus caldolyticus 5 'WCCGGW
3 'WGGCCW 		5 '--- В   CCGGW --- 3 '
3 '--- WGGCC   Ш --- 5 '
BccIБактероидтар какасы 5 'CCATC
3 'GGTAG 		5 '--- CCATCNNNN   N --- 3 '
3 '--- GGTAGNNNNN   --- 5'
Bce4IBacillus cereus B4 5 'GCN7GC
3 'CGN7CG 		5 '--- GCNNNNN   NNGC --- 3 '
3 '--- CGNN   NNNNNCG --- 5 '
Bce22IBacillus cereus 22 5 'GGNCC
3 'CCNGG 		5 '--- Г.   GNCC --- 3 '
3 '--- CCNG   G --- 5 ' 		AspS9I, Bac36I, BavAII, BshKI, BspBII, CcuI, FmuI, Pde12I
Bce83I [43]Bacillus cereus 83 5 'CTTGAG
3 'GAACTC 		5 '--- CTTAGAGN13NNN   --- 3'
3 '--- GAACTCN13N   NN --- 5 '
Bce243IBacillus cereus 5 'GATC
3 'CTAG 		5' ---   GATC --- 3 '
3 '--- CTAG   --- 5' 		Bfi57I, Bsp143I, BspJI, BstMBI, CviAI, Kzo9I, NdeII, Sth368I
Bce751IBacillus cereus 751 5 'GGATCC
3 'CCTAGG 		5 '--- Г.   GATCC --- 3 '
3 '--- CCTAG   G --- 5 ' 		BamHI, Bce751I, BnaI, Bsp98I, Bsp4009I, BstI, NspSAIV, Pfl8I
BceAIBacillus cereus 1315 5 'ACGGC
3 'TGCCG 		5 '--- ACGGCN11N   NN --- 3 '
3 '--- TGCCGN11NNN   --- 5'
BceBIBacillus cereus 1323 5 'CGCG
3 'GCGC 		5 '--- CG   CG --- 3 '
3 '--- МК   GC --- 5 ' 		AccII, Bsh1236I, BtkI, Csp68KVI, FalII, FauBII, FnuDII, СелИ, Таиланд
BceCIBacillus cereus 1195 5 'GCN7GC
3 'CGN7CG 		5 '--- GCNNNNN   NNGC --- 3 '
3 '--- CGNN   NNNNNCG --- 5 '
BcefI [44]Bacillus cereus fluorescens 5 'ACGGC
3 'TGCCG 		5 '--- ACGGCN10NN   N --- 3 '
3 '--- TGCCGN10NNN   --- 5'
BcgI [45][46]Bacillus коагуландары 5 'CGAN6TGC
3 'GCTN6ACG 		5 '--- CGAN6TGCN9NNN   --- 3'
3 '--- GCTN6ACGN9N   NN --- 5 '
Bci29IBacillus circulans 29 5 'ATCGAT
3 'TAGCTA 		5 '--- AT   CGAT --- 3 '
3 '--- TAGC   TA --- 5 ' 		BavCI, BciBI, Bli86I, BseCI, BspZEI, Bsu15I, ClaI, Rme21I
BciBIBacillus circulans B 5 'ATCGAT
3 'TAGCTA 		5 '--- AT   CGAT --- 3 '
3 '--- TAGC   TA --- 5 ' 		BavCI, BcmI, Bli86I, BseCI, BspZEI, Bsu15I, ClaI, Rme21I
BciBIIBacillus circulans B 5 'CCWGG
3 'GGWCC 		5 '--- CC   WGG --- 3 '
3 '--- GGW   CC --- 5 ' 		AjnI, ApyI, BptI, Bst1I, BstOI, BstM6I, Bst2UI, EcoRII, MvaI
BciVI [47]Bacillus circulans 5 'GTATCC
3 'CATAGG 		5 '--- GTATCCN4NN   --- 3'
3 '--- CATAGGN4N   N --- 5 ' 		BfuI
BclI [15][48][49]Bacillus caldolyticus 5 'TGATCA
3 'ACTAGT 		5 '--- Т   GATCA --- 3 '
3 '--- ACTAG   T --- 5 '
Аба, BsiQI, BspXII,
BstT7I, FbaI, Ksp22I, ParI 
BcmIBacillus sp. 5 'ATCGAT
3 'TAGCTA 		5 '--- AT   CGAT --- 3 '
3 '--- TAGC   TA --- 5 ' 		BsuTUI, Bsu15I, BavCI, Bli86I, BspZEI, Rme21I, BseCI, BdiI
BcnI [50][51][52]2ODHBacillus centrosporus RFL1 5 'CCSGG
3 'GGSCC 		5 '--- CC   SGG --- 3 '
3 '--- GGS   CC --- 5 '
AhaI, AseII, AsuC2I,BpuMI,CauII,
Eco1831I, HgiS22I,Kpn49kII, NciI
BcoI [53]Bacillus коагуландары SM 1 5 'CYCGRG
3 'GRGCYC 		5 '--- С   YCGRG --- 3 '
3 '--- GRGCY   C --- 5 ' 		Ama87I, AquI, BsoBI, BstSI, Eco88I, NspSAI, OfoI, PunAI
Bco5IBacillus коагуландары 5 5 'CTCTTC
3 'ГАГААГ 		5 '--- CTCTTCN   NNN --- 3 '
3 '--- GAGAAGNNNN   --- 5'
Bco27IBacillus коагуландары 27 5 'CCGG
3 'GGCC 		5 '--- С   CGG --- 3 '
3 '--- GGC   C --- 5 '
Bco116IBacillus коагуландары 116 5 'CTCTTC
3 'ГАГААГ 		5 '--- CTCTTCN   NNN --- 3 '
3 '--- GAGAAGNNNN   --- 5'
Bco118IBacillus коагуландары 118 5 'RCCGGY
3 'YGGCCR 		5 '--- R   CCGGY --- 3 '
3 '--- YGGCC   R --- 5 '
BcoAIBacillus коагуландары AUCM B-732 5 'CACGTG
3 'GTGCAC 		5 '--- CAC   GTG --- 3 '
3 '--- GTG   CAC --- 5 ' 		AcvI, BbrPI, Eco72I, PmaCI, PmlI, PspCI
BcoKIBacillus коагуландары 5 'CTCTTC
3 'ГАГААГ 		5 '--- CTCTTCN   NNN --- 3 '
3 '--- GAGAAGNNNN   --- 5'
BcuIBacillus коагуландары Vs 29-022 5 'ACTAGT
3 'TGATCA 		5 '--- A   CTAGT --- 3 '
3 '--- TGATC   A --- 5 ' 		AhII, AclNI, SpeI
BcuAIBacillus cereus BKM B-814 5 'GGWCC
3 'CCWGG 		5 '--- Г.   GWCC --- 3 '
3 '--- CCWG   G --- 5 ' 		BamNxI, BsrAI, Csp68KI, EagMI, FssI, HgiCII, HgiJI, SinI
Бұл тізім толық емес; Сіз көмектесе аласыз жетіспейтін заттарды қосу бірге сенімді көздер.

Ескертулер

  1. ^ Smith HO, Nathans D (желтоқсан 1973). «Хат: бактериалды иелерді модификациялау және рестрикциялау жүйелері мен олардың ферменттеріне арналған ұсынылған номенклатура». Дж.Мол. Биол. 81 (3): 419–23. дои:10.1016/0022-2836(73)90152-6. PMID  4588280.
  2. ^ Робертс Р.Ж., Белфорт М, Бестор Т, Багват А.С., Бикл ТА, Битинайт Дж, Блументал Р.М., Дегтярев С.К., Драйден Д.Т., Дибвиг К, Фирман К, Громова Э.С., Гумпорт Р.И., Халлфорд С.Е., Хаттман С, Хейтман Дж, Хорнби Д.П. , Janulaitis A, Jeltsch A, Josephsen J, Kiss A, Klaenhammer TR, Kobayashi I, Kong H, Krüger DH, S жетіспейді, Marinus MG, Miyahara M, Morgan RD, Murray NE, Nagaraja V, Piekarowicz, Pingoud A, Raleigh E, Rao DN, Reich N, Repin VE, Selker EU, Shaw PC, Stein DC, Stoddard BL, Szybalski W, Trautner TA, Van Etten JL, Vitor JM, Wilson GG, Xu SY (сәуір, 2003). «Рестриктикалық ферменттер, ДНҚ метилтрансферазалар, гоминг эндонуклеазалар және олардың гендері үшін номенклатура». Нуклеин қышқылдары. 31 (7): 1805–12. дои:10.1093 / nar / gkg274. PMC  152790. PMID  12654995.
  3. ^ Джереми М.Б., Джон Л.Т., Люберт С (2002). «3. Ақуыздың құрылымы және қызметі». Биохимия. Сан-Франциско: В. Х. Фриман. ISBN  0-7167-4684-0.
  4. ^ Анфинсен С.Б. (1973). «Протеин тізбектерінің бүктелуін басқаратын принциптер». Ғылым. 181 (4096): 223–30. дои:10.1126 / ғылым.181.4096.223. PMID  4124164.
  5. ^ Kessler C, Manta V (тамыз 1990). «Шектеу эндонуклеазаларының және ДНҚ модификациясының метилтрансферазаларының ерекшелігі (шолу 3)». Джин. 92 (1–2): 1–248. дои:10.1016 / 0378-1119 (90) 90486-B. PMID  2172084.
  6. ^ Pingoud A, Jeltsch A (қыркүйек 2001). «II типті рестрикциялық эндонуклеаздардың құрылымы және қызметі». Нуклеин қышқылдары. 29 (18): 3705–27. дои:10.1093 / нар / 29.18.3705. PMC  55916. PMID  11557805.
  7. ^ Sears LE, Zhou B, Aliotta JM, Morgan RD, Kong H (қыркүйек 1996). «BaeI, тағы бір ерекше BcgI-ге ұқсас шектеу эндонуклеаза». Нуклеин қышқылдары. 24 (18): 3590–2. дои:10.1093 / нар / 24.18.3590. PMC  146138. PMID  8836187.
  8. ^ Уено Х, Като I, Ишино Ю (маусым 1996). «BalI шектеу-модификация жүйесін клондау және экспрессиясы». Нуклеин қышқылдары. 24 (12): 2268–70. дои:10.1093 / нар / 24.12.2268 ж. PMC  145948. PMID  8710495.
  9. ^ Gelinas RE, Myers PA, Weiss GH, Roberts RJ, Murray K (тамыз 1977). «Нақты эндонуклеаза Brevibacterium albidum". Дж Мол Биол. 114 (3): 433–40. дои:10.1016/0022-2836(77)90260-1. PMID  909093.
  10. ^ Вей Х, Терриен С, Бланчард А, Гуан С, Чжу З (мамыр 2008). «Fidelity Index ДНҚ-рестрикциялық эндонуклеаздардың жұлдыздық белсенділігінің жүйелі кванттауын қамтамасыз етеді». Нуклеин қышқылдары. 36 (9): e50. дои:10.1093 / nar / gkn182. PMC  2396408. PMID  18413342.
  11. ^ Нишигаки К, Канеко Ю, Вакуда Х, Хусими Ю, Танака Т (тамыз 1985). «II типті рестрикциялық эндонуклеаздар жалпы бір тізбекті ДНҚ-ны бөледі». Нуклеин қышқылдары. 13 (16): 5747–60. дои:10.1093 / нар / 13.16.5747. PMC  321909. PMID  2994012.
  12. ^ а б Нельсон М, Крист С, Шилдкраут I (шілде 1984). «Эндонуклеазаның анықталған шектеулерін ДНҚ метилазаларымен тану ерекшеліктерін өзгерту». Нуклеин қышқылдары. 12 (13): 5165–73. дои:10.1093 / nar / 12.13.5165. PMC  318911. PMID  6087274.
  13. ^ Nelson PS, Papas TS, Schweinfest CW (1993 ж. Ақпан). «5-метил-дезоксицитозиннің гемиметилденген ДНҚ-ның эндукуклеазаның шектелуі, жоғары фермент-субстрат қатынасында». Нуклеин қышқылдары. 21 (3): 681–6. дои:10.1093 / нар / 21.3.681. PMC  309169. PMID  8441677.
  14. ^ Greene PJ, Heyneker HL, Bolivar F, Rodriguez RL, Betlach MC, Covarrubias AA, Backman K, Russel DJ, Tait R, Boyer HW (шілде 1978). «Рестриктазаларды тазартудың жалпы әдісі». Нуклеин қышқылдары. 5 (7): 2373–80. дои:10.1093 / nar / 5.7.2373. PMC  342170. PMID  673857.
  15. ^ а б Хуанг ЛХ, Фарнет CM, Эрлих К.С., Эрлих М (наурыз 1982). «Жоғары модификацияланған бактериофагты ДНҚ-ны эндонуклеазалармен шектеу арқылы қорыту». Нуклеин қышқылдары. 10 (5): 1579–91. дои:10.1093 / нар / 10.5.1579. PMC  320551. PMID  6280151.
  16. ^ Уилсон Г.А., Жас ФЭ (қыркүйек 1975). «Тізбектелген эндонуклеазаны (BamI) оқшаулау Bacillus amyliliquefaciens H «. Дж Мол Биол. 97 (1): 123–5. дои:10.1016 / S0022-2836 (75) 80028-3. PMID  1177312.
  17. ^ Робертс Р.Ж., Уилсон Г.А., Янг Ф.Е. (қаңтар 1977). «BamH.I спецификалық эндонуклеазаны тану реттілігі Bacillus amyliliquefaciens H «. Табиғат. 265 (5589): 82–4. Бибкод:1977 ж.265 ... 82R. дои:10.1038 / 265082a0. PMID  834250.
  18. ^ Brooks JE, Benner JS, Heiter DF, Silber KR, Sznyter LA, Jager-Quinton T, Moran LS, Slatko BE, Wilson GG, Nwankwo DO (ақпан 1989). «BamHI шектеу модификация жүйесін клондау». Нуклеин қышқылдары. 17 (3): 979–97. дои:10.1093 / нар / 17.3.979. PMC  331717. PMID  2537955.
  19. ^ Viadiu H, Aggarwal AK (мамыр 2000). «BamHI құрылымы спецификалық емес ДНҚ-мен байланысқан: ДНҚ сырғанауының моделі». Мол. Ұяшық. 5 (5): 889–95. дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80329-9. PMID  10882125.
  20. ^ Джордж Дж, Чирикджян Дж.Г. (сәуір 1982). «BamHI реттілігінің эндонуклеазы: реттілікті танудың релаксациясы». Proc Natl Acad Sci USA. 79 (8): 2432–6. Бибкод:1982PNAS ... 79.2432G. дои:10.1073 / pnas.79.8.2432. PMC  346212. PMID  6283522.
  21. ^ Mukhopadhyay P, Roy KB (1984). «Тізбектік спецификалық BamHI метилаза. Тазарту және сипаттама». Биологиялық химия журналы. 259 (16): 10357–62. PMID  6469968.
  22. ^ Робинсон CR, Sligar SG (сәуір 1995). «Ректрикциялық эндонуклеазалар арқылы молекулалық танудағы біртектілік: BamHI, Pvu II және EcoRV спецификасына осмостық және гидростатикалық қысымның әсері». Proc Natl Acad Sci USA. 92 (8): 3444–8. Бибкод:1995 PNAS ... 92.3444R. дои:10.1073 / pnas.92.8.3444. PMC  42183. PMID  7724581.
  23. ^ Viadiu H, Aggarwal AK (қазан 1998). «BamHI эндонуклеазасының шектелуімен катализдегі металдардың рөлі». Nat Struct Biol. 5 (10): 910–6. дои:10.1038/2352. PMID  9783752.
  24. ^ Ньюман М, Стржелекка Т, Дорнер Л.Ф., Шилдкраут I, Аггарвал АК (тамыз 1995). «ДНҚ-мен байланысқан Bam HI эндонуклеазасының құрылымы: ДНҚ-мен байланысу кезінде жартылай бүктелу және бүктелу». Ғылым. 269 (5224): 656–63. Бибкод:1995Sci ... 269..656N. дои:10.1126 / ғылым.7624794. PMID  7624794.
  25. ^ Рой К.Б, Врушанк Д (1995 ж. Шілде). «Bam HI өзін-өзі толықтыратын d-CGCGGAGCCGCG кодерін екі G-ден бұрын бөліп алады және ДНҚ-ның майорында байланысуы мүмкін». Биохим Мол Биол Инт. 36 (4): 759–70. PMID  8528138.
  26. ^ Newman M, Strzelecka T, Dorner LF, Schildkraut I, Aggarwal AK (мамыр 1994). «MAD талдауы бойынша шешімді эндонуклеазды шектеу құрылымы 1.95 деңгейден басталады». Құрылым. 2 (5): 439–52. дои:10.1016 / S0969-2126 (00) 00045-9. PMID  8081758.
  27. ^ Newman M, Strzelecka T, Dorner LF, Schildkraut I, Aggarwal AK (сәуір 1994). «BamHI шектеу эндонуклеазасының құрылымы және оның EcoRI-мен байланысы». Табиғат. 368 (6472): 660–4. Бибкод:1994 ж.36..660N. дои:10.1038 / 368660a0. PMID  8145855.
  28. ^ Рой К.Б, Врушанк Д, Джаярам Б (шілде 1994). «BamHI шектеу эндонуклеазасы үшін Km және Kcat кинетикалық тұрақтыларын анықтауда изотопты-сұйылту құбылысын қолдану: эмпирикалық және итерациялық тәсіл». Анал биохимиясы. 220 (1): 160–4. дои:10.1006 / abio.1994.1313. PMID  7978240.
  29. ^ Брукс Дж., Натан П.Д., Лэндри Д, Шнйтер Л.А., Уэйт-Рис П, Айвес КЛ, Моран Л.С., Слатко Б.Е., Беннер Дж.С. (1991 ж. Ақпан). «Клондалған BamHI рестрикциялық модификация жүйесінің сипаттамасы: оның нуклеотидтік реттілігі, метилазаның қасиеттері және гетерологиялық иелердегі көрінісі». Нуклеин қышқылдары. 19 (4): 841–50. дои:10.1093 / нар / 19.4.841. PMC  333720. PMID  1901989.
  30. ^ Mukhopadhyay P, Roy KB (қазан 1998). «BamHI эндуклеазасын шектейтін протеиндік инженерия: Алаға Cys54-ті алмастыру каталитикалық белсенділікті күшейтеді». Ақуыз Eng. 11 (10): 931–5. дои:10.1093 / ақуыз / 11.10.931. PMID  9862213.
  31. ^ а б c Сугисаки Х, Маекава Ю, Каназава С, Таканами М (қазан 1982). «Acetobacter aceti және Bacillus aneurinolyticus жаңа рестрикциялық эндонуклеаздар». Нуклеин қышқылдары. 10 (19): 5747–52. дои:10.1093 / nar / 10.19.5747. PMC  320926. PMID  6292849.
  32. ^ Schildkraut I, Lynch J, Morgan R (шілде 1987). «BanI және HgiC I эндонуклеазаларының шектелуіне арналған бөлу орны 5 '... G азаяды GPyPuCC ... 3'". Шилдкраут I, Линч Дж, Морган Р.. 15 (13): 5492. дои:10.1093 / нар / 15.13.5492. PMC  305987. PMID  3037499.
  33. ^ Хосака Т, Сакурай Т, Такахаши Х, Сайто Н (ақпан 1982). «Bifidobacterium breve-ден жаңа жаңа эндонуклеаза Bbei». Джин. 17 (2): 117–22. дои:10.1016/0378-1119(82)90063-4. PMID  6282709.
  34. ^ Веселий З, Шмитц Г.Г., Ярш М, Кесслер С (маусым 1990). «BbrPI, Bacillus brevis-тен шыққан PmacI романының 5'-CAC / GTG-3 танитын изосизомері»'". Нуклеин қышқылдары. 18 (11): 3423. дои:10.1093 / нар / 18.11.3423. PMC  330975. PMID  2162525.
  35. ^ Кафри Т, Гершко А, Разин А (маусым 1993). «CBGP шектеу ферментімен CACGTG-де CpG метилденуін зондтау». Нуклеин қышқылдары. 21 (12): 2950. дои:10.1093 / нар / 21.12.2950. PMC  309701. PMID  8332512.
  36. ^ Протозанова Е, Демидов В.В., Нильсен П.Е., Франк-Каменецкий MD (шілде 2003). «Псевдокомплементарлы ПНҚ дуплексті ДНҚ-дағы белок белсенділігінің селективті модификаторы ретінде: II типті рестриктоздық ферменттердің жағдайы». Нуклеин қышқылдары. 31 (14): 3929–35. дои:10.1093 / nar / gkg450. PMC  165965. PMID  12853608.
  37. ^ Aubert E, Spurgeon S, Ray W, Davies J (қазан 1990). «SphI изозизомерін Bacillus циркуландарынан тазарту және сипаттамасы». Нуклеин қышқылдары. 18 (20): 6152. дои:10.1093 / нар / 18.20.6152. PMC  332440. PMID  2146591.
  38. ^ Gingeras TR, MIlazzo JP, Roberts RJ (қараша 1978). «Шектеу ферменттерін тану орындарын анықтаудың компьютерлік әдісі». Нуклеин қышқылдары. 5 (11): 4105–27. дои:10.1093 / нар / 5.11.4105. PMC  342737. PMID  724510.
  39. ^ Хаттман С, Кейстер Т, Готтехер А (қазан 1978). «Бастап ДНҚ метилазаларының реттілігі Bacillus amyliliquefaciens және Bacillus brevis". Дж Мол Биол. 124 (4): 701–11. дои:10.1016 / 0022-2836 (78) 90178-X. PMID  712853.
  40. ^ Матвиенко Н.И., Пачкунов Д.М., Крамаров В.М. (1984). «BbvII учаскесіне тән эндонуклеазаның танылу кезектілігі Bacillus brevis 80". FEBS Lett. 177: 23–36. дои:10.1016/0014-5793(84)80973-4.
  41. ^ Репин В.Е., Речкунова Н.И., Дегтярев С.К., Хачатурян А.А., Африкян Е.К. (1989). «Рестрикциялық эндонуклеаз өндірушілері ретінде аэробты спора түзетін бактериялар». Biol J Армения. 42: 969–72.
  42. ^ Heiter DF, Lunnen KD, Wilson GG (мамыр 2005). «Гетеродимериялық рестрикция эндонуклеазасының R.BbvCI учаскесіне тән ДНҚ-никант мутанттары». Дж Мол Биол. 348 (3): 631–40. дои:10.1016 / j.jmb.2005.02.034. PMID  15826660.
  43. ^ Матвиенко Н.Н; Крамаров В.М.; Иванов Л.Ю; Матвиенко Н.И. (сәуір 1992 ж.). «Bce83I, 5'-CTTGAG-3 'жаңа палиндромды емес тізбекті танитын және S-аденозилметионинмен ынталандырылатын Bacillus cereus 83-тен келетін шектеу эндонуклеазасы». Нуклеин қышқылдары. 20 (7): 1803. дои:10.1093 / нар / 20.7.1803. PMC  312275. PMID  1315959.
  44. ^ Venetianer P, Orosz A (сәуір 1988). «BcefI, жаңа типті IIS шектеу эндонуклеазы». Нуклеин қышқылдары. 16 (7): 3053–60. дои:10.1093 / нар / 16.7.3053. PMC  336451. PMID  2835751.
  45. ^ Kong H, Roemer SE, Waite-Rees PA, Benner JS, Wilson GG, Nwankwo DO (қаңтар 1994). «BcgI сипаттамасы, шектеу-модификация жүйесінің жаңа түрі». J Biol Chem. 269 (1): 683–90. PMID  8276869.
  46. ^ Kong H, Morgan RD, Maunus RE, Schildkraut I (1993 ж. Ақпан). «Bacillus коагуландарының бірегей шектеу эндонуклеазы, BcgI». Нуклеин қышқылдары. 21 (4): 987–91. дои:10.1093 / нар / 21.4.987. PMC  309233. PMID  8451198.
  47. ^ Робертс RJ, Macelis D (қаңтар 1997). «РЕБАЗ-рестриктивті ферменттер мен метилазалар». Нуклеин қышқылдары. 25 (1): 248–62. дои:10.1093 / нар / 25.1.248. PMC  146408. PMID  9016548.
  48. ^ Rowland GC, Lim PP, Glass RE (шілде 1992). «'Стоп-кодонға тән 'рестрикциялық эндонуклеаздар: оларды картаға түсіру және генмен манипуляциялау кезінде қолдану ». Джин. 116 (1): 21–6. дои:10.1016 / 0378-1119 (92) 90624-X. PMID  1628840.
  49. ^ Бингем А.Х., Аткинсон Т, Скиаки Д, Робертс Р.Ж. (қазан 1978). «Bacillus caldolyticus-тен арнайы эндонуклеаза». Нуклеин қышқылдары. 5 (10): 3457–67. дои:10.1093 / нар / 5.10.3457. PMC  342687. PMID  724493.
  50. ^ Janulaitis A, Klimasauskas S, Petrusyte M, Butkus V (қыркүйек 1983). «BcnI метилаза арқылы ДНҚ-да цитозин модификациясы N4-метилцитозин береді». FEBS Lett. 161 (1): 131–4. дои:10.1016/0014-5793(83)80745-5. PMID  6884523.
  51. ^ Janulaitis AA, Petrusite MA, Jaskelavicene Б.П., Краев А.С., Скрябин К.Г., Баев А.А. (қаңтар 1982). «BcnI жаңа шектеу эндонуклеазы Bacillus centrosporus RFL 1 ». FEBS Lett. 137 (2): 178–80. дои:10.1016/0014-5793(82)80343-8. PMID  6277689.
  52. ^ Соколовска М, Каус-Дробек М, Чапинска Н, Тамулайтис Г, zепановский Р.Х., Урбанке С, Сикснис V, Бохтлер М (маусым 2007). «BcnI мономериялық рестрикциясы эндонуклеаза apo түрінде және мақсатты ДНҚ-мен асимметриялық кешенде». Дж Мол Биол. 369 (3): 722–34. дои:10.1016 / j.jmb.2007.03.018. PMID  17445830.
  53. ^ Leung SM, Kam KM, Chan KY, Shaw PC (1990). «BcoI шектеуінің топырақ изоляциясынан тазарту және сипаттамасы Bacillus коагуландары". FEMS Microbiol Lett. 66 (2): 153–6. дои:10.1111 / j.1574-6968.1990.tb03988.x. PMID  1936944.