HDAC9 - HDAC9

HDAC9
Қол жетімді құрылымдар
PDBОртологиялық іздеу: PDBe RCSB
Идентификаторлар
Бүркеншік аттарHDAC9, HD7, HD7b, HD9, HDAC, HDAC7, HDAC7B, HDAC9B, HDAC9FL, HDRP, MITR, гистон деацетилаза 9
Сыртқы жеке куәліктерOMIM: 606543 MGI: 1931221 HomoloGene: 128578 Ген-карталар: HDAC9
Геннің орналасуы (адам)
7-хромосома (адам)
Хр.7-хромосома (адам)[1]
7-хромосома (адам)
HDAC9 үшін геномдық орналасу
HDAC9 үшін геномдық орналасу
Топ7p21.1Бастау18,086,949 bp[1]
Соңы19,002,416 bp[1]
Ортологтар
ТүрлерАдамТышқан
Энтрез
Ансамбль
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001271386
NM_024124

RefSeq (ақуыз)

NP_001258315
NP_077038

Орналасқан жері (UCSC)Chr 7: 18.09 - 19 MbХр 12: 34.05 - 34.92 Мб
PubMed іздеу[3][4]
Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеуТінтуірді қарау / өңдеу

Гистон деацетилаза 9 болып табылады фермент адамдарда кодталған HDAC9 ген.[5][6][7]

Функция

Гистондар транскрипциялық реттелуде, жасуша циклінің прогрессиясында және даму оқиғаларында шешуші рөл атқарады. Гистон ацетилденуі / деацетилденуі хромосомалардың құрылымын өзгертеді және ДНҚ-ға транскрипция факторының қол жетімділігіне әсер етеді. Осы генмен кодталған ақуыз гистон деацетилаза тұқымдасының мүшелеріне арналған бірізділік гомологиясына ие. Бұл ген Ксенопус пен тышқанның MITR гендеріне ортологиялық болып табылады. MITR ақуызында гистон деацетилаза каталитикалық домені жоқ. Ол CtBP және HDAC-терді қамтитын көп компонентті корепрессорлық кешендерді жалдау арқылы MEF2 белсенділігін басады. Бұл кодталған ақуыз гемопоэзде рөл атқаруы мүмкін. Бұл ген үшін бірнеше балама транскрипциялар сипатталған, бірақ олардың кейбірінің толық табиғаты анықталмаған.[7]

Өзара әрекеттесу

HDAC9 көрсетілген өзара әрекеттесу бірге:

Сондай-ақ қараңыз

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ а б c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000048052 - Ансамбль, Мамыр 2017
  2. ^ а б c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000004698 - Ансамбль, Мамыр 2017
  3. ^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  4. ^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  5. ^ Wang AH, Bertos NR, Vezmar M, Pelletier N, Crosato M, Heng HH, Th'ng J, Han J, Yang XJ (қараша 1999). «HDAC4, HDA1 ашытқысына қатысты адамның гистоны деацетилаза, транскрипциялық корепрессор болып табылады». Молекулалық және жасушалық биология. 19 (11): 7816–27. дои:10.1128 / mcb.19.11.7816. PMC  84849. PMID  10523670.
  6. ^ Торғай Д.Б., Миска Е.А., Лэнгли Е, Рейно-Деонавт С, Котеча С, Тауэрс Н, Спорр Г, Кузаридес Т, Мохун Т.Ж. (қыркүйек 1999). «MEF-2 функциясы жаңа репрессормен өзгертілген, MITR». EMBO журналы. 18 (18): 5085–98. дои:10.1093 / emboj / 18.18.5085. PMC  1171579. PMID  10487760.
  7. ^ а б «Entrez Gene: HDAC9 гистон деацетилаза 9».
  8. ^ а б Asare Y, Campbell-James TA, Bokov Y, Yu LL, Prestel M, El Bounkari O, Roth S, Megens RT, Straub T, Thomas K, Yan G, Schneider M, Ziesch N, Tiedt S, Silvestre-Roig C, Braster Q, Huang Y, Schneider M, Malik R, Haffner C, Liesz A, Soehnlein O, Bernhagen J, Dichgans M (маусым 2020). «Гистон деацетилаза 9 атеросклеротикалық тақта осалдығын реттеу үшін IKK-ны белсендіреді». Айналымды зерттеу. 127 (6): 811–823. дои:10.1161 / CIRCRESAHA.120.316743. PMID  32546048. S2CID  219726725.
  9. ^ а б Чжан CL, McKinsey TA, Olson EN (қазан 2002). «II дәрежелі гистон деацетилазаларының гетерохроматин ақуызымен ассоциациясы: бұлшықет дифференциациясын басқарудағы гистон метилденуінің әлеуетті рөлі». Молекулалық және жасушалық биология. 22 (20): 7302–12. дои:10.1128 / mcb.22.20.7302-7312.2002. PMC  139799. PMID  12242305.
  10. ^ а б c Petrie K, Guidez F, Howell L, Healy L, Waxman S, Greaves M, Zelent A (мамыр 2003). «Гистон деацетилаза 9 гені көптеген ақуыз изоформаларын кодтайды». Биологиялық химия журналы. 278 (18): 16059–72. дои:10.1074 / jbc.M212935200. PMID  12590135.
  11. ^ Чжоу Х, Ричон В.М., Рифкинд Р.А., Маркс ПА (2000 ж. Ақпан). «4 және 5 гистон деацетилазаларының каталитикалық емес аймағына жататын транскрипциялық репрессорды анықтау». Америка Құрама Штаттарының Ұлттық Ғылым Академиясының еңбектері. 97 (3): 1056–61. дои:10.1073 / pnas.97.3.1056. PMC  15519. PMID  10655483.
  12. ^ Мишели Л, Д'Андреа Г, Леонарди Л, Тирон Ф (шілде 2017). «HDAC1, HDAC4 және HDAC9 PC3 / Tis21 / Btg2-мен байланысады және оны жасуша циклінің прогрессиясын және D1 циклинін білдіруді тоқтату үшін қажет» (PDF). Жасушалық физиология журналы. 232 (7): 1696–1707. дои:10.1002 / jcp.25467. PMID  27333946. S2CID  4070837.
  13. ^ Miska EA, Karlsson C, Langley E, Nielsen SJ, Pines J, Kouzarides T (қыркүйек 1999). «HDAC4 деацетилаза MEF2 транскрипция факторымен байланысады және оны басады». EMBO журналы. 18 (18): 5099–107. дои:10.1093 / emboj / 18.18.5099. PMC  1171580. PMID  10487761.
  14. ^ Lemercier C, Verdel A, Galloo B, Curtet S, Brocard MP, Khochbin S (мамыр 2000). «mHDA1 / HDAC5 гистон деацетилаза MEF2A транскрипциялық белсенділігімен әрекеттеседі және оларды басады» (PDF). Биологиялық химия журналы. 275 (20): 15594–9. дои:10.1074 / jbc.M908437199. PMID  10748098. S2CID  39220205.
  15. ^ Koipally J, Georgopoulos K (маусым 2002). «Ikaros-CtIP өзара әрекеттесуі C-терминалды байланыстыратын ақуызды қажет етпейді және деацетилазадан тәуелсіз репрессия режиміне қатысады». Биологиялық химия журналы. 277 (26): 23143–9. дои:10.1074 / jbc.M202079200. PMID  11959865.

Әрі қарай оқу

Сыртқы сілтемелер

Бұл мақалада Америка Құрама Штаттарының Ұлттық медицина кітапханасы, ол қоғамдық домен.