Аутофагиямен байланысты ақуыз 101 - Autophagy-related protein 101 - Wikipedia
Аутофагиямен байланысты ақуыз 101 ретінде белгілі ATG101 Бұл ақуыз адамдарда кодталған C12 немесе 44 ген (хромосома 12 ашық оқудың жақтауы 44).[5]
Аутофагия а қалыптастыру процесі болып табылады вакуоль лизосомаларда ыдырайтын белоктар мен нуклеин қышқылдарының айналасында. Транскрипцияланған мРНҚ C12orf44 реттілігі - 1287 базалық жұп, ал келесі аудармадан кейін - 218 аминқышқылдары ұзындығы бойынша. ATG101 ақуызы локализацияланған цитоплазма, сонымен бірге а деп аталатын құрылымға байланысты табуға болады фагофор, аутофагияға қатысады. Ген сүтқоректілер арасында өте жақсы сақталған, сонымен қатар эукариоттардың көпшілігінде консервацияны көрсетеді. Тікелей өзара әрекеттеседі деп ойлайды ATG13 ішінде ULK1 фагофорларды белсендіру үшін маңызды болуы мүмкін күрделі.
Функция
ATG101 - аутофагияға жауапты көптеген басқа ақуыздардың арасында жаңадан табылған аутофагияға байланысты маңызды ақуыз, бұл процесс эукариоттық организмдердің көпшілігінде жақсы сақталған. Алайда ATG101 басқа ATG ақуыздарының ешқайсысына гомолог емес. ATG101 маңызды аутофагия ақуызымен әрекеттеседі ATG13 сүтқоректілерде, бұл а ULK1 өзара әрекеттесетін ақуыз.[6] ULK1 (51-тәрізді киназа 1) сүтқоректілерде макроавтофагияны белсендіру үшін маңызды деп саналады. ATG101 ATG13-ті протеазомдық деградациядан қорғауға ұсынылған, сондықтан жасушаларда болатын ATG13 деңгейлерін тұрақтандырады және макроавтофагия деңгейлерін реттейді.[7] Жарияланған құжаттарға сәйкес, ATG101 фагофор деп те аталатын оқшаулау мембранасына локализацияланады. Фагофорға қосылу үшінші АА-да орналасқан пальмитоиляция орнын түсіндіруі мүмкін, бұл цистеин. Фагофорлар деградацияға ұшырайтын материалдарды тануға және оларды қоршауға жауапты лизосома, деградацияға ұшырайтын материалдарды толығымен қоршайтын мембрананы қалыптастыру арқылы.
Ақуыздардың қасиеттері
| Белгісіз DUF1649 функциясының ақуызы | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторлар | |||||||||
| Таңба | DUF1649 | ||||||||
| Pfam | PF07855 | ||||||||
| InterPro | IPR012445 | ||||||||
| |||||||||
ATG101 ақуызында DUF1649 домені бар (белгісіз функциясы 1649 домені).
ATG101 көптеген омыртқалы жануарлар арасында, оның ішінде тышқан сияқты жануарлармен өте сақталған, олардың адамдармен ортақ атасы 65 - 85 миллион жыл бұрын әр түрлі болды деп ойлаған. Бұл ATG101 функцияны сақтап қалу үшін құрылымдық жағынан консервацияланатындай етіп маңызды екендігінің дәлелі болуы мүмкін. Тек 2 рет SNPs ATG101 үшін ДНҚ тізбегінде белгілі, бұл ақуыздың басқа нұсқалары жоқ екенін көрсетіп, оның құрылымдық маңыздылығын да көрсетеді.
Бұл тұжырымдамалық аудармада үшінші аминқышқылындағы пальмитоиляция алаңын, сондай-ақ жақшалармен қоршалған фосфорлану учаскесін көруге болады. Аминқышқылдары мРНҚ-ның кодталу аймағының үстінде орналасқан, ол да бүйірлерінде нөмірленген. ATG101-де бұл ақуыз валинге бай.
Ген экспрессиясы
ATG101-ді нақты бір аймақта орнататын нақты деректер жоқ. Адамдарда да, тышқандарда да бірнеше экспрессия жиынтығын қарап, барлық жерде тіндерде көрінетін гипотеза жасалды.
Гендер маңы
- GRASP GRP1 (фосфоинозиттер үшін жалпы рецептор 1) - ассоциацияланған тіреуіш ақуызы[8] -
Төменде көрсетілгендей, C12orf44-пен бірдей тізбекте орналасқан, жалпыға бірдей белгісіз жалпы рецепторлық ақуыздың кодтары 8924 а.к.
- NR4A1 (ядролық рецепторлардың 4-отбасы, А тобы, 1-мүше) -
Бұл ген стероидты-тиреоидты гормон-ретиноидты рецептордың супфамилиясының мүшесі болып табылатын IB нервтік өсу факторын кодтайды. Экспрессия адамның лимфоциттеріндегі фитогемагглютининмен және қамауға алынған фибробласттардың сарысуымен ынталандыруымен туындайды. Кодталған ақуыз ядролық транскрипция факторы ретінде әрекет етеді. Ақуыздың ядродан митохондрияға ауысуы апоптозды қоздырады. Орналасқан жері C12orf44 сияқты, 8097 а.к.
- OR7E47P (иіс сезу рецепторы, 7-отбасы, субфамилия E, мүше 47 псевдоген) -
Иіс сезу рецепторлары иіс сезуді тудыратын нейрондық реакцияны бастау үшін мұрындағы одорант молекулаларымен өзара әрекеттеседі. Иіс сезу рецепторларының ақуыздары - бұл бір кодтау-экзон гендерінен туындайтын G-ақуыздармен байланысқан рецепторлардың (GPCR) үлкен отбасының мүшелері. Иіс сезу рецепторлары 7-трансмембраналық домен құрылымын көптеген нейротрансмиттерлермен және гормондар рецепторларымен бөліседі және одорантты сигналдардың танылуы мен G ақуыз арқылы трансдукциясы үшін жауап береді. Хромосомада C12orf44 кейін орналасқан, ол сол тізбекте жатыр және ұзындығы 946 а.к.
- KRT80 (кератин 80) -
Бұл ген эпителий кератинін кодтайды, ол тілде әлсіз өрнектелген. Ол C12orf44 қарама-қарсы тізбегінде орналасқан және ұзындығы 23 005 б.т.
Әдебиеттер тізімі
- ^ а б c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000123395 - Ансамбль, Мамыр 2017
- ^ а б c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000037204 - Ансамбль, Мамыр 2017
- ^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
- ^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
- ^ «Entrez Gene: хромосома 12 ашық оқудың жақтауы 44».
- ^ Mercer CA, Kaliappan A, Dennis PB (шілде 2009). «Адамның Atg13 байланыстыратын протеині Atg101 роман ULK1-мен әрекеттеседі және макроавтофагия үшін өте маңызды». Аутофагия. 5 (5): 649–62. дои:10.4161 / auto.5.5.8249. PMID 19287211.
- ^ Хосокава Н, Сасаки Т, Иемура С, Натсуме Т, Хара Т, Мизусима Н (қазан 2009). «Atg101, Atg13-пен әрекеттесетін жаңа сүтқоректілер аутофагиясының ақуызы». Аутофагия. 5 (7): 973–9. дои:10.4161 / auto.5.7.9296. PMID 19597335.
- ^ NM_001098673.1. NCBI анықтамалығы [Интернет]. Бетезда (MD): Ұлттық медицина кітапханасы (АҚШ), Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы; 2002 ж. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=Кітаптар
Сыртқы сілтемелер
- Адам ATG101 геномның орналасуы және ATG101 геннің егжей-тегжейлі беті UCSC Genome Browser.