APIP - APIP - Wikipedia

APIP
4m6r apip.png
Қол жетімді құрылымдар
PDBОртологиялық іздеу: PDBe RCSB
Идентификаторлар
Бүркеншік аттарAPIP, APIP2, CGI29, MMRP19, hCGI-29, APAF1 өзара әрекеттесетін ақуыз
Сыртқы жеке куәліктерOMIM: 612491 MGI: 1926788 HomoloGene: 6277 Ген-карталар: APIP
Геннің орналасуы (адам)
11-хромосома (адам)
Хр.11-хромосома (адам)[1]
11-хромосома (адам)
APIP үшін геномдық орналасу
APIP үшін геномдық орналасу
Топ11p13Бастау34,853,094 bp[1]
Соңы34,916,379 bp[1]
РНҚ экспрессиясы өрнек
PBB GE APIP 218698 at fs.png
Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Ортологтар
ТүрлерАдамТышқан
Энтрез

51074

56369

Ансамбль

ENSG00000149089

ENSMUSG00000010911

UniProt

Q96GX9

Q9WVQ5

RefSeq (mRNA)

NM_015957

NM_019735
NM_001355473
NM_001355474

RefSeq (ақуыз)

NP_057041

NP_062709
NP_001342402
NP_001342403

Орналасқан жері (UCSC)Хр 11: 34.85 - 34.92 МбХр 2: 103.07 - 103.09 Мб
PubMed іздеу[3][4]
Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеуТінтуірді қарау / өңдеу

APAF1-өзара әрекеттесетін ақуыз Бұл ақуыз адамдарда кодталған APIP ген.[5][6][7] Бұл фермент Меттитрибулоза 1-фосфатдегидратаза белсенділік[8][9] қатысатын метионин құтқару жолы.

APIP жетіспеушілігі байланысты жасуша өлімі[10] және қатерлі ісік.

Өзара әрекеттесу

APIP көрсетілді өзара әрекеттесу бірге APAF1.[6]

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ а б c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000149089 - Ансамбль, Мамыр 2017
  2. ^ а б c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000010911 - Ансамбль, Мамыр 2017
  3. ^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  4. ^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  5. ^ Lai CH, Chou CY, Chang LY, Liu CS, Lin W (тамыз 2000). «Ценорхабдита элегандарында эволюциялық жолмен сақталған адамның жаңа гендерін салыстырмалы протеомика әдісімен анықтау». Genome Res. 10 (5): 703–13. дои:10.1101 / гр.10.5.703. PMC  310876. PMID  10810093.
  6. ^ а б Cho DH, Hong YM, Lee HJ, Woo HN, Pyo JO, Mak TW, Jung YK (қыркүйек 2004). «Апап-1-өзара әрекеттесетін ақуыздың APIP, ишемиялық / гипоксиялық зақымданудың индукциялық ингибициясы». J Biol Chem. 279 (38): 39942–50. дои:10.1074 / jbc.M405747200. PMID  15262985.
  7. ^ «Entrez Gene: APIP APAF1 өзара әрекеттесетін ақуыз».
  8. ^ Мэри С, Дуек П, Саллерон Л, Тиенц П, Буманн Д, Байроч А, Лейн L (2012). Ди Кунто Ф (ред.) «APIP-ді адамның mtnB, метионинді құтқару жолындағы негізгі фермент ретінде функционалды анықтау». PLOS ONE. 7 (12): e52877. дои:10.1371 / journal.pone.0052877. PMC  3532061. PMID  23285211.
  9. ^ Кан, В; Хонг, С. Х .; Ли, Х.М .; Ким, Н .; Лим, Ю.С .; Ле Ле, Т.М .; Лим, Б; Ким, Х .; Ким, Т .; Ашида, Н; Йокота, А; Ха, С .; Чун, К.Х .; Юнг, Ю.К .; Янг, Дж. К. (2014). «Метионинді құтқару ферменті APIP, жасуша өлімін тежеудің құрылымдық және биохимиялық негіздері». Ұлттық ғылым академиясының материалдары. 111 (1): E54-61. дои:10.1073 / pnas.1308768111. PMC  3890807. PMID  24367089.
  10. ^ Ko DC, Gamazon ER, Shukla KP, Pfuetzner RA, Whittington D, Holden TD, Brittnacher MJ, Fong C, Radey M, Ogohara C, Stark AL, Akey JM, Dolan ME, Wurfel MM, Miller SI (2012). «Адамның алуан түрлілігінің функционалды генетикалық сценарийі метионинді құтқару ферменті қабыну жасушаларының өлімін реттейтіндігін анықтайды». Ұлттық ғылым академиясының материалдары. 109 (35): E2343-E2352. дои:10.1073 / pnas.1206701109. PMC  3435171. PMID  22837397.

Сыртқы сілтемелер

Әрі қарай оқу

  • Кимура К, Вакамацу А, Сузуки Ю, Ота Т, Нишикава Т, Ямашита Р, Ямамото Дж, Секине М, Цуритани К, Вакагури Х, Ишии С, Сугияма Т, Сайто К, Исоно Ю, Ири Р, Кушида Н, Йонеяма Т , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (2006) . «Транскрипциялық модуляцияны әртараптандыру: ауқымды идентификация және адам гендерінің болжамды альтернативті промоторларының сипаттамасы». Genome Res. 16 (1): 55–65. дои:10.1101 / гр.4039406. PMC  1356129. PMID  16344560.
  • Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Смоляр А, Босак С, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill Hill, Roth FP, Vidal M (2005). «Адамның протеин-протеинмен өзара әрекеттесу желісінің протеома-масштабты картасына қарай». Табиғат. 437 (7062): 1173–8. дои:10.1038 / табиғат04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
  • Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, Angrand PO, Bergamini G, Croughton K, Cruciat C, Eberhard D, Gagneur J, Ghidelli S, Hopf C, Huhse B, Mangano R, Michon AM, Schirle M, Schlegl J, Schwab M , Stein MA, Bauer A, Casari G, Drewes G, Gavin AC, Jackson DB, Jobery G, Neubauer G, Rick J, Kuster B, Superti-Furga G (2004). «Адамның TNF-альфа / NF-kappa B сигналын беру жолының физикалық-функционалдық картасы». Нат. Жасуша Биол. 6 (2): 97–105. дои:10.1038 / ncb1086. PMID  14743216. S2CID  11683986.
  • Сузуки Ю, Йошитомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (1997). «Толық көлемде байытылған және 5-деңгеймен байытылған cDNA кітапханасының құрылысы және сипаттамасы». Джин. 200 (1–2): 149–56. дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
  • Маруяма К, Сугано С (1994). «Олиго-жабу: эукариоттық мРНҚ-ның қақпақ құрылымын олигорибонуклеотидтермен ауыстырудың қарапайым әдісі». Джин. 138 (1–2): 171–4. дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.