Цвиттермицин А. - Zwittermicin A

Цвиттермицин А.
Атаулар
	IUPAC атауы 4,8-диамин-N- [1-амин-3- (карбамойламино) -1-оксопропан-2-ыл] -2,3,5,7,9-пентагидроксинонанамид
Идентификаторлар
CAS нөмірі	155547-95-8 ;
3D моделі (JSmol )	Интерактивті сурет;
Чеби	Чеби: 80056;
ЧЕМБЛ	ChEMBL1093072 ;
ChemSpider	24669086 ;
KEGG	C15726;
PubChem CID	44474866;
	InChI InChI = 1S / C13H28N6O8 / c14-4 (3-20) 6 (21) 1-7 (22) 8 (15) 9 (23) 10 (24) 12 (26) 19-5 (11 (16) 25) 2-18-13 (17) 27 / h4-10,20-24H, 1-3,14-15H2, (H2,16,25) (H, 19,26) (H3,17,18,27) / t4-, 5-, 6 +, 7 +, 8 +, 9 +, 10- / m0 / s1 Кілт: FYIPKJHNWFVEIR-VTAUKWRXSA-N ; InChI = 1 / C13H28N6O8 / c14-4 (3-20) 6 (21) 1-7 (22) 8 (15) 9 (23) 10 (24) 12 (26) 19-5 (11 (16) 25) 2-18-13 (17) 27 / h4-10,20-24H, 1-3,14-15H2, (H2,16,25) (H, 19,26) (H3,17,18,27) / t4-, 5-, 6 +, 7 +, 8 +, 9 +, 10- / m0 / s1 Кілт: FYIPKJHNWFVEIR-VTAUKWRXBI;
	КҮЛМІЗ C ([C @ H] ([C @ H] (CO) N) O) [C @ H] ([C @ H] ([C @ H] ([C @@ H] (C (= O) ” N [C @@ H] (CNC (= O) N) C (= O) N) O) O) N) O;
Қасиеттері
Химиялық формула	C13H28N6O8
Молярлық масса	396.396820
	Өзгеше белгіленбеген жағдайларды қоспағанда, олар үшін материалдар үшін деректер келтірілген стандартты күй (25 ° C [77 ° F], 100 кПа).
	тексеру (бұл не ?)
	Infobox сілтемелері

Цвиттермицин А. бактериядан анықталған антибиотик болып табылады Bacillus cereus UW85.^[1] Бұл ауылшаруашылық индустриясына қызығушылық тудыратын молекула, өйткені оның белгілі бір грам оң және грам теріс әсеріне байланысты спектрі кең болғандықтан, өсімдік ауруларын басу мүмкіндігі бар. прокариоттық микроорганизмдер. Молекула метаболизм тұрғысынан да қызықтырады, өйткені ол антибиотиктің жаңа құрылымдық класын білдіреді және кроссоверді ұсынады поликетид және рибосомалық емес пептидті биосинтетикалық жолдар. Цвиттермицин - сызықтық аминополол.^[2]

Биосинтез

Цвиттермицин А. биосинтез поликетидтің және рибосомалық емес пептидті синтетикалық жолдардың буданы. Мүмкін, барлық синтазалар бір типтегі май қышқылының синтазы сияқты бір мегасинтазада орналасқан. Мутантты зерттеулер негізінде цвиттермицин өндірісіне қатысатын биосинтетикалық кластер анықталды және жол ұсынылды. The гендер цвиттермицин А өндірісіне жауап беретін құрамында тоғыз орф және змаR, a өзіне төзімді ген бар 16 кб кластерде орналасқан ген ан кодтайтын ацилдеу фермент цвиттермицинді ажырататын^[3] Гибрид синтаза цвиттермицинде қолданылатын А өндірісінде гидроксималонил-ACP, аминомалонил-ACP және модификацияланған ұзартқыш қондырғылар қолданылады 2,3-диаминопропионат. Сондықтан биосинтетикалық кластердегі көптеген гендер кодталады ферменттер гибридті синтазада қолданылатын осы экстендерлік қондырғылардың синтезіне жауап береді. Мысалы, orf5 LW-серинді 2,3-диаминопропионатқа айналдыратын PLP-дің аминациясына жауап беретін фермент ZWA5A-ны кодтайды. Orf5, orf7, orf4 және orf6 аминомалонил-ACP және orf3, orf2 және orf1 биосинтезіне қатысып, гидроксималонил-ACP синтездейтіні көрсетілген.^[4]

Zwittermicin A өндірісінде қолданылатын қондырғылар

L-2,3 Диаминопропионаттың биосинтезі

Zwittermicin A биосинтетикалық кластерінің гендік ұйымы.

Магистральды құрастыруға жауапты жеті компонентті гибридті синтазаны кодтайтын гендер ең үлкен генде немесе orf8 орналасқан болуы мүмкін. Жинау серинді қалдықтың активтенуінен басталады. Бұл аминқышқылын рибосомалық емес пептидті синтетаза арқылы пептидтік тасымалдаушы ақуызға байлау арқылы жасалады. Кейіннен ацил тасымалдаушы ақуызға кетосинтаза арқылы ковалентті бекітілген активтендірілген малонил қондырғысының созылуы бес көміртегі бірлігін береді. Келесі екі созылу сатысы екінші және үшінші кетосинтазадан аминомалонил және гидроксималонил қондырғыларын қолдану арқылы жалғасады. Соңында, 2,3-диаминопропионаттың тасымалданған молекуламен екінші ренибосомальпептидті синтаза арқылы конденсациясы цвиттермицин А түзеді. Амидотрансфераза ферменті арқылы аммиактың шабуылы тасымалдаушы ақуызды шығарады. Соңғы сатыға карбомилтрансфераза ферменті кіреді, ол босатылған молекуланы соңғы өнімге жеткізеді.^[5]

Цвиттермицин А биосинтезі

Сілтемелер

^ Хаййин, Ол (сәуір, 1994) «Цвиттермицин, саңырауқұлаққа қарсы және өсімдіктерді Bacillus церусынан қорғауға арналған агент», тетраэдрон хаттары 35 (16) 2499-2502 дои = 10.1016 / S0040-4039 (00) 77154-1
^ Роджерс Э.В., Молинский Т.Ф. (ақпан 2007). «Диастереомерлік диаминогептанететраолдардың асимметриялық синтезі. (+) - zwittermicin а конфигурациясы бойынша ұсыныс». Org. Летт. 9 (3): 437–40. дои:10.1021 / ol062804a. PMC 2729442. PMID 17249781.
^ Stohl EA, Milner JL, Handelsman J (қыркүйек 1999). «Zwittermicin биосинтетикалық кластері». Джин. 237 (2): 403–11. дои:10.1016 / S0378-1119 (99) 00315-7. PMID 10521664.
^ Чжао С, Луо Ю, Сонг С және т.б. (Сәуір 2007). «Bacillus thuringiensis subsp. Kurstaki штаммынан алынған Zwittermicin A биосинтезіне байланысты үш генді анықтау. YBT-1520». Арка. Микробиол. 187 (4): 313–9. дои:10.1007 / s00203-006-0196-3. PMID 17225146. S2CID 24773281.
^ Эммерт Е.А., Климович А.К., Томас М.Г., Handelsman J (қаңтар 2004). «Цвиттермициннің генетикасы, Bacillus cereus өндірісі». Қолдану. Environ. Микробиол. 70 (1): 104–13. дои:10.1128 / AEM.70.1.104-113.2004. PMC 321298. PMID 14711631.

[Zwittermicin-1] Хаййин, Ол (сәуір, 1994) «Цвиттермицин, саңырауқұлаққа қарсы және өсімдіктерді Bacillus церусынан қорғауға арналған агент», тетраэдрон хаттары 35 (16) 2499-2502 дои = 10.1016 / S0040-4039 (00) 77154-1

[Synthesis-2] Роджерс Э.В., Молинский Т.Ф. (ақпан 2007). «Диастереомерлік диаминогептанететраолдардың асимметриялық синтезі. (+) - zwittermicin а конфигурациясы бойынша ұсыныс». Org. Летт. 9 (3): 437–40. дои:10.1021 / ol062804a. PMC 2729442. PMID 17249781.

[Cluster-3] Stohl EA, Milner JL, Handelsman J (қыркүйек 1999). «Zwittermicin биосинтетикалық кластері». Джин. 237 (2): 403–11. дои:10.1016 / S0378-1119 (99) 00315-7. PMID 10521664.

[Related_Genes-4] Чжао С, Луо Ю, Сонг С және т.б. (Сәуір 2007). «Bacillus thuringiensis subsp. Kurstaki штаммынан алынған Zwittermicin A биосинтезіне байланысты үш генді анықтау. YBT-1520». Арка. Микробиол. 187 (4): 313–9. дои:10.1007 / s00203-006-0196-3. PMID 17225146. S2CID 24773281.

[Genetics-5] Эммерт Е.А., Климович А.К., Томас М.Г., Handelsman J (қаңтар 2004). «Цвиттермициннің генетикасы, Bacillus cereus өндірісі». Қолдану. Environ. Микробиол. 70 (1): 104–13. дои:10.1128 / AEM.70.1.104-113.2004. PMC 321298. PMID 14711631.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

Атаулар

IUPAC атауы 4,8-диамин-N- [1-амин-3- (карбамойламино) -1-оксопропан-2-ыл] -2,3,5,7,9-пентагидроксинонанамид
Идентификаторлар
CAS нөмірі	155547-95-8^Y
3D моделі (JSmol )	Интерактивті сурет
Чеби	Чеби: 80056
ЧЕМБЛ	ChEMBL1093072^N
ChemSpider	24669086^N
KEGG	C15726
PubChem CID	44474866
InChI InChI = 1S / C13H28N6O8 / c14-4 (3-20) 6 (21) 1-7 (22) 8 (15) 9 (23) 10 (24) 12 (26) 19-5 (11 (16) 25) 2-18-13 (17) 27 / h4-10,20-24H, 1-3,14-15H2, (H2,16,25) (H, 19,26) (H3,17,18,27) / t4-, 5-, 6 +, 7 +, 8 +, 9 +, 10- / m0 / s1^N Кілт: FYIPKJHNWFVEIR-VTAUKWRXSA-N^N InChI = 1 / C13H28N6O8 / c14-4 (3-20) 6 (21) 1-7 (22) 8 (15) 9 (23) 10 (24) 12 (26) 19-5 (11 (16) 25) 2-18-13 (17) 27 / h4-10,20-24H, 1-3,14-15H2, (H2,16,25) (H, 19,26) (H3,17,18,27) / t4-, 5-, 6 +, 7 +, 8 +, 9 +, 10- / m0 / s1 Кілт: FYIPKJHNWFVEIR-VTAUKWRXBI
КҮЛМІЗ C ([C @ H] ([C @ H] (CO) N) O) [C @ H] ([C @ H] ([C @ H] ([C @@ H] (C (= O) ” N [C @@ H] (CNC (= O) N) C (= O) N) O) O) N) O
Қасиеттері
Химиялық формула	C₁₃H₂₈N₆O₈
Молярлық масса	396.396820
Өзгеше белгіленбеген жағдайларды қоспағанда, олар үшін материалдар үшін деректер келтірілген стандартты күй (25 ° C [77 ° F], 100 кПа).
N тексеру (бұл не ^YN ?)
Infobox сілтемелері