Кит-1 РНҚ мотиві - Whalefall-1 RNA motif

Кит-1 РНҚ мотиві
Whalefall-1-RNA.svg
Whalefall-1 РНҚ-ның екінші құрылымы
Идентификаторлар
Таңбаwf-1
РфамRF01762
Басқа деректер
РНҚ түрісРНҚ
Домен (дер)Киттер метагеномға түседі
PDB құрылымдарPDBe

The Кит-1 РНҚ мотиві (деп те аталады wf-1) консервіленгендерге қатысты РНҚ көмегімен ашылған құрылым биоинформатика.[1][2] Құрылымдық жағынан мотив екіден тұрады сабақтар (диаграмманы қараңыз), оның екіншісін көбінесе CUUG тоқтатады тетралооп, бұл энергетикалық тұрғыдан қолайлы РНҚ тізбегі. Whalefall-1 РНҚ тек қана кездеседі ДНҚ өңделмеген жерден алынған бактериялар табылды кит құлау, яғни, а кит қаңқа. 2010 жылдан бастап Whalefall-1 РНҚ-лары бактериялардың белгілі, мәдени түрлерінде анықталған жоқ, демек, бірнеше бактериялардың бірі болып табылады Қоршаған орта сынамаларында болатын РНҚ.

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ Weinberg Z, Wang JX, Bogue J және т.б. (Наурыз 2010). «Салыстырмалы геномика бактериялардан, архейлерден және олардың метагеномаларынан 104 үміткер құрылымдалған РНҚ анықтайды». Геном Биол. 11 (3): R31. дои:10.1186 / gb-2010-11-3-r31. PMC  2864571. PMID  20230605.
  2. ^ Weinberg Z, Perreault J, Meyer MM, Breaker RR (желтоқсан 2009). «Бактериалды метагеномды талдау арқылы анықталған ерекше құрылымдалған кодталмаған РНҚ». Табиғат. 462 (7273): 656–9. дои:10.1038 / табиғат08586. PMC  4140389. PMID  19956260.

Сыртқы сілтемелер