TOP3A - TOP3A

TOP3A
Қол жетімді құрылымдар
PDB	Ортологиялық іздеу: PDBe RCSB
PDB идентификатор кодтарының тізімі
	4CGY, 4CHT
Идентификаторлар
Бүркеншік аттар	TOP3A, TOP3, ZGRF7, топоизомераза (ДНҚ) III альфа, ДНҚ топоизомераза III альфа, PEOB5, MGRISCE2
Сыртқы жеке куәліктер	OMIM: 601243 MGI: 1197527 HomoloGene: 3394 Ген-карталар: TOP3A
Геннің орналасуы (адам)
Хр.	17-хромосома (адам)
Соңы	18,315,007 bp
Геннің орналасуы (тышқан)
Хр.	11-хромосома (тышқан)
Соңы	60,777,365 bp
РНҚ экспрессиясы өрнек
	; ;
	Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Гендік онтология
Молекулалық функция	• І типті ДНҚ топоизомеразасы; • ДНҚ байланыстыру; • мырыш ионымен байланыстыру; • GO: 0001948 ақуыздармен байланысуы; • изомераза белсенділігі; • металл ионымен байланыстыру; • ДНҚ топоизомеразасының белсенділігі; • бір тізбекті ДНҚ байланысы; • нуклеин қышқылымен байланысуы;
Ұялы компонент	• PML денесі; • нуклеоплазма; • хромосома; • жасуша ядросы; • митохондрия; • митохондриялық матрица;
Биологиялық процесс	• ДНҚ репликациясы; • ДНҚ топологиялық өзгерісі; • GO: 0007126 мейоздық жасушалық цикл; • митохондриялық ДНҚ метаболизм процесі; • хромосомалардың бөлінуі; • p53 класс медиаторының сигнал беруін реттеу;
	Дереккөздер:Амиго / QuickGO
Ортологтар
	7156
	21975
	ENSG00000284238; ENSG00000177302
	ENSMUSG00000002814
	Q13472
	O70157
	NM_004618; NM_001320759
	NM_009410
	NP_001307688; NP_004609
	NP_033436
	Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеу	Тінтуірді қарау / өңдеу

ДНҚ топоизомеразы 3-альфа болып табылады фермент адамдарда кодталған TOP3A ген.^[5]^[6]

Функция

Бұл ген транскрипция кезінде ДНҚ-ның топологиялық күйін басқаратын және өзгертетін фермент - ДНҚ топоизомеразасын кодтайды. Бұл фермент ДНҚ-ның бір тізбегінің уақытша үзілуін және қайта қосылуын катализдейді, бұл жіптердің бір-бірінен өтуіне мүмкіндік береді, осылайша супер катушкалар саны азаяды және ДНҚ топологиясы өзгереді. Бұл фермент соматикалық жасушалардағы рекомбинацияны реттейтін BLM бар кешен құрайды.^[6]

Мейоз

Мейоздық рекомбинацияның қолданыстағы моделі, екі тізбекті үзілістен немесе саңылаудан басталады, содан кейін гомологты хромосомамен жұптасады және рекомбинациялық жөндеу процесін бастау үшін тізбектің инвазиясы. Саңылауды қалпына келтіру бүйірлік аймақтардың кроссоверіне (СО) немесе кроссоверге (NCO) әкелуі мүмкін. CO рекомбинациясы жоғарыда оң жағында бейнеленген Double Holliday Junction (DHJ) моделі арқылы жүреді деп болжануда. ККО рекомбинанттары, ең алдымен, сол жақта бейнеленген, синтезге тәуелді тізбекті жасыту (SDSA) моделі арқылы пайда болады деп ойлайды. Рекомбинациялық оқиғалардың көпшілігі SDSA типті болып көрінеді.

Рекомбинация кезінде мейоз көбінесе ДНҚ-ның екі тізбекті үзілісі (DSB) арқылы басталады. Рекомбинация кезінде үзілістің 5 'ұштарындағы ДНҚ бөлімдері деп аталатын процесте кесіледі резекция. Ішінде бұрымды басып кіру одан кейінгі қадам, сынған ДНҚ молекуласының 3 'ұшынан асып кетуі, ығысу контурын құрайтын гомологты хромосоманың ДНҚ-сына «еніп» кетеді (D-цикл ). Жіңішке шабуылдан кейін оқиғалардың келесі реттілігі кроссоверге (СО) немесе кроссоверге (NCO) рекомбинантқа апаратын екі негізгі жолдың екеуі бойынша жүруі мүмкін (қараңыз) Генетикалық рекомбинация және суретті қараңыз). КЕҰ-ға апаратын жол деп аталады Синтезге байланысты тізбекті күйдіру (SDSA).

Зауытта Arabidopsis thaliana, көптеген механизмдер мейоздық СО шектейді.^[7] Мейоз кезінде TOP3A және RECQ4A / B геликазасы FANCM геликазасына параллель CO түзілуін антагонизациялайды.^[7] Секвела-Арно және басқалар.^[7] СО-ны рекомбинациялаудың ұзақ мерзімді шығындарына, яғни аллельдердің бұрынғы генетикалық комбинацияларының ыдырауына байланысты шектеулер бар деп санайды табиғи сұрыптау.

Жаңадан ашытқыда Saccharomyces cerevisiae, топоизомераза III (TOP3) -RMI1 гетеродимер (ДНҚ-ның бір тізбекті өтуін катализдейді) консервіленген кешен құрайды Sgs1 геликаза (ан.) ортолог адамның Блум синдромы геликаза ). Бұл кешен мейоз кезінде КЕҰ рекомбинанттарының ерте пайда болуына ықпал етеді^[8] TOP3-RMI1 тізбегінің өту белсенділігі мейоз кезінде екі маңызды функцияға ие сияқты.^[8] Біріншіден, бұрандалы өту қызметі ерте келісілген түрде қолданылады Sgs1 рекомбинациялық жолды дұрыс таңдауға ықпал ету үшін геликаза. Екіншіден, тізбекті өту әрекеті кейінірек, Sgs1 геликазасынан тәуелсіз, рекомбинациялық аралықтарда шешілмейтін жіпшеліктердің сақталуын болдырмау үшін қолданылады.

Өзара әрекеттесу

TOP3A көрсетілген өзара әрекеттесу бірге Блум синдромының ақуызы.^[9]^[10]^[11]^[12]

Әдебиеттер тізімі

^ ^а ^б ^c ENSG00000177302 GRCh38: Ансамбль шығарылымы 89: ENSG00000284238, ENSG00000177302 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000002814 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ Elsea SH, Fritz E, Schoener-Scott R, Meyn MS, Patel PI (қаңтар 1998). «Смит-Магенис синдромының критикалық аймағындағы топоизомераза III карталарының гені: жасушалық циклдің таралуы мен сәулеленуге сезімталдығы». Американдық медициналық генетика журналы. 75 (1): 104–8. дои:10.1002 / (SICI) 1096-8628 (19980106) 75: 1 <104 :: AID-AJMG21> 3.0.CO; 2-P. PMID 9450867.
^ ^а ^б «Entrez Gene: TOP3A топоизомераза (ДНҚ) III альфа».
^ ^а ^б ^c Séguéla-Arnaud M, Crismani W, Larchevêque C, Mazel J, Froger N, Choinard S, Lemhemdi A, Macaisne N, Van Leene J, Gevaert K, De Jaeger G, Chelysheva L, Mercier R (сәуір 2015). «Көптеген механизмдер мейоздық кроссоверлерді шектейді: TOP3α және екі BLM гомологтары FANCM-ге параллель кроссинговерлерді антагонизациялайды». Америка Құрама Штаттарының Ұлттық Ғылым Академиясының еңбектері. 112 (15): 4713–8. дои:10.1073 / pnas.1423107112. PMC 4403193. PMID 25825745.
^ ^а ^б Kaur H, De Muyt A, Lichten M (ақпан 2015). «Top3-Rmi1 ДНҚ бір тізбекті декатеназасы мейоздық рекомбинациялық аралық заттардың түзілуі мен ажыратылуының ажырамас бөлігі болып табылады». Молекулалық жасуша. 57 (4): 583–94. дои:10.1016 / j.molcel.2015.01.020. PMC 4338413. PMID 25699707.
^ Ву Л, Дэвис С.Л., Солтүстік П.С., Гулауик Х, Риу Дж.Ф., Турли Х, Гаттер К.С., Хиксон ID (наурыз 2000). «Блум синдромының ген өнімі топоизомераз III-мен әрекеттеседі». Биологиялық химия журналы. 275 (13): 9636–44. дои:10.1074 / jbc.275.13.9636. PMID 10734115.
^ Freire R, d'Adda Di Fagagna F, Wu L, Pedrazzi G, Stagljar I, Hickson ID, Jackson SP (тамыз 2001). «Каспаза-3 арқылы апоптоз кезінде Блум синдромы генінің өнімін бөлшектеу топоизомераза IIIалфамен өзара әрекеттесудің бұзылуына әкеледі». Нуклеин қышқылдарын зерттеу. 29 (15): 3172–80. дои:10.1093 / нар / 29.15.3172. PMC 55826. PMID 11470874.
^ Ху П, Берестен С.Ф., ван Брабант АЖ, Е. Т.З., Пандолфи П.П., Джонсон Ф.Б., Гуаренте Л, Эллис Н.А. (маусым 2001). «Геномдық тұрақтылықта BLM және Топоизомераза IIIалфаның өзара әрекеттесуінің дәлелі». Адам молекулалық генетикасы. 10 (12): 1287–98. дои:10.1093 / хмг / 10.12.1287. PMID 11406610.
^ Brosh RM, Li JL, Kenny MK, Karow JK, Cooper MP, Kureekattil RP, Hickson ID, Bohr VA (тамыз 2000). «Репликация ақуызы Блум синдромы ақуызымен физикалық өзара әрекеттеседі және оның хеликаза белсенділігін ынталандырады». Биологиялық химия журналы. 275 (31): 23500–8. дои:10.1074 / jbc.M001557200. PMID 10825162.

Әрі қарай оқу

Hanai R, Caron PR, Wang JC (сәуір 1996). «Адамның TOP3: топоизомераза III ДНҚ-ны кодтайтын бір даналы ген». Америка Құрама Штаттарының Ұлттық Ғылым Академиясының еңбектері. 93 (8): 3653–7. дои:10.1073 / pnas.93.8.3653. PMC 39666. PMID 8622991.
Fritz E, Elsea SH, Patel PI, Meyn MS (сәуір 1997). «Адамның қиылған топоизомеразасы III-нің артық экспрессиясы атаксия-телангиэктазия фенотипінің көптеген аспектілерін ішінара түзетеді». Америка Құрама Штаттарының Ұлттық Ғылым Академиясының еңбектері. 94 (9): 4538–42. дои:10.1073 / pnas.94.9.4538. PMC 20758. PMID 9114025.
Kim JC, Yoon JB, Koo HS, Chung IK (қазан 1998). «Адамның топоизомеразы III геніне клондау және 5'-бүйірлік аймақты сипаттау». Биологиялық химия журналы. 273 (40): 26130–7. дои:10.1074 / jbc.273.40.26130. PMID 9748294.
Голуик Х, Рулон Т, Фламанд О, Грондард Л, Лавель Ф, Рио ДжФ (маусым 1999). «Адамның топоизомераза IIIалфасының ДНҚ-ны тазарту және сипаттамасы». Нуклеин қышқылдарын зерттеу. 27 (12): 2443–50. дои:10.1093 / нар / 27.12.2443. PMC 148446. PMID 10352172.
Шимамото А, Нишикава К, Китао С, Фуручи Ю (сәуір 2000). «Адамның RecQ5beta, RecQ5 ДНҚ-геликазаның үлкен изомері, нуклеоплазмада локализацияланып, 3alpha және 3beta топоизомеразаларымен әрекеттеседі». Нуклеин қышқылдарын зерттеу. 28 (7): 1647–55. дои:10.1093 / nar / 28.7.1647. PMC 102787. PMID 10710432.
Ву Л, Дэвис С.Л., Солтүстік П.С., Гулауик Х, Риу Дж.Ф., Турли Х, Гаттер К.С., Хиксон ID (наурыз 2000). «Блум синдромының ген өнімі топоизомераз III-мен әрекеттеседі». Биологиялық химия журналы. 275 (13): 9636–44. дои:10.1074 / jbc.275.13.9636. PMID 10734115.
Lin CW, Darzynkiewicz Z, Li X, Traganos F, Bedner E, Tse-Dinh YC (сәуір 2000). «HL-60 лейкемия жасушаларында және адамның перифериялық қан лимфоциттерінде жасушалық цикл прогрессиясы кезінде адамның топоизомераза IIIалфасының дифференциалды көрінісі». Эксперименттік жасушаларды зерттеу. 256 (1): 225–36. дои:10.1006 / экср.1999.4778. PMID 10739669.
Brosh RM, Li JL, Kenny MK, Karow JK, Cooper MP, Kureekattil RP, Hickson ID, Bohr VA (тамыз 2000). «Репликация ақуызы Блум синдромы ақуызымен физикалық өзара әрекеттеседі және оның хеликаза белсенділігін ынталандырады». Биологиялық химия журналы. 275 (31): 23500–8. дои:10.1074 / jbc.M001557200. PMID 10825162.
Лодж AJ, Андерсон JJ, Ng SW, Фенвик F, Стюард M, Хаугк B, Хорне CH, Ангус B (тамыз 2000). «Жаңа моноклональды антиденені қолдану арқылы иммуногистохимиямен анықталған қалыпты және неопластикалық тіндерде топоизомераза IIIалфаның экспрессиясы». Британдық қатерлі ісік журналы. 83 (4): 498–505. дои:10.1054 / bjoc.2000.1293. PMC 2374664. PMID 10945498.
Ху П, Берестен С.Ф., ван Брабант АЖ, Е. Т.З., Пандолфи П.П., Джонсон Ф.Б., Гуаренте Л, Эллис Н.А. (маусым 2001). «Геномдық тұрақтылықта BLM және Топоизомераза IIIалфаның өзара әрекеттесуінің дәлелі». Адам молекулалық генетикасы. 10 (12): 1287–98. дои:10.1093 / хмг / 10.12.1287. PMID 11406610.
Freire R, d'Adda Di Fagagna F, Wu L, Pedrazzi G, Stagljar I, Hickson ID, Jackson SP (тамыз 2001). «Каспаза-3 арқылы апоптоз кезінде Блум синдромы генінің өнімін бөлшектеу топоизомераза IIIалфамен өзара әрекеттесудің бұзылуына әкеледі». Нуклеин қышқылдарын зерттеу. 29 (15): 3172–80. дои:10.1093 / нар / 29.15.3172. PMC 55826. PMID 11470874.
Bi W, Yan J, Stankiewicz P, Park SS, Walz K, Boerkoel CF, Potocki L, Shaffer LG, Devriendt K, Nowaczyk MJ, Inoue K, Lupski JR (мамыр 2002). «Тазартылған Смит-Магенис синдромындағы гендер, 17p11.2 хромосомасында және тінтуірдің синтетикалық аймағында критикалық жою интервалы». Геномды зерттеу. 12 (5): 713–28. дои:10.1101 / гр.73702. PMC 186594. PMID 11997338.
Ван Ю, Лю Ю.Л., Ванг Дж.К. (2002 ж. Қыркүйек). «Митохондрия мен ядроға адамның топоизомераза IIIалфасының ДНҚ-ның қосарланған локализациясы». Америка Құрама Штаттарының Ұлттық Ғылым Академиясының еңбектері. 99 (19): 12114–9. дои:10.1073 / pnas.192449499. PMC 129407. PMID 12209014.
У Л, Хиксон ИД (қараша 2002). «Блум синдромының геликазасы адамның IIIoлфа топоизомеразасының белсенділігін ынталандырады». Нуклеин қышқылдарын зерттеу. 30 (22): 4823–9. дои:10.1093 / nar / gkf611. PMC 137159. PMID 12433984.
Meetei AR, de Winter JP, Medhurst AL, Wallisch M, Waisfisz Q, van de Vrugt HJ, Oostra AB, Yan Z, Ling C, Епископ CE, Хоатлин ME, Joenje H, Wang W (қазан 2003). «Убиквитин лигасының жаңа романында Фанкони анемиясы жетіспейді». Табиғат генетикасы. 35 (2): 165–70. дои:10.1038 / ng1241. PMID 12973351. S2CID 10149290.
Jiao R, Bachrati CZ, Pedrazzi G, Kuster P, Petkovic M, Li JL, Egli D, Hickson ID, Stagljar I (маусым 2004). «Блум синдромы генінің өнімі мен хроматинді жинаудың 1-факторының ең үлкен суббірлігі арасындағы физикалық және функционалды өзара әрекеттесу». Молекулалық және жасушалық биология. 24 (11): 4710–9. дои:10.1128 / MCB.24.11.4710-4719.2004. PMC 416397. PMID 15143166.
Yin J, Sobeck A, Xu C, Meetei AR, Hoatlin M, Li L, Wang W (сәуір 2005). «BLAP75, геномның тұтастығын сақтайтын Блум синдромының ақуыз кешендерінің маңызды компоненті». EMBO журналы. 24 (7): 1465–76. дои:10.1038 / sj.emboj.7600622. PMC 1142546. PMID 15775963.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ENSG00000177302 GRCh38: Ансамбль шығарылымы 89: ENSG00000284238, ENSG00000177302 - Ансамбль, Мамыр 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000002814 - Ансамбль, Мамыр 2017

[3] «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[4] «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[pmid9450867-5] Elsea SH, Fritz E, Schoener-Scott R, Meyn MS, Patel PI (қаңтар 1998). «Смит-Магенис синдромының критикалық аймағындағы топоизомераза III карталарының гені: жасушалық циклдің таралуы мен сәулеленуге сезімталдығы». Американдық медициналық генетика журналы. 75 (1): 104–8. дои:10.1002 / (SICI) 1096-8628 (19980106) 75: 1 <104 :: AID-AJMG21> 3.0.CO; 2-P. PMID 9450867.

[entrez-6] а ^б «Entrez Gene: TOP3A топоизомераза (ДНҚ) III альфа».

[Arnaud-7] а ^б ^c Séguéla-Arnaud M, Crismani W, Larchevêque C, Mazel J, Froger N, Choinard S, Lemhemdi A, Macaisne N, Van Leene J, Gevaert K, De Jaeger G, Chelysheva L, Mercier R (сәуір 2015). «Көптеген механизмдер мейоздық кроссоверлерді шектейді: TOP3α және екі BLM гомологтары FANCM-ге параллель кроссинговерлерді антагонизациялайды». Америка Құрама Штаттарының Ұлттық Ғылым Академиясының еңбектері. 112 (15): 4713–8. дои:10.1073 / pnas.1423107112. PMC 4403193. PMID 25825745.

[Kaur-8] а ^б Kaur H, De Muyt A, Lichten M (ақпан 2015). «Top3-Rmi1 ДНҚ бір тізбекті декатеназасы мейоздық рекомбинациялық аралық заттардың түзілуі мен ажыратылуының ажырамас бөлігі болып табылады». Молекулалық жасуша. 57 (4): 583–94. дои:10.1016 / j.molcel.2015.01.020. PMC 4338413. PMID 25699707.

[pmid10734115-9] Ву Л, Дэвис С.Л., Солтүстік П.С., Гулауик Х, Риу Дж.Ф., Турли Х, Гаттер К.С., Хиксон ID (наурыз 2000). «Блум синдромының ген өнімі топоизомераз III-мен әрекеттеседі». Биологиялық химия журналы. 275 (13): 9636–44. дои:10.1074 / jbc.275.13.9636. PMID 10734115.

[pmid11470874-10] Freire R, d'Adda Di Fagagna F, Wu L, Pedrazzi G, Stagljar I, Hickson ID, Jackson SP (тамыз 2001). «Каспаза-3 арқылы апоптоз кезінде Блум синдромы генінің өнімін бөлшектеу топоизомераза IIIалфамен өзара әрекеттесудің бұзылуына әкеледі». Нуклеин қышқылдарын зерттеу. 29 (15): 3172–80. дои:10.1093 / нар / 29.15.3172. PMC 55826. PMID 11470874.

[pmid11406610-11] Ху П, Берестен С.Ф., ван Брабант АЖ, Е. Т.З., Пандолфи П.П., Джонсон Ф.Б., Гуаренте Л, Эллис Н.А. (маусым 2001). «Геномдық тұрақтылықта BLM және Топоизомераза IIIалфаның өзара әрекеттесуінің дәлелі». Адам молекулалық генетикасы. 10 (12): 1287–98. дои:10.1093 / хмг / 10.12.1287. PMID 11406610.

[pmid10825162-12] Brosh RM, Li JL, Kenny MK, Karow JK, Cooper MP, Kureekattil RP, Hickson ID, Bohr VA (тамыз 2000). «Репликация ақуызы Блум синдромы ақуызымен физикалық өзара әрекеттеседі және оның хеликаза белсенділігін ынталандырады». Биологиялық химия журналы. 275 (31): 23500–8. дои:10.1074 / jbc.M001557200. PMID 10825162.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]