TIMP1 - TIMP1 - Wikipedia

TIMP1
Ақуыз TIMP1 PDB 1d2b.png
Қол жетімді құрылымдар
PDBОртологиялық іздеу: PDBe RCSB
Идентификаторлар
Бүркеншік аттарTIMP1, CLGI, EPA, EPO, HCI, TIMP, TIMP-1, TIMP metallopeptidase inhibitor 1
Сыртқы жеке куәліктерOMIM: 305370 MGI: 98752 HomoloGene: 36321 Ген-карталар: TIMP1
Геннің орналасуы (адам)
Х хромосома (адам)
Хр.Х хромосома (адам)[1]
Х хромосома (адам)
TIMP1 үшін геномдық орналасу
TIMP1 үшін геномдық орналасу
ТопXp11.3Бастау47,582,408 bp[1]
Соңы47,586,789 bp[1]
РНҚ экспрессиясы өрнек
PBB GE TIMP1 201666 at fs.png
Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Ортологтар
ТүрлерАдамТышқан
Энтрез
Ансамбль
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_003254

NM_001044384
NM_001294280
NM_011593

RefSeq (ақуыз)

NP_003245
NP_003245.1

NP_001037849
NP_001281209
NP_035723

Орналасқан жері (UCSC)Chr X: 47.58 - 47.59 MbChr X: 20.87 - 20.87 Mb
PubMed іздеу[3][4]
Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеуТінтуірді қарау / өңдеу

TIMP металлопептидазаның тежегіші 1, сондай-ақ TIMP1, а металлопротеиназалардың тіндік ингибиторы, бұл организмдердің бірнеше ұлпаларынан бөлінетін гликопротеин.

Бұл ақуыз TIMP отбасы. The гликопротеин табиғи болып табылады ингибитор туралы матрицалық металлопротеиназалар (MMPs), деградацияға қатысатын пептидазалар тобы жасушадан тыс матрица. Белгілі MMP-дің көпшілігіне қарсы ингибиторлық рөлінен басқа, кодталған ақуыз алға жылжуға қабілетті ұяшық жасуша түрлерінің кең таралуы, сонымен қатар антиапоптотикалық функцияға ие болуы мүмкін.

Функция

TIMP1 - матрицалық металопротеиназаларды (MMPs), ал дезинтегрин-металлопротеиназаларды (ADAMs және ADAMTS) реттейтін тежегіш молекула.[5] MMP-ді реттеу кезінде TIMP1 жасушадан тыс матрица (ECM) құрамы, жараларды емдеу,[6] және жүктілік.[7][8][9]

TIMP1 реттелмеген белсенділігі қатерлі ісікке байланысты болды.[10] Жүктілік кезінде TIMP1 имплантация процесінде реттеуші рөл атқарады, әсіресе жатыр эндометриясының цитотрофобласт инвазиясы.[11] Сонымен қатар, бұл жүктіліктің ерте кезеңдерімен байланысты ұрық пен плацентарлы тіндердің транскрипциялық профилін реттеуде маңызды рөл атқарады.[12] Зерттеулер бұл рөлді TIMP1 промотор аймағында хроматин құрылымын қамтитын, TIMP1 терапевтік реттеудің жаңа фармацевтикалық мүмкіндіктерін қарастыратын механизммен байланыстырады. Тиісінше, TIMP1 манипуляциялануы мүмкін in vitro TIMP1 нокаут сияқты тәсілдерді қолдану.[13][14][15]

Басқа атаулар

  • Эритроидты күшейту белсенділігі (EPA)
  • Адам коллагеназының ингибиторы (HCI)

TIMP өрнегін реттеу

Транскрипция осы туралы ген көпшілігіне жауап ретінде өте индуктивті цитокиндер және гормондар. Сонымен қатар, кейбіреулердің өрнегі, бірақ бәрі белсенді емес Х хромосомалар бұл генді инактивациялау полиморфты адам әйелдер. Бұл ген интронның 6 шегінде орналасқан синапсин I ген және кері бағытта транскрипцияланады.[16]

Адренокортикальды жасушаларда ACTH трофикалық гормоны TIMP-1 экспрессиясын тудырады және TIMP экспрессиясының жоғарылауы коллагеназа белсенділігінің төмендеуімен де байланысты.[17]

TIMP1 экспрессиясының жоғарылауы әртүрлі ісіктердің нашар болжамымен байланысты екені анықталды, мысалы көмей карциномасы [18] немесе меланома.[19]

Сондай-ақ қараңыз

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ а б c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000102265 - Ансамбль, Мамыр 2017
  2. ^ а б c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000001131 - Ансамбль, Мамыр 2017
  3. ^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  4. ^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  5. ^ Brew K, Nagase H (қаңтар 2010). «Металлопротеиназалардың тіндік ингибиторлары (TIMPs): құрылымдық және функционалды әртүрлілігі бар ежелгі отбасы». Biochimica et Biofhysica Acta (BBA) - молекулалық жасушаларды зерттеу. 1803 (1): 55–71. дои:10.1016 / j.bbamcr.2010.01.003. PMC  2853873. PMID  20080133.
  6. ^ Brew K, Dinakarpandian D, Nagase H (наурыз 2000). «Металлопротеиназалардың тіндік ингибиторлары: эволюциясы, құрылымы және қызметі». Biochimica et Biofhysica Acta (BBA) - ақуыздың құрылымы және молекулалық энзимология. 1477 (1–2): 267–83. дои:10.1016 / S0167-4838 (99) 00279-4. PMID  10708863.
  7. ^ Грэм ЧХ, Лала ПК (тамыз 1991). «Орнында трофобласт инвазиясын бақылау механизмі». Жасушалық физиология журналы. 148 (2): 228–34. дои:10.1002 / jcp.1041480207. PMID  1652588.
  8. ^ Nothnick WB, Soloway P, Curry TE (мамыр 1997). «Функционалды TIMP-1 гені жоқ әйел тышқандарда периовулярлық кезеңдегі металлопротеиназа-1 (TIMP-1) тіндік тежегішінің рөлін бағалау». Көбею биологиясы. 56 (5): 1181–8. дои:10.1095 / биолрепрод 56.5.1181. PMID  9160717.
  9. ^ Nothnick WB (қыркүйек 2000). «Металлопротеиназа-1 генінің тіндік тежегішінің бұзылуы репродуктивті жастағы ұрғашы тышқандарда репродуктивті циклдылық пен жатыр морфологиясының өзгеруіне әкеледі». Көбею биологиясы. 63 (3): 905–12. дои:10.1095 / биолрепрод 63.3.905. PMID  10952938.
  10. ^ Kim YS, Kim SH, Kang JG, Ko JH (2012). «Экспрессия деңгейі мен гликан динамикасы TIMP-1-дің қатерлі ісікке әсерін анықтайды. BMB есептері. 45 (11): 623–8. дои:10.5483 / BMBRep.2012.45.11.233. PMC  4133808. PMID  23187000.
  11. ^ Грэм ЧХ, Лала ПК (тамыз 1991). «Орнында трофобласт инвазиясын бақылау механизмі». Жасушалық физиология журналы. 148 (2): 228–34. дои:10.1002 / jcp.1041480207. PMID  1652588.
  12. ^ Винсент З.Л., Митчелл MD, Поннампалам AP (желтоқсан 2015). «Адам плацента мен ұрықтың мембраналарында TIMP-1-ді липополисахарид пен деметилирлеуші ​​5-аза-2'-дезоксититидинмен реттеу». Репродуктивті биология және эндокринология. 13: 136. дои:10.1186 / s12958-015-0132-ж. PMC  4687108. PMID  26691525.
  13. ^ Гонг Y, Скотт Е, Лу Р, Сю Ю, Ох ВК, Ю Q (2013-10-15). «TIMP-1 қатерлі ісікке байланысты фибробласттардың жиналуына және онкологиялық прогрессияға ықпал етеді». PLOS ONE. 8 (10): e77366. дои:10.1371 / journal.pone.0077366. PMC  3797040. PMID  24143225.
  14. ^ Jourquin J, Tremblay E, Bernard A, Charton G, Chaillan FA, Marchetti E, Roman FS, Soloway PD, Dive V, Yiotakis A, Khrestchatisky M, Rivera S (қараша 2005). «Металлопротеиназа-1 тіндерінің ингибиторы (TIMP-1) нейрондардың өлуін, аксональды пластиканы және оқуды және есте сақтауды модуляциялайды». Еуропалық неврология журналы. 22 (10): 2569–78. дои:10.1111 / j.1460-9568.2005.04426.x. PMID  16307599.
  15. ^ Грэм ЧХ, Лала ПК (тамыз 1991). «Орнында трофобласт инвазиясын бақылау механизмі». Жасушалық физиология журналы. 148 (2): 228–34. дои:10.1002 / jcp.1041480207. PMID  1652588.
  16. ^ «Entrez Gene: TIMP1 TIMP металлопептидаза ингибиторы 1».
  17. ^ Рейхенштейн М, Рейх Р, ЛеХоук Дж.Г., Ханукоглу I (ақпан 2004). «ACTH TIMP-1 экспрессиясын тудырады және бүйрек үсті безінің кортекс жасушаларында коллагеназаны тежейді». Молекулалық және жасушалық эндокринология. 215 (1–2): 109–14. CiteSeerX  10.1.1.538.7614. дои:10.1016 / j.mce.2003.11.011. PMID  15026182.
  18. ^ Ma J, Wang J, Fan W, Pu X, Zhang D, Fan C, Xiong L, Zhu H, Xu N, Chen R, Liu S (желтоқсан 2013). «Реттелген TIMP-1 кеңірдектің жалпақ жасушалы карциномасының нашар болжамымен корреляцияланады». Халықаралық клиникалық және эксперименттік патология журналы. 7 (1): 246–54. PMC  3885479. PMID  24427345.
  19. ^ Тархини А.А., Лин Й, Еку О, ЛаФрамбоиз В.А., Ашраф М, Сандер С, Ли С, Кирквуд Дж.М. (қаңтар 2014). «TNF-RII, TGF-α, TIMP-1 және CRP төрт таңбалы қолтаңбасы хирургиялық жолмен резекцияланған жоғары қатерлі меланомада өмір сүрудің нашарлауы туралы болжам болып табылады». Аударма медицина журналы. 12: 19. дои:10.1186/1479-5876-12-19. PMC  3909384. PMID  24457057.

Әрі қарай оқу

Сыртқы сілтемелер

  • The MEROPS пептидазалар мен олардың ингибиторларына арналған онлайн-мәліметтер базасы: I35.001
  • Сайтында қол жетімді барлық құрылымдық ақпаратқа шолу PDB үшін UniProt: P01033 (Металлопротеиназа тежегіші 1) кезінде PDBe-KB.