Синергин гаммасы - Synergin gamma

SYNRG
Қол жетімді құрылымдар
PDB	Ортологиялық іздеу: PDBe RCSB
PDB идентификатор кодтарының тізімі
	2MX7
Идентификаторлар
Бүркеншік аттар	SYNRG, AP1GBP1, SYNG, синергин, гамма, синергин гаммасы
Сыртқы жеке куәліктер	OMIM: 607291 MGI: 1354742 HomoloGene: 105680 Ген-карталар: SYNRG
Геннің орналасуы (адам)
Хр.	17-хромосома (адам)
Соңы	37,609,472 bp
Геннің орналасуы (тышқан)
Хр.	11-хромосома (тышқан)
Соңы	84,044,578 bp
Гендік онтология
Молекулалық функция	• GO: 0001948 ақуыздармен байланысуы;
Ұялы компонент	• цитоплазма; • АП-1 адаптер кешені; • Гольджи аппараты; • мембрана;
Биологиялық процесс	• ақуызды тасымалдау; • жасуша ішіндегі ақуыздың тасымалдануы; • эндоцитоз;
	Дереккөздер:Амиго / QuickGO
Ортологтар
	11276
	217030
	ENSG00000275066; ENSG00000274047
	ENSMUSG00000034940
	Q9UMZ2
	Q5SV85
NM_001163544; NM_001163545; NM_001163546; NM_001163547; NM_007247;
	NM_080550; NM_198882
	NM_001115009; NM_194341
NP_001157016; NP_001157017; NP_001157018; NP_001157019; NP_009178;
	NP_542117; NP_942583
	NP_919322
	Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеу	Тінтуірді қарау / өңдеу

Синергин гаммасы ретінде белгілі AP1 суббірлік гамма байланыстыратын ақуыз 1 (AP1GBP1) Бұл ақуыз адамдарда кодталған SYNRG ген.^[5]^[6]

Функция

Бұл ген AP1 гамма суббірлігімен өзара әрекеттесетін ақуызды кодтайды клатрин-адаптер кешені. AP1 кешені орналасқан транс-гольджи желісі және спецификалық ақуыздарды клатринмен жабылған көпіршіктермен байланыстырады. Бұл кодталған ақуыз AP1 кешенін басқа ақуыздармен байланыстыруға әсер етуі мүмкін. Бұл ген үшін әр түрлі изоформаларды кодтайтын балама транскрипт нұсқалары сипатталған.^[6]

Өзара әрекеттесу

AP1GBP1 көрсетілген өзара әрекеттесу бірге AP1G1^[7]^[8] және Алаяқтық1.^[9]

Әдебиеттер тізімі

^ ^а ^б ^c ENSG00000274047 GRCh38: Ensembl шығарылымы 89: ENSG00000275066, ENSG00000274047 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000034940 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ Бет LJ, Sowerby PJ, Lui WW, Робинсон MS (қазан 1999). «Гамма-синергин: құрамында гамма-адаптинмен әрекеттесетін құрамында домен бар EH ақуызы». Дж. Жасуша Биол. 146 (5): 993–1004. дои:10.1083 / jcb.146.5.993. PMC 2169493. PMID 10477754.
^ ^а ^б «Entrez Gene: AP1GBP1 AP1 гамма суббірлік байланыстыратын ақуыз 1».
^ Nogi T, Shiba Y, Kawasaki M, Shiba T, Matsugaki N, Igarashi N, Suzuki M, Kato R, Takatsu H, Nakakama K, Wakatsuki S (шілде 2002). «Гамма-адаптинді құлақ домені бойынша ақуыздарды қосымша алудың құрылымдық негіздері». Нат. Құрылым. Биол. 9 (7): 527–31. дои:10.1038 / nsb808. PMID 12042876. S2CID 42630285.
^ Такацу Х, Ёшино К, Накаяма К (мамыр 2000). «Гамма-синергинмен әрекеттесетін гамма-адаптин және GGA белоктарында сақталған гамма-құлақтың гомологиялық доменінің адаптері». Биохимия. Биофиз. Res. Коммун. 271 (3): 719–25. дои:10.1006 / bbrc.2000.2700. PMID 10814529.
^ Fernández-Chacón R, Achiriloaie M, Janz R, Albanesi JP, Südhof TC (сәуір, 2000). «Эндоцитоздағы SCAMP1 функциясы». Дж.Биол. Хим. 275 (17): 12752–6. дои:10.1074 / jbc.275.17.12752. PMID 10777571.

Әрі қарай оқу

Peyrard M, Parveneh S, Lagercrantz S, Ekman M, Fransson I, Sahlén S, Dumanski JP (1998). «Адамның гамма-адаптин генінің (ADTG) 16q23-ке клондау, экспрессия және хромосомалық тағайындау». Геномика. 50 (2): 275–80. дои:10.1006 / geno.1998.5289. PMID 9653655.
Hirst J, Lui WW, Bright NA, Totty N, Seaman MN, Робинсон MS (2000). «Транс-Гольджи желісі мен вакуоль / лизосома арасындағы айналымды жеңілдететін гамма-адаптинді және VHS домендері бар ақуыздар отбасы». Дж. Жасуша Биол. 149 (1): 67–80. дои:10.1083 / jcb.149.1.67. PMC 2175106. PMID 10747088.
Fernández-Chacón R, Achiriloaie M, Janz R, Albanesi JP, Südhof TC (2000). «Эндоцитоздағы SCAMP1 функциясы». Дж.Биол. Хим. 275 (17): 12752–6. дои:10.1074 / jbc.275.17.12752. PMID 10777571.
Такацу Х, Ёшино К, Накаяма К (2000). «Гамма-синергинмен әрекеттесетін гамма-адаптин және GGA белоктарында сақталған гамма-құлақтың гомологиялық доменінің адаптері». Биохимия. Биофиз. Res. Коммун. 271 (3): 719–25. дои:10.1006 / bbrc.2000.2700. PMID 10814529.
Nogi T, Shiba Y, Kawasaki M, Shiba T, Matsugaki N, Igarashi N, Suzuki M, Kato R, Takatsu H, Nakakama K, Wakatsuki S (2002). «Гамма-адаптинді құлақ домені бойынша ақуыздарды қосымша алудың құрылымдық негіздері». Нат. Құрылым. Биол. 9 (7): 527–31. дои:10.1038 / nsb808. PMID 12042876. S2CID 42630285.
Кент Х.М., Макмахон Х.Т., Эванс PR, Бенмера А, Оуэн DJ (2002). «Гамма-адаптинді қосымшаның домені: құрылымы және Eps15 пен гамма-синергинге арналған байланыс орны». Құрылым. 10 (8): 1139–48. дои:10.1016 / S0969-2126 (02) 00801-8. PMID 12176391.
Mills IG, Praefcke GJ, Vallis Y, Peter BJ, Olesen LE, Gallop JL, Butler PJ, Evans PR, McMahon HT (2003). «EpsinR: көпіршіктердің айналымына қатысатын AP1 / клатринмен әрекеттесетін ақуыз». Дж. Жасуша Биол. 160 (2): 213–22. дои:10.1083 / jcb.200208023. PMC 2172650. PMID 12538641.
Lui WW, Коллинз Б.М., Хирст Дж, Мотли А, Миллар С, Шу П, Оуэн Джейдж, Робинсон МС (2003). «GGAs және гамма-адаптиннің COOH-терминалды қосымшалар домендерінің байланыстырушы серіктестері». Мол. Биол. Ұяшық. 14 (6): 2385–98. дои:10.1091 / mbc.E02-11-0735. PMC 194887. PMID 12808037.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (2004). «HeLa жасушалық ядролық фосфопротеидтердің ауқымды сипаттамасы». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 101 (33): 12130–5. дои:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Хирст Дж, Борнер Г.Х., Харбор М, Робинсон МС (2005). «Афтифилин / р200 / гамма-синергин кешені». Мол. Биол. Ұяшық. 16 (5): 2554–65. дои:10.1091 / mbc.E04-12-1077. PMC 1087257. PMID 15758025.
Теос AC, Tenza D, Мартина Дж.А., Хурбейн I, Педен А.А., Свидерская Е.В., Стюарт А, Робинсон МС, Беннетт DC, Катлер Д.Ф., Бонифасино Дж.С., Маркс МС, Рапосо G (2005) «Тирозиназаны эндосомалардан меланосомаларға дейін сұрыптаудағы адаптер ақуызының (AP) -3 және AP-1 функциялары». Мол. Биол. Ұяшық. 16 (11): 5356–72. дои:10.1091 / mbc.E05-07-0626. PMC 1266432. PMID 16162817.

Бұл мақала а ген қосулы адамның хромосомасы 17 Бұл бұта. Сіз Уикипедияға көмектесе аласыз оны кеңейту.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ENSG00000274047 GRCh38: Ensembl шығарылымы 89: ENSG00000275066, ENSG00000274047 - Ансамбль, Мамыр 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000034940 - Ансамбль, Мамыр 2017

[3] «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[4] «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[pmid10477754-5] Бет LJ, Sowerby PJ, Lui WW, Робинсон MS (қазан 1999). «Гамма-синергин: құрамында гамма-адаптинмен әрекеттесетін құрамында домен бар EH ақуызы». Дж. Жасуша Биол. 146 (5): 993–1004. дои:10.1083 / jcb.146.5.993. PMC 2169493. PMID 10477754.

[entrez-6] а ^б «Entrez Gene: AP1GBP1 AP1 гамма суббірлік байланыстыратын ақуыз 1».

[pmid12042876-7] Nogi T, Shiba Y, Kawasaki M, Shiba T, Matsugaki N, Igarashi N, Suzuki M, Kato R, Takatsu H, Nakakama K, Wakatsuki S (шілде 2002). «Гамма-адаптинді құлақ домені бойынша ақуыздарды қосымша алудың құрылымдық негіздері». Нат. Құрылым. Биол. 9 (7): 527–31. дои:10.1038 / nsb808. PMID 12042876. S2CID 42630285.

[pmid10814529-8] Такацу Х, Ёшино К, Накаяма К (мамыр 2000). «Гамма-синергинмен әрекеттесетін гамма-адаптин және GGA белоктарында сақталған гамма-құлақтың гомологиялық доменінің адаптері». Биохимия. Биофиз. Res. Коммун. 271 (3): 719–25. дои:10.1006 / bbrc.2000.2700. PMID 10814529.

[pmid10777571-9] Fernández-Chacón R, Achiriloaie M, Janz R, Albanesi JP, Südhof TC (сәуір, 2000). «Эндоцитоздағы SCAMP1 функциясы». Дж.Биол. Хим. 275 (17): 12752–6. дои:10.1074 / jbc.275.17.12752. PMID 10777571.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]