Құпия - Secretome

The құпия жиынтығы белоктар ағзамен және құпия ішіне жасушадан тыс кеңістік. Адамдарда бұл протеома барлық белоктардың 13-20% қамтиды, соның ішінде цитокиндер, өсу факторлары, жасушадан тыс матрица ақуыздар мен реттегіштер және төгілген рецепторлар. Нақты ұлпаның секретомын өлшеуге болады масс-спектрометрия және оның талдауы түрін құрайды протеомика ретінде белгілі секретомика.

Анықтама

Термин құпия Цялсма және оның әріптестері 2004 жылы жасушадан бөлінетін барлық факторларды және секреторлық жолды құраушыларды белгілеу үшін ойлап тапты.[1] 2010 жылы секретомның бұл анықтамасы жасушадан тыс кеңістікте бөлінетін ақуыздарды ғана қамти отырып қайта қаралды.[2] Байланысты ұғымдарға матризома, оған кіретін секретомның ішкі бөлігі жасушадан тыс матрица ақуыздар және олармен байланысты белоктар;[3] The рецептом барлық мембраналық рецепторларды қамтиды,[4] және жабысқақ оған қатысатын барлық ақуыздар кіреді жасушалардың адгезиясы.[5][6]

Сандық

Адамдардағы бөлінетін белоктар бүкіл құрамның 13–20% құрайды протеома және өсу факторларын, химокиндерді, цитокиндерді, адгезия молекулаларын, протеазаларды және төгілген рецепторларды қамтиды.[2] Адамның ақуызды кодтайтын гендері (39%, 19613 гендер[7]) сәйкес пептидті сигнал және / немесе кем дегенде бір трансмембраналық аймақ болады деп болжануда, бұл протеиннің жасушадан белсенді түрде тасымалдануы (секреция) немесе жасушадағы көптеген мембраналық жүйелердің бірінде орналасуы. Дәлелдердің көбеюі ақуыз жүктерінен басқа, ақуыз емес компоненттер, мысалы, липид, микро-РНҚ және хабарлаушы-РНҚ-ны жасушалар екеуі арқылы бөле алатындығын көрсетті. микровезулалар (100–> 1000 нм диаметрі) - плазмалық мембранадан төгілу - және экзосомалар (Диаметрі 30-150 нм) - эндосомальды-экзоцитоз оқиғасы арқылы шығарылады.[8] Бұл екі органеллада да бар факторлар секретомның 42% құрайды және ұжымдық секретом ретінде енгізілген.[9] Өсімдік жасушаларының, сүтқоректілер клеткаларының, дің жасушаларының және рак клеткаларының жасушалық секретомдарын зерттеуге арналған көптеген әдістемелер бар.[9]

Сондай-ақ қараңыз

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ Тялсма, Х .; Антельманн, Х .; Джонгблед, Дж. Д.Х .; Браун, П.Г .; Дармон, Е .; Доренбос, Р .; Дюбуа, Дж. Ф .; Вестерс, Х .; Занен, Г .; Куакс, В. Дж .; Куйперс, О. П .; Брон, С .; Хекер М .; van Dijl, J. M. (8 маусым 2004). «Bacillus subtilis-тен протеин секрециясының протеомикасы: секретомның» құпияларын «бөлу». Микробиология және молекулалық биологияға шолу. 68 (2): 207–233. дои:10.1128 / MMBR.68.2.207-233.2004. PMID  15187182.
  2. ^ а б Agrawal GK, Jwa NS, Lebrun MH, Job D, Rakwal R (ақпан 2010). «Өсімдік секретомы: бөлінетін ақуыздардың құпияларын ашу». Протеомика. 10 (4): 799–827. дои:10.1002 / pmic.200900514. PMID  19953550.
  3. ^ Хайнс, Р.О .; Наба, А. (21 қыркүйек 2011). «Матрисомаға шолу - жасушадан тыс матрицаның құрылтайлары мен функцияларын түгендеу». Биологиядағы суық көктем айлағының болашағы. 4 (1): a004903. дои:10.1101 / cshperspect.a004903. PMC  3249625. PMID  21937732.
  4. ^ Бен-Шломо, Мен .; Ю Хсу, С .; Рауч, Р .; Ковальски, Х.В .; Hsueh, A. J. W. (17 маусым 2003). «Сигналды рецептом: сигналды өткізуге қатысатын плазмалық мембраналық рецепторлардың геномдық және эволюциялық перспективасы». Ғылыми сигнал беру. 2003 (187): қайта дои:10.1126 / stke.2003.187.re9. PMID  12815191.
  5. ^ Зайдель-Бар, Ронен; Ицковиц, Шалев; Мааян, Ави; Ийенгар, Рави; Гейгер, Бенджамин (2007 ж. Тамыз). «Интегрин адгезиясының функционалды атласы». Табиғи жасуша биологиясы. 9 (8): 858–867. дои:10.1038 / ncb0807-858. PMC  2735470. PMID  17671451.
  6. ^ Хортон, Эдвард Р .; Байрон, Адам; Аскари, Джанет А .; Нг, Даниэль Дж .; Миллон-Фремиллон, Анжелика; Робертсон, Джозеф; Копер, Эва Дж .; Пол, Никки Р.; Уорвуд, Стейси; Рыцарь, Дэвид; Хамфрис, Джонатан Д .; Хамфрис, Мартин Дж. (19 қазан 2015). «Интегринді адгезоның консенсусын анықтау және оның адгезиялық кешенді құрастыру және бөлшектеу кезіндегі динамикасы». Табиғи жасуша биологиясы. 17 (12): 1577–1587. дои:10.1038 / ncb3257. PMC  4663675. PMID  26479319.
  7. ^ Uhlén M, Fagerberg L, Hallström BM, Lindskog C, Oksvold P, Mardinoglu A және т.б. (Қаңтар 2015). «Протеомика. Адам протеомының тіндік картасы». Ғылым. 347 (6220): 1260419. дои:10.1126 / ғылым.1260419. PMID  25613900.
  8. ^ Xu R, Greening DW, Zhu HJ, Takahashi N, Simpson RJ (сәуір 2016). «Жасушадан тыс көпіршікті оқшаулау және сипаттамасы: клиникалық қолдануға қарай». Клиникалық тергеу журналы. 126 (4): 1152–62. дои:10.1172 / JCI81129. PMC  4811150. PMID  27035807.
  9. ^ а б Mukherjee P, Mani S (қараша 2013). «Жасуша секретомын ашу әдістемесі». Biochimica et Biofhysica Acta (BBA) - ақуыздар және протеомика. 1834 (11): 2226–32. дои:10.1016 / j.bbapap.2013.01.022. PMC  3652893. PMID  23376189.

Әрі қарай оқу