STAU1 - STAU1

STAU1
Қол жетімді құрылымдар
PDB	Ортологиялық іздеу: PDBe RCSB
PDB идентификатор кодтарының тізімі
	4DKK
Идентификаторлар
Бүркеншік аттар	STAU1, PPP1R150, STAU, стауфен екі тізбекті РНҚ байланыстыратын ақуыз 1
Сыртқы жеке куәліктер	OMIM: 601716 MGI: 1338864 HomoloGene: 3384 Ген-карталар: STAU1
Геннің орналасуы (адам)
Хр.	20-хромосома (адам)
Соңы	49,188,367 bp
Геннің орналасуы (тышқан)
Хр.	2-хромосома (тышқан)
Соңы	166,996,299 bp
РНҚ экспрессиясы өрнек
	; ; ; ;
	Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Гендік онтология
Молекулалық функция	• ақуызды фосфатаза 1 байланыстырады; • GO: 0001948 ақуыздармен байланысуы; • қос тізбекті РНҚ байланыстыру; • РНҚ байланысы;
Ұялы компонент	• цитоплазма; • жасуша денесі; • дөрекі эндоплазмалық тор; • мембрана; • жасуша қабығы; • микротүтікшемен байланысты кешен; • нейрондық жасуша денесі; • дендрит; • эндоплазмалық тор; • цитоплазмалық рибонуклеопротеин түйіршігі; • нейрондық проекция; • Стресс түйіршігі; • жасушадан тыс экзома; • цитозол; • глутаматергиялық синапс;
Биологиялық процесс	• ұзақ мерзімді синаптикалық күшейтудің оң реттелуі; • қабылдаушы жасушадағы вирустық ақуыз деңгейінің вируспен оң реттелуі; • тотығу стрессіне жасушалық жауап; • вирустық геномның репликациясының оң реттелуі; • химиялық синаптикалық берілісті модуляциялау; • постсинапстық құрылымды модификациялау; • GO: 0022415 вирустық процесс;
	Дереккөздер:Амиго / QuickGO
Ортологтар
	6780
	20853
	ENSG00000124214
	ENSMUSG00000039536
	O95793
	Q9Z108
NM_001037328; NM_004602; NM_017452; NM_017453; NM_017454;
	NM_001319134; NM_001319135; NM_001322927; NM_001322928; NM_001322929; NM_001322930; NM_001322931; NM_001322932; NM_001322933
	NM_001109905; NM_001109906; NM_001291160; NM_011490
NP_001032405; NP_001306063; NP_001306064; NP_001309856; NP_001309857;
	NP_001309858; NP_001309859; NP_001309860; NP_001309861; NP_001309862; NP_004593; NP_059346; NP_059347; NP_059348
	NP_001103375; NP_001103376; NP_001278089; NP_035620
	Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеу	Тінтуірді қарау / өңдеу

Екі реттік РНҚ-мен байланысатын ақуыз Staufen гомологы 1 Бұл ақуыз адамдарда кодталған STAU1 ген.^[5]^[6]^[7]

Штауфен - отбасының мүшесі екі тізбекті РНҚ (dsRNA) байланыстыратын ақуыздар тасымалдауға және / немесе оқшаулауға қатысады мРНҚ әртүрлі жасушалық бөлімдерге және / немесе органеллаларға. Бұл ақуыздар екі тізбекті екінші ретті құрылымдары бар РНҚ-ны байланыстыру үшін қажет болатын бірнеше дсРНҚ-мен байланысатын домендердің болуымен сипатталады. STAU кодталған стауфеннің адам гомологы құрамында а микротүтікше -байланыстырушы домен микротүтікшелермен байланысты белок 1В, және байланыстырады тубулин. STAU генінің өнімі цитоплазмада дөрекі эндоплазмалық тор (RER), бұл протеинді мРНҚ-ны микротүтікшелер желісі арқылы RER-ге, трансляция өтетін жерге тасымалдауға әсер етеді. Нәтижесіндегі бес транскрипция нұсқасы балама қосу және үш изоформаны кодтайтын STAU генінің сипаттамасы берілген. Осы нұсқалардың үшеуі бірдей изоформаны кодтайды, бірақ олардың 5'UTR-мен ерекшеленеді.^[7]

STAU1 байланысты стресс түйіршіктері.^[8]

Әдебиеттер тізімі

^ ^а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000124214 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000039536 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ DesGroseillers L, Lemieux N (ақпан 1997). «Адамның екі тізбекті РНҚ-мен байланысатын ақуыз генін (STAU) флуоресценттік орнында будандастыру арқылы 20q13.1 жолағына дейін оқшаулау». Геномика. 36 (3): 527–529. дои:10.1006 / geno.1996.0499. PMID 8884277.
^ Kim YK, Furic L, Desgroseillers L, Maquat LE (қаңтар 2005). «Сүтқоректілер Staufen1 mRNA ыдырауын тудыру үшін Upf1-ді белгілі бір mRNA 3'UTR-ге қабылдайды». Ұяшық. 120 (2): 195–208. дои:10.1016 / j.cell.2004.11.050. PMID 15680326. S2CID 16786108.
^ ^а ^б «Entrez Gene: STAU1 staufen, РНҚ байланыстыратын ақуыз, гомолог 1 (Drosophila)».
^ Thomas MG, Martinez Tosar LJ, Loschi M, Pasquini JM, Correale J, Kindler S, Boccaccio GL (қаңтар 2005). «Стауфенді стресс түйіршіктеріне қабылдау олигодендроциттердегі мРНҚ-ның ерте тасымалдануына әсер етпейді». Жасушаның молекулалық биологиясы. 16 (1): 405–420. дои:10.1091 / mbc.E04-06-0516. PMC 539183. PMID 15525674.

Әрі қарай оқу

Kiebler MA, DesGroseillers L (2000). «Сүтқоректілердің жүйке жүйесіндегі мРНҚ-ның тасымалдануы және жергілікті аудармасы туралы молекулалық түсініктер». Нейрон. 25 (1): 19–28. дои:10.1016 / S0896-6273 (00) 80868-5. PMID 10707969. S2CID 2565210.
Marión RM, Fortes P, Beloso A және т.б. (1999). «Стауфеннің адамдағы бірізділік гомологы - бұл полисомалармен байланысқан және өрескел эндоплазмалық торға локализацияланған РНҚ-байланысатын ақуыз». Мол. Ұяшық. Биол. 19 (3): 2212–2219. дои:10.1128 / mcb.19.3.2212. PMC 84014. PMID 10022908.
Wickham L, Duchaîne T, Luo M және т.б. (1999). «Сүтқоректілер стауфені - бұл өрескел эндоплазмалық ретикулумға оқшауланған, қос тізбекті-РНҚ және тубулинмен байланысатын ақуыз». Мол. Ұяшық. Биол. 19 (3): 2220–2230. дои:10.1128 / mcb.19.3.2220. PMC 84015. PMID 10022909.
Falcón AM, Fortes P, Marión RM және т.б. (1999). «NS1 тұмау вирусының өзара әрекеттесуі және in vivo және in vitro жағдайында Стауфеннің адам гомологы». Нуклеин қышқылдары. 27 (11): 2241–2247. дои:10.1093 / нар / 27.11.2241. PMC 148787. PMID 10325410.
Mouland AJ, Mercier J, Luo M және т.б. (2000). «Стауфеннің екі тізбекті байланыстыратын ақуызы адамның иммунитет тапшылығы вирусының 1 типіне енгізілген: геномдық РНҚ-ның инкапсидациясы рөлінің дәлелі». Дж. Вирол. 74 (12): 5441–5451. дои:10.1128 / JVI.74.12.5441-5451.2000. PMC 112028. PMID 10823848.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R және т.б. (2001). «Адам гендері мен ақуыздарының каталогына қарай: адамның кДНҚ-ын кодтайтын 500 жаңа ақуыздың дәйектілігі мен анализі». Genome Res. 11 (3): 422–435. дои:10.1101 / гр. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Deloukas P, Matthews LH, Ashurst J және т.б. (2002). «ДНҚ тізбегі және адамның 20 хромосомасын салыстырмалы талдау». Табиғат. 414 (6866): 865–871. дои:10.1038 / 414865a. PMID 11780052.
Моншаузен М, Рехбейн М, Рихтер Д, Киндлер С (2002). «Егеуқұйрық миынан РНҚ-ны байланыстыратын Staufen ақуызы фосфатаза-1 протеинімен әрекеттеседі». Дж.Нейрохим. 81 (3): 557–564. дои:10.1046 / j.1471-4159.2002.00887.x. PMID 12065664. S2CID 41323424.
Luo M, Duchaîne TF, DesGroseillers L (2002). «Адам Стауфен-рибосома ассоциациясына қатысатын детерминанттардың молекулалық картасы». Биохимия. Дж. 365 (Pt 3): 817–824. дои:10.1042 / BJ20020263. PMC 1222739. PMID 12133005.
Охаши С, Коикэ К, Омори А және т.б. (2002). «Құрамында Puralpha, mStaufen, сынғыш X ақуызы және миозин Va бар mRNA / белок (mRNP) кешендерін анықтау және олардың кинезин қозғалтқышымен жабдықталған өрескел эндоплазмалық тормен байланысы». Дж.Биол. Хим. 277 (40): 37804–37810. дои:10.1074 / jbc.M203608200. PMID 12147688.
Ангенштейн Ф, Эванс А.М., Сеттлэйдж Р.Е. және т.б. (2002). «Белсендірілген С киназаға арналған рецептор - бұл нейрондардағы полиА-мРНҚ-мен байланысқан рибонуклеопротеиндік хабарлаушы кешендердің бөлігі». Дж.Нейросчи. 22 (20): 8827–8837. дои:10.1523 / jneurosci.22-20-08827.2002. PMID 12388589.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH және т.б. (2003). «Адам мен тышқанның 15000-нан астам толық ұзындықтағы кДНҚ тізбектерінің генерациясы және алғашқы талдауы». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 99 (26): 16899–16903. дои:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Macchi P, Kroening S, Palacios IM және т.б. (2003). «Баренц, сүтқоректілер клеткаларындағы құрамында штафені бар рибонуклеопротеин бөлшектерінің жаңа компоненті, штауфенмен РНҚ-ға тәуелді түрде әрекеттеседі». Дж.Нейросчи. 23 (13): 5778–5788. дои:10.1523 / jneurosci.23-13-05778.2003. PMID 12843282.
Ота Т, Сузуки Ю, Нишикава Т және т.б. (2004). «Адамның 21,243 толық ұзындықтағы кДНҚ-ның толық тізбегі және сипаттамасы». Нат. Генет. 36 (1): 40–45. дои:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Chatel-Chaix L, Clément JF, Martel C және т.б. (2004). «Стауфенді адамның 1 типті иммунитет тапшылығы вирусындағы гаг-рибонуклеопротеин кешеніндегі идентификация және инфекциялық вирустық бөлшектерді құрудағы рөлі». Мол. Ұяшық. Биол. 24 (7): 2637–2648. дои:10.1128 / MCB.24.7.2637-2648.2004. PMC 371130. PMID 15024055.
Villacé P, Marión RM, Ortín J (2004). «Адам жасушаларынан құрамында Стауфен бар РНҚ түйіршіктерінің құрамы олардың реттелетін тасымалдау мен хабарлаушы РНҚ-ның трансляциясындағы рөлін көрсетеді». Нуклеин қышқылдары. 32 (8): 2411–2420. дои:10.1093 / nar / gkh552. PMC 419443. PMID 15121898.
Colland F, Jacq X, Trouplin V және т.б. (2004). «Адамның сигналдық жолының функционалды протеомикасын картографиялау». Genome Res. 14 (7): 1324–1332. дои:10.1101 / гр.2334104. PMC 442148. PMID 15231748.
Brendel C, Rehbein M, Kreienkamp HJ және т.б. (2005). «Staufen 1 рибонуклеопротеидті кешендердің сипаттамасы». Биохимия. Дж. 384 (Pt 2): 239–246. дои:10.1042 / BJ20040812. PMC 1134106. PMID 15303970.

Бұл мақала а ген қосулы адамның хромосомасы 20 Бұл бұта. Сіз Уикипедияға көмектесе аласыз оны кеңейту.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000124214 - Ансамбль, Мамыр 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000039536 - Ансамбль, Мамыр 2017

[3] «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[4] «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[pmid8884277-5] DesGroseillers L, Lemieux N (ақпан 1997). «Адамның екі тізбекті РНҚ-мен байланысатын ақуыз генін (STAU) флуоресценттік орнында будандастыру арқылы 20q13.1 жолағына дейін оқшаулау». Геномика. 36 (3): 527–529. дои:10.1006 / geno.1996.0499. PMID 8884277.

[pmid15680326-6] Kim YK, Furic L, Desgroseillers L, Maquat LE (қаңтар 2005). «Сүтқоректілер Staufen1 mRNA ыдырауын тудыру үшін Upf1-ді белгілі бір mRNA 3'UTR-ге қабылдайды». Ұяшық. 120 (2): 195–208. дои:10.1016 / j.cell.2004.11.050. PMID 15680326. S2CID 16786108.

[entrez-7] а ^б «Entrez Gene: STAU1 staufen, РНҚ байланыстыратын ақуыз, гомолог 1 (Drosophila)».

[8] Thomas MG, Martinez Tosar LJ, Loschi M, Pasquini JM, Correale J, Kindler S, Boccaccio GL (қаңтар 2005). «Стауфенді стресс түйіршіктеріне қабылдау олигодендроциттердегі мРНҚ-ның ерте тасымалдануына әсер етпейді». Жасушаның молекулалық биологиясы. 16 (1): 405–420. дои:10.1091 / mbc.E04-06-0516. PMC 539183. PMID 15525674.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]