SRRM1 - SRRM1

SRRM1

Ақуыз SRRM1 PDB 1mp1.png

Қол жетімді құрылымдар

Адам UniProt іздеу: PDBe RCSB

PDB идентификатор кодтарының тізімі
1МП1

Идентификаторлар

Бүркеншік аттар

SRRM1, 160-KD, POP101, SRM160, серин және аргининнің қайталанатын матрицасы 1

Сыртқы жеке куәліктер

OMIM: 605975 HomoloGene: 136796 Ген-карталар: SRRM1

Геннің орналасуы (адам)

Хр.	1-хромосома (адам)^[1]

Топ	1p36.11	Бастау	24,631,716 bp^[1]
Топ	1p36.11	Соңы	24,673,267 bp^[1]

РНҚ экспрессиясы өрнек

Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер

Гендік онтология
Молекулалық функция	• ДНҚ байланыстыру • GO: 0001948 ақуыздармен байланысуы • РНҚ байланысы
Ұялы компонент	• ядролық матрица • цитозол • 2-ші каталитикалық саты сплизесома • сплизеозомдық кешен • жасуша ядросы • нуклеоплазма • ядролық дақ
Биологиялық процесс	• РНҚ-ны бөлу, трансестерификация реакциялары арқылы • мРНҚ-ны бөлу, сплитеосома арқылы • РНҚ полимераза II транскрипциясының аяқталуы • мРНҚ өңдеу • mRNA 3'соңындағы өңдеу • ядродан мРНҚ экспорты • РНҚ қосылуы • Ядродан РНҚ экспорты
Дереккөздер:Амиго / QuickGO

Ортологтар

Түрлер

Адам

Тышқан


10250


жоқ

Ансамбль


ENSG00000133226


жоқ


Q8IYB3


жоқ

RefSeq (mRNA)


NM_001303448 NM_001303449 NM_005839


жоқ

RefSeq (ақуыз)

NP_001290377 NP_001290378 NP_005830 NP_001353494 NP_001353495
NP_001353496 NP_001353497 NP_001353498 NP_001353499 NP_001353500 NP_001353501 NP_001353502 NP_001353504 NP_001353505 NP_001353506 NP_001353507 NP_001353510 NP_001353511 NP_001353513 NP_001353514 NP_001353515 NP_001353516 NP_001353517 NP_001353518 NP_001353519 NP_001353520 NP_001353521 NP_001353522 NP_001353523 NP_001353524 NP_001353525 NP_001353526 NP_001353527 NP_001353528 NP_001353529


жоқ

Орналасқан жері (UCSC)

Chr 1: 24.63 - 24.67 Mb

жоқ

PubMed іздеу

^[2]

жоқ

Уикидеректер

Адамды қарау / өңдеу

Серин / аргинин матрицасының қайталанатын 1 ақуызы Бұл ақуыз адамдарда кодталған SRRM1 ген.^[3]^[4]

Өзара әрекеттесу

SRRM1 көрсетілген өзара әрекеттесу бірге CDC5L.^[5]

Әдебиеттер тізімі

^ ^а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000133226 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ Бленкоу Б.Дж., Иснер Р, Никерсон Дж.А., Sharp PA (мамыр 1998). «МРНҚ-ға дейінгі қосудың коактиваторы». Genes Dev. 12 (7): 996–1009. дои:10.1101 / gad.12.7.996. PMC 316672. PMID 9531537.
^ «Entrez Gene: SRRM1 серин / аргининнің қайталанатын матрицасы 1».
^ Ajuh P, Kuster B, Panov K, Zomerdijk JC, Mann M, Lamond AI (желтоқсан 2000). «Адамның CDC5L кешенін функционалды талдау және оның компоненттерін масс-спектрометрия әдісімен анықтау». EMBO J. 19 (23): 6569–81. дои:10.1093 / emboj / 19.23.6569. PMC 305846. PMID 11101529.

Әрі қарай оқу

Wang HY, Lin W, Dyck JA, Yeakley JM, Songyang Z, Cantley LC, Fu XD (1998). «SRPK2: сүтқоректілердің жасушаларында мРНҚ-ға дейінгі сплайсинг факторларының өзара әрекеттесуі мен локализациясына қатысатын SR ақуызға тән киназа дифференциалды түрде көрсетілген». Дж. Жасуша Биол. 140 (4): 737–50. дои:10.1083 / jcb.140.4.737. PMC 2141757. PMID 9472028.
Уилсон KF, Fortes P, Сингх АҚШ, Ohno M, Mattaj IW, Cerione RA (1999). «Ядролық қақпақты байланыстыратын кешен - бұл өсу факторы рецепторларымен байланысқан сигналды берудің жаңа мақсаты». Дж.Биол. Хим. 274 (7): 4166–73. дои:10.1074 / jbc.274.7.4166. PMID 9933612.
Eldridge AG, Li Y, Sharp PA, Blencowe BJ (1999). «SRm160 / 300 біріктіру коактиваторы экзон-күшейткіш функциясы үшін қажет». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 96 (11): 6125–30. дои:10.1073 / pnas.96.11.6125. PMC 26846. PMID 10339552.
Blencowe BJ, Baurén G, Eldridge AG, Issner R, Nickerson JA, Rosonina E, Sharp PA (2000). «SRm160 / 300 біріктіру коактиваторының суббірліктері». РНҚ. 6 (1): 111–20. дои:10.1017 / S1355838200991982. PMC 1369899. PMID 10668804.
Le Hir H, Moore MJ, Maquat LE (2000). «МРНҚ-ға дейінгі сплайсинг mRNP құрамын өзгертеді: экзон-экзон түйіспелеріндегі белоктардың тұрақты ассоциациясының дәлелі». Genes Dev. 14 (9): 1098–108. PMC 316578. PMID 10809668.
McGarvey T, Rosonina E, McCracken S, Li Q, Arnaout R, Mientjes E, Nickerson JA, Awrey D, Greenblatt J, Grosveld G, Blencowe BJ (2000). «Миелоидты лейкемиямен байланысқан жедел ақуыз, DEK, экзон-өнім кешендерімен сплайсингке тәуелді әрекеттеседі». Дж. Жасуша Биол. 150 (2): 309–20. дои:10.1083 / jcb.150.2.309. PMC 2180225. PMID 10908574.
Le Hir H, Izaurralde E, Maquat LE, Moore MJ (2000). «Spliceosome көптеген ақуыздарды мРНҚ экзон-экзон қосылыстарының ағынында 20-24 нуклеотидтерге жинайды». EMBO J. 19 (24): 6860–9. дои:10.1093 / emboj / 19.24.6860. PMC 305905. PMID 11118221.
Лыкке-Андерсен Дж, Шу MD, Штейц Дж.А. (2001). «RNPS1 ақуызының көмегімен mRNA қадағалау аппаратурасына экзон-экзон қосылыстарының орналасуын хабарлау». Ғылым. 293 (5536): 1836–9. дои:10.1126 / ғылым.1062786. PMID 11546874.
McCracken S, Lambermon M, Blencowe BJ (2002). «SRm160 біріктіру коактиваторы транскрипт 3'-ұшты бөлуге ықпал етеді». Мол. Ұяшық. Биол. 22 (1): 148–60. дои:10.1128 / MCB.22.1.148-160.2002 ж. PMC 134228. PMID 11739730.
Szymczyna BR, Pineda-Lucena A, Mills JL, Syyperski T, Arrowsmith CH (2002). «1H, 13C және 15N резонанс тағайындаулары және PMI доменінің қайталама құрылымы, SRm160-тан кішірейтілген өлшемділікті қолдана отырып». J. Biomol. NMR. 22 (3): 299–300. дои:10.1023 / A: 1014904502424. PMID 11991360.
Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR, Grigorieff N, Moore MJ (2002). «Үш өлшемді құрылымдық талдауға жарамды жергілікті сплитеосомаларды тазарту және сипаттамасы». РНҚ. 8 (4): 426–39. дои:10.1017 / S1355838202021088. PMC 1370266. PMID 11991638.
Lejeune F, Ishigaki Y, Li X, Maquat LE (2002). «Экзон-түйісу кешені CBP80-мен, бірақ eIF4E-мен байланыспаған мРНҚ-да сүтқоректілер клеткасында анықталады: mRNP қайта құру динамикасы». EMBO J. 21 (13): 3536–45. дои:10.1093 / emboj / cdf345. PMC 126094. PMID 12093754.
Meissner M, Lopato S, Gotzmann J, Sauermann G, Barta A (2003). «Прото-онкопротеин TLS / FUS ядролық матрицамен байланысты және PTB, SRm160 және SR ақуыздарының сплайсинг факторларымен кешенделген». Exp. Ұяшық Рес. 283 (2): 184–95. дои:10.1016 / S0014-4827 (02) 00046-0. PMID 12581738.
Szymczyna BR, Bowman J, McCracken S, Pineda-Lucena A, Lu Y, Cox B, Lambermon M, Graveley BR, Arrowsmith CH, Blencowe BJ (2003). «PWI мотивінің құрылымы мен қызметі: мРНҚ-ға дейінгі өңдеуді жеңілдететін нуклеин қышқылымен байланысатын жаңа домен». Genes Dev. 17 (4): 461–75. дои:10.1101 / gad.1060403. PMC 196000. PMID 12600940.
Вагнер С, Чиосей С, Никерсон Дж.А. (2003). «SRm160 кеңістіктік мақсатты және ядролық матрицаны байланыстыратын домендер». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 100 (6): 3269–74. дои:10.1073 / pnas.0438055100. PMC 152281. PMID 12624182.
McCracken S, Longman D, Johnstone IL, Cáceres JF, Blencowe BJ (2003). «Экзондық қосылыс кешенінің түзілуіне тәуелсіз жұмыс жасайтын, 3-ұшты өңдеудегі SRm160 үшін эволюциялық түрде сақталған рөл». Дж.Биол. Хим. 278 (45): 44153–60. дои:10.1074 / jbc.M306856200. PMID 12944400.
Вагнер С, Чиосей С, Ившина М, Никерсон Дж. (2004). «In vitro FRAP экзонды қосылыс SRm160 ақуызының ATP-ге тәуелді ядролық мобилизациясын анықтайды». Дж. Жасуша Биол. 164 (6): 843–50. дои:10.1083 / jcb.200307002. PMC 2172284. PMID 15024032.
Brill LM, Salomon AR, Ficarro SB, Mukherji M, Stettler-Gill M, Peters EC (2004). «Тирозинді фосфорлану учаскелерін иммобилизденген металға жақындық хроматографиясын және тандемдік масс-спектрометрияны қолданып, адамның Т жасушаларынан фосфопротеомдық профильді профильдеу». Анал. Хим. 76 (10): 2763–72. дои:10.1021 / ac035352d. PMID 15144186.

Сыртқы сілтемелер

SRRM1 адам генінің орналасуы UCSC Genome Browser.
SRRM1 адам генінің бөлшектері UCSC Genome Browser.

Бұл мақала а ген қосулы адамның хромосомасы 1 Бұл бұта. Сіз Уикипедияға көмектесе аласыз оны кеңейту.