SPOP - SPOP

Ажырату: анимациялық серияларды қараңыз She-Ra: Билік ханшайымы.
Сингапурлық әншілер байқауына қараңыз SPOP ән!
SPOP
Ақуыз SPOP PDB 2cr2.png
Қол жетімді құрылымдар
PDBОртологиялық іздеу: PDBe RCSB
Идентификаторлар
Бүркеншік аттарSPOP, BTBD32, TEF2, дақ дақтары BTB / POZ ақуызы, NEDMIDF, NSDVS1, NSDVS2, NEDMACE
Сыртқы жеке куәліктерOMIM: 602650 MGI: 1343085 HomoloGene: 68354 Ген-карталар: SPOP
Геннің орналасуы (адам)
17-хромосома (адам)
Хр.17-хромосома (адам)[1]
17-хромосома (адам)
SPOP үшін геномдық орналасу
SPOP үшін геномдық орналасу
Топ17q21.33Бастау49,598,884 bp[1]
Соңы49,678,163 bp[1]
РНҚ экспрессиясы өрнек
Ps.Bng мекен-жайында PBB GE SPOP 208927

Fs.png-де PBB GE SPOP 204640 с
Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Ортологтар
ТүрлерАдамТышқан
Энтрез
Ансамбль
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_025287
NM_001359107

RefSeq (ақуыз)

NP_079563
NP_001346036

Орналасқан жері (UCSC)Хр 17: 49.6 - 49.68 МбChr 11: 95.41 - 95.49 Mb
PubMed іздеу[3][4]
Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеуТінтуірді қарау / өңдеу

Дақтар типіндегі POZ ақуызы Бұл ақуыз адамдарда кодталған SPOP ген.[5][6][7]

Бұл ген а кодтайды ақуыз бұл өліммен байланысты ақуыздың транскрипциялық репрессиялық белсенділігін модуляциялай алатын 6 (DAXX ) өзара әрекеттеседі гистон деацетилаза, ядро гистондар, және басқа гистонмен байланысты ақуыздар. Тінтуірде кодталған ақуыз болжаммен байланысады лейцинді найзағай домен макроH2A1.2, активтенбеген Х хромосомалармен байытылған H2A гистонының нұсқасы. Бұл протеиннің BTB / POZ домені транскрипциялық репрессияны және гистон деацетилаза ко-репрессорлық кешендерінің компоненттерімен өзара әрекеттесетін басқа ақуыздарда көрсетілген. Балама қосу осы геннің нәтижесінде бір протеинді кодтайтын бірнеше транскрипт нұсқалары пайда болады.[7]

Клиникалық маңыздылығы

Мутациялар SPOP барлығының шамамен 15% -ына қатысады деп ойлаған қуықасты безі ісігінің түріне әкеледі простата қатерлі ісіктері.[8][9]

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ а б c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000121067 - Ансамбль, Мамыр 2017
  2. ^ а б c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000057522 - Ансамбль, Мамыр 2017
  3. ^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  4. ^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  5. ^ Nagai Y, Kojima T, Muro Y, Hachiya T, Nishizawa Y, Wakabayashi T, Hagiwara M (қараша 1997). «SPOP жаңа ядролық дақ түріндегі ақуызды анықтау». FEBS хаттары. 418 (1–2): 23–6. дои:10.1016 / S0014-5793 (97) 01340-9. PMID  9414087. S2CID  32204506.
  6. ^ Zapata JM, Pawlowski K, Haas E, Ware CF, Godzik A, Reed JC (маусым 2001). «Ісік некрозы факторларының рецепторларымен байланысты факторларының домендері бар ақуыздардың әр түрлі отбасы». Биологиялық химия журналы. 276 (26): 24242–52. дои:10.1074 / jbc.M100354200. PMID  11279055.
  7. ^ а б «Entrez Gene: SPOP дақ түріндегі POZ ақуызы».
  8. ^ Хайди Эванс (20 мамыр 2012). «Ғалымдар қуық асты безі қатерлі ісігінің жаңа түрін тапты - бұл емдеу арнайы емдеуге әкелуі мүмкін». New York Daily News. Алынған 20 мамыр 2012.
  9. ^ Barbieri CE, Baca SC, Lawrence MS, Demichelis F, Blattner M, Theurillat JP, White TA, Stojanov P, Van Van Alen E, Stransky N, Nickerson E, Chae SS, Boysen G, Auclair D, Onofrio RC, Park K, Китабаяши N, MacDonald TY, шейх K, Vuong T, Guiducci C, Cibulskis K, Sivachenko A, Carter SL, Saksena G, Voet D, Hussain WM, Ramos AH, Winckler W, Redman MC, Ардли K, Tewari AK, Mosquera JM, Rupp N, Wild PJ, Moch H, Morrissey C, Nelson PS, Kantoff PW, Gabriel SB, Golub TR, Meyerson M, Lander ES, Getz G, Rubin MA, Garraway LA (маусым 2012). «Exome секвенциясы простата қатерлі ісігінің қайталанатын SPOP, FOXA1 және MED12 мутациясын анықтайды». Табиғат генетикасы. 44 (6): 685–9. дои:10.1038 / нг.2279. PMC  3673022. PMID  22610119.

Әрі қарай оқу