Роксан (ақуыз) - Roxan (protein) - Wikipedia

ZC3H7B
Идентификаторлар
Бүркеншік аттарZC3H7B, RoXaN, құрамында 7В, ROXAN1 бар мырыш саусағы CCCH
Сыртқы жеке куәліктерOMIM: 618206 MGI: 1328310 HomoloGene: 9735 Ген-карталар: ZC3H7B
Геннің орналасуы (адам)
22-хромосома (адам)
Хр.22-хромосома (адам)[1]
22-хромосома (адам)
ZC3H7B үшін геномдық орналасу
ZC3H7B үшін геномдық орналасу
Топ22q13.2Бастау41,301,525 bp[1]
Соңы41,360,147 bp[1]
РНҚ экспрессиясы өрнек
Fs.png-де PBB GE ZC3H7B 205877 с

PBB GE ZC3H7B 213323 с at fs.png
Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Ортологтар
ТүрлерАдамТышқан
Энтрез
Ансамбль
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_017590

NM_001081016

RefSeq (ақуыз)

NP_060060

NP_001074485

Орналасқан жері (UCSC)Хр 22: 41.3 - 41.36 МбХр 15: 81.75 - 81.8 Мб
PubMed іздеу[3][4]
Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеуТінтуірді қарау / өңдеу

RoXaN (Ротавирус 'X'-құрылымдық емес ақуыз), сондай-ақ белгілі ZC3H7B (құрамында 7В бар мырыш саусағы CCCH типі), а ақуыз адамдарда кодталған ZC3H7B ген.[5] RoXaN құрамында белок бар тетратрикопептидті қайталау және лейцин-аспартатты қайталау саусақ мырыш домендер. Бұл ақуыз сонымен бірге ротавирус құрылымдық емес ақуыз NSP3.[5]

Функция

Ротавирус мРНҚ болып табылады жабық бірақ жоқ полиаденилденген және вирустық ақуыздар болып табылады аударылған ұялы аударма машинасы арқылы. Бұл вирустың әрекеті арқылы жүзеге асырылады Құрылымдық ақуыз NSP3 вирустық мРНҚ-ның 3 'консенсус дәйектілігін арнайы байланыстырады өзара әрекеттеседі эукариоттық трансляцияның басталу факторымен eIF4G I.[6]

RoXaN (ротавирус X ақуызымен байланысты NSP3 ) - бұл ақуыз-ақуыз немесе нуклеин қышқылы-ақуыздың өзара әрекеттесуіне қатысуы мүмкін деп болжанған кем дегенде үш аймақтан тұратын 110-кДа жасушалық ақуыз. A тетратрикопептид қайталанатын аймақ, көбінесе мультипротеинді кешендерде кездесетін ақуыз-ақуыздың өзара әрекеттесу саласы амин-терминал аймағында болады. Карбокси терминалында кем дегенде бес саусақ мырыш мотивтер байқалады, бұдан әрі RoXaN басқа ақуыздарды немесе нуклеин қышқылдарын байланыстыру қабілетін көрсетеді. Осы екі аймақтың арасында а паксиллин ақуыз-ақуыздың өзара әрекеттесуіне қатысатын лейцин-аспартатты қайталану (LD) мотиві.[6]

Клиникалық маңызы

RoXaN in vivo және ротавирустық инфекция кезінде NSP3-пен өзара әрекеттесуге қабілетті. Өзара әрекеттесу домендері NSP3 (аминқышқылдары 163-тен 237-ге дейін) және RoXaN (аминқышқылдары 244-тен 341-ге дейінгі) LD доменіне сәйкес келеді. NSP3 пен RoXaN арасындағы өзара әрекеттесу NSP3 пен eIF4G I арасындағы өзара әрекеттесуді бұзбайды, ал NSP3, RoXaN және eIF4G I-ден құралған үштік кешенді ротавирус жұқтырған жасушалардан анықтауға болады, бұл RoXaN аударма реттеу.[6]

RoXaN экспрессиясының GIST-тегі жоғары ісік дәрежесімен байланысы бар екендігі анықталды (асқазан-ішек стромальды ісіктері ).[7]

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ а б в GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000100403 - Ансамбль, Мамыр 2017
  2. ^ а б в GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000022390 - Ансамбль, Мамыр 2017
  3. ^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  4. ^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  5. ^ а б «Entrez Gene: ZC3H7B мырыш саусағы CCCH типті, құрамында 7Б».
  6. ^ а б в Vitour D, Lindenbaum P, Vende P, Becker MM, Poncet D (сәуір 2004). «RoXaN, құрамында TPR, LD және мырыш саусақ мотивтері бар жасушалық ақуыз, 4G эукариоттық инициация коэффициентімен және NSP3 ротавирусымен үштік кешен құрайды». Дж. Вирол. 78 (8): 3851–62. дои:10.1128 / JVI.78.8.3851-3862.2004. PMC  374268. PMID  15047801.
  7. ^ Kang HJ, Koh KH, Yang E, You KT, Kim HJ, Paik YK, Kim H (ақпан 2006). «KIT және PDGFRA мутациясы бар асқазан-ішек стромальды ісіктеріндегі дифференциалды түрде көрсетілген белоктар». Протеомика. 6 (4): 1151–7. дои:10.1002 / pmic.200500372. PMID  16402362.

Әрі қарай оқу