RBBP5 - RBBP5

RBBP5
Қол жетімді құрылымдар
PDB	Ортологиялық іздеу: PDBe RCSB
PDB идентификатор кодтарының тізімі
	3P4F, 4X8N, 4X8P, 5F6K, 5F6L
Идентификаторлар
Бүркеншік аттар	RBBP5, RBQ3, SWD1, ретинобластома байланыстыратын ақуыз 5, RB байланыстыратын ақуыз 5, гистон лизин метилтрансфераза кешені суббірлігі
Сыртқы жеке куәліктер	OMIM: 600697 MGI: 1918367 HomoloGene: 3709 Ген-карталар: RBBP5
Геннің орналасуы (адам)
Хр.	1-хромосома (адам)
Соңы	205,122,015 bp
Геннің орналасуы (тышқан)
Хр.	1-хромосома (тышқан)
Соңы	132,505,659 bp
РНҚ экспрессиясы өрнек
	Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Гендік онтология
Молекулалық функция	• метилденген гистонмен байланысуы; • GO: 0001948 ақуыздармен байланысуы; • гистон метилтрансфераза белсенділігі (H3-K4 спецификалық); • гистон-лизин N-метилтрансфераза белсенділігі;
Ұялы компонент	• MLL1 кешені; • ядро; • MLL3 / 4 кешені; • жасуша ядросы; • нуклеоплазма; • гистон метилтрансфераза кешені; • Set1C / COMPASS кешені;
Биологиялық процесс	• эстрогенге жауап; • гистонның H3-K4 метилденуі; • транскрипцияны реттеу, ДНҚ-шаблонмен; • транскрипция, ДНҚ-шаблонмен; • ДНҚ-ның зақымдалуына әсер ететін жасушалық жауап; • бета-катенин-TCF жиынтығы; • аудармадан кейінгі модификация; • мегакариоциттер дифференциациясының реттелуі; • хроматинді ұйымдастыру;
	Дереккөздер:Амиго / QuickGO
Ортологтар
	5929
	213464
	ENSG00000117222
	ENSMUSG00000026439
	Q15291
	Q8BX09
	NM_001193272; NM_001193273; NM_005057
	NM_172517; NM_001357486; NM_001357487
	NP_001180201; NP_001180202; NP_005048
	NP_766105; NP_001344415; NP_001344416
	Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеу	Тінтуірді қарау / өңдеу

Ретинобластоманы байланыстыратын ақуыз 5 Бұл ақуыз адамдарда кодталған RBBP5 ген.^[5]^[6]

Функция

Осы генмен кодталған ақуыз барлық жерде көрсетілген ядролық ақуыз болып табылады және WD қайталанатын ақуыздардың жоғары консервіленген субфамилиясына жатады. Ол жасушалардың көбеюін реттейтін ретинобластома ақуызымен тікелей байланысатын бірнеше белоктардың арасында кездеседі. Кодталған ақуыз фосфорланған ретинобластома ақуызымен E1A байланыстыратын қалта В арқылы жақсырақ әрекеттеседі.^[6]

Өзара әрекеттесу

RBBP5 көрсетілді өзара әрекеттесу бірге:

ASCL2,^[7]
MLL,^[8]
MLL3,^[7] және
NCOA6.^[7]

Пайдаланылған әдебиеттер

^ ^а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000117222 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000026439 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ Saijo M, Sakai Y, Kishino T, Niikawa N, Matsuura Y, Morino K, Tamai K, Taya Y (маусым 1995). «Ретинобластома ақуызымен байланысатын және хромосомалық картаға түсіретін адам ақуызын молекулалық клондау». Геномика. 27 (3): 511–9. дои:10.1006 / geno.1995.1084. PMID 7558034.
^ ^а ^б «Entrez Gene: RBBP5 ретинобластома байланыстыратын ақуыз 5».
^ ^а ^б ^c Goo YH, Sohn YC, Kim DH, Kim SW, Kang MJ, Jung DJ, Kwak E, Barlev NA, Berger SL, Chow VT, Roeder RG, Azorsa DO, Meltzer PS, Suh PG, Song EJ, Lee KJ, Lee YC , Lee JW (қаңтар 2003). «Белсенді коинтегратор 2 активтендірілуі триторакс тобының ақуыздарының құрамына кіретін тұрақты тұрақты кешенге жатады». Молекулалық және жасушалық биология. 23 (1): 140–9. дои:10.1128 / mcb.23.1.140-149.2003 ж. PMC 140670. PMID 12482968.
^ Yokoyama A, Wang Z, Wysocka J, Sanyal M, Aufiero DJ, Kitabayashi I, Herr W, Cleary ML (шілде 2004). «Лейкоз прото-онкопротеин MLL менксі бар HET генінің экспрессиясын реттеу үшін SET1 тәрізді гистон метилтрансфераза кешенін құрайды». Молекулалық және жасушалық биология. 24 (13): 5639–49. дои:10.1128 / MCB.24.13.5639-5649.2004. PMC 480881. PMID 15199122.

Әрі қарай оқу

Hillier LD, Lennon G, Becker M, Bonaldo MF, Chiapelli B, Chissoe S, Dietrich N, DuBuque T, Favello A, Gish W, Hawkins M, Hultman M, Kucaba T, Lacy M, Le M, Le N, Mardis E , Мур В, Моррис М, Парсонс Дж, Пранж С, Рифкин Л, Рольфинг Т, Шелленберг К, Бенто Соарес М, Тан Ф, Тьерри-Мег Дж, Треваскис Е, Андервуд К, Вольдман П, Уотерстон Р, Уилсон Р, Марра М (қыркүйек 1996). «280 000 адам білдіретін дәйектілік белгілерін құру және талдау». Геномды зерттеу. 6 (9): 807–28. дои:10.1101 / гр.6.9.807. PMID 8889549.
Suzuki Y, Tsunoda T, Sese J, Taira H, Mizushima-Sugano J, Hata H, Ota T, Isogai T, Tanaka T, Nakamura Y, Suyama A, Sakaki Y, Morishita S, Okubo K, Sugano S (мамыр 2001) . «Адам гендерінің 1031 түрінің ықтимал промоутерлік аймақтарын анықтау және сипаттау». Геномды зерттеу. 11 (5): 677–84. дои:10.1101 / гр.гр-1640р. PMC 311086. PMID 11337467.
Goo YH, Sohn YC, Kim DH, Kim SW, Kang MJ, Jung DJ, Kwak E, Barlev NA, Berger SL, Chow VT, Roeder RG, Azorsa DO, Meltzer PS, Suh PG, Song EJ, Lee KJ, Lee YC , Lee JW (қаңтар 2003). «Белсенді коинтегратор 2 активтендірілуі триторакс тобының ақуыздарының құрамына кіретін тұрақты тұрақты кешенге жатады». Молекулалық және жасушалық биология. 23 (1): 140–9. дои:10.1128 / MCB.23.1.140-149.2003 ж. PMC 140670. PMID 12482968.
Хьюз К.М., Розенблатт-Розен О, Милн ТА, Копеланд ТД, Левин СС, Ли Дж.К., Хейз Д.Н., Шанмугам К.С., Бхаттачаржи А, Бионди Калифорния, Кэй Г.Ф., Хейвард Н.К., Хесс Дж.Л., Мейерсон М (ақпан 2004). «Мен менің триторакс отбасылық гистон метилтрансфераза кешенімен және hoxc8 локусымен байланысады». Молекулалық жасуша. 13 (4): 587–97. дои:10.1016 / S1097-2765 (04) 00081-4. PMID 14992727.
Yokoyama A, Wang Z, Wysocka J, Sanyal M, Aufiero DJ, Kitabayashi I, Herr W, Cleary ML (шілде 2004). «Лейкоз прото-онкопротеин MLL менксі бар HET генінің экспрессиясын реттеу үшін SET1 тәрізді гистон метилтрансфераза кешенін құрайды». Молекулалық және жасушалық биология. 24 (13): 5639–49. дои:10.1128 / MCB.24.13.5639-5649.2004. PMC 480881. PMID 15199122.
Dou Y, Milne TA, Tackett AJ, Smith ER, Fukuda A, Wysocka J, Allis CD, Chait BT, Hess JL, Roeder RG (маусым 2005). «H3 K4 метилтрансфераза MLL1 және H4 K16 ацетилтрансфераза MOF физикалық ассоциациясы және координаталық қызметі». Ұяшық. 121 (6): 873–85. дои:10.1016 / j.cell.2005.04.031. PMID 15960975.
Scacheri PC, Davis S, Odom DT, Crawford GE, Perkins S, Halawi MJ, Agarwal SK, Marks SJ, Spiegel AM, Meltzer PS, Collins FS (сәуір 2006). «Меноммен байланыстырудың геномдық анализі MEN1 тумерогенезі туралы түсінік береді». PLoS генетикасы. 2 (4): e51. дои:10.1371 / journal.pgen.0020051. PMC 1428788. PMID 16604156.
Хига Л.А., Ву М, Е Т, Кобаяши Р, Сун Х, Чжан Н (қараша 2006). «CUL4-DDB1 убиквитин лигазы көптеген WD40 қайталанатын ақуыздармен әрекеттеседі және гистон метиляциясын реттейді». Табиғи жасуша биологиясы. 8 (11): 1277–83. дои:10.1038 / ncb1490. PMID 17041588.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (қараша 2006). «Сигналды желілердегі ғаламдық, in vivo және нақты фосфорлану динамикасы». Ұяшық. 127 (3): 635–48. дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983.

Бұл мақала а ген қосулы адамның хромосомасы 1 Бұл бұта. Сіз Уикипедияға көмектесе аласыз оны кеңейту.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000117222 - Ансамбль, Мамыр 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000026439 - Ансамбль, Мамыр 2017

[3] «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[4] «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[pmid7558034-5] Saijo M, Sakai Y, Kishino T, Niikawa N, Matsuura Y, Morino K, Tamai K, Taya Y (маусым 1995). «Ретинобластома ақуызымен байланысатын және хромосомалық картаға түсіретін адам ақуызын молекулалық клондау». Геномика. 27 (3): 511–9. дои:10.1006 / geno.1995.1084. PMID 7558034.

[entrez-6] а ^б «Entrez Gene: RBBP5 ретинобластома байланыстыратын ақуыз 5».

[pmid12482968-7] а ^б ^c Goo YH, Sohn YC, Kim DH, Kim SW, Kang MJ, Jung DJ, Kwak E, Barlev NA, Berger SL, Chow VT, Roeder RG, Azorsa DO, Meltzer PS, Suh PG, Song EJ, Lee KJ, Lee YC , Lee JW (қаңтар 2003). «Белсенді коинтегратор 2 активтендірілуі триторакс тобының ақуыздарының құрамына кіретін тұрақты тұрақты кешенге жатады». Молекулалық және жасушалық биология. 23 (1): 140–9. дои:10.1128 / mcb.23.1.140-149.2003 ж. PMC 140670. PMID 12482968.

[pmid15199122-8] Yokoyama A, Wang Z, Wysocka J, Sanyal M, Aufiero DJ, Kitabayashi I, Herr W, Cleary ML (шілде 2004). «Лейкоз прото-онкопротеин MLL менксі бар HET генінің экспрессиясын реттеу үшін SET1 тәрізді гистон метилтрансфераза кешенін құрайды». Молекулалық және жасушалық биология. 24 (13): 5639–49. дои:10.1128 / MCB.24.13.5639-5649.2004. PMC 480881. PMID 15199122.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]