RAPGEF2 - RAPGEF2

RAPGEF2
Идентификаторлар
Бүркеншік аттар	RAPGEF2, CNrasGEF, NRAPGEP, PDZ-GEF1, PDZGEF1, RA-GEF, RA-GEF-1, Rap-GEP, nRap GEP, Rap гуаниндік нуклеотидтермен алмасу коэффициенті 2, RAGEF
Сыртқы жеке куәліктер	OMIM: 609530 MGI: 2659071 HomoloGene: 35477 Ген-карталар: RAPGEF2
Геннің орналасуы (адам)
Хр.	4-хромосома (адам)
Соңы	159,360,174 bp
Геннің орналасуы (тышқан)
Хр.	3-хромосома (тышқан)
Соңы	79,286,517 bp
Гендік онтология
Молекулалық функция	• кальций ионымен байланысуы; • GO: 0001948 ақуыздармен байланысуы; • диацилглицеринмен байланысуы; • сигнал түрлендіргішінің белсенділігі; • гуанил-нуклеотидтік алмасу факторының белсенділігі; • WW доменін байланыстыру; • фосфатид қышқылымен байланысуы; • PDZ доменін байланыстыру; • cAMP байланыстыруы; • cGMP байланыстыру; • бета-1 адренергиялық рецепторларды байланыстыру; • GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 GTPase активаторының әрекеті; • Рап гуанил-нуклеотидтік алмасу факторының белсенділігі; • Рас гуанил-нуклеотидтік алмасу факторының белсенділігі;
Ұялы компонент	• жасушааралық түйісу; • эндоцитикалық көпіршік; • синапс; • плазмалық мембрананың ажырамас компоненті; • апикальды плазмалық мембрана; • екі жасушалы тығыз байланыс; • эндосома; • жасушалық түйісу; • нейрондық проекция; • нейрондық жасуша денесі; • цитоплазма; • цитозол; • кеш эндосома; • мембрана; • жасуша қабығы; • цитоплазманың перинуклеарлы аймағы; • макромолекулалық кешен; • жасушаішілік;
Биологиялық процесс	• ERK1 және ERK2 каскадының оң реттелуі; • мидың алынған нейротрофиялық факторлы рецепторлық сигнал беру жолы; • cGMP-ге жасушалық жауап; • қарыншалық жүйенің дамуы; • ақуыздармен байланысудың оң реттелуі; • мидың алдыңғы миының дамуы; • ұяшықтардың түйісуін реттеу; • ақуыздың плазмалық мембранаға оқшаулануы; • нейрондық проекцияның дамуын оң реттеу; • аденилатциклазаны белсендіретін адренергиялық рецепторлардың сигнализациясы; • жүйке жүйесінің дамуы; • нейрондық миграция; • нейропептидтік сигнал беру жолы; • көп жасушалы организмнің дамуы; • G-ақуызбен байланысқан рецепторлық сигнал беру жолы; • меланин биосинтетикалық процестің теріс реттелуі; • жүйке өсу факторын ынталандыруға жасушалық жауап; • жасушалардың дифференциациясы; • cAMP-делдалдығының оң реттелуі; • GO: 0007243 жасушаішілік сигнал беру; • cAMP-ге жасушалық жауап; • жүйенің өсу факторы сигнализациясы; • жасушалардың көбеюін реттеу; • Реп ақуызды сигналды беру; • шағын GTPase арқылы сигнал беру; • жасушалардың көбеюін теріс реттеу; • қан тамырларының дамуы; • дендритті жасушаның апоптотикалық процесінің оң реттелуі; • васкулогенездің оң реттелуі; • microvillus құрастыру; • дендрит морфогенезінің теріс реттелуі; • синаптикалық пластиканы реттеу; • нейрондық проекцияны дамыту; • эндотелий ішек тосқауылын орнату; • цАМФ-қа тәуелді протеинкиназа белсенділігінің оң реттелуі; • нейрондық миграцияның оң реттелуі; • ақуыздың киназа белсенділігінің оң реттелуі; • эндотелий тосқауылын орнату; • сигнал беру; • MAPK каскады; • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 GTPase белсенділігінің оң реттелуі; • cAMP-делдалдық сигнал беру;
	Дереккөздер:Амиго / QuickGO
Ортологтар
	9693
	76089
	ENSG00000109756
	ENSMUSG00000062232
	Q9Y4G8
	Q8CHG7
NM_014247; NM_001351724; NM_001351725; NM_001351726; NM_001351727;
	NM_001351728
	NM_001099624; NM_001310536
NP_055062; NP_001338653; NP_001338654; NP_001338655; NP_001338656;
	NP_001338657
	NP_001093094; NP_001297465
	Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеу	Тінтуірді қарау / өңдеу

Рап-гуаниндік нуклеотидтік алмасу коэффициенті 2 Бұл ақуыз адамдарда кодталған RAPGEF2 ген.^[5]^[6]^[7]

RAPGEF2 а циклдық AMP байланыстыратын ақуыз.^[8]^[9]

Функция

Мүшелері RAS қосалқы отбасы туралы GTP фазалары белсенді емес режимде ауысатын GTP / ЖІӨ реттелетін қосқыштар ретінде сигнал берудегі функция ЖІӨ - және белсенді GTP - шекаралас мемлекеттер. Гуаниндік нуклеотидтік алмасу факторлары (GEF), мысалы, RAPGEF2, белсенді GTP-мен байланысқан күйді сақтау үшін GTP-ді алуға ықпал ету арқылы RAS активаторлары ретінде қызмет етеді және жасуша бетінің рецепторлары мен RAS активациясы арасындағы негізгі байланыс болып табылады.^[6]

Өзара әрекеттесу

RAPGEF2 көрсетілді өзара әрекеттесу бірге RAP1A^[6] және РАЛГДС.^[10]

Пайдаланылған әдебиеттер

^ ^а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000109756 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000062232 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ Нагасе Т, Исикава К, Накаджима Д, Охира М, Секи Н, Мияджима Н, Танака А, Котани Х, Номура Н, Охара О (қыркүйек 1997). «Адамның анықталмаған гендерінің кодталу ретін болжау. VII. Ірі протеиндерді in vitro кодтай алатын мидағы 100 жаңа кДНК клондарының толық тізбегі». DNA Res. 4 (2): 141–50. дои:10.1093 / dnares / 4.2.141. PMID 9205841.
^ ^а ^б ^c Ребхун Дж.Ф., Кастро АФ, Квиллиам Л.А. (қараша 2000). «Rap1 GTPase үшін гуаниндік нуклеотидтік алмасу факторларын (GEF) анықтау. M-Ras-GTP өзара әрекеттесуімен MR-GEF-ті реттеу». J Biol Chem. 275 (45): 34901–8. дои:10.1074 / jbc.M005327200. PMID 10934204.
^ «Entrez Gene: RAPGEF2 Rap гуаниндік нуклеотидтік алмасу коэффициенті (GEF) 2».
^ Фам Н, Чеглаков I, Кох СА, де Хуг КЛ, Моран М.Ф., Ротин Д (мамыр 2000). «CNrasGEF гуаниндік нуклеотидтік алмасу коэффициенті cAMP және cGMP реакцияларына жауап береді». Curr. Биол. 10 (9): 555–8. дои:10.1016 / S0960-9822 (00) 00473-5. PMID 10801446. S2CID 16896523.
^ Emery AC, Eiden MV, Mustafa T, Eiden LE (2013). «Rapgef2 нейрондық және эндокриндік жасушаларда ERK активациясына GPCR-делдалды cAMP сигналдарын қосады». Ғылыми сигнал. 6 (281): ra51. дои:10.1126 / scisignal.2003993. PMC 3932028. PMID 23800469.
^ Спаргарен М, Bischoff JR (желтоқсан 1994). «Ral үшін гуаниндік нуклеотидті диссоциациялаушы стимуляторды R-ras, H-ras, K-ras және Rap-тің болжамды эффекторлы молекуласы ретінде анықтау». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 91 (26): 12609–13. дои:10.1073 / pnas.91.26.12609. PMC 45488. PMID 7809086.

Әрі қарай оқу

Андерссон Б, Вентланд М.А., Рикафренте Дж., Т.б. (1996). «Мылтық кітапханасын жақсартуға арналған» қос адаптер «әдісі». Анал. Биохимия. 236 (1): 107–13. дои:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.
Ю В, Андерссон Б, Уорли К.С. және т.б. (1997). «Үлкен масштабты біріктіру cDNA тізбегі». Genome Res. 7 (4): 353–8. дои:10.1101 / гр.7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174.
Охцука Т, Хата Ю, Иде Н және т.б. (1999). «nRap GEP: синаптикалық орман молекуласымен (S-SCAM) әрекеттесетін rap1 кіші G ақуызына жаңа нейрондық ЖІӨ / GTP алмасу ақуызы» «. Биохимия. Биофиз. Res. Коммун. 265 (1): 38–44. дои:10.1006 / bbrc.1999.1619. PMID 10548487.
Liao Y, Kariya K, Ху CD және т.б. (2000). «RA-GEF, құрамына Ras / Rap1A байланыстыратын домені кіретін Rap1A гуаниндік нуклеотидтік алмасу факторы, нематод пен адамдар арасында сақталған». Дж.Биол. Хим. 274 (53): 37815–20. дои:10.1074 / jbc.274.53.37815. PMID 10608844.
de Rooij J, Boenink NM, van Triest M және т.б. (2000). «PDZ-GEF1, Rap1 және Rap2 үшін гуаниндік нуклеотидтік алмасу коэффициенті». Дж.Биол. Хим. 274 (53): 38125–30. дои:10.1074 / jbc.274.53.38125. PMID 10608883.
Чикуми Х, Фукухара С, Гуткинд Дж.С. (2002). «Rho, PDZ-RhoGEF және LARG үшін G ақуызға байланысты гуаниндік нуклеотидтік алмасу факторларын тирозинфосфорлану арқылы реттеу: фокустық адгезия киназының рөлінің дәлелі». Дж.Биол. Хим. 277 (14): 12463–73. дои:10.1074 / jbc.M108504200. PMID 11799111.
Wistow G, Bernstein SL, Wyatt MK және т.б. (2002). «NEIBank жобасы үшін ересек адамның объективінің дәйектілік белгісін талдау: 2000-нан астам артық емес транскрипциялар, роман-гендер және сплайс нұсқалары». Мол. Vis. 8: 171–84. PMID 12107413.
Aurandt J, Vikis HG, Gutkind JS және т.б. (2002). «Семафоринді қабылдаушы плексин-B1 Rho-ға тән нуклеотидтік алмасу коэффициентімен тікелей әсерлесу арқылы сигнал береді, LARG». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 99 (19): 12085–90. дои:10.1073 / pnas.142433199. PMC 129402. PMID 12196628.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH және т.б. (2003). «Адам мен тышқанның 15000-нан астам толық ұзындықтағы кДНҚ тізбектерінің генерациясы және алғашқы талдауы». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 99 (26): 16899–903. дои:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Кимура К, Вакамацу А, Сузуки Ю және т.б. (2006). «Транскрипциялық модуляцияны әртараптандыру: ауқымды идентификация және адам гендерінің болжамды альтернативті промоторларының сипаттамасы». Genome Res. 16 (1): 55–65. дои:10.1101 / гр.4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Хисата С, Сакисака Т, Баба Т және т.б. (2007). «Rap1-PDZ-GEF1 кеш эндосомаларда нейротрофинді рецептормен өзара әрекеттеседі, бұл Rap1 және ERK тұрақты активациясына және нейриттердің өсуіне әкеледі». Дж. Жасуша Биол. 178 (5): 843–60. дои:10.1083 / jcb.200610073. PMC 2064548. PMID 17724123.

Бұл ақуыз - қатысты мақала а бұта. Сіз Уикипедияға көмектесе аласыз оны кеңейту.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000109756 - Ансамбль, Мамыр 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000062232 - Ансамбль, Мамыр 2017

[3] «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[4] «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[pmid9205841-5] Нагасе Т, Исикава К, Накаджима Д, Охира М, Секи Н, Мияджима Н, Танака А, Котани Х, Номура Н, Охара О (қыркүйек 1997). «Адамның анықталмаған гендерінің кодталу ретін болжау. VII. Ірі протеиндерді in vitro кодтай алатын мидағы 100 жаңа кДНК клондарының толық тізбегі». DNA Res. 4 (2): 141–50. дои:10.1093 / dnares / 4.2.141. PMID 9205841.

[pmid10934204-6] а ^б ^c Ребхун Дж.Ф., Кастро АФ, Квиллиам Л.А. (қараша 2000). «Rap1 GTPase үшін гуаниндік нуклеотидтік алмасу факторларын (GEF) анықтау. M-Ras-GTP өзара әрекеттесуімен MR-GEF-ті реттеу». J Biol Chem. 275 (45): 34901–8. дои:10.1074 / jbc.M005327200. PMID 10934204.

[entrez-7] «Entrez Gene: RAPGEF2 Rap гуаниндік нуклеотидтік алмасу коэффициенті (GEF) 2».

[pmid10801446-8] Фам Н, Чеглаков I, Кох СА, де Хуг КЛ, Моран М.Ф., Ротин Д (мамыр 2000). «CNrasGEF гуаниндік нуклеотидтік алмасу коэффициенті cAMP және cGMP реакцияларына жауап береді». Curr. Биол. 10 (9): 555–8. дои:10.1016 / S0960-9822 (00) 00473-5. PMID 10801446. S2CID 16896523.

[pmid23800469-9] Emery AC, Eiden MV, Mustafa T, Eiden LE (2013). «Rapgef2 нейрондық және эндокриндік жасушаларда ERK активациясына GPCR-делдалды cAMP сигналдарын қосады». Ғылыми сигнал. 6 (281): ra51. дои:10.1126 / scisignal.2003993. PMC 3932028. PMID 23800469.

[pmid7809086-10] Спаргарен М, Bischoff JR (желтоқсан 1994). «Ral үшін гуаниндік нуклеотидті диссоциациялаушы стимуляторды R-ras, H-ras, K-ras және Rap-тің болжамды эффекторлы молекуласы ретінде анықтау». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 91 (26): 12609–13. дои:10.1073 / pnas.91.26.12609. PMC 45488. PMID 7809086.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]