RAB5B - RAB5B

RAB5B
Қол жетімді құрылымдар
PDB	Ортологиялық іздеу: PDBe RCSB
PDB идентификатор кодтарының тізімі
	2HEI
Идентификаторлар
Бүркеншік аттар	RAB5B, Rab-5B, RAS онкогендер отбасы
Сыртқы жеке куәліктер	OMIM: 179514 MGI: 105938 HomoloGene: 104027 Ген-карталар: RAB5B
Геннің орналасуы (адам)
Хр.	12-хромосома (адам)
Соңы	55,996,683 bp
Геннің орналасуы (тышқан)
Хр.	10-хромосома (тышқан)
Соңы	128,696,264 bp
РНҚ экспрессиясы өрнек
	Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Гендік онтология
Молекулалық функция	• нуклеотидті байланыстыру; • ЖІӨ міндетті; • GTP байланысы; • GTP тәуелді ақуыздармен байланысуы; • GO: 0001948 ақуыздармен байланысуы; • GTPase белсенділігі;
Ұялы компонент	• эндосома; • мембрана; • меланосома; • эндоцитикалық көпіршік; • жасушаішілік; • ерте эндосома; • жасушадан тыс экзома; • жасуша қабығы; • секреторлы түйіршік қабықшасы; • ерте эндосома қабығы; • жасушаішілік мембранамен шектелген органоид; • синаптикалық көпіршік мембранасының зәкірлі компоненті;
Биологиялық процесс	• эндоцитоздың реттелуі; • антигенді өңдеу және презентация; • эндосома ұйымы; • плазмалық мембрана эндосоманың тасымалдануына дейін; • ақуызды тасымалдау; • нейтрофилді дегрануляция; • көлік; • жасуша ішіндегі ақуыздың тасымалдануы; • Раб ақуызының сигналын беру; • эндоцитоз;
	Дереккөздер:Амиго / QuickGO
Ортологтар
	5869
	19344
	ENSG00000111540
	ENSMUSG00000000711
	P61020
	P61021
	NM_001252036; NM_001252037; NM_002868
	NM_011229; NM_177411
	NP_001238965; NP_001238966; NP_002859
	NP_803130
	Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеу	Тінтуірді қарау / өңдеу

Rab-5B ақуызымен байланысты Бұл ақуыз адамдарда бар кодталған бойынша RAB5B ген.^[5]^[6]^[7]

Әдебиеттер тізімі

^ ^а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000111540 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000000711 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ Уилсон Д.Б., Уилсон МП (сәуір 1992). «GTPase-ге байланысты супфамиланың жаңа мүшесі, адамның rab5b-н анықтау және ішкі жасушалық оқшаулау». J Clin Invest. 89 (3): 996–1005. дои:10.1172 / JCI115683. PMC 442949. PMID 1541686.
^ Chiariello M, Bruni CB, Bucci C (тамыз 1999). «Rab5a, Rab5b және Rab5c ұсақ GTPases in vitro дифференциалды түрде фосфорланады». FEBS Lett. 453 (1–2): 20–4. дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 00686-9. PMID 10403367. S2CID 30308802.
^ «Entrez Gene: RAB5B RAB5B, RAS онкогендер отбасы».

Әрі қарай оқу

Bucci C, Lütcke A, Steele-Mortimer O, Olkkonen VM, Dupree P, Chiariello M, Bruni CB, Simons K, Zerial M (1995). «Эндоцитоздың үш Rab5 изоформасымен бірлесіп реттелуі». FEBS Lett. 366 (1): 65–71. дои:10.1016 / 0014-5793 (95) 00477-Q. PMID 7789520. S2CID 40284549.
Korenberg JR, Chen XN, Адамс MD, Venter JC (1996). «Адам геномының cDNA картасына». Геномика. 29 (2): 364–70. дои:10.1006 / geno.1995.9993. PMID 8666383.
Bao S, Zhu J, Garvey WT (1999). «Адамның қаңқа бұлшықетінде көрсетілген Rab GTPase клондау: инсулинге төзімді субъектілерде зерттеулер». Хорм. Metab. Res. 30 (11): 656–62. дои:10.1055 / с-2007-978953. PMID 9918381.
Каллаган Дж, Никсон С, Буччи С, Тох Б.Х., Стенмарк Н (1999). «EEA1-нің Rab5b-мен тікелей өзара әрекеттесуі». EUR. Дж. Биохим. 265 (1): 361–6. дои:10.1046 / j.1432-1327.1999.00743.x. PMID 10491193.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). «In vitro сайтқа тән рекомбинацияны қолдану арқылы ДНҚ-ны клондау». Genome Res. 10 (11): 1788–95. дои:10.1101 / гр.143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (2001). «Адам гендері мен ақуыздарының каталогына қарай: адамның кДНҚ-ын кодтайтын 500 жаңа ақуыздың дәйектілігі мен анализі». Genome Res. 11 (3): 422–35. дои:10.1101 / гр. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (2001). «Үлкен масштабты кДНҚ секвенциясы арқылы анықталған жаңа ақуыздардың жүйелік жасушалық оқшаулануы». EMBO Rep. 1 (3): 287–92. дои:10.1093 / embo-report / kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
Tall GG, Barbieri MA, Stahl PD, Horazdovsky BF (2001). «Рас-белсендірілген эндоцитоз RIN5-тің Rab5 гуаниндік нуклеотидтік алмасу белсенділігімен жүреді». Dev. Ұяшық. 1 (1): 73–82. дои:10.1016 / S1534-5807 (01) 00008-9. PMID 11703925.
Saito K, Murai J, Kajiho H, Kontani K, Kurosu H, Katada T (2002). «Гомофильді тетрамерден тұратын жаңа байланысатын ақуыз шағын GTPase Rab5 үшін ерекше қасиеттер көрсетеді». Дж.Биол. Хим. 277 (5): 3412–8. дои:10.1074 / jbc.M106276200. PMID 11733506.
Merithew E, Stone C, Eathiraj S, Lambright DG (2003). «Ерте эндосома антигенінің 1 терминалымен Rab5 әсерлесуінің детерминанттары». Дж.Биол. Хим. 278 (10): 8494–500. дои:10.1074 / jbc.M211514200. PMID 12493736.
Kajiho H, Saito K, Tsujita K, Kontani K, Araki Y, Kurosu H, Katada T (2004). «RIN3: ерте эндоцитарлық жолға түскен амфифизин II-мен өзара әрекеттесетін Rab5 GEF романы». J. Cell Sci. 116 (Pt 20): 4159-68. дои:10.1242 / jcs.00718. PMID 12972505.
Wiemann S, Arlt D, Huber W, Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (2004). «ORFeome-ден биологияға: функционалды геномика құбыры». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. дои:10.1101 / гр.2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Мехрле А, Розенфелдер Н, Шупп I, дель Валь С, Арлт Д, Ханне Ф, Бехтель С, Симпсон Дж, Хофманн О, Жасыру W, Глаттинг КХ, Хубер В, Пепперкок Р, Поустка А, Виеманн С (2006). «LIFEdb дерекқоры 2006 ж.». Нуклеин қышқылдары. 34 (Деректер базасы мәселесі): D415–8. дои:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.
Chi A, Valencia JC, Hu ZZ, Watabe H, Yamaguchi H, Mangini NJ, Huang H, Canfield VA, Cheng KC, Yang F, Abe R, Yamagishi S, Шабановиц Дж, Есту VJ, Wu C, Appella E, Hunt DF (2007). «Меланосомалардың биогенезі мен қызметінің протеомдық және биоинформатикалық сипаттамасы». J. Proteome Res. 5 (11): 3135–44. дои:10.1021 / pr060363j. PMID 17081065.
Hirota Y, Kuronita T, Fujita H, Tanaka Y (2007). «Эндозомдық және лизосомалық бөлімдердің биогенезіндегі Rab5 белсенділігінің рөлі». Биохимия. Биофиз. Res. Коммун. 364 (1): 40–7. дои:10.1016 / j.bbrc.2007.09.089. PMID 17927960.

Бұл мақала а ген қосулы адамның хромосомасы 12 Бұл бұта. Сіз Уикипедияға көмектесе аласыз оны кеңейту.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000111540 - Ансамбль, Мамыр 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000000711 - Ансамбль, Мамыр 2017

[3] «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[4] «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[pmid1541686-5] Уилсон Д.Б., Уилсон МП (сәуір 1992). «GTPase-ге байланысты супфамиланың жаңа мүшесі, адамның rab5b-н анықтау және ішкі жасушалық оқшаулау». J Clin Invest. 89 (3): 996–1005. дои:10.1172 / JCI115683. PMC 442949. PMID 1541686.

[pmid10403367-6] Chiariello M, Bruni CB, Bucci C (тамыз 1999). «Rab5a, Rab5b және Rab5c ұсақ GTPases in vitro дифференциалды түрде фосфорланады». FEBS Lett. 453 (1–2): 20–4. дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 00686-9. PMID 10403367. S2CID 30308802.

[entrez-7] «Entrez Gene: RAB5B RAB5B, RAS онкогендер отбасы».

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]