Pseudomonas balearica - Pseudomonas balearica - Wikipedia

Pseudomonas balearica
Ғылыми классификация өңдеу
Домен:Бактериялар
Филум:Протеобактериялар
Сынып:Гаммапротеобактериялар
Тапсырыс:Pseudomonadales
Отбасы:Pseudomonadaceae
Тұқым:Псевдомонас
Түрлер тобы:Pseudomonas stutzeri топ
Түрлер:
P. balearica
Биномдық атау
Pseudomonas balearica
Беннасар, т.б., 1996
Штаммды теріңіз
CCUG 44487

CIP 105297
DSM 6083

Pseudomonas balearica Бұл Грам теріс, таяқша тәрізді, флуоресцентті емес, қозғалмалы, және денитрификациялау бактерия.[1] Бұл экологиялық бүкіл әлем бойынша ластанған ортадан оқшауланған бактерия. Көптеген изоляттар бірнеше қосылыстарды ыдыратуға мүмкіндіктерін көрсетті. Штаммдардың кейбіреулері нафталинді ыдыратушылар[1] және Жаңа Зеландияда оқшауланған бір штам тотығу мүмкіндігін көрсетті бейорганикалық күкірт қосылыстар тетратионатты.[2] 16S негізінде рРНҚ талдау, P. balearica ішіне орналастырылды P. stutzeri топ.[3]

Толық геном тізбегі P. balearica типті штамм DSM 6083Т (= CCUG 44595Т = SP1402Т) жалпыға қол жетімді Жапонияның ДНҚ-ның деректер банкі, Еуропалық нуклеотидтік мұрағат, және GenBank қосылу нөмірі астында CP007511.[4] Жоба геномының тізбегі P. balearica LS401 (CCUG 66666) және P. balearica st101 (CCUG 66667) қосылу нөмірлері бойынша да қол жетімді LONE00000000 және LONF00000000 сәйкесінше.[5] Түрлердің геномдарының мөлшері 4,2 ​​- 4,4 Мб аралығында өзгереді және GC-64,6 - 65,1% аралығында болады.

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ а б Беннасар; Росселло-Мора, Р; Лалукат, Дж; Мур, ЭР; т.б. (Қаңтар 1996). «Геномоварларына қатысты 16S rRNA гендерінің реттілігін талдау Pseudomonas stutzeri және ұсынысы Pseudomonas balearica sp. нов ». Int J Syst бактериол. 46 (1): 200–5. дои:10.1099/00207713-46-1-200. PMID  8573496.
  2. ^ Сорокин; Теске, А; Робертсон, Лос-Анджелес; Куэнен, Дж .; т.б. (Қазан 1999). «Тиосульфаттың тетратионатқа дейін анаэробты тотығуы міндетті гетеротрофты бактериялармен тиесілі Pseudomonas stutzeri топ «. FEMS Microbiol Ecol. 30 (2): 113–123. дои:10.1111 / j.1574-6941.1999.tb00640.x. PMID  10508936.
  3. ^ Анзай; Ким, Н; Парк, Дж .; Вакабаяши, Н; Ояизу, Н; т.б. (Шілде 2000). «16S рРНҚ дәйектілігі негізінде псевдомонадалардың филогенетикалық байланысы». Int J Syst Evol микробиол. 50 (4): 1563–89. дои:10.1099/00207713-50-4-1563. PMID  10939664.
  4. ^ Беннасар-Фигерас, Антони; Сальва-Серра, Франциско; Жан-Лучоро, Даниэль; Сегу, Каролина; Алиага, Франциско; Бускетс, Антонио; Гомила, Маргарита; Мур, Эдвард Р.Б .; Лалукат, Хорхе (2016-04-28). «Pseudomonas balearica DSM 6083T геномының толық тізбегі». Геном туралы хабарландырулар. 4 (2): e00217-16. дои:10.1128 / геномA.00217-16. ISSN  2169-8287. PMC  4841123. PMID  27103708.
  5. ^ Сальва-Серра, Франциско; Якобссон, Хедвиг Э .; Бускетс, Антонио; Гомила, Маргарита; Жан-Лучоро, Даниэль; Сегу, Каролина; Алиага-Лозано, Франциско; Гарсия-Вальдес, Елена; Лалукат, Хорхе (2017-04-06). «Лас теңіз шөгінділерінен және мұнай өңдеу зауытының учаскесінен оқшауланған псевдомонас балеарикасының нафталинді бұзатын екі штамдарының геномдық тізбегі». Геном туралы хабарландырулар. 5 (14): e00116–17. дои:10.1128 / геномA.00116-17. ISSN  2169-8287. PMC  5383889.

Сыртқы сілтемелер