Жоба: Парвулин 14 (Пар14) - Draft:Parvulin 14 (Par14)

Пар14 (парвулиннің эукариоттық гомологы, EHPF) парвулин адамдардағы пептидил-пролил-цис / транс-изомеразалар (ППИаз) тұқымдасы пролил изомеразы белсенділік.[1]

Тарих

1999 жылы Par14-ті екі топ дербес анықтады.[2][3] Адам ашылғаннан кейін PIN1 1996 жылы,[4] Par14 адамның парвулиндер отбасының екінші мүшесі болып шықты. Pin1-ден айырмашылығы, Par14 аз каталитикалық белсенділік көрсетеді, фосфорланған субстраттарға артықшылық бермейді[2] және Pin1-ге байланысты парвулин Ess1-дің ашытқыдағы жоғалуын құтқара алмайды.[5] Par14 ортологтары көптеген біржасушалы эукариоттарда және барлық көпжасушалы организмдерде кездеседі. 2006 жылы Par17 деп аталатын Par14 изоформасы сипатталды, ол N-терминалының 25 қалдықты кеңейтетін және тек гоминидтермен өрнектелген.[6]

Өрнек және локализация

Par14 Xq13.1 хромосомасында PIN4 генінің транскрипциясынан туындайды. Промоторлы аймақ TATA-дан аз және CpG аралында орналасқан.[6] Ақуыз, ең алдымен, жасушаның ядросы / ядросы ішінде белсенді, сонымен қатар цитоплазмасында болады.[3][4][5][6][7]

Биологиялық функция

Цитоплазма:Par14 инсулин рецепторларының субстратымен (IRS-1) өзара әрекеттеседі және IRS-1 инсулині әсер ететін тирозин-фосфорлануын күшейтеді.[8] Митоз кезінде Par14 шпиндель аппаратымен байланысады.[7] In vitro эксперименттер Par14 жіптердің полимерленуіне қатысуы мүмкін екенін көрсетті.[9][10]

Ядро / Ядро:Ser19 фосфорлануы казеинкиназа 2 Par14-ті жасуша ядросына ауыстырады.[11] Депосфорилденуден кейін ақуыз ассоциацияланады хроматин,[12] негізінен жоғары аффинитті ДНҚ-мен байланысуға жауап беретін N-терминалымен.[13] Пар14 рибосомаға дейінгі рибонуклеарлы ақуыз кешендерінде кездеседі, мұнда ол рРНҚ өңдеу факторы ретінде әрекет етеді.[7][14] Фотоафиндиді таңбалау және Сұйық хроматография - масс-спектрометрия талдау барысында жұмыс жасайтын ақуыздармен байланысты фермент анықталады ДНҚ репликациясы, ДНҚ-ны қалпына келтіру және / немесе хроматинді қайта құру.[10] Par14 үшін Ser7 және Ser9 фосфорлануы қажет ақуыз киназасы B (Ақт) (немесе ақуыз С ) ядролық экспортқа арналған. Бұл экспортты, мүмкін, қолдайды 14-3-3 ақуыз Crm1 тәуелді жол.[15]

Құрылым

Par14 каталитикалық домені типтік парвулин қатпарын көрсетеді (structure1-α1-α2-h-β2-α3-β3-β4 екінші құрылым элементтерінің реті; α = α-спираль, β = β-тізбек, h = бұрандалы бұрылыс) осы отбасы мүшелері, әзірге.[16] Оның үш өлшемді құрылымы PDB-идентификатор: 3UI4 PDB-идентификатор: 1EQ3 α-спиральға қарама-қарсы орталық β парақты өзекпен (төрт антипараллельді жіптен тұратын) «ұстайтын қол» топологиясымен сипатталады 3. Каталитикалық орталық β парағының ойыс жағында орналасқан.[16][17] N-терминалы IDR[ажырату қажет ]- бұл доменнің алдында негізінен ұсақ немесе негізгі қалдықтардан тұратын созылу сияқты. IDR элементі аудармадан кейінгі модификацияға бейім.

Ауруға байланысты функция / клиникалық аспектілер

Par14-ті реттеуге қатысады гепатит В вирустың репликациясы.[18] Par14 өрнегі өзара байланысты біріншілік билиарлы цирроз, аутоиммунды созылмалы холестатикалық бауыр ауруы.[19] K-RAS экзосомалар жабық қатерлі ісік жасушаларының Par14 болатындығы анықталды.[20]

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ Матена, Анья; Рихик, Эдиса; Хёниг, Дана; Камба, Бианка; Байер, Питер (2018). «Пин1 және Пар14 / 17 адамның парвулиндерінің құрылымы және қызметі». Биологиялық химия. 399 (2): 101–125. дои:10.1515 / hsz-2017-0137. PMID  29040060. S2CID  46851627.
  2. ^ а б Учида, Такафуми; Фуджимори, Фумихиро; Трейдер, Томас; Фишер, Гюнтер; Рахфельд, Дженс-У (1999). «14 к-ді анықтау және сипаттау Да Парвулинге ұқсас пептидил пролил цис / Транс изомераза сияқты адам ақуызы ». FEBS хаттары. 446 (2–3): 278–282. дои:10.1016 / s0014-5793 (99) 00239-2. PMID  10100858. S2CID  45172611.
  3. ^ а б Торп, Джулиан Р .; Рултен, Стюарт Л .; Кей, Джон Э. (1999). «Иммуногольд этикеткасының трансмиссиялық электронды микроскопиясы арқылы анықталған путативті және белгілі шаперон протеинінің байланысы: Шаперондарды мақсатты белоктарды тарату үшін зонд ретінде қолдану». Гистохимия және цитохимия журналы. 47 (12): 1633–1640. дои:10.1177/002215549904701215. PMID  10567447. S2CID  13140240.
  4. ^ а б Пинг Лу, Кун; Ханес, Стивен Д .; Hunter, Tony (1996). «Адамның пептидил-пролил изомеразы митозды реттеу үшін маңызды». Табиғат. 380 (6574): 544–547. Бибкод:1996 ж.380..544P. дои:10.1038 / 380544a0. PMID  8606777. S2CID  4258406.
  5. ^ а б Метцнер, Мартин; Столлер, Герлинд; Рюкнагель, Карл П .; Лу, Кун Пинг; Фишер, Гюнтер; Лакнер, Мартин; Кюллерц, Герхард (2001). «Esvential ESS1-ді ашытқыдағы функционалды ауыстыру ParvulinDlPar13 зауытымен». Биологиялық химия журналы. 276 (17): 13524–13529. дои:10.1074 / jbc.M007005200. PMID  11118437. S2CID  39847373.
  6. ^ а б c Мюллер, Джонатан; Кесслер, Даниел; Нейман, Даниел; Стратманн, Тина; Папатеодору, Панагиотис; Хартманн-Фату, Кристина; Байер, Питер (2006). «Парвулиннің адам тіндерінде барлық жерде көрінетін және альтернативті транскрипция инициациясынан туындайтын жаңа созылған изоформаларының сипаттамасы». BMC молекулалық биология. 7: 9. дои:10.1186/1471-2199-7-9. PMC  1420321. PMID  16522211.
  7. ^ а б c Фудзияма-Накамура, Салли; Йошикава, Харунори; Хомма, Кейиичи; Хаяно, Тошия; Цудзимура-Такахаси, Теруко; Изумикава, Кейичи; Исикава, Хидеаки; Миядзава, Наоки; Янагида, Мицуаки; Миура, Ютака; Шинкава, Такаси; Ямаути, Йосио; Isobe, Toshiaki; Такахаси, Нобухиро (2009). «Парвулин (Par14), пептидил-пролилцис-транс Изомераза, бұл метазоа тектес дамыған рРНҚ-ны өңдеудің жаңа факторы ». Молекулалық және жасушалық протеомика. 8 (7): 1552–1565. дои:10.1074 / мкп.M900147-MCP200. PMC  2716718. PMID  19369196.
  8. ^ Чжан, Джун; Накацу, Юсуке; Синджо, Таканори; Гуо, Ин; Сакода, Хидеюки; Ямамотоя, Такеши; Отани, Юйчиро; Окубо, Хирофуми; Кушияма, Акифуми; Фудзиширо, Мидори; Фукусима, Тосиаки; Цучия, Ёсихиро; Камата, Хидеаки; Ивашита, Мисаки; Нишимура, Фусанори; Катагири, Хидеки; Такахаси, Шин-Ичиро; Курихара, Хироки; Учида, Такафуми; Асано, Томоичиро (2013). «Пар14 ақуызы инсулин рецепторлары субстрат 1-мен байланысады (IRS-1), осылайша инсулин индукцияланған IRS-1 фосфорлануын және метаболикалық әрекеттерді күшейтеді». Биологиялық химия журналы. 288 (28): 20692–20701. дои:10.1074 / jbc.M113.485730. PMC  3711332. PMID  23720771.
  9. ^ Тиле, Александра; Кренцлин, Каролин; Эрдманн, Франк; Раух, Дэвид; Хоуз, Герд; Цервек, Йоханнес; Килка, Сюзанн; Пёсел, Стефани; Фишер, Гюнтер; Utутковски, Майк; Вейвад, Матиас (2011). «Парвулин 17 пептидил-пролил цис / транс изомераза белсенділігі арқылы микротүтікшелерді жинауға ықпал етеді». Молекулалық биология журналы. 411 (4): 896–909. дои:10.1016 / j.jmb.2011.06.040. PMID  21756916.
  10. ^ а б Геринг, Анна; Мичин, Ирина; Гердес, Тина; Шульце, Нина; Блюггель, Майк; Рихик, Эдиса; Касчани, Фарнуш; Кайзер, Маркус; Байер, Питер (2020). «Диазиринмен қозғалатын өзара байланыстыру арқылы парвулин-интеракторларды бағыттау адамның Par14 / 17 актинді полимерленуіндегі жасушалық рөлін ашады». Биологиялық химия. 401 (8): 955–968. дои:10.1515 / hsz-2019-0423. S2CID  212621904.
  11. ^ Реймер, Татьяна; Вейвад, Матиас; Шерхорн, Анжелика; Рюкнагель, Питер-Карл; Рахфельд, Йенс-Ульрих; Байер, Питер; Фишер, Гюнтер (2003). «N-терминалды доменнің фосфорлануы субпетилді локализацияны және пептидил-пролил цис / ДНҚ-мен байланысу қасиеттерін реттейді / Транс Изомераза hPar14». Молекулалық биология журналы. 330 (5): 955–966. дои:10.1016 / s0022-2836 (03) 00713-7. PMID  12860119.
  12. ^ Санингонг, Акума Д .; Байер, Питер (2015). «Адамның ДНҚ-мен байланысатын пептидил-пролил цис / Транс изомераза Par14 - бұл жасуша циклі тәуелді экспрессияланған және in vivo хроматинмен байланысады». BMC биохимиясы. 16: 4. дои:10.1186 / s12858-015-0033-x. PMC  4327958. PMID  25645591.
  13. ^ Сурмач, Татьяна Анна; Байер, Елена; Рахфельд, Йенс-Ульрих; Фишер, Гюнтер; Байер, Питер (2002). «Адам Parvulin hPar14-тің N-терминалының негізгі домені Ядроның кіруіне және ДНҚ-ға жоғары байланыстылығына жауап береді». Молекулалық биология журналы. 321 (2): 235–247. дои:10.1016 / s0022-2836 (02) 00615-0. PMID  12144781.
  14. ^ Фудзияма, Салли; Янагида, Мицуаки; Хаяно, Тошия; Миура, Ютака; Isobe, Toshiaki; Такахаси, Нобухиро; Учида, Т .; Такахаси, Н. (2002). «Адамның парвулинмен байланыстыратын прерибосомалық рибонуклеопротеидті кешендердің оқшаулануы және протеомдық сипаттамасы». Биологиялық химия журналы. 277 (26): 23773–23780. дои:10.1074 / jbc.M201181200. PMID  11960984. S2CID  43724722.
  15. ^ Реймер Т (2003), Пептидил-пролил цис-транс изомеразасының hPar14 жасушалық локализациясы және қызметі. PhD диссертация
  16. ^ а б Секерина, Елена; Рахфельд, Йенс Ульрих; Мюллер, Джонатан; Фангхель, Йорг; Рашер, Кристин; Фишер, Гюнтер; Байер, Питер (2000). «H Par14 NMR ерітінді құрылымы h Pin1 митоздық реттегішінің пептидил пролил цис / Транс изомераза аймағына ұқсастығын анықтайды, бірақ 1 1 ақуыздың басқа функционалдығын көрсетеді. А. Фершт редакциялаған». Молекулалық биология журналы. 301 (4): 1003–1017. дои:10.1006 / jmbi.2000.4013. PMID  10966801.
  17. ^ Терада, Тохру; Ширузу, Микако; Фукумори, Ясухиро; Фуджимори, Фумихиро; Ито, Ютака; Кигава, Таканори; Йокояма, Шигеюки; Учида, Такафуми (2001). «Адамның парвулин тәрізді пептидил пролил цисінің ерітінді құрылымы / Транс изомераза, hPar14». Молекулалық биология журналы. 305 (4): 917–926. дои:10.1006 / jmbi.2000.4293. PMID  11162102.
  18. ^ Саид, Омар; Ким, Джуми; Пирача, Захра Захид; Квон, Хёнжун; Джунг, Джэсун; Чва, Йонг-Джун; Саябақ, күн; Шин, Хо-Джун; Ким, Кёнмин (2018). «Парвулин 14 пен Парвулин 17 HBX және cccDNA-мен байланысады және гепатит В вирусын регуляциялайды, hccm-ге тәуелді cccDNA-дан Вирионға репликация». Вирусология журналы. 93 (6). дои:10.1128 / JVI.01840-18. PMC  6401437. PMID  30567987.
  19. ^ Митчелл, Мишель М .; Ллео, Ана; Замматаро, Лука; Мэйо, Марлин Дж .; Инвернцци, Пьетро; Бах, Нэнси; Шимода, Синдзи; Гордон, Стюарт; Подда, Мауро; Гершвин, М.Эрик; Селми, Карло; Lasalle, Janine M. (2011). «Біріншілік билиарлы циррозға сәйкес келмейтін монозиготалы егіз әйел егіздеріндегі өзгермелі X хромосомалардың инактивтелген гендерін эпигенетикалық зерттеу». Эпигенетика. 6 (1): 95–102. дои:10.4161 / epi.6.1.13405. PMC  3029486. PMID  20864813.
  20. ^ Демори Беклер, Мишель; Хиггинботам, Джеймс Н .; Франклин, Джеффри Л .; Хэм, Эми-Джоан; Хэлви, Патрик Дж.; Имасуен, Имад Е .; Уитвелл, Корбин; Ли, Мин; Либлер, Даниэл С .; Коффи, Роберт Дж. (2013). «Мутантты KRAS ішек қатерлі ісігі жасушаларынан алынған экзомдарды протеомиялық талдау мутантты КРАС-тың жасушааралық трансфертін анықтайды». Молекулалық және жасушалық протеомика. 12 (2): 343–355. дои:10.1074 / mcp.M112.022806. S2CID  30398978.