PRPF4 - PRPF4

PRPF4
Қол жетімді құрылымдар
PDB	Ортологиялық іздеу: PDBe RCSB
PDB идентификатор кодтарының тізімі
	1МВт, 3JCR
Идентификаторлар
Бүркеншік аттар	PRPF4, HPRP4, HPRP4P, PRP4, Prp4p, RP70, SNRNP60, mRNA-ға дейінгі өңдеу коэффициенті 4
Сыртқы жеке куәліктер	OMIM: 607795 MGI: 1917302 HomoloGene: 3446 Ген-карталар: PRPF4
Геннің орналасуы (адам)
Хр.	9-хромосома (адам)
Соңы	113,292,905 bp
Геннің орналасуы (тышқан)
Хр.	4-хромосома (тышқан)
Соңы	62,426,990 bp
РНҚ экспрессиясы өрнек
	; ;
	Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Гендік онтология
Молекулалық функция	• U4 snRNA байланыстырады; • GO: 0001948 ақуыздармен байланысуы; • U6 snRNA байланыстырады;
Ұялы компонент	• Кажал денесі; • ядролық дақ; • сплизеозомдық кешен; • spliceosomal snRNP кешені; • U4 / U6 snRNP; • нуклеоплазма; • U4 / U6 x U5 tri-snRNP кешені; • жасуша ядросы; • U2 типті прекаталитикалық сплицеома;
Биологиялық процесс	• РНҚ-ны бөлу, трансестерификация реакциялары арқылы; • мРНҚ өңдеу; • РНҚ өңдеу; • РНҚ қосылуы; • мРНҚ-ны бөлу, сплитеосома арқылы;
	Дереккөздер:Амиго / QuickGO
Ортологтар
	9128
	70052
	ENSG00000136875
	ENSMUSG00000066148
	O43172
	Q9DAW6
	NM_001244926; NM_004697; NM_001322266; NM_001322267
	NM_027297
	NP_001231855; NP_001309195; NP_001309196; NP_004688
	NP_081573
	Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеу	Тінтуірді қарау / өңдеу

U4 / U6 кіші ядролық рибонуклеопротеині Prp4 Бұл ақуыз адамдарда кодталған PRPF4 ген.^[5]^[6]^[7]Жою интрондар ядролық алдын-ала мРНҚ деп аталатын кешендерде пайда болады сплизесомалар, олар 4-тен тұрады шағын ядролық рибонуклеопротеин (snRNP) бөлшектері және анықталмаған саны, өтпелі байланыстырушы факторлар. PRPF4 - U4 және U6 snRNP-мен байланысатын бірнеше ақуыздың 1. [Жеткізген OMIM ]^[7]

Әдебиеттер тізімі

^ ^а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000136875 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000066148 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ Lauber J, Plessel G, Prehn S, Will CL, Fabrizio P, Groning K, Lane WS, Luhrmann R (қыркүйек 1997). «Адамның U4 / U6 snRNP құрамында 60 және 90kD ақуыздар бар, олар Prp4p және Prp3p ашытқыларын біріктіру факторларына құрылымдық жағынан гомологты болып табылады». РНҚ. 3 (8): 926–41. PMC 1369537. PMID 9257651.
^ Horowitz DS, Kobayashi R, Krainer AR (желтоқсан 1997). «Жаңа циклофилин және Prp3 және Prp4 ашытқысының адам гомологтары U4 / U6 snRNP-мен байланысты кешен құрайды». РНҚ. 3 (12): 1374–87. PMC 1369579. PMID 9404889.
^ ^а ^б «Entrez Gene: PRPF4 PRP4 mRNA-ға дейінгі өңдеу факторы 4 гомолог (ашытқы)».

Әрі қарай оқу

Маруяма К, Сугано С (1994). «Олиго-жабу: эукариоттық мРНҚ-ның қақпақ құрылымын олигорибонуклеотидтермен ауыстырудың қарапайым әдісі». Джин. 138 (1–2): 171–4. дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Horowitz DS, Krainer AR (1997). «МРНҚ-ға дейінгі сплайсингтің екінші сатысына қажетті адам протеині функционалды түрде ашытқы сплайсинг факторымен байланысты». Genes Dev. 11 (1): 139–51. дои:10.1101 / gad.11.1.139. PMID 9000057.
Ванг А, Форман-Кэй Дж, Луо Ю және т.б. (1997). «Hpp3p және Hprp4p кодтайтын адам гендерін, сплитеосоманың өзара әрекеттесетін компоненттерін анықтау және сипаттамасы». Хум. Мол. Генет. 6 (12): 2117–26. дои:10.1093 / hmg / 6.12.2117 ж. PMID 9328476.
Сузуки Ю, Йошитомо-Накагава К, Маруяма К және т.б. (1997). «Толық көлемде байытылған және 5-деңгеймен байытылған cDNA кітапханасының құрылысы және сипаттамасы». Джин. 200 (1–2): 149–56. дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Хенг ХХ, Ванг А, Ху Дж (1998). «Uq / U6 байланысты сплайсинг факторларын кодтайтын адамның HPRP3 және HPRP4 гендерін 1q21.1 және 9q31-q33 хромосомаларына кескіндеу». Геномика. 48 (2): 273–5. дои:10.1006 / geno.1997.5181. PMID 9521884.
Кожима Т, Зама Т, Вада К және т.б. (2001). «Адамның PRP4-ті клондау Clk1-мен өзара әрекеттесуді анықтайды». Дж.Биол. Хим. 276 (34): 32247–56. дои:10.1074 / jbc.M103790200. PMID 11418604.
Гонсалес-Сантос Дж.М., Ванг А, Джонс Дж және т.б. (2002). «Hprp3p адамның сплайсинг факторының орталық аймағы Hprp4p-мен өзара әрекеттеседі». Дж.Биол. Хим. 277 (26): 23764–72. дои:10.1074 / jbc.M111461200. PMID 11971898.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH және т.б. (2003). «Адам мен тышқанның 15000-нан астам толық ұзындықтағы кДНҚ тізбектерінің генерациясы және алғашқы талдауы». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 99 (26): 16899–903. дои:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Reidt U, Wahl MC, Fasshauer D және т.б. (2003). «Адамның сплизеозомдық циклофилин H мен U4 / U6 snRNP-60K пептидінің арасындағы комплекстің кристалдық құрылымы» (PDF). Дж.Мол. Биол. 331 (1): 45–56. дои:10.1016 / S0022-2836 (03) 00684-3. hdl:11858 / 00-001M-0000-0012-F239-9. PMID 12875835.
Ингельфингер Д, Гётель С.Ф., Марахиэль М.А. және т.б. (2004). «Адамның сплитеосомамен байланысты циклофилині бойынша ақуыз-ақуыздың өзара әрекеттесуінің екі жері». Нуклеин қышқылдары. 31 (16): 4791–6. дои:10.1093 / nar / gkg660. PMC 169899. PMID 12907720.
Stanek D, Neugebauer KM (2004). «Кадал денелерінде snRNP құрастыру аралықтарын флуоресценттік резонанс энергиясын беру арқылы анықтау». Дж. Жасуша Биол. 166 (7): 1015–25. дои:10.1083 / jcb.200405160. PMC 2172029. PMID 15452143.
Герхард Д.С., Вагнер Л, Фейнголд Е.А. және т.б. (2004). «NIH толық ұзындықтағы cDNA жобасының мәртебесі, сапасы және кеңеюі: Сүтқоректілер гендерінің коллекциясы (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121-7. дои:10.1101 / гр.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Андерсен JS, Лам YW, Leung AK және т.б. (2005). «Ядролық протеом динамикасы». Табиғат. 433 (7021): 77–83. дои:10.1038 / табиғат03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
Barrios-Rodiles M, Brown Brown, Ozdamar B, et al. (2005). «Сүтқоректілер клеткаларындағы динамикалық сигнал беру желісінің жоғары өнімділігі». Ғылым. 307 (5715): 1621–5. дои:10.1126 / ғылым.1105776. PMID 15761153. S2CID 39457788.
Rual JF, Венкатесан К, Хао Т және т.б. (2005). «Адамның протеин-протеинмен өзара әрекеттесу желісінің протеома-масштабты картасына қарай». Табиғат. 437 (7062): 1173–8. дои:10.1038 / табиғат04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Liu S, Rauhut R, Vornlocher HP, Lührmann R (2006). «Адам U4 / U6.U5 tri-snRNP ішіндегі ақуыз-ақуыздың өзара әрекеттесу желісі». РНҚ. 12 (7): 1418–30. дои:10.1261 / rna.55406. PMC 1484429. PMID 16723661.
Хуанг Б, Анн Ю.Т., Макферсон Л және т.б. (2007). «PRP4-тің Круппелге ұқсас 13-фактормен өзара әрекеттесуі CCL5 транскрипциясын реттейді». Дж. Иммунол. 178 (11): 7081–7. дои:10.4049 / jimmunol.178.11.7081. PMC 2674583. PMID 17513757.

Бұл мақала а ген қосулы адамның хромосомасы 9 Бұл бұта. Сіз Уикипедияға көмектесе аласыз оны кеңейту.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000136875 - Ансамбль, Мамыр 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000066148 - Ансамбль, Мамыр 2017

[3] «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[4] «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[pmid9257651-5] Lauber J, Plessel G, Prehn S, Will CL, Fabrizio P, Groning K, Lane WS, Luhrmann R (қыркүйек 1997). «Адамның U4 / U6 snRNP құрамында 60 және 90kD ақуыздар бар, олар Prp4p және Prp3p ашытқыларын біріктіру факторларына құрылымдық жағынан гомологты болып табылады». РНҚ. 3 (8): 926–41. PMC 1369537. PMID 9257651.

[pmid9404889-6] Horowitz DS, Kobayashi R, Krainer AR (желтоқсан 1997). «Жаңа циклофилин және Prp3 және Prp4 ашытқысының адам гомологтары U4 / U6 snRNP-мен байланысты кешен құрайды». РНҚ. 3 (12): 1374–87. PMC 1369579. PMID 9404889.

[entrez-7] а ^б «Entrez Gene: PRPF4 PRP4 mRNA-ға дейінгі өңдеу факторы 4 гомолог (ашытқы)».

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]