Ядролық рецепторлардың қосалқы репрессоры 2 - Nuclear receptor co-repressor 2

NCOR2
Ақуыз NCOR2 PDB 1xc5.png
Қол жетімді құрылымдар
PDBОртологиялық іздеу: PDBe RCSB
Идентификаторлар
Бүркеншік аттарNCOR2, CTG26, N-CoR2, SMAP270, SMRT, SMRTE, SMRTE-tau, TNRC14, TRAC, TRAC-1, TRAC1, ядролық рецепторлық корепрессор 2
Сыртқы жеке куәліктерOMIM: 600848 MGI: 1337080 HomoloGene: 31370 Ген-карталар: NCOR2
Геннің орналасуы (адам)
12-хромосома (адам)
Хр.12-хромосома (адам)[1]
12-хромосома (адам)
NCOR2 үшін геномдық орналасу
NCOR2 үшін геномдық орналасу
Топ12q24.31Бастау124,324,415 bp[1]
Соңы124,567,589 bp[1]
РНҚ экспрессиясы өрнек
PBB GE NCOR2 208888 с at fs.png

Fs.png мекен-жайы бойынша PBB GE NCOR2 207760 с

Fs.png мекен-жайы бойынша PBB GE NCOR2 208889 с
Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Ортологтар
ТүрлерАдамТышқан
Энтрез

9612

20602

Ансамбль

ENSG00000196498

ENSMUSG00000029478

UniProt

Q9Y618

Q9WU42

RefSeq (mRNA)

NM_006312
NM_001077261
NM_001206654

NM_001253904
NM_001253905
NM_011424

RefSeq (ақуыз)

NP_001070729
NP_001193583
NP_006303
NP_001193583.1

NP_001240833
NP_001240834
NP_035554

Орналасқан жері (UCSC)Chr 12: 124.32 - 124.57 MbChr 5: 125.02 - 125.18 Mb
PubMed іздеу[3][4]
Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеуТінтуірді қарау / өңдеу

The ядролық рецепторлардың қосалқы репрессоры 2 (NCOR2 ) Бұл транскрипциялық циркуляциялық құрамында бірнеше ақуыз бар ядролық рецептор - өзара әрекеттесетін домендер. Сонымен қатар, NCOR2 жұмысқа қабылдайтын көрінеді гистон деацетилазалары ДНҚ промотор аймақтарына. Демек, NCOR2 төмендегі ядролық рецепторларға көмектеседі реттеу мақсатты ген экспрессиясының.[5][6] NCOR2 сонымен қатар ретиноидты немесе тиреоидты-гормонды рецепторлардың тыныштық медиаторы деп аталады (SMRT)[5] немесе Т.3 рецепторлық-ассоциациялық кофактор 1 (TRAC-1).[6]

Функция

NCOR2 / SMRT - бұл бірнеше автономды репрессиялық домендерді, сондай-ақ екі немесе үшті қамтитын бірнеше модуляторлы функционалды домендерді қамтитын транскрипциялық ядролық ақуыз. C-терминалы ядролық рецепторлармен өзара әрекеттесетін домендер.[5] NCOR2 / SMRT репрессивті негізгі реттеу факторы ретінде қызмет етеді (корепрессор ) еселік үшін транскрипция коэффициенті жолдар. Осыған байланысты NCOR2 / SMRT платформалық ақуыз ретінде жұмыс істейді, бұл жұмысқа қабылдауды жеңілдетеді гистон деацетилазалары оның өзара әрекеттесетін транскрипция факторларымен байланысқан ДНҚ промоторларына.[7]

Отбасы

Бұл ядролық рецепторлық корепресорлар отбасының мүшесі; бұл отбасының мүшесі болып табылатын басқа адам ақуызы Ядролық рецепторлардың ко-репрессоры 1.[8]

Ашу

SMRT бастапқыда клондалған және зертханада сипатталған Dr. Роналд М. Эванс Salk биологиялық зерттеулер институтында.[5] Осы молекула туралы тағы бір ерте тергеуде осыған ұқсас мәліметтер TRAC-1 деп аталатын нұсқада баяндалды.[6]

Өзара әрекеттесу

Ядролық рецепторлардың ко-репрессоры 2 көрсетілген өзара әрекеттесу бірге:

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ а б c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000196498 - Ансамбль, Мамыр 2017
  2. ^ а б c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000029478 - Ансамбль, Мамыр 2017
  3. ^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  4. ^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  5. ^ а б c г. Чен Дж.Д., Эванс RM (қазан 1995). «Ядролық гормондардың рецепторларымен әрекеттесетін транскрипциялық ко-репрессор». Табиғат. 377 (6548): 454–7. Бибкод:1995 ж. 377..454С. дои:10.1038 / 377454a0. PMID  7566127. S2CID  4361329.
  6. ^ а б c Санде С, Привальски М.Л. (1996 ж. Шілде). «Ядролық гормондардың рецепторларымен ассоциациялайтын және олардың белсенділігін модуляциялайтын кофакторлар отбасы (Т3 рецепторларды-ассоциациялайтын кофакторларды) анықтау». Молекулалық эндокринология. 10 (7): 813–25. дои:10.1210 / ме.10.7.813. PMID  8813722.
  7. ^ Nagy L, Kao HY, Chakravarti D, Lin RJ, Hassig CA, Ayer DE, Schreiber SL, Evans RM (мамыр 1997). «SMRT, mSin3A және гистон деацетилаза бар кешен арқылы жүзеге асырылатын ядролық рецепторлардың репрессиясы». Ұяшық. 89 (3): 373–80. дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80218-4. PMID  9150137. S2CID  14686941.
  8. ^ UniProt Ядролық рецепторлық корепресорлар отбасы Бет 26 маусымда қол жеткізілді
  9. ^ Liao G, Chen LY, Zhang A, Godavarthy A, Xia F, Ghosh JC, Li H, Chen JD (ақпан 2003). «СМРТ ядролық рецепторлық корепрессоры арқылы андрогендік рецепторлардың белсенділігін реттеу». Биологиялық химия журналы. 278 (7): 5052–61. дои:10.1074 / jbc.M206374200. PMID  12441355.
  10. ^ Ән LN, Coghlan M, Gelmann EP (қаңтар 2004). «Мифепристонның андрогенді антиакрогенді әсер ету және андрогенді рецептормен коактиватор мен корепрессордың өзара әрекеттесуі». Молекулалық эндокринология. 18 (1): 70–85. дои:10.1210 / ме.2003-0189. PMID  14593076.
  11. ^ Dotzlaw H, Moehren U, Mink S, Cato AC, Iñiguez Lluhí JA, Baniahmad A (сәуір 2002). «Адамның AR-нің амин термині корепрессорлық әсер ету және антигормонды агонизм болып табылады». Молекулалық эндокринология. 16 (4): 661–73. дои:10.1210 / ме.16.4.661. PMID  11923464.
  12. ^ а б Вонг CW, Привальский ML (қазан 1998). «SMRT корепрессорлық кешенінің компоненттері POZ доменінің PLZF, PLZF-RARalpha және BCL-6 онкопротеиндерімен ерекше өзара әрекеттесуін көрсетеді». Биологиялық химия журналы. 273 (42): 27695–702. дои:10.1074 / jbc.273.42.27695. PMID  9765306.
  13. ^ Huynh KD, Fischle W, Verdin E, Bardwell VJ (шілде 2000). «BCoR, BCL-6 репрессиясына қатысқан жаңа корепрессор». Гендер және даму. 14 (14): 1810–23. дои:10.1101 / gad.14.14.1810 ж (белсенді емес 2020-10-12). PMC  316791. PMID  10898795.CS1 maint: DOI 2020 жылдың қазанындағы жағдай бойынша белсенді емес (сілтеме)
  14. ^ Deltour S, Guerardel C, Leprince D (желтоқсан 1999). «SMRT / N-CoR-mSin3A-HDAC-репрессиялық кешендерді жалдау BTB / POZ транскрипциялық репрессорлары үшін жалпы механизм емес: HIC-1 және гаммаFBP-B жағдайы». Америка Құрама Штаттарының Ұлттық Ғылым Академиясының еңбектері. 96 (26): 14831–6. Бибкод:1999 PNAS ... 9614831D. дои:10.1073 / pnas.96.26.14831. PMC  24733. PMID  10611298.
  15. ^ а б c г. Ли С.К., Ким Дж.Х., Ли Ю.К., Чеонг Дж, Ли Дж.В. (сәуір 2000). «Ретиноин қышқылы мен тиреоидты гормондардың рецепторларының медиаторы, активтендіретін протеин-1, ядро ​​факторы-каппаБ және сарысудағы жауап факторының транскрипциялық корепрессорлық молекуласы ретінде тынышталу». Биологиялық химия журналы. 275 (17): 12470–4. дои:10.1074 / jbc.275.17.12470. PMID  10777532.
  16. ^ а б Фишер DD, Cai R, Bhatia U, Asselbergs FA, Song C, Terry R, ​​Trogani N, Widmer R, Atadja P, Cohen D (ақпан 2002). «II класс гистон деацетилаза романының оқшаулануы және сипаттамасы», HDAC10 «. Биологиялық химия журналы. 277 (8): 6656–66. дои:10.1074 / jbc.M108055200. PMID  11739383.
  17. ^ а б Underhill C, Qutob MS, Yee SP, Torchia J (желтоқсан 2000). «N-CoR жаңа ядролық рецепторлық корепрессорлық кешені құрамында сүтқоректілердің SWI / SNF кешенінің және KAP-1 корепрессорының компоненттері бар». Биологиялық химия журналы. 275 (51): 40463–70. дои:10.1074 / jbc.M007864200. PMID  11013263.
  18. ^ а б c Ли Дж, Ванг Дж, Ванг Дж, Наваз З, Лю Дж.М., Цин Дж, Вонг Дж (тамыз 2000). «SMRT және N-CoR корепрессорлық ақуыздарының екеуі де HDAC3 бар ірі ақуыз кешендерінде бар». EMBO журналы. 19 (16): 4342–50. дои:10.1093 / emboj / 19.16.4342. PMC  302030. PMID  10944117.
  19. ^ а б Yoon HG, Chan DW, Huang ZQ, Li J, Fondell JD, Qin J, Wong J (наурыз 2003). «Адамның N-CoR кешенін тазарту және функционалды сипаттамасы: HDAC3, TBL1 және TBLR1 рөлдері». EMBO журналы. 22 (6): 1336–46. дои:10.1093 / emboj / cdg120. PMC  151047. PMID  12628926.
  20. ^ а б Guenther MG, Yu J, Kao GD, Yen TJ, Lazar MA (желтоқсан 2002). «SMRT-гистон деацетилаза 3 репрессиялық кешенін құрастыру үшін TCP-1 сақина кешені қажет». Гендер және даму. 16 (24): 3130–5. дои:10.1101 / gad.1037502. PMC  187500. PMID  12502735.
  21. ^ а б Guenther MG, Lane WS, Fischle W, Вердин Е, Лазар М.А., Шихаттар Р (мамыр 2000). «HDAC3 және TBL1, саңырауға байланысты қайталанатын WD40 ақуызы бар негізгі SMRT корепрессорлық кешені». Гендер және даму. 14 (9): 1048–57. дои:10.1101 / gad.14.9.1048 (белсенді емес 2020-10-12). PMC  316569. PMID  10809664.CS1 maint: DOI 2020 жылдың қазанындағы жағдай бойынша белсенді емес (сілтеме)
  22. ^ а б Фишл W, Dequiedt F, Hendzel MJ, Guenther MG, Lazar MA, Voelter W, Verdin E (қаңтар 2002). «II дәрежелі HDAC-мен байланысты ферменттік белсенділік құрамында HDAC3 және SMRT / N-CoR бар мультипротеинді кешенге тәуелді». Молекулалық жасуша. 9 (1): 45–57. дои:10.1016 / S1097-2765 (01) 00429-4. hdl:11858 / 00-001M-0000-002C-9FF9-9. PMID  11804585.
  23. ^ Yoon HG, Chan DW, Reynolds AB, Qin J, Wong J (қыркүйек 2003). «N-CoR метил CpG байланыстыратын ақуыз Kaiso арқылы ДНҚ-ның метилденуіне тәуелді репрессияны жүргізеді». Молекулалық жасуша. 12 (3): 723–34. дои:10.1016 / j.molcel.2003.08.008. PMID  14527417.
  24. ^ а б c Хуанг Э.Й., Чжан Дж, Миска Е.А., Гюнтер М.Г., Кузаридес Т, Лазар М.А. (қаңтар 2000). «Sin3 тәуелсіз репрессия жолында ядролық рецепторлардың корепрессорлары II класты гистон деацетилазалармен серіктес». Гендер және даму. 14 (1): 45–54. PMC  316335. PMID  10640275.
  25. ^ Lyst MJ, Ekiert R, Ebert DH, Merusi C, Nowak J, Selfridge J, Guy J, Kastan NR, Robinson ND, de Lima Alves F, Rappsilber J, Greenberg ME, Bird A (шілде 2013). «Ретт синдромының мутациясы MeCP2-нің NCoR / SMRT ко-репрессорымен өзара әрекеттесуін жояды». Табиғат неврологиясы. 16 (7): 898–902. дои:10.1038 / nn.3434. PMC  3786392. PMID  23770565.
  26. ^ Sohn YC, Kwak E, Na Y, Lee JW, Lee SK (қараша 2001). «Ретиноидты және тиреоидты гормонды рецепторлардың медиаторын тыныштандыру және жетім ядролық рецептордың транскрипциялық ядролық реттегіштері ретінде коинтегратор-2 сигнализациясы». Биологиялық химия журналы. 276 (47): 43734–9. дои:10.1074 / jbc.M107208200. PMID  11559707.
  27. ^ Какизава Т, Миямото Т, Ичикава К, Такеда Т, Сузуки С, Мори Дж, Кумагай М, Ямашита К, Хашизуме К (наурыз 2001). «Ретиноид пен тиреоидты гормондардың рецепторлары үшін тыныштық медиаторы октамер транскрипциясы фактор-1-мен өзара әрекеттеседі және транскрипциялық репрессор ретінде қызмет етеді». Биологиялық химия журналы. 276 (13): 9720–5. дои:10.1074 / jbc.M008531200. PMID  11134019.
  28. ^ Ши Ю, Хон М, Эванс RM (наурыз 2002). «Пероксисома-пролифератор-рецепторлы дельта, транскрипциялық репрессия мен ядролық рецепторлық сигнализация интеграторы». Америка Құрама Штаттарының Ұлттық Ғылым Академиясының еңбектері. 99 (5): 2613–8. Бибкод:2002 PNAS ... 99.2613S. дои:10.1073 / pnas.052707099. PMC  122396. PMID  11867749.
  29. ^ Giangrande PH, Kimbrel EA, Эдвардс DP, McDonnell DP (мамыр 2000). «Адамның прогестерон рецепторының екі изоформасының қарама-қарсы транскрипциялық қызметі дифференциалды кофактормен байланысуымен байланысты». Молекулалық және жасушалық биология. 20 (9): 3102–15. дои:10.1128 / MCB.20.9.3102-3115.2000. PMC  85605. PMID  10757795.
  30. ^ Хан ММ, Номура Т, Ким Х, Каул СК, Вадхва Р, Шинагава Т, Ичикава-Ивата Е, Чжун С, Пандолфи П.П., Ишии С (маусым 2001). «Ашық делдалдықты транскрипциялық репрессияда PML және PML-RARalpha рөлі». Молекулалық жасуша. 7 (6): 1233–43. дои:10.1016 / S1097-2765 (01) 00257-X. PMID  11430826.
  31. ^ Хонг Ш., Ян З, Привальский МЛ (қараша 2001). «Мышьяк триоксиді - SMRT корепрессорының транскрипция факторы серіктестерімен, соның ішінде адамның жедел промиелоциттік лейкемиясында кездесетін ПМЛ-ретиноин қышқылы альфа-онкопротеинмен өзара әрекеттесуінің күшті тежегіші». Молекулалық және жасушалық биология. 21 (21): 7172–82. дои:10.1128 / MCB.21.21.7172-7182.2001. PMC  99892. PMID  11585900.
  32. ^ Beatus P, Lundkvist J, Oberg C, Pedersen K, Lendahl U (маусым 2001). «Анкириннің қайталанатын аймағының Notch жасушаішілік домендерінде пайда болуы HES промоутерлік қызметін реттеу үшін өте маңызды». Даму механизмдері. 104 (1–2): 3–20. дои:10.1016 / S0925-4773 (01) 00373-2. PMID  11404076. S2CID  9526831.
  33. ^ Чжоу С, Хейвард SD (қыркүйек 2001). «CBF1 ядролық оқшаулауы SMRT корепрессорлық кешенімен өзара әрекеттесу арқылы реттеледі». Молекулалық және жасушалық биология. 21 (18): 6222–32. дои:10.1128 / MCB.21.18.6222-6232.2001 ж. PMC  87339. PMID  11509665.
  34. ^ Espinosa L, Inglés-Esteve J, Robert-Moreno A, Bigas A (ақпан 2003). «IkappaBalpha және p65 ядролық коррепрессорлардың цитоплазмалық ығысуын реттейді: Notch және NFkappaB жолдарының арасындағы тоғысу». Жасушаның молекулалық биологиясы. 14 (2): 491–502. дои:10.1091 / mbc.E02-07-0404. PMC  149987. PMID  12589049.
  35. ^ а б Takahashi S, McConnell MJ, Harigae H, Kaku M, Sasaki T, Melnick AM, Licht JD (маусым 2004). «Flt3 ішкі тандемінің қайталану мутанты SMRT-мен өзара әрекеттесуді блоктау арқылы транскрипциялық репрессорлардың қызметін тежейді». Қан. 103 (12): 4650–8. дои:10.1182 / қан-2003-08-2759. PMID  14982881.
  36. ^ Zhang J, Hug BA, Huang EY, Chen CW, Gelmetti V, Maccarana M, Minucci S, Pelicci PG, Lazar MA (қаңтар 2001). «ЭТО-ны олигомеризациялау корепрессорлық өзара әрекеттесу үшін міндетті болып табылады». Молекулалық және жасушалық биология. 21 (1): 156–63. дои:10.1128 / MCB.21.1.156-163.2001. PMC  88789. PMID  11113190.
  37. ^ Dong S, Tweardy DJ (сәуір 2002). «STAT5b-RARalpha, жаңа жедел промиелоциттік лейкемия синтезінің ақуызы, ретиноин қышқылының рецепторымен және STAT3 сигнал беру жолдарымен өзара әрекеттесуі». Қан. 99 (8): 2637–46. дои:10.1182 / қан.V99.8.2637. PMID  11929748.
  38. ^ а б Hong SH, David G, Wong CW, Dejean A, Privalky ML (тамыз 1997). «SMRT корепрессоры PLZF-мен және жедел прмиелоциттік лейкемиямен байланысты PML-ретиноин қышқылының альфа (RARalpha) және PLZF-RARalpha онкопротеиндерімен өзара әрекеттеседі». Америка Құрама Штаттарының Ұлттық Ғылым Академиясының еңбектері. 94 (17): 9028–33. Бибкод:1997 PNAS ... 94.9028H. дои:10.1073 / pnas.94.17.9028. PMC  23013. PMID  9256429.
  39. ^ Чжоу С, Фуджимуро М, Хсие Дж.Дж., Чен Л, Хейвард SD (ақпан 2000). «CBF1-репрессияланған промоторлардың EBNA2 активациясындағы SKIP рөлі». Вирусология журналы. 74 (4): 1939–47. дои:10.1128 / JVI.74.4.1939-1947.2000. PMC  111672. PMID  10644367.
  40. ^ Чжоу С, Фуджимуро М, Хсие Дж., Чен Л, Миямото А, Вайнмастер Г, Хейвард SD (сәуір 2000). «SKIP, CBF1-ге байланысты ақуыз, NotchIC функциясын жеңілдету үшін NotchIC анкириннің қайталанатын доменімен өзара әрекеттеседі». Молекулалық және жасушалық биология. 20 (7): 2400–10. дои:10.1128 / MCB.20.7.2400-2410.2000. PMC  85419. PMID  10713164.
  41. ^ Ши Ю, Даунс М, Сэ В, Као Х.Й., Ордентлич П, Цай CC, Хон М, Эванс RM (мамыр 2001). «Өткір, ядролық рецепторлардың репрессиясы мен активациясын біріктіретін индуктивті кофактор». Гендер және даму. 15 (9): 1140–51. дои:10.1101 / gad.871201. PMC  312688. PMID  11331609.
  42. ^ Liu Y, Takeshita A, Misiti S, Chin WW, Yen PM (қазан 1998). «Коактиваторлардың өзара әрекеттесуінің болмауы мутантты тиреоидты гормонды рецепторлардың доминантты теріс белсенділігі механизмі бола алады». Эндокринология. 139 (10): 4197–204. дои:10.1210 / endo.139.10.6218. PMID  9751500.
  43. ^ а б Tagami T, Lutz WH, Kumar R, Jameson JL (желтоқсан 1998). «Д витаминінің рецепторының ядролық рецепторлық корепрессорлармен және коактиваторлармен әрекеттесуі». Биохимиялық және биофизикалық зерттеулер. 253 (2): 358–63. дои:10.1006 / bbrc.1998.9799. PMID  9878542.
  44. ^ Ando S, Sarlis NJ, Krishnan J, Feng X, Refetoff S, Zhang MQ, Oldfield EH, Yen PM (қыркүйек 2001). «ТТГ-шығаратын гипофиз ісігіндегі қалқанша безінің гормондары рецепторының балама альтернативті қосылуы гормондардың тұрақтылығының механизмі болып табылады». Молекулалық эндокринология. 15 (9): 1529–38. дои:10.1210 / ме.15.9.1529. PMID  11518802.
  45. ^ Puccetti E, Obradovic D, Beissert T, Bianchini A, Washburn B, Chiaradonna F, Boehrer S, Hoelzer D, Ottmann OG, Pelicci PG, Nervi C, Ruthardt M (желтоқсан 2002). «AML-мен байланысты транслокация өнімдері D (3) рецепторының секвестрі арқылы D дәрумені алынған дифференциацияны блоктайды». Онкологиялық зерттеулер. 62 (23): 7050–8. PMID  12460926.

Әрі қарай оқу


Сыртқы сілтемелер