Липрин-альфа-1 - Liprin-alpha-1

PPFIA1
Қол жетімді құрылымдар
PDB	Адам UniProt іздеу: PDBe RCSB
PDB идентификатор кодтарының тізімі
	1N7F
Идентификаторлар
Бүркеншік аттар	PPFIA1, Альфа 1 өзара әрекеттесетін LIP.1, LIP1, LIPRIN, PTPRF
Сыртқы жеке куәліктер	OMIM: 611054 MGI: 1924750 HomoloGene: 20802 Ген-карталар: PPFIA1
Геннің орналасуы (адам)
Хр.	11-хромосома (адам)
Соңы	70,385,312 bp
Геннің орналасуы (тышқан)
Хр.	7-хромосома (тышқан)
Соңы	144,553,729 bp
РНҚ экспрессиясы өрнек
	; ; ; ;
	Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Гендік онтология
Молекулалық функция	• GO: 0001948 ақуыздармен байланысуы; • сигнал түрлендіргішінің белсенділігі;
Ұялы компонент	• пресинапстық белсенді аймақ; • фокальды адгезия; • цитоплазма; • цитозол; • аксон; • дендрит; • макромолекулалық кешен;
Биологиялық процесс	• матрицалық адгезия; • кернеу талшығын құрастыруды теріс реттеу; • сигнал беру; • плазма мембранасына ақуыз локализациясының теріс реттелуі; • GO: 0010554 нейротрансмиттердің секрециясы; • глутамат секрециясы;
	Дереккөздер:Амиго / QuickGO
Ортологтар
	8500
	233977
	ENSG00000131626
	ENSMUSG00000037519
	Q13136
	жоқ
	NM_003626; NM_177423; NM_001378006
	NM_001033319; NM_001195086
	NP_003617; NP_803172; NP_001364935
	жоқ
	Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеу	Тінтуірді қарау / өңдеу

Липрин-альфа-1 Бұл ақуыз адамдарда кодталған PPFIA1 ген.^[5]^[6]^[7]

Функция

Осы генмен кодталған ақуыз LAR мүшесі болып табылады ақуыз тирозинфосфатаза - өзара әрекеттесетін ақуыз (липриндер) отбасы. Липриндер аксонды басқару және сүт бездерінің дамуы үшін маңызды екендігі белгілі трансмембраналық протеин тирозинфосфатазалар тобының мүшелерімен өзара әрекеттеседі. Бұл ақуыз тирозинфосфатаза LAR-ның жасушаішілік мембраналық-дистальды фосфатаза аймағымен байланысады және LAR-ны жасушалық фокустық адгезияға оқшаулайды. Бұл өзара әрекеттесу фокалды адгезияны бөлшектеуді реттей алады және осылайша жасуша-матрицалық өзара әрекеттесуді ұйымдастыруға көмектеседі. Әр түрлі изоформаларды кодтайтын балама транскрипт нұсқалары сипатталған.^[7]

Өзара әрекеттесу

Белокты тирозинфосфатаза, рецепторлық тип, f полипептид (PTPRF), өзара әрекеттесетін белок (липрин), альфа 1 өзара әрекеттесу бірге:

Әдебиеттер тізімі

^ ^а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000131626 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000037519 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ ^а ^б Serra-Pagès C, Kedersha NL, Fazikas L, Medley Q, Debant A, Streuli M (тамыз 1995). «LAR трансмембраналық протеин тирозинфосфатаза және ширатылған катушкалар LAR-әрекеттесетін протеин фокалды адгезия кезінде бірге оқшауланады». EMBO J. 14 (12): 2827–2838. дои:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07282.x. PMC 398401. PMID 7796809.
^ ^а ^б ^c ^г. Serra-Pagès C, Medley QG, Tang M, Hart A, Streuli M (шілде 1998). «Липриндер, LAR трансмембраналық протеин-тирозинфосфатазамен әрекеттесетін ақуыздар отбасы». J Biol Chem. 273 (25): 15611–15620. дои:10.1074 / jbc.273.25.15611. PMID 9624153.
^ ^а ^б «Entrez Gene: PPFIA1 ақуыз тирозинфосфатаза, рецепторлық тип, f полипептид (PTPRF), өзара әрекеттесетін белок (липрин), альфа 1».
^ ^а ^б ^c Ko J, Na M, Kim S, Lee JR, Kim E (қазан 2003). «RIM-байланыстыратын ақуыздардың ERC тобының мультидоменді ақуыздардың липрин-альфа тобымен өзара әрекеттесуі». Дж.Биол. Хим. 278 (43): 42377–85. дои:10.1074 / jbc.M307561200. PMID 12923177.
^ ^а ^б Ko J, Kim S, Valtschanoff JG, Shin H, Lee JR, Sheng M, Premont RT, Weinberg RJ, Kim E (наурыз 2003). «AMPA рецепторларын бағыттау үшін липрин-альфа мен GIT1 арасындағы өзара әрекеттесу қажет». Дж.Нейросчи. 23 (5): 1667–77. дои:10.1523 / JNEUROSCI.23-05-01667.2003. PMC 6741975. PMID 12629171.
^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill Hill, Roth FP, Vidal M (қазан 2005). «Адамның протеин-протеинмен өзара әрекеттесу желісінің протеомды масштабты картасына қарай». Табиғат. 437 (7062): 1173–8. дои:10.1038 / табиғат04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
^ ^а ^б ^c Pulido R, Serra-Pagès C, Tang M, Streuli M (желтоқсан 1995). «Трансмембраналық протеин-тирозин-фосфатазалардың LAR / PTP дельта / PTP сигма подфамилиясы: көптеген адамның LAR, PTP дельтасы және PTP сигма изоформалары тінге тән түрде көрінеді және LAR-өзара әрекеттесетін LIP.1 ақуызымен байланысады». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 92 (25): 11686–90. дои:10.1073 / pnas.92.25.11686. PMC 40467. PMID 8524829.

Әрі қарай оқу

Pulido R, Serra-Pagès C, Tang M, Streuli M (1996). «Трансмембраналық протеин-тирозин-фосфатазалардың LAR / PTP дельта / PTP сигма подфамилиясы: көптеген адамның LAR, PTP дельтасы және PTP сигма изоформалары тінге тән түрде көрінеді және LAR-өзара әрекеттесетін LIP.1 ақуызымен байланысады». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 92 (25): 11686–11690. дои:10.1073 / pnas.92.25.11686. PMC 40467. PMID 8524829.
Вишински М, Ким Е, Дуна А.В., Пассафаро М, Вальцанофф Дж.Г., Серра-Пажес С, Стрели М, Вайнберг RJ, Шенг М (2002). «AMPA рецепторларын бағыттау үшін GRIP пен липрин-альфа / SYD2 арасындағы өзара әрекеттесу қажет». Нейрон. 34 (1): 39–52. дои:10.1016 / S0896-6273 (02) 00640-2. PMID 11931740.
Ko J, Kim S, Valtschanoff JG, Shin H, Lee JR, Sheng M, Premont RT, Weinberg RJ, Kim E (2003). «AMPA рецепторларын бағыттау үшін липрин-альфа мен GIT1 арасындағы өзара әрекеттесу қажет». Дж.Нейросчи. 23 (5): 1667–1677. дои:10.1523 / JNEUROSCI.23-05-01667.2003. PMID 12629171.
Ko J, Na M, Kim S, Lee JR, Kim E (2004). «RIM-байланыстыратын ақуыздардың ERC тобының мультидоменді ақуыздардың липрин-альфа тобымен өзара әрекеттесуі». Дж.Биол. Хим. 278 (43): 42377–42385. дои:10.1074 / jbc.M307561200. PMID 12923177.
Jin J, Smith FD, Stark C, Wells CD, Fawcett JP, Kulkarni S, Metaltnikov P, O'Donnell P, Taylor P, Taylor L, Zougman A, Woodgett JR, Langeberg LK, Scott JD, Pawson T (2004). «In vivo 14-3-3 байланыстыратын ақуыздардың протеомдық, функционалдық және доменге негізделген анализі, цитоскелетті реттеуге және жасушалық ұйымдастыруға қатысады». Curr. Биол. 14 (16): 1436–1450. дои:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID 15324660.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Смоляр А, Босак С, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill Hill, Roth FP, Vidal M (2005). «Адамның протеин-протеинмен өзара әрекеттесу желісінің протеомды масштабты картасына қарай». Табиғат. 437 (7062): 1173–1178. дои:10.1038 / табиғат04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Serra-Pagès C, Streuli M, Medley QG (2006). «Липринді фосфорлану LAR-мен байланысуды реттейді: липринді автофосфорлануға дәлел». Биохимия. 44 (48): 15715–15724. дои:10.1021 / bi051434f. PMC 2529169. PMID 16313174.
Lim J, Hao T, Shaw C, Patel AJ, Szabó G, Rual JF, Fisk CJ, Li N, Smolyar A, Hill DE, Barabási AL, Vidal M, Zoghbi HY (2006). «Адамның тұқым қуалайтын атаксиялары мен Пуркинье жасушаларының деградациясының бұзылыстары үшін ақуыз-ақуыздың өзара әрекеттесуі». Ұяшық. 125 (4): 801–814. дои:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID 16713569.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (2006). «Сигналдық желілердегі ғаламдық, in vivo және нақты фосфорлану динамикасы». Ұяшық. 127 (3): 635–648. дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983.
Hoogenraad CC, Feliu-Mojer MI, Spangler SA, Milstein AD, Dunah AW, Hung AY, Sheng M (2007). «Липриналфа1-дің кальций / кальмодулинге тәуелді протеинкиназа II әсерінен ыдырауы LAR рецепторлары тирозинфосфатазаның таралуын және дендрит дамуын реттейді. Dev. Ұяшық. 12 (4): 587–602. дои:10.1016 / j.devcel.2007.02.006. PMID 17419996.

Сыртқы сілтемелер

Сайтында қол жетімді барлық құрылымдық ақпаратқа шолу PDB үшін UniProt: Q13136 (Липрин-альфа-1) кезінде PDBe-KB.

Бұл мақала а ген қосулы адамның хромосомасы 11 Бұл бұта. Сіз Уикипедияға көмектесе аласыз оны кеңейту.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000131626 - Ансамбль, Мамыр 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000037519 - Ансамбль, Мамыр 2017

[3] «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[4] «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[pmid7796809-5] а ^б Serra-Pagès C, Kedersha NL, Fazikas L, Medley Q, Debant A, Streuli M (тамыз 1995). «LAR трансмембраналық протеин тирозинфосфатаза және ширатылған катушкалар LAR-әрекеттесетін протеин фокалды адгезия кезінде бірге оқшауланады». EMBO J. 14 (12): 2827–2838. дои:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07282.x. PMC 398401. PMID 7796809.

[pmid9624153-6] а ^б ^c ^г. Serra-Pagès C, Medley QG, Tang M, Hart A, Streuli M (шілде 1998). «Липриндер, LAR трансмембраналық протеин-тирозинфосфатазамен әрекеттесетін ақуыздар отбасы». J Biol Chem. 273 (25): 15611–15620. дои:10.1074 / jbc.273.25.15611. PMID 9624153.

[entrez-7] а ^б «Entrez Gene: PPFIA1 ақуыз тирозинфосфатаза, рецепторлық тип, f полипептид (PTPRF), өзара әрекеттесетін белок (липрин), альфа 1».

[pmid12923177-8] а ^б ^c Ko J, Na M, Kim S, Lee JR, Kim E (қазан 2003). «RIM-байланыстыратын ақуыздардың ERC тобының мультидоменді ақуыздардың липрин-альфа тобымен өзара әрекеттесуі». Дж.Биол. Хим. 278 (43): 42377–85. дои:10.1074 / jbc.M307561200. PMID 12923177.

[pmid12629171-9] а ^б Ko J, Kim S, Valtschanoff JG, Shin H, Lee JR, Sheng M, Premont RT, Weinberg RJ, Kim E (наурыз 2003). «AMPA рецепторларын бағыттау үшін липрин-альфа мен GIT1 арасындағы өзара әрекеттесу қажет». Дж.Нейросчи. 23 (5): 1667–77. дои:10.1523 / JNEUROSCI.23-05-01667.2003. PMC 6741975. PMID 12629171.

[pmid16189514-10] Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill Hill, Roth FP, Vidal M (қазан 2005). «Адамның протеин-протеинмен өзара әрекеттесу желісінің протеомды масштабты картасына қарай». Табиғат. 437 (7062): 1173–8. дои:10.1038 / табиғат04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

[pmid8524829-11] а ^б ^c Pulido R, Serra-Pagès C, Tang M, Streuli M (желтоқсан 1995). «Трансмембраналық протеин-тирозин-фосфатазалардың LAR / PTP дельта / PTP сигма подфамилиясы: көптеген адамның LAR, PTP дельтасы және PTP сигма изоформалары тінге тән түрде көрінеді және LAR-өзара әрекеттесетін LIP.1 ақуызымен байланысады». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 92 (25): 11686–90. дои:10.1073 / pnas.92.25.11686. PMC 40467. PMID 8524829.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]