KIAA1958 - KIAA1958 - Wikipedia

KIAA1958
Идентификаторлар
Бүркеншік аттарKIAA1958
Сыртқы жеке куәліктерOMIM: 617390 HomoloGene: 136743 Ген-карталар: KIAA1958
Геннің орналасуы (адам)
9-хромосома (адам)
Хр.9-хромосома (адам)[1]
9-хромосома (адам)
KIAA1958 үшін геномдық орналасу
KIAA1958 үшін геномдық орналасу
Топ9q32Бастау112,486,847 bp[1]
Соңы112,669,397 bp[1]
Ортологтар
ТүрлерАдамТышқан
Энтрез
Ансамбль
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001287036
NM_001287038
NM_133465

жоқ

RefSeq (ақуыз)

NP_001273965
NP_001273967
NP_597722

жоқ

Орналасқан жері (UCSC)Chr 9: 112.49 - 112.67 Mbжоқ
PubMed іздеу[2]жоқ
Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеу

Ақуыз KIAA1958 Бұл ақуыз адамдарда KIAA1958 кодталған ген.[3] Ортологтар KIAA1958 моделі эволюция жолында аккордтар дегенмен, бұл гомологияда жақынырақ приматтар кез келген басқа ортологтарға қарағанда. KIAA1958 белгісіз параллельдер.

Джин

KIAA1958 ұзын қолында орналасқан 9-хромосома (9.q32) адамдарда 115249248-ден 115427597-ге дейінгі аралықта.[4] Оның мРНҚ-да 2683 а.к.[3] Ген 9-хромосомада келесі көршілерге ие:

KIAA1958 гендік көршілері

HSDL2: гидроксистероид дегидрогеназа тәрізді ақуыз 2 рөл атқарады нуклеотид міндетті, оксидоредуктаза және стерол міндетті.[5]

C9orf147: 9-хромосома оқудың 147 белгісі белгісіз функцияға ие.[6]

C9orf80: 9-хромосома оқудың ашық жақтауы SOSS кешенінің құрамдас бөлігі, MRN кешенінің төменгі ағысында жұмыс істейтін көп протеинді кешен ДНҚ-ны қалпына келтіру және G2 /М бақылау пункті. SOSS кешені ДНҚ зақымданған кезде бір тізбекті ДНҚ-мен байланысады және жасушадағы әртүрлі нүктелерге әсер етеді. ДНҚ зақымдануы жауап, оның ішінде ұялы циклді бақылау нүктесі белсендіру, рекомбинациялық жөндеу және геномдық тұрақтылықты қолдау.[7]

SNX30: сұрыптау nexin-30 байланысты болуы мүмкін фосфатидилинозитол міндетті.[8]

Өрнек

KIAA1958 ең жоғары мөлшерде көрсетілген көмей EST ұсынған.[9] Ішіндегі ең жоғары өрнек даму кезеңі болып табылады бластоциста денсаулық жағдайы үшін бұл ең көп кездеседі жатырдың ісіктері.[9]NCBI GEO профилінен алынған мәліметтер[10] KIAA1958 өрнегі адам ағзасындағы көптеген тіндік типтерді қамтитындығын көрсетеді. EMBL-EBI қолдану арқылы KIAA1958 шамадан тыс әсер еткені анықталды жалған аяқ Миграция кезінде РНҚ метастатикалық қатерлі ісік жасушалар.[11] KIAA1958 сонымен қатар Stat5 / ab және 3 статусында шамадан тыс көрсетілді, бұл простата қатерлі ісігі жасушаларының өсуі мен өміршеңдігі үшін транскрипция факторлары болып табылады[11] және екеуі де эмбриондық бағаналы жасуша және плурипотентті бағаналы жасуша.[11]

Ақуыз

KIAA1958 фосфорланған учаскелерді болжады

KIAA1958 716-дан тұрады аминқышқылдары және 6,375 изо-электрлік нүктесімен 79212 Да салмағы бар.[12] KIAA1958 ақуызы туралы көп мәлімет болмаса да, KIAA1958 құрылымы мен қызметін болжау үшін суперкомпьютерлердің көмегімен ғылыми болжамдар жасалды. KIAA1958 өтеді аудармадан кейінгі модификация. Ең қызықты модификация фосфорлану. Басқа ақуыздармен салыстырғанда, KIAA1958 трансляциядан кейінгі модификация кезінде фосфорланған сериндердің едәуір мөлшеріне ие. 36 серин фосфорланады деп болжануда.

Құрылым

PELE on SDSC Biology WorkBench - бұл KIAA1958 ақуызының екінші құрылымын болжауға қабілетті суперкомпьютер.[13] Бұл құралға сәйкес, ақуыздың екінші реттік құрылымы альфа-спиральдар мен бета парақтарының тіркесімі болып табылады, шамамен бірдей мөлшерде және ақуызға біркелкі таралады.

Өзара әрекеттесу

Қазіргі уақытта KIAA1958 басқа ақуыздармен әрекеттесетіндігі туралы нақты дәлел жоқ.[14]

Гомология

Түр және түрлерЖалпы атыҚосылу нөміріДәйекті. ҰзындықДәйекті. Жеке басын куәландыратынДәйекті. Ұқсастық
ПантроглодиттерШимпанзеXM_5283917945 а.к.99%99%
Бұлшықет бұлшықетіТышқанBAC38268719 а97%98%
Каллитрикс жакусы Кәдімгі мармосетXM_0027432042346 б / с97%82%
Pongo abeliiСуматран ОрангутанXM_0028201121120bp96%4%
Sus scrofaЖабайы қабанXM_0031220702502 а.к.93%81%
Ailuropoda melanoleucaАлып пандаXM_0029259382151 б.т.85%91%
Номаск лейкогенезіАқ щек гиббонXM_003263945950 а.к.93%5%
Oryctolagus cuniculusЕуропалық қоянXM_0027079902223 б93%43%
Loxodonta africana Африка бұтаның піліXM_0034075212388 а.к.93%80%
Cricetulus griseus Қытай хомякXM_0035055082534 а.к.92%42%
Equus caballusЖылқыXM_0019163022536 а.к.91%93%
Бос таурусСиырXM_876102.52480 а.к.91%81%
Rattus norvegicusЕгеуқұйрықXM_0027265321364 а.к.91%36%
Cavia porcellusтеңіз шошқасыXM_0034637912217 б.т.91%43%
Monodelphis domesticaOpossumXM_0013759762217 б.т.78%41%
Branchiostoma floridaeЛанцетXP_002611438719 а29%48%
Amphimedon queenslandicaГубкаXP_003390994388 а25%48%
Acyrthosiphon pisumБұршақ тлиXP_0019437201197 аа24%43%
Oikopleura dioicaХордатCBY34656629 а22%43%
Ciona intestinalisВаза туникасыXP_0021259641004 аа23%43%
Ксенопус (силурана) tropicalisБатыс тырнақ бақаAAI61073679 а23%43%
Halocynthia roretziТеңіз ананасыBAB40645980 а23%45%

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ а б c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000165185 - Ансамбль, Мамыр 2017
  2. ^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  3. ^ а б «Homo sapiens KIAA1958 (KIAA1958), mRNA». NCBI. Алынған 20 сәуір 2012.
  4. ^ «KIAA1958 кодтайтын Homo sapiens гені KIAA1958». AceView. Алынған 19 сәуір 2012.
  5. ^ «Q6YN16 (HSDL2_HUMAN) қаралды, UniProtKB / Swiss-Prot». UniProt. Алынған 1 мамыр 2012.
  6. ^ «Homo sapiens гені C9orf147, 9 хромосоманы кодтайтын 147 оқу рамкасы». AceView. Алынған 1 мамыр 2012.
  7. ^ «Q9NRY2 (SOSSC_HUMAN) қаралды, UniProtKB / Swiss-Prot». Алынған 1 мамыр 2012.
  8. ^ «Q5VWJ9 (SNX30_HUMAN) қаралды, UniProtKB / Swiss-Prot». Алынған 1 мамыр 2012.
  9. ^ а б «Unigene EST профилі». Unigene. Алынған 8 мамыр 2012.
  10. ^ «Гео профильдер». NCBI. Алынған 28 сәуір 2012.
  11. ^ а б c «Гендердің көріністері». Эмбл-Эби. Алынған 8 мамыр 2012.
  12. ^ «Биология WorkBench». SDSC. Алынған 3 мамыр 2012.
  13. ^ «Биология жұмыс үстелі». SDSC Biology WorkBench. Алынған 28 сәуір 2012.
  14. ^ «Ақуыздардың өзара әрекеттесуі». Жол. Алынған 7 мамыр 2012.

Әрі қарай оқу

  • Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (қараша 2006). «Сигналды желілердегі ғаламдық, in vivo және нақты фосфорлану динамикасы». Ұяшық. 127 (3): 635–48. дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.