Кари Стефанссон - Kári Stefánsson

Кари Стефанссон
Кари Стефансон - PopTech 2012 - Рейкьявик Исландия (7473568524) (кесілген) .jpg
DeCODE Genetics негізін қалаушы және бас директоры
Туған (1949-04-06) 6 сәуір 1949 ж (71 жас)
Рейкьявик, Исландия
ҰлтыИсландия
Алма матерИсландия университеті
БелгіліПопуляция генетикасы
ЖұбайларValgerður Ólafsdóttir (1970 - қазіргі уақытқа дейін)
Балалар3
МарапаттарҰлттық ғылым академиясына сайланды; Уильям Аллан сыйлығы; Андерс Джахре сыйлығы; Ханс Кребс медалі
Веб-сайтwww.код.com

Кари Стефанссон[a] (немесе Кари Стефанссон; 1949 ж. 6 сәуірде туған)[1] - исландиялық невропатолог және Рейкьявиктегі биофармацевтикалық компанияның негізін қалаушы және бас директоры deCODE генетикасы. Жылы Исландия ол адам геномының дәйектілігінің өзгеруін түсіну үшін популяциялық масштабтағы генетиканы қолданудың бастамашысы болды. Оның жұмысы геномдық алуан түрліліктің қалай пайда болатындығына және кең таралған ауруларға бейімділіктің әсер ететін реттілік нұсқаларын табуға бағытталған. Популяцияның бұл тәсілі бүкіл әлем бойынша ұлттық геномдық жобаларға үлгі болды және дәл медицинаның бірнеше аспектілерін жүзеге асыруға ықпал етті.[2][3]

Ерте өмірі және білімі

Стефанссон 1949 жылы дүниеге келген Рейкьявик, Исландия.[4] Ол Сольвейг Халлдорсдоттир мен бес баланың екінші кенжесі болды Стефан Йонссон [болып табылады ], көрнекті радио қайраткері, жазушы және парламенттің демократиялық социалист мүшесі.[5] Орта білімін ол аяқтады Рейкьявик кіші колледжі және оны қабылдады М.Д. 1976 ж. және оның Доктор мед. 1986 жылдан бастап Исландия университеті.

Оқу мансабы

Исландия ұлттық госпиталінде тағылымдамадан өткен соң ол емханаға барды Чикаго университеті Барри Арнасонның басқаруымен жұмыс істеу керек (кездейсоқ а Исландия текті канадалық ). Онда ол резиденцияларын аяқтады неврология және невропатология 1983 ж. факультетке қосылды. 1993 жылы неврология, невропатология және неврология ғылымдарының профессоры болып тағайындалды Гарвард университеті және Бостондағы невропатология бөлімінің бастығы Бет Израиль ауруханасы. Ішінде Бостон, ол және оның әріптесі Джеффри Гульчер Исландияға оралып, генетикалық зерттеулер жүргізу үшін шешім қабылдады склероз тәуекел.[6] Стефанссон 1997 жылы deCODE құрып, Рейкьявикке оралғаннан кейін екі лауазымнан бас тартты.[7] 2010 жылдан бастап Исландия университетінде медицина профессоры атағын алады.[8] Ол Исландияда және АҚШ-та невропатолог және невропатолог ретінде сертификатталған.[9]

Биологиядан генетикаға дейін

Стефанссонның академиялық жұмысы нейродегенеративті ауруға бағытталды.[10] Бұл зерттеуге ақуыздық биология тәсілі шектеулі үлгілерді, негізінен, қайтыс болған науқастардың ми тінін пайдаланып, күрделі процестерді картаға түсіруге тырысты. Тұрақты түрде жариялағанымен, Стефанссон прогресстің қарқынына және көбінесе ол сипаттайтын белоктардың ауруды тудырғанына немесе ауру процесінің өніміне қатысы бар-жоғын білмей, ренжіді.[11] Ол және оның әріптестері аутоиммунды ауру ретіндегі склероздың (МС) анықтамасына да күмәнданды.[12]

Ол Чикагодан Гарвардқа қабылданған кезде, Стефанссон, көптеген басқа медицина ғалымдары сияқты, геном мұндай зерттеулерге биологиядан гөрі жақсы бастама бере алады деп ойлады. Гендер ақуыздарды кодтайды, сондықтан пациенттер дені сау адамдарға қарағанда жиі бөлісуге бейім болған гендер мен ерекше генетикалық вариацияларды анықтап, аурудың патогенезінде тірек болуы керек.[13] Бұл ретте олар жаңа дәрі-дәрмектер мен болжамды диагностиканың биологиялық маңызды мақсаттарын көрсетуі мүмкін.[14]

Алайда, 1990 жылдардың ортасында геномның реттілігін оқуға арналған құралдар қарабайыр болды. Деректер аз және қымбат болды, олардың негізгі назарында болды Адам геномының жобасы жақсы әдістерді әзірлеу болды.[15] Бұл арада генетиканы - геномның қалай араласып, ұрпақтан ұрпаққа берілуін - қолда бар деректерден көбірек ақпарат алу құралы ретінде пайдалану шешілді.[16] Бауырлар өздерінің геномдарының жартысын бөліседі; бірақ сегізден бір бөлесі, екінші немере ағасы отыз екінші және т.с.с. кеңейтілген генеалогиямен байланысты пациенттерді зерттеу сондықтан тиімді табуға мүмкіндік беруі керек. кез-келген фенотиптің немесе белгінің мұрагерлік компоненті, тіпті төмен ажыратымдылықты маркерлерді қолдану.

Исландияға оралу

Осындай кеңейтілген шежірелерді қайда табуға болатындығы және болмауы маңызды мәселе болды. Көптеген жетекші генетиктердің жиі кездесетін ауруларға қатысты сұрақ қоюы мүмкін емес.[17] Исландия ретінде Стефанссон елдің шежіреге деген құштарлығын бірінші кезекте білген және оның ұлттық денсаулық сақтау жүйесімен бірге өсіп, дайындалған. 1995 жылы ол өзінің әріптесі және бұрынғы аспирант Джеффри Гульчермен бірге Исландияға склероз ауруын зерттеу туралы шешім қабылдады. Ұлттық денсаулық сақтау жүйесіндегі дәрігерлермен жұмыс барысында олар зерттеуді бастау үшін қан үлгілерін берген жүздеген науқастар мен туыстарын анықтады. Исландиялықтар ретінде олар анықтамалар бойынша дерлік туыстық қатынасқа ие болды және ұлттық шежіреге байланысты бұл қатынастар орнауы мүмкін еді.

Стефанссон мен Гульчер Бостонға оралғанда, олардың грант ұсынысы бас тартылды NIH, алыстағы науқастарды қолдана отырып, қаржыландыру тәжірибесі аз болды. Бірақ Стефанссон Исландияда іс жүзінде кез-келген жалпы аурудың генетикалық компонентін табуға осындай тәсілді қолдану әлеуетін көрді.[18] Бұл академиялық зертхананың шеңберінен тыс болды және ол венчурлық фирмалармен байланыс орнатып, мұндай кәсіпорынды жеке компания ретінде қаржыландыруға болатындығын білді. 1996 жылдың жазында ол deCODE генетикасын құру үшін бірнеше американдық венчурлық қордан 12 миллион доллар жинады.[19] Ол Гүлчермен бірге Исландияға барып, операциялар жүргізіп, келесі жылы Гарвардтағы қызметінен бас тартты.[20]

deCODE және популяция тәсілі

Стефанссон deCODE-ді адам генетикасына арналған өнеркәсіптік кәсіпорын ретінде ойластырды. Жеке зертханаларында дискретті жобаларды жүзеге асыратын ғалымдардың басым академиялық моделінен айырмашылығы, ол халықтың түкпір-түкпірінен мүмкіндігінше генеалогиялық, медициналық және геномдық мәліметтерді жинап, қалыптастыруды ұсынды. Биоинформатика мен статистиканы қолдана отырып, содан кейін deCODE барлық деректі гипотезасыз түрде кезектіліктің өзгеруі мен кез-келген ауру немесе белгілер арасындағы корреляция үшін біріктіріп, жинай алады.[21] Іскерлік модель бұл күш-жігерді жаңа дәрі-дәрмектерді жасау үшін ашылған жаңалықтарды қолданатын фармацевтикалық компаниялармен серіктестік арқылы қаржыландыруы керек еді.[22]

Исландияда осы «халықтық көзқарас» үшін қажетті деректер көздері болды: жоғары сапалы бір төлемді денсаулық сақтау жүйесі; салыстырмалы түрде біртектес популяция, бұл аурудың нұсқаларын табуды онша күрделі етпейтін;[23] зерттеу үшін ДНҚ мен медициналық және денсаулық туралы ақпарат беруге дайын білімді азамат; және ең ерекше, жан-жақты ұлттық шежірелер.[24] Мэри Клар Кинг, кім анықтау үшін отбасы тегтерін қолданған BRCA1 сүт безі қатерлі ісігінде бұл жазбалардың әлеуетін мойындаған ғалымдардың қатарында болды. Нью-Йоркке айтқанындай, «бүкіл халықтың шежіресін мың жыл бойы анықтай білу ... және дені сау адамдардан қан мен тіндердің үлгілерін алу ... қазіргі заманғы медицинаның қазынасының бірі бола алады. «[25]

Оның пайда болуынан бастап, Стефанссонның стратегиясындағы барлық іс жүзінде дәлелденбеген немесе қайшылықты болды. Геномика қауымдастығы алғашқы адамның геномдық тізбегін құрудан әлі де алыс болды; ол жүз мыңдаған геномдарды өндіруге арналған деректер жүйесін ұсынды. Сардиниядағы, Ньюфаундлендтегі, Финляндиядағы және басқа жерлердегі оқшауланған отбасыларда сирек синдромдармен байланысты гендер анықталды. BRCA2 нұсқасы Исландияда табылған, бірақ ол ең көп кездесетін денсаулық сақтау проблемаларын қарастырғысы келді.[26] Wall Street Journal басылымы бұл «үлкен ойын» деп атап, атап өткен ғалымдарға сілтеме жасап: «зерттеушілер Исландия тұрғындары немесе кез келген ел арасында күрделі аурудың генетикасын шеше алатындығына ғылыми дәлел жоқ».[27] DeCODE - бұл бүкіл халықты оқу бірлігі ретінде қабылдайтын, бұрын-соңды болмаған қоғамдық қатынастар мен қатысуларға әкелетін жеке компания.

Стефанссонның 1997 жылы генеалогиялық және геномдық мәліметтермен корреляциялау үшін ұлттық денсаулық сақтау қызметінен алынған медициналық карталар көшірмелерінің дерекқорын құру туралы ұсынысы ең көп дау тудырды.[28] Жұртшылықтың және парламент мүшелерінің басым көпшілігі қолдайды Денсаулық сақтау секторының дерекқоры туралы акт мұндай мәліметтер базасын құруға және оны коммерциялық мақсатта пайдалануға лицензиялау 1998 жылы қабылданған. Бірақ оған жергілікті академиктер мен дәрігерлер тобы және көптеген халықаралық биоэтиктер қатаң қарсы болды.[29] Исландияның денсаулық сақтау секторы дерекқорының (IHD) қарсыластары жалпыға ортақ мәліметтерді жеке кәсіпорынның қолдануына қарсы болды және медициналық карталарды зерттеу кезінде пайдалану үлгісі ретінде келісім қабылдады. Олар жоба жеке тұлғалардың деректерінің құпиялылығына қауіп төндіреді, ғылыми еркіндікті тежейді деп тұжырымдады және олар deCODE ұсынған биомедициналық инновацияның венчуралық қаржыландырудың жаңа моделін негізінен мақұлдамады.[30]

Жүздеген сұхбаттар мен мақалаларда Стефанссонға IHD және оның кеңейтілген тәсілі үшін шабуыл жасалды - және оны дәл солай қорғады.[31] Ол дәстүрлі дерек көздерін немесе зерттеушілерді ығыстырудан гөрі денсаулық сақтау қызметі үшін ресурстар мен мүмкіндіктердің жаңа шкаласын жасайды деп мәлімдеді; Исландия ғалымдарын алдыңғы қатарлы салаларға оралту және жалдау арқылы қоғамдастыққа пайда келтіру; және халықаралық биоэтика мен деректерді қорғау органдарының және жаңа деректерді және құпиялылықты қорғаудың хаттамаларын қадағалай отырып, ауқымды зерттеулерде жаңа стандарттарды белгілей отырып, келісімнің халықаралық нормаларын сақтау.[32] Сол кездегі сыншылар сенімді болмады. Стэнфорд биоэтикі Хэнк Грили жай ғана «исландиялық модель басқа жерлерде ұқсас зерттеулер жүргізу үшін жақсы прецедент емес» деген тұжырым жасады.[33]

Ғылыми үлестер

Популяция генетикасы мен ұлттық геномдық жобалардың орындылығы

DeCODE архитекторы, ғылыми жетекшісі және көпшілік алдында тұрған тұлға ретінде Стефанссонның геномиканың ұлттық масштабта жасалуы мүмкін екенін көрсету және оны қалай жасауға болатындығын көрсету Стефанссонның маңызды үлестерінің бірі болды.[34] Сол уақытқа шейін Адам геномының жобасы және Celera 2001 жылы олардың адам геномының дәйектілік жобасын жариялады, оның популяция генетикасына деген көзқарасы қалыптасып үлгерді және ауруға, адам эволюциясы мен популяция тарихына байланысты дәйектіліктің өзгеруін ерте ашты.[35][36] 2002 жылы deCODE Исландияда геномның генетикалық картасын жариялау үшін өзінің мүмкіндіктерін пайдаланды, ол адамның геномының анықтамалық тізбегінің соңғы жиынтығын аяқтады.[37] Онжылдықтың ортасында, тіпті бұрынғы сыншылар да Стефанссонның Исландияда толығымен келісілген жеке қатысу және мәліметтер беру арқылы салған нәрселері шынымен де Ұлыбританияда, АҚШ-та, Канадада, Швецияда, Эстонияда және басқа жерлерде геномдық жобалар үшін маңызды үлгі болғанын және қор үшін мойындады. Кең институт сияқты жаңа институттардың.[38][39]

Стефанссонның стратегиясының сәттілігінің бір негізі оның deCODE зерттеулеріне қатысуға он мыңдаған адамдарды ерікті болуға сендіру және олардың деректерін шежірелер арқылы байланыстырып, талдауы болды. Жергілікті бағдарламалық жасақтама жасаушымен ерте серіктестік Фрикрик Скуласон барлық тірі исландиялықтарды байланыстыратын компьютерленген ұлттық шежірелер базасын құрды және соңғы он бір жүз жыл ішінде Исландияда өмір сүрген адамдардың көпшілігін қамтыды.[40] 2003 жылы Исландияның ұлттық сәйкестендіру нөмірі бар кез келген адам үшін thisslendingabók деп аталатын осы мәліметтер базасының бір нұсқасы Интернетте еркін қол жетімді болды және оны күн сайын мыңдаған азаматтар қолданады.[41] Зерттеулерде қолданылған нұсқа атауларды Исландияның деректерді қорғау жөніндегі комиссия қадағалайтын шифрланған жеке идентификаторлармен ауыстырады. Бұл кез-келген адамдар тобының генетикалық және фенотиптік деректерін анонимді түрде байланыстыратын асыл тұқымдарды жасауға мүмкіндік береді. Стефанссон мен Гульчер басқа геномдық жобаларды пайдалану үшін деректерді қорғау жүйесінің құрылымын жариялады.[42]

DeCODE зерттеулеріне кадрларды жинаудың негізгі құралдары денсаулық сақтау саласындағы дәрігерлермен ынтымақтастық арқылы болды, олар әр түрлі аурулары бар науқастардың тізімін жасайды, содан кейін қатысуға шақырылады. Қатысу тек жазбаша келісіммен ғана емес, сонымен бірге денсаулық сауалнамасын толтырумен де байланысты; егжей-тегжейлі клиникалық тексеруден және өлшемдерден өту; және ДНҚ оқшаулау үшін қан беру; мұның бәрі арнайы клиникада өтеді және қатысушылардың бірнеше сағат ішінде орындауы қажет.[43] IHD ешқашан салынбаған, оның ғылыми және іскери негіздемесі, негізінен, исландтықтардың өз деректерін бір-бірлеп үлес қосуға деген жауабымен алмастырылған.[44] 2003 жылға қарай адамдардың 95% -ы қатысуға келіскен кезде, 100000-нан астам адам бір немесе бірнеше он үш ауруды зерттеуге қатысқан.[45] 2007 жылға қарай бұл 130 000-ға дейін өсті;[46] ал 2018 жылға қарай 160 000-нан асады. Бұл барлық ересек азаматтардың шамамен 70% құрайды, олардың 60,000-да бүкіл геномдары ретке келтірілген.[47]

Геномды оқудың технологиясының әрбір келесі кезеңінде - бастап микроспутник үшін белгілер SNPs тұтас геномды тізбектеуге - бұл қатысу халықтың үлесі ретінде ерекше және сонымен қатар әлемдегі геномдық деректердің абсолюттік өлшемдер бойынша ең ірі коллекцияларының бірін құрайды.[48] DeCODE шежірелерін пайдалану арқылы 300000-нан астам бүкіл геномнан тұратын бір шифрланған, минималды деректер жиынтығын бере отырып, бүкіл халықтың дәйектілік деректерін анықтауға болады.[49]

Ашылымдар мен жарияланымдар

Стефанссон өзінің deCODE әріптестерін осы халықтық мәліметтер жиынтығын үнемі құруға және қайта сұрауға жетекшілік ете отырып, геномның реттілігінің өзгеруі және оның денсаулық пен ауруға қалай әсер ететіндігін түсінуге тұрақты үлес қосты. Майлс Экстон, ұзақ жылдар бойы редактор болған Табиғат генетикасыdeCODE-дің 20 жылдық мерейтойында атап өткендей, бұл басшылық deCODE мен Исландияны «революцияның алдыңғы қатарына шығарды, ол адам геномын бейнелеуде уәде етілгендердің көп бөлігін берді».[50]  

Бұл жаңалықтар, құралдар мен бақылаулар жүздеген ғылыми басылымдарда ғылыми қауымдастықпен бөлісті. Стефанссон deCODE-дегі барлық зерттеулерге басшылық жасайды және бақылайды, оның жобаларында аға автор болып табылады, жоба мен топ жетекшілерімен бірге deCODE ынтымақтастықта болған жүздеген жергілікті және халықаралық мекемелер мен ұйымдардан алынған алғашқы авторлар мен авторлар қатысады.[51] Олардың көп бөлігі осы салаға қосқан үлесі болып табылады және Стефанссон және оның бірнеше deCODE әріптестері генетика мен молекулалық биология саласындағы ең жоғары дәйексөз жазған ғалымдардың қатарына кіреді.[52]

Адамның алуан түрлілігі және эволюция механизмдері

Жиырма жылға жуық уақыт ішінде жарияланған оннан астам ірі мақалаларда Стефанссон және оның әріптестері адам геномының жаңа картинасын ақпарат беру жүйесі ретінде құру үшін бүкіл халыққа деген тұтас көзқарасын пайдаланды. Олар геномды қалай қолданатыны туралы толық көрініс берді рекомбинация, де ново мутация және гендердің конверсиясы әртүрлілікті алға жылжыту және қалыптастыру, бірақ белгілі бір шектерде.

2002 жылы deCODE адам геномының алғашқы рекомбинациялық картасын жариялады. Ол 5000 микроспутниктік маркерлермен салынған және адам геномы жобасының геномның құрастыру жиынтығына 104 түзету енгізіліп, жобаның дәлдігін бірден 93-тен 99% -ға дейін арттырды. Бірақ эволюциялық биология тұрғысынан ол рекомбинациялардың кездейсоқ емес орналасуын - жұмыртқа мен сперматозоидтар түзуге кететін геномның өзгеруін - және әйелдердің ерлерге қарағанда 1,6 есе көп рекомбинацияланатынын жаңа егжей-тегжейлі көрсетті.[53]

Содан кейін олар егде жастағы әйелдердің жас әйелдерге қарағанда рекомбинацияланатындығын көрсетті; жоғары рекомбинацияның жоғары құнарлылықпен корреляциясы;[54] және қазіргі кезде 17-хромосомадағы үлкен инверсия европалық популяцияларда оң эволюциялық сұрыпталу жағдайында, ал тасымалдаушылар тасымалдаушыларға қарағанда рекомбинация мен құнарлылық коэффициенттері жоғары.[55] 2010 жылы жарияланған екінші рекомбинациялық карта 300,000 SNP пайдаланды және әйелдер мен ерлер арасындағы әртүрлі рекомбинациялық ошақтарды, сондай-ақ рекомбинация жылдамдығына әсер ететін генетикалық генетикалық вариацияларды және Еуропа мен Африка популяцияларында әртүрлі болатындығын анықтады.[56]

Бұл карта рекомбинацияның көбіне әйелдер жауапты болса, оның негізгі бөлігін ерлер құрайтындығын көрсетті де ново мутациялар. 2012 жылдан бергі көп талқыланған мақалада олар мұндай мутациялардың саны - балалардың геномында пайда болатын, бірақ ата-анасынан екеуіне де мұра болып табылмайтын варианттар әкелік жасқа байланысты өсіп, сирек кездесетін аурулардың негізгі көзі болып табылатындығын көрсетті.[57] Аналық және әкелік сипаттамалары мен таралуы бойынша егжей-тегжейлі талдау де ново мутациялар 2017 жылы жарияланған,[58] және келесі қағазда қалай көрсетілген де ново ата-аналардың мутациясы берілуі мүмкін.[59]  

Геномдық әртүрліліктің үшінші көзі, гендердің конверсиясы, анықтау өте қиын шежірелерден басқа. deCODE шамамен 150,000 адамға қатысты геномдық және генеалогиялық деректерді біріктірді, бұл процесс кроссовер рекомбинациясы сияқты, әйелдерде жиі кездесетіндігін көрсетті; жасына байланысты; және ерлер мен әйелдердің гендер конверсиялары тип бойынша бірін-бірі бақылауда ұстайтын етіп бірін-бірі толықтыруға бейім.[60] 2019 жылы deCODE геномның үшінші рекомбинациялық картасын жариялау үшін генеалогияларды, алдыңғы жылдары аяқталған көптеген геномдар тізбегін (WGS) және халықтың көп бөлігі туралы геноитпинг мәліметтерін пайдаланды. Бұл WGS деректерін қолданып жасалған бірінші, және алдыңғы карталар сияқты әлемдік ғылыми қоғамдастыққа ашық түрде қол жетімді болды.[61]  

Популяция тарихына және генетикалық антропологияға қосқан үлестерге мутациялық жылдамдық пен митохондрия мен Y хромосомасындағы механизмдер бойынша алғашқы жұмыстар жатады;[62] ежелгі мен қазіргі ДНҚ-ны салыстыру;[63] Исландия популяциясындағы митохондрия мен Y хромосомаларының тиісті скандинавиялық және кельтік тамырларының сипаттамасы;[64] генетикалық дрейф құбылысын бақылаулар, өйткені оқшауланған популяция уақыт өте келе оның негізгі популяцияларынан алшақтайды;[65] туыстық пен құнарлылықтың арақатынасы;[66] популяция құрылымының ауруға байланысты нұсқаларға әсері және керісінше,[67] және адам нокауттарының, белгілі бір гендерді жоғалтқан адамдардың жалпы каталогы.[68]  

2018 жылы deCODE геномын қалпына келтіру үшін өзінің мүмкіндіктерін пайдаланды Ханс Джонатан, Африка тектес алғашқы исландиялықтардың бірі. Ол Исландияға 1802 жылы көшіп келді және оның геномы 800-ге жуық тірі ұрпағының 180 геномының фрагменттерінен қалпына келтірілді. Lslendingabok.[69]

Жалпы аурулар мен белгілердің генетикасы

Стефанссон өзінің және оның deCODE әріптестерінің аурудың пайда болу қаупімен және басқа да бірқатар белгілермен байланысты генетикалық вариацияларды табуға қосқан үлесімен танымал болуы мүмкін. Популяция тәсілі - ресурстардың ауқымы мен кеңдігі және әр түрлі мәліметтер жиынтығына бағытталуы - бұл өнімділіктің кілті болды. Бұл фенотиптердің кең және қатаң анықтамаларын қолдануға, идеяларды тез тексеруге және deCODE ғалымдарының деректерді өздерінің гипотезаларына емес, қайда әкелетініне назар аударуына мүмкіндік береді.[70] Бұл ауруларды байланыстыратын және кейде фенотиптерді ерекше тәсілдермен қайта анықтау үшін генетиканы қолданатын көптеген жаңалықтардың ашылуына әкелді, ал Стефанссон бұл жаңалықтарды және олардың пайдалы жақтарын ғылыми және қарапайым ақпарат құралдарына түсіндіруге айтарлықтай уақыт жұмсады. Әдетте, Исландияда ашылған жаңалықтар валидациямен қатар сыртқы популяцияларда жарияланады. Керісінше, deCODE өз ресурстарын басқа жерлерде ашылған жаңалықтарды растау үшін жиі пайдаланады. Осы жаңалықтардың ішіндегі назар аударарлықтарының қатарына аурулары мен белгілері бойынша:

Альцгеймер ауруы

Нұсқасы APP тасымалдаушылардан қорғайтын ген 2012 жылы табылды Альцгеймер ауруы (AD) және қарттарды когнитивті құлдыраудан қорғайды. Бұл туралы кеңінен келтірілген және дамуды ақпараттандыру үшін қолданылған BACE1 ингибиторлар әлеуетті емдеу әдісі ретінде.[71] Стефанссон және deCODE тобы сонымен қатар олардың нұсқаларын тапты TREM2 және ABCA7 АД қаупін арттыратын гендер.[72]   

Шизофрения, басқа психикалық бұзылулар, таным

Стефанссон және оның командасы компанияның мәліметтер жиынтығының кеңдігін және аурулар мен белгілер арасындағы байланысты психикалық аурудың жаңа тәуекел нұсқаларын табу үшін пайдаланды, сонымен қатар осы шарттар мен танымның табиғатын анықтайтын толқулар туралы түсінікті жетілдірді. 2000 жылдардың басындағы зерттеулер олардың қатысуын бейнелеген Неурегулин 1 шизофрениядағы ген, бұл жаңа жолда елеулі зерттеулерге әкеледі.[73] Келесі он бес жыл ішінде олар стандартты GWAS қолданды және ұрықтылықты аралық фенотип ретінде SNP-де үйге әкелу және шизофрения және басқа да бұзылыстар қаупімен байланысты нөмірлердің вариацияларын (CNV) азайту;[74] олар шизофрения мен аутизмге генетикалық қауіп факторлары бақылау субъектілерінде де когнитивті ауытқулар тудыратынын көрсетті;[75] олар шизофренияны, биполярлық бұзылысты шығармашылықпен де, тәуелділіктің даму қаупімен де байланыстырды;[76] олар білім деңгейімен және балалық таныммен байланысты генетикалық нұсқаларды анықтады;[77] және осы нұсқалар қазіргі кезде теріс эволюциялық сұрыптауда екенін көрсетті.[78] Жалпыға ортақ психиатриялық бұзылулар мен когнитивті процестер мен қасиеттерді шешуде бұл жұмыс тобы осы жағдайларды дискретті фенотиптер ретінде емес, фундаментальды когнитивті функцияларды бұзу арқылы байланысты түсінуге ықпал етті.

Қатерлі ісік

Стефанссон және оның әріптестері геном варианттарының көптеген алғашқы жаңалықтарын жасады, олар көптеген қатерлі ісіктер қаупін тудырды. Олар қатерлі ісік ауруын түсінудің қазіргі кездегі жалпы қабылданған жаңа парадигмасын қалыптастыруда маңызды рөл атқарды: оны денеде пайда болатын жермен салыстырғанда молекулалық тұрғыдан кем дегенде анықтау керек. deCODE бұл туралы біртұтас дәлелдерді елу жылдан астам Исландияда кез-келген адамда диагноз қойылған барлық қатерлі ісіктердің отбасылық жиынтығында және басқа агрегациялық зерттеулерде жариялады.[79] Бұлар негізгі генетика арқылы кейбір сайттардың қатерлі ісіктері отбасыларға шоғырланған болса, басқалары жалпы емес молекулалық себептерге сілтеме жасай отырып, нақты емес жолмен кластерленгенін көрсетті. Олар 8q24 хромосомасын көптеген қатерлі ісіктердің қауіпті нұсқалары ретінде анықтады,[80] және TERT, TP53 және LG24 гендеріндегі нұсқалар көптеген қатерлі ісіктердің қауіпті факторлары ретінде.[81]  

deCODE қуық асты безінің қатерлі ісігінің даму қаупімен байланысты бірқатар бірқатар нұсқаларды тапты (сонымен қатар қорғаныс нұсқасы),[82] сүт безі қатерлі ісігі,[83] меланома және базальды жасушалы карцинома,[84] Қалқанша безінің қатерлі ісігі,[85] мочевого көпіршік қатерлі ісігі,[86] аналық без қатерлі ісігі,[87] бүйрек жасушаларының қатерлі ісігі,[88] асқазан рагы,[89] аталық без рагы,[90] өкпе рагы,[91] және клональды гемопоэз.[92] Он жылға жуық уақыттағы үш зерттеу никотинге тәуелділіктің артуымен және тәулігіне темекі шегетін темекі санымен байланысты өкпенің қатерлі факторы болып табылатын қарапайым және сирек кездесетін нұсқаларын көрсете отырып, Исландиядағы халықтың деректер жиынтығының күшін көрсетті; яғни темекі шегуге генетикалық бейімділік сонымен бірге темекі шегуге байланысты аурудың қауіпті факторы болды.[93]

Жүрек - қан тамырлары ауруы

Стефанссон және оның жүрек-қантамырлық зерттеу тобы бүкіл әлемдегі әріптестерімен атриальды фибрилляция қаупімен байланысты кең таралған және сирек кездесетін нұсқаларды табуда жұмыс істеді,[94] коронарлық артерия ауруы (CAD),[95] инсульт,[96] перифериялық артерия ауруы,[97] синус синдромы,[98] және қолқа мен интракраниальды аневризма.[99] Жақында ашылған жаңалықтардың ішінде сирек кездесетін нұсқасы бар ASGR1 дамыған әлемдегі өлімнің жетекші себебі, коронарлық артерия ауруларынан айтарлықтай қорғаныс беретін ген.[100] Бұл жаңалық есірткіні табуда және дамытуда қолданылады Амген.[101] 300,000 адамнан алынған клиникалық және бүтін геномдық дәйектілік деректерін талдай отырып, тағы бір өте үлкен зерттеу холестерин деңгейінің жоғарылауына сәйкес келетін оннан астам салыстырмалы сирек нұсқаларын тапты. Алайда, АЖЖ-мен байланысты генетикалық байланыстар холестериннің жүрек ауруымен байланысы туралы жаңа көзқарас тудырды. Олар HDL емес холестеринді өлшеу («жақсы холестерол» деп аталады) LDL (немесе «жаман») холестеринді өлшеуге қарағанда тәуекелді жақсырақ ұстайды, бұл стандартты тәжірибе.[102]

Қант диабеті және басқа белгілер мен жағдайлар

deCODE 2 типті қант диабеті (T2D) мен TCF7L2 генінің нұсқалары арасындағы байланысты анықтады,[103] белгілі генетикалық қауіп факторы және индукин реакциясымен байланысты CDKAL1 және басқа гендердегі варианттар, сонымен қатар T2D қаупі жоғарылаған және төмендеген.[104] DeCODE тобы генетикалық вариацияны түсінуге үлес қосты, бұл басқа аурулар мен белгілерге, соның ішінде глаукомаға әсер етеді;[105] менарх;[106] маңызды тремор;[107] туберкулезге бейімділік;[108] биіктігі;[109] ген экспрессиясы;[110] шашты, көзді және теріні пигментациялау;[111] қолқа қақпағының стенозы;[112] риносинусит;[113] және басқалары.

2014 жылы Стефанссон Финляндия мен Швециядан оралғанда deCODE жанында тоқтаған кең институт директорының орынбасары Дэвид Альтшулерді таң қалдырды деп хабарланды. Альтшулер T2D зерттеу жұмыстарына жетекшілік етті және сирек кездесетін нұсқаны тапты, олар өмір сүрудің жалпы қауіпті факторлары бар адамдарды да аурудан қорғайды. Стефанссон өзінің топ жетекшілерінің біріне қоңырау шалып, одан deCODE деректеріндегі ассоциацияның іздеуін тексеруді өтінді. Бірнеше минут ішінде олар исландиялықтардың Альтшулер командасында тапқан нақты нұсқасы болмағанын, бірақ сол генде T2D үшін анық қорғайтын басқа нұсқасы болғанын растады.[114] Содан кейін deCODE тобы өзінің нұсқасын Nature Genetics-те жарияланған мақалаға қосты.[115]

Мемлекеттік-жекеменшік ынтымақтастық және дәл медицинаны дамыту

Стефанссонның дизайны мен жаппай қатысу ғылымына негізделген жеке кәсіпорын ретіндегі deCODE-ді басқаруы медициналық зерттеулерге қатысу, өнімді дамыту және мемлекеттік-жеке серіктестіктің жаңа модельдеріне ықпал етті.

DeCODE әлемдегі алғашқы және ең ауқымды ұлттық геномдық жобаны қамтитынымен, ол ешқашан үкімет тарапынан қаржыландырылмаған. Бұл әрқашан азаматтар мен ұлттық денсаулық сақтау жүйесінің дәрігерлерінің ғылыми жаңалықтарға серіктес ретінде ерікті қатысуына негізделген бизнес болды. Стефанссонға қисынды болып көрінген, басқаларға қарама-қайшы келетін және кейбіреулерге ұнамайтын азаматтар мен жеке кәсіпкерлік арасындағы бұл қатынастар жиі кездеседі.[116] Оның Исландиядағы жетістігі мен қатысуының негізі болып табылатын факторлардың бірі - бұл елдің кішігірім және тарихи оқшаулануын маңызды саладағы ерекше артықшылыққа айналдыратын ұлттық мақтаныш. Тағы бір жаңалық - бұл дәрі-дәрмектер мен денсаулықты жақсарту үшін нақты өнімдерді жасауға және сатуға бағытталған. 2017 сұхбатында Исландияның бұрынғы президенті Вигдис Финнбогадоттир «Исландиялықтар әлемнің денсаулығына үлес қоса алса, мен мақтан тұтамын. Мен ризамын» деген жалпы көзқарасты ұстанды.[117]  

Жеке геномика және ауру қаупін диагностикалау

deCODE-тің бизнестегі сәттілігі шиеленісті болды, бірақ Стефанссон өзінің ашылуларын медициналық тұрғыдан пайдалы және коммерциялық тұрғыдан сәтті өнімдерге айналдыру үшін әрқашан нақты жұмыс жасады. Олардың кейбіреулері жоғары инновациялық болды және жаңа өндірістер мен нарықтарға жол ашты. Кейінгі жылдары Lslendingabok Интернеттегі исландиялықтардың шежіресін қосыңыз Генографиялық жоба сияқты компаниялар MyHeritage, FamilyTreeDNA және Ата-баба барлық жерде адамдар өздерінің генеалогиясын құру үшін генетиканы қолдануға тырысуға мүмкіндік беретін веб-сайттарды іске қосты.[118] 2007 жылдың қараша айында deCODE алғашқы жеке геномика қызметін deCODEme іске қосты, келесі күні Google -қайта 23 және мен.[119] deCODEme негізінен оншақты кең таралған ауруларға жеке бейімділікті анықтау үшін оның ашылуларына негізделген полигендік қауіп-қатер көрсеткіштерін, 23andMe және басқаларын қолданады. deCODE жарияланған тәуекел маркерлері барлық осындай қызметтер үшін ең қатаң тексерілген негіз болды.[120]

Стефанссон сонымен қатар 2 типті қант диабеті, инфаркт, қуық асты безінің қатерлі ісігі, жүрекшелер фибрилляциясы мен инсультының полигендік қаупі үшін клиникалық сынақтарды нарыққа шығаратын deCODE-ті басқарды.[121] Бұл өнімдер мен deCODEme маркетингі 2011 жылы компанияның қаржылық қиындықтарымен тоқтады, бірақ Массачусетс жалпы ауруханасында жүргізілген жақында жүргізілген танымал зерттеулер полигендік қауіп-қатердің медициналық құндылығына деген қызығушылықты жандандыра түсті. Бұл тестілерде бірнеше белгілер мен жаңа алгоритмдер қолданылып, қауіп-қатердің нұсқаларына сүйене отырып, Исландияда дәл осы ауруларға жол ашты.[122]

Есірткіні табу

Стефанссонның басты мақсаты әрдайым геномды жақсы дәрілік заттардың дамуын хабарлау үшін пайдалану болды. Жылдар бұрын дәлме-дәл медицина ол жалпы терминге айналды, ол оның негізін қалағысы келді: дәрі-дәрмектік химиядағы сынақтар мен қателіктерге емес, аурудың жолына негізделген дәрілік заттарды табуды және растауды;[123] сондай-ақ емделушілерге тиімді жауап беруі мүмкін препараттарды тағайындау және тағайындау мүмкіндігі.[124] Бұл дәрі-дәрмектерді дамытудағы көптен бергі өнімділік мәселелерін шешеді және Стефанссон компанияны негізінен фармацевтикалық компаниялармен серіктестік құра отырып қаржыландырды. 1998 жылы Рошпен 200 миллион долларлық генді және мақсатты жаңалықтарды табу туралы келісімшарт бұл саланың геномикаға жақсы дәрілер жасауға қызығушылығының алғашқы белгісі болды.[125] Merck, Pfizer, Astra Zeneca және басқалармен басқа серіктестіктер құрылды. 2000 жылдардың ортасында компания өзінің бірнеше қосылыстарын клиникалық дамуға әкелді, бірақ төлем қабілетсіздігінен және 2009 жылы қайта құрылымдаудан кейін олардың дамуын жалғастыруға қаржылық мүмкіндіктері болмады.[126]  

Әзірге Амгенмен ең ұзақ, терең және нәтижелі серіктестік болды. 2012 жылы Amgen 415 миллион долларға deCODE сатып алды. Содан бері ол Amgen дәрі-дәрмектерді шығару құбыры бойынша өзінің мүмкіндіктерін қолдана отырып, өзінің меншігі болып табылатын, бірақ мүлдем тәуелсіз еншілес компания ретінде жұмыс істеп келеді.[127] Amgen компаниясының толық қолдауымен коммерциялық мақсаттар, фундаменталды ғылым және нәтижелерді көпшілікке тарату өзара тиімді болатындығына жоғары мысал келтіріп, гендерге және есірткіге бағытталған ашылымдарды, сонымен қатар адамның әртүрлілігі мен эволюциясы туралы жариялауды жалғастырды.[128]

Amgen-мен интеграция deCODE кең ауқымды бүкіл геномды тізбектеудің басталуымен және осы деректерді компанияның Исландия деректер жиынтығында есептеуімен сәйкес келді. Осы мәліметтермен Стефанссон және оның Амгендегі әріптестері геномика есірткіні дамытуда тек SNP-чип және GWAS мәліметтерімен мүмкін емес жолмен өзгеруі мүмкін деп сенді.[129] Маңыздысы, олар кең таралған фенотиптерге әсер ететін сирек кездесетін, жоғары әсер ететін мутацияны анықтауы мүмкін - қысқаша, кең таралған аурулардың ең экстремалды нұсқалары - бұл терапевтік әлеуеті жоғары және расталатын дәрілік заттардың мақсатына әкеледі. Бұл «сирек кездесетін» тәсілді қазір көптеген дәрі-дәрмек шығаратын компаниялар ұстануда.[130] ASGR1 идентификациясы бұған мысал болды және холестеролмен күресетін жаңа дәрілік заттарды жасау үшін дәрі-дәрмектерді табуға қабылданды.[131]  

Кеңірек айтсақ, Амгеннің ұзақ жылдар бойғы бас ғылыми қызметкері Шон Харпер 2018 жылы «біз deCODE сатып алғаннан кейін популяция генетикасын жасаудың өндірістік мүмкіндігіне ие болдық» деп мәлімдеді, бұл кез-келген мақсатқа немесе қосылысқа адамның генетикалық расталуын қамтамасыз ете алады. deCODE сатып алынғаннан кейін бір ай ішінде Amgen компаниясының бүкіл клиникалық құбырын бағалап, клиникалық сәтсіздіктерді болдырмауға және сынақтарға басымдық беріп, басшылыққа алуға көмектесетін ақпарат берді. Харпер бұл «бірінші дәрі-дәрмектерді әзірлеу» моделі компанияға өндірістің эндемикалық проблемасының өзіндік нұсқасын шешуге мүмкіндік берді деп мәлімдейді. Оның пайымдауынша, «тек сіздің құбырыңыздың жартысына күшті генетикалық қолдау көрсете отырып, сіз ғылыми-зерттеу жұмыстарына инвестициялардың кірістілігін шамамен 50% жақсарта аласыз».[132]  

Қоғамдық денсаулық сақтау: BRCA2 скринингі

2018 жылы deCODE а веб-сайт бұл Исландияға олардың SNP бар-жоғын анықтау үшін олардың кезектілік деректерін талдауды сұрауға мүмкіндік береді BRCA2 gene linked to significantly increased risk of breast and prostate cancer in Icelanders.[133] This was the first time that deCODE, which is primarily a research organization, returned information from its research data to participants. Stefansson had tried for many years to convince the Icelandic Ministry of Health that this was a serious public health issue that deCODE's data could address at virtually no cost, and it was but one of the clearest-cut of many such possible precision medicine applications to healthcare in Iceland.[134]  

With no response from the health system, Stefansson went ahead and put the matter in the hands of citizens. As of late 2018, some 40,000 people, more than ten percent of the population, had utilized the site to learn their BRCA2 status. Hundreds of people have been able to learn that they are carriers and the National Hospital has built up its counseling and other services to help those decide how they wish to use this information to protect their health.[135] Given the disease and mortality rates from breast and prostate cancer associated with BRCA2, the availability of this information should enable the prevention and early detection of hundreds of cancers and save dozens of lives.[136]  

The Iceland population approach as a global model

Introducing Stefansson for the Уильям Аллан сыйлығы lecture at the 2017 Американдық генетика қоғамы annual conference, Марк Дэйли, then co-director of the Кең институт, айтты:

"it is impossible to overlook a pervasive paradigm involving biobanks recruited with full population engagement, historical medical registry data, investments in large-scale genetic data collection and statistical methodology, and collaborative follow-up across academic and industry boundaries. What is often overlooked is that Kári and his colleagues at deCODE provided the template for this discovery engine. Moreover, it is easy to forget that when Kári founded deCODE Genetics 21 years ago, these concepts were considered quite radical and unlikely to succeed. He was both literally and figuratively on a small island of his own. As Питер Доннелли put it, “the number of countries now investing millions in similar resources is an astonishing testament to the perspicacity of his vision.”[137]

Following on Iceland's success, countries now pursuing or planning national genome projects of varying scale, scope and rationale include the UK (via the UK Biobank Сонымен қатар Геномика Англия және Шотландиялық геномдар бойынша серіктестік separately); the US (Біздің бәріміз сияқты Million Veteran Program ), Австралия, Канада, Дубай, Эстония, Финляндия, Франция, Гонконг, Жапония, Нидерланды, Катар, Сауд Арабиясы, Сингапур, Оңтүстік Корея, Швеция, және Түйетауық. Projects funded either largely or partially by pharmaceutical companies to inform drug target discovery include FinnGen (partly led by Mark Daly), Regeneron/Geisinger, және Genomics Medicine Ireland.

In April 2019, Stefansson was named the first president of the Nordic Society of Human Genetics and Precision Medicine. The society was formed to create a pan-Nordic framework for human genetics research and the application of genomics to healthcare across the region, with the aim of generating and integrating genomic and healthcare data from Iceland, Norway, Sweden, Denmark, Finland and Estonia.

Марапаттар мен марапаттар

Stefansson has received some of the highest honors in biomedical research and genetics, including the Anders Jahre Award, Уильям Аллан сыйлығы,[138] және Hans Krebs Medal.[139] His work has been recognized by patient and research organizations such as the American Alzheimer's Society and by major international publications and bodies including Time,[140] Newsweek,[141] Forbes,[142] BusinessWeek[143] and the World Economic Forum.[144] He has also received Iceland's highest honor, the Order of the Falcon.[145] In 2019, he was elected a foreign associate of the US Ұлттық ғылым академиясы, and received the International KFJ Award from Rigshospitalet, one of the oldest and most prestigious medical institutions in Denmark.[146][147]

Отбасы

In June 2012, his daughter, Sólveig "Sóla" Káradóttir, married Дани Харрисон, марқұмның ұлы Джордж Харрисон және оның әйелі, Оливия Харрисон.[148][149] Олар 2016 жылы бөлінді.

Танымал мәдениеттегі көріністер

Stefansson is the model for professor Lárus Jóhannsson in Dauðans óvissi tími арқылы Bráinn Bertelsson and the principal villain of Óttar M. Norðfjörð 's satirical 2007 book Jón Ásgeir & afmælisveislan, in which he creates a female version of Дэвид Оддссон from a sample of Davíð's hair. He is the model for Hrólfur Zóphanías Magnússon, director of the company CoDex, in CoDex 1962 арқылы Шон.[150][151] In his 2002 novel Jar City, Арналдур Индридасон mixes critical and humorous references to deCODE and Stefansson by creating a vaguely sinister genetics institute based in Reykjavik headed by a scrupulously polite, petite brunette named Karitas. Ішінде 2006 жылғы фильм нұсқасы режиссер Baltasar Kormakur, Stefansson (who is 6'5" and with gray hair) plays himself, adding a moment of верите but losing the satirical irony of his namesake.[152] He was also in the documentary Бобби Фишер әлемге қарсы where he engaged in controversial debate with late Бобби Фишер.[153][154]

Ескертулер

  1. ^ Бұл Исландия атауы. Тегі әкесінің аты, а аты-жөні; in Iceland he is referred to by the given name Кари, but internationally he may be referred to as Стефанссон.

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ Gunnlaugur Haraldsson, ed. (2000). Læknar á Íslandi [Short biographies of Icelandic physicians]. Þjóðsaga. б. 963.
  2. ^ Marx, Vivien (27 August 2015). «Ұлттың ДНҚ-сы». Табиғат. 524 (7566): 503–505. Бибкод:2015 ж. 524..503M. дои:10.1038 / 524503a. ISSN  0028-0836. PMID  26310768.
  3. ^ An, Joon Yong (2017-10-16). "National human genome projects: an update and an agenda". Эпидемиология және денсаулық. 39: e2017045. дои:10.4178/epih.e2017045. ISSN  2092-7193. PMC  5675980. PMID  29056031.
  4. ^ "Biographies of Delegates S-Y". Imperial College London. Архивтелген түпнұсқа on 21 October 2004.
  5. ^ Obituary notice for Stefán Jónsson, Morgunblaðið, 18 September 1990, accessed at http://timarit.is/view_page_init.jsp?pageId=1729310
  6. ^ Executive Profile from BusinessWeek журнал [1]
  7. ^ "Company website management page". Алынған 2 мамыр 2019.
  8. ^ "Staff page, University of Iceland". Алынған 2 мамыр 2019.
  9. ^ "2019 Human Genome Meeting speaker biography". Алынған 2 мамыр 2019.
  10. ^ His particular focus was myelin degeneration in multiple sclerosis. A selection of his publications from this period can be searched on Google Scholar.
  11. ^ Adam Piore, "Bring us your genes: A Viking scientist's quest to conquer disease," Наутилус, 2015 жылғы 2 шілде
  12. ^ Gulcher, JR, Vartanian, T, and Stefansson K, "Is Multiple Sclerosis an automimmune disease?" Клиникалық неврология 2(3-4):246-52 (1994)
  13. ^ For contemporary views of this potential, MS Guyer and FS Collins, "The Human Genome Project and the future of medicine," Американдық балалар аурулары журналы, 147(11):1145-52 (November 1993)
  14. ^ An authoritative mid-1990s view of the promise of genetics in diagnostics, Min J Khoury and Diane K Wagener, "Epidemiological evaluation of the use of genetics to improve the predictive value of disease risk factors," Американдық генетика журналы, 56:835-844, 5 January 1995
  15. ^ FS Collins et al., " New Goals for the U.S. Human Genome Project: 1998 –2003," Ғылым, Т. 282, pp. 682-689, 23 Oct 1998
  16. ^ An influential early – and at that time still largely theoretical – discussion of different possible approaches to common rather than rare diseases is ES Lander and NJ Schork, "Genetic dissection of complex traits," Ғылым, Том. 265, Issue 5181, pp. 2037–2048, 30 September 1994
  17. ^ This was not an obvious thing to look for. Even prominent experts who predicted the future power of population genetics and association studies seem not to have considered that linkage analysis could be extended to common diseases, and aid in association studies, through population-wide genealogies. Neil Risch and Kathleen Merikangas, "The future of genetic studies of complex human diseases," Ғылым, Т. 273, No. 5281, pp 1516–1517, 13 September 1996; Aravinda Chakravarti, "Population genetics: making sense out of sequence," Табиғат генетикасы 21, pages 56–60, 1 January 1999
  18. ^ Nicholas Wade, "SCIENTIST AT WORK/Kari Stefansson; Hunting for Disease Genes In Iceland's Genealogies," New York Times, 18 June 2002
  19. ^ бастап Alta Venture Partners, Polaris Venture серіктестері, Arch Venture Partners, Atlas Venture, басқалардың арасында. A complete list of early investors is in the Icelandic business paper Frjals Verslun from 1 March 1998, p. 37
  20. ^ Announcement of deCODE starting operations on the front page of Morgunblaðið, 31 May 1996
  21. ^ An early description of the discovery model and process by Stefansson and Gulcher when they still planned to build the IHD, in "Population genomics: laying the groundwork for genetic disease modeling and targeting," Клиникалық химия және зертханалық медицина (жазылу қажет) 36(8):523-7, 1 August 1998
  22. ^ A good early outline of Stefansson's vision and the business model in Stephen D. Moore, "Biotech firm turns Iceland into a giant genetics lab," Wall Street Journal (жазылу қажет), 1997 жылғы 3 шілде
  23. ^ Gulcher, J, Helgason A, Stefansson, K, "Genetic homogeneity of Icelanders," Табиғат генетикасы (жазылу қажет) volume 26, page 395, December 2000. One example of the relative genetic homogeneity but global utility of studying the Icelandic population is breast cancer. Around the world there are many variants in the BRCA2 gene known to confer substantial increased risk of breast cancer, but in Iceland there is essentially one disease-linked variant, which was published on the eve of deCODE's operational launch in Iceland: Steinnun Thorlacius et al., "A single BRCA2 mutation in male and female breast cancer families from Iceland with varied cancer phenotypes," Табиғат генетикасы (жазылу қажет), Volume 13, pages117–119, 1 May 1996. deCODE now has a website that enables Icelanders to find out if they carry the mutation.
  24. ^ The resources and their utility for gene discovery is concisely summarized in deCODE's first press release: "Icelandic Genomics Company Identifies Location of Gene for Essential Tremor," 25 August 1997, on the company website.
  25. ^ Quoted in Michael Specter, "Decoding Iceland," Нью-Йорк (жазылу қажет), 18 қаңтар 1999 ж
  26. ^ See for example Francesco Cuca et al., "The distribution of DR4 haplotypes in Sardinia suggests a primary association of type I diabetes with DRB1 and DQB1 loci," Адам иммунологиясы, Volume 43, Issue 4, pp 301-308, August 1995, ; EM Petty т.б., "Mapping the gene for hereditary hyperparathyroidism and prolactinoma (MEN1Burin) to chromosome 11q: evidence for a founder effect in patients from Newfoundland," Американдық генетика журналы, 54(6): 1060–1066, June 1994; Melanie M Mahtani т.б., "Mapping of a gene for type 2 diabetes associated with an insulin secretion defect by a genome scan in Finnish families," Табиғат генетикасы (жазылу қажет), Volume 14, pp 90–94, 1 September 1996; Steinnun Thorlacius т.б., "A single BRCA2 mutation," оп. cit.
  27. ^ Stephen D. Moore, "Biotech firm turns Iceland into," оп. cit.
  28. ^ Gulcher and Stefansson, "Population genomics: laying the groundwork," оп. cit.
  29. ^ Stefansson and Gulcher cite polls showing public support for the IHD of 75%, in "An Icelandic saga on a centralized healthcare database and democratic decision making," Табиғи биотехнология (жазылу қажет)(subscription required), volume 17, page 620, July 1999. Icelandic opponents to the IHD created an organization called Mannvernd to fight it and to encourage people to exercise their right to opt-out. The number of opt-outs provides one concrete measure of opposition to the idea as well as, conversely, a measure of how many people either favored the idea or held no strong opinion. Сәйкес archived snapshot of Mannvernd's website from September 2003, in the five years following the passage of the law authorizing the IHD, just over 20,000 people had opted out, or 7% of a 2003 population of 288,000.
  30. ^ Books and major research articles by bioethicists on these themes include: Mike Fortun, Promising genomics: Iceland and deCODE genetics in a World of speculation (Беркли: Калифорния университетінің баспасы, 2008); David Winickoff, "Genome and nation: Iceland's Health Sector Database and its legacy," Innovations: Technology Governance Globalization 1(2):80-105, February 2006"; Henry T. Greely, "Iceland's plan for genomics research: Facts and implications," Юриметрия (жазылу қажет) 40, жоқ. 2, pp153-91, Winter 2000; and Jon Merz, "Iceland, Inc?: On the ethics of commercial population genomics", Әлеуметтік ғылымдар және медицина 58(6):1201-9, April 2004. Apart from Mannvernd's, another website in Berkeley, California was devoted to the anthropological implications of deCODE and genetics research in Iceland: http://www.lib.berkeley.edu/iceland/
  31. ^ Stefansson and Gulcher estimated that by 1999 more than 700 articles and interviews had been published. For this and their view on the benefits of what deCODE was doing: "An Icelandic saga on a centralized healthcare database," оп. cit. A partial snapshot of the number, flavor and sources of articles can be seen from an archived view from May 1999 of the website of Mannvernd, the Icelandic organization formed to oppose the IHD, and in a highly detailed bibliography created by Dr Skúli Sigurðsson, a leading member of Mannvernd.
  32. ^ J Gulcher, K Kristjansson, H Gudbjartsson, K Stefansson, "Protection of privacy by third-party encryption in genetic research in Iceland," Еуропалық адам генетикасы журналы (жазылу қажет), volume 8, pages 739–742, 3 October 2000
  33. ^ Henry T Greely, "Iceland's plan for genomics research," op. cit.
  34. ^ How Stefansson's population strategy transformed thinking in the field and gene discovery by the mid-2000s in Lee Silver, "Biology reborn: A genetic science breakthrough," Newsweek, 9 қазан 2007 ж.
  35. ^ The Адам геномының жобасы draft was published in Табиғат; Celera 's draft in Ғылым, both on 15 February 2001
  36. ^ A list of deCODE's key publications, on virtually all of which Stefansson is senior author, are listed by year on the company's website at https://www.decode.com/publications/
  37. ^ JL Weber, "The Iceland Map," and A Kong т.б., "A high resolution recombination map of the human genome," Табиғат генетикасы (жазылу қажет), Volume 31, pp 225–226 and 241–247, respectively, 10 June 2002. On how the map improved the accuracy of the reference sequence see Nicholas Wade, "Human genome sequence has errors, scientists say," New York Times, 11 June 2002.
  38. ^ In 1999, Icelandic anthropologist Gisli Palsson already noted the success of the deCODE model: Gisli Palsson and Paul Rabinow, "Iceland: The case of a national genome project," Бүгінгі антропология Том. 15, No. 5, pp. 14-18, 5 October 1999. A 2009 report by genetics ethics watchdog GeneWatch, a vehement opponent of the IHD and the use of medical records data in research without explicit consent, notes deCODE as a major inspiration for the UK Biobank. In 2000, bioethicist George Annas already noted emulation of the deCODE approach, Жаңа Англия Медицина журналы (жазылу қажет), 342:1830-1833, 15 June 2000; David Winickoff, "Genome and nation," оп. cit. On deCODE's early successes and their importance as an example to other biobank projects and the field in general see also Nicholas Wade, "Scientist at Work/Kari Stefansson: Hunting for disease genes in Iceland's genealogies," New York Times, 18 маусым 2002 ж.
  39. ^ Jocelyn Kaiser, "Population databases boom from Iceland to U.S.," Ғылым (жазылу қажет) Том. 298, Issue 5596, pp. 1158–1161, 8 November 2002. No one else had comparable genealogies, but Eric Lander was inspired by the scale and data-driven approach in Iceland and founded the Кең институт on the idea of using rapidly developing technologies for generating more data – SNP chips and then sequencing – to power discovery. Lee Silver, "Biology reborn: a genetic science breakthrough," Newsweek, 9 қазан 2007 ж
  40. ^ This database is overwhelmingly complete going back to the Исландиядағы халық санағы 1703 ж, the world's first complete national census and now part of UNESCO's registered world heritage, and extending back to before the arrival of the first inhabitants in the 9th century.
  41. ^ Usage numbers cited on the Íslendingabok Wiki page. A more detailed discussion by a longtime observer, anthropologist Gísli Pálsson, in "The Web of Kin: An Online Genealogical Machine," in Sandra C. Bamford, ed., Kinship and Beyond: The Genealogical Model Reconsidered (New York: Berghahn Books, 2009), pp. 84-110.
  42. ^ Details of how the privacy protection system works in Gulcher т.б., "Protection of privacy by third-party encryption," оп. cit.
  43. ^ A good early description of how people are asked to participate and how their data is used in research is on pp 7-9 of deCODE's 2002 annual report filed with the SEC.
  44. ^ By 2004, the government and deCODE had effectively stopped all work on the IHD and moved on. On page 10 of deCODE's 2003 annual report filed with the SEC, the company described the mutual lack of activity: "As of March 2004, a government-mandated review of the IHD's data encryption and protection protocols, which began in April 2000, had not been completed. When and if this review and issuance of related security certification is completed, we will evaluate whether and when, if at all, to proceed with the development of the IHD in light of our priorities and resources at that time. In light of our current business plans and priorities, we do not expect the IHD to be a material aspect of our business in the near future."
  45. ^ Helen Pearson, "Profile: Kari Stefansson," Табиғат медицинасы, volume 9, page 1099, 1 September 2003; participation rate in deCODE's annual report from 2002 filed with the SEC, p 8.
  46. ^ James Butcher, "Kari Stefansson, general of genetics," Лансет, 27 қаңтар 2007 ж
  47. ^ Anna Azvolinsky, "Master Decoder: A Profile of Kári Stefánsson," Ғалым, 1 наурыз 2019
  48. ^ In 2018, most advanced national genome efforts were still aspiring to generate and assemble 100,000 whole genome sequences in one place. See Alex Phillipidis, "10 Countries in the 100K genome club," Clinical Omics, 30 тамыз 2018 жыл
  49. ^ A pioneering early methodology for phasing and imputation is in A Kong т.б., "Detection of sharing by descent, long-range phasing and haplotype imputation," Табиғат генетикасы (жазылу қажет) volume 40, pages 1068–1075, 17 August 2008. The first published sequence imputation dates from 2015: DF Gudbjartsson т.б., "Large-scale whole-genome sequencing of the Icelandic population" published as part of the "Genomes of Icelanders" special edition, Табиғат генетикасы (жазылу қажет), 47, pages 435–444, 25 May 2015
  50. ^ Axton also pointed out that notwithstanding deCODE scientists' hundreds of publications elsewhere, 111 papers, or five percent of the papers published during his tenure at the journal over the preceding twelve years, had come out of deCODE. Axton's comments are from his remarks at deCODE's 20th anniversary conference, held in Reykjavik on 30 September 2016, available in video on the company website at https://www.decode.com/20-years/
  51. ^ A list of all of deCODE's major publications since 1997 are on the company's website at https://www.decode.com/publications/
  52. ^ Recent lists of highly cited scientists at https://hcr.clarivate.com/resources/archived-lists/ Мұрағатталды 2019-04-20 сағ Wayback Machine
  53. ^ A Kong т.б., "A high resolution recombination map of the human genome," Табиғат генетикасы (жазылу қажет), Volume 31, pp 241–247, 10 June 2002
  54. ^ A Kong т.б., "Reproduction rate and reproductive success," Табиғат генетикасы (жазылу қажет), volume 36, pp 1203–1206, 3 October 2004
  55. ^ H Stefansson т.б., "A common inversion under selection in Europeans," Табиғат генетикасы (жазылу қажет), volume 37, pages 129–137, 16 January 2005
  56. ^ A Kong т.б., "Fine-scale recombination rate differences between sexes, populations and individuals," Табиғат (жазылу қажет), volume 467, pp 1099–1103, 28 October 2010
  57. ^ A Kong т.б., "Rate of де ново mutations and the importance of father’s age to disease risk," Табиғат , volume 488, pp 471–475, 23 August 2012
  58. ^ H Jonsson т.б., "Parental influence on human germline де ново mutations in 1,548 trios from Iceland," Табиғат (жазылу қажет), volume 549, pp 519–522, 28 September 2017
  59. ^ A Jonsson т.б., "Multiple transmissions of де ново mutations in families," Табиғат генетикасы (жазылу қажет), Volume 50, pp 1674-1680, 5 November 2018
  60. ^ BV Halldorsson т.б., "The rate of meiotic gene conversion varies by sex and age," Табиғат генетикасы (жазылу қажет), volume 48, pp 1377–1384, 19 September 2016
  61. ^ BV Halldorsson т.б., "Characterizing mutagenic effects of recombination through a sequence-level genetic map," Ғылым, Т. 363, Issue 6425, eaau1043, 25 Jan 2019
  62. ^ A Helgason т.б., "The Y chromosome point mutation rate in humans," Табиғат генетикасы, (жазылу қажет), volume 47, pp 453–457, 25 March 2015
  63. ^ A Helgason т.б., "Sequences from first settlers reveal rapid evolution in Icelandic mtDNA pool," PLoS генетикасы, 16 қаңтар 2009 ж
  64. ^ A Helgason т.б., "Estimating Scandinavian and Gaelic ancestry in the male settlers of Iceland," Американдық генетика журналы, 67(3): 697–717, 7 August 2000; and A Helgason т.б., "mtDNA and the Origin of the Icelanders: Deciphering Signals of Recent Population History," Американдық генетика журналы, 66(3):999-1016, 23 February 2000
  65. ^ SS Ebenesersdottir т.б., "Ancient genomes from Iceland reveal the making of a human population," Ғылым (жазылу қажет), Т. 360, Issue 6392, pp. 1028-1032, 1 June 2018
  66. ^ A Helgason т.б., "An association between the kinship and fertility of human couples," Ғылым (жазылу қажет), Т. 319, Issue 5864, pp. 813-816, 8 February 2008
  67. ^ A Helgason et al., " An Icelandic example of the impact of population structure on association studies," Табиғат генетикасы (жазылу қажет), Volume 37, pages 90–95, 19 December 2004
  68. ^ P Sulem et al., " Identification of a large set of rare complete human knockouts," Табиғат генетикасы (жазылу қажет), Volume 47, pages 448–452, 25 March 2015
  69. ^ A Jagadeesan т.б., "Reconstructing an African haploid genome from the 18th century," Табиғат генетикасы (жазылу қажет), volume 50, pp199–205, 15 January 2018. Ханс Джонатан is the subject of a book by Icelandic anthropologist Gisli Palsson, The Man Who Stole Himself (Chicago: University of Chicago Press, 2016) and Stefansson addressed the reconstruction of Hans Jonatan's genome in the New York Times, Атлант, Newsweek, Der Spiegel және басқа жерлерде.
  70. ^ Stefansson presented an early explanation of the 'broad but rigorous' approach to the definition of phenotypes powered by datamining at the European Molecular Biology Laboratory (EMBL) conference in Barcelona in 2000; it is also discussed in many publications. See for example S Gretarsdottir т.б., "Localization of a susceptibility gene for common forms of stroke to 5q12," Американдық генетика журналы, Volume 70, Issue 3, pp 593-603, March 2002
  71. ^ T Jonsson т.б., "A mutation in APP protects against Alzheimer’s disease and age-related cognitive decline," Табиғат, 488, pp 96–99, 11 June 2012; Michael Specter, "The good news about Alzheimer's Disease," Нью-Йорк, 11 July 2012; Ewen Callaway, "Gene mutation defends against Alzheimer's Disease," Табиғат, 11 шілде 2012 ж
  72. ^ T Jonsson т.б., "Variant of TREM2 associated with the risk of Alzheimer's disease," Жаңа Англия Медицина журналы, 368(2):107-16, 10 January 2013; S Steinberg т.б., "Loss-of-function variants in ABCA7 confer risk of Alzheimer's disease," Табиғат генетикасы, 47(5):445-7, 25 March 2015
  73. ^ H Stefansson т.б., "Neuregulin 1 and susceptibility to schizophrenia," Американдық генетика журналы, Volume 71, Issue 4, pp 877-892, October 2002. Like many early linkage-based findings, this association itself has not proved fruitful, but substantial later work has been done on the pathway. See for example A Buonanno, "The neuregulin signaling pathway and schizophrenia: From genes to synapses and neural circuits," Миды зерттеу бюллетені, Volume 83, Issues 3–4, pp 122-131, 30 September 2010
  74. ^ H Stefansson т.б., "Large recurrent microdeletions associated with schizophrenia," Табиғат (жазылу қажет), volume 455, pp 232-6, 11 September 2008; H Stefansson т.б., Табиғат (жазылу қажет), "Common variants conferring risk of schizophrenia," Nature, volume 460, pp 744-7, 6 August 2009; Niamh Mullins т.б., "Reproductive fitness and genetic risk of psychiatric disorders in the general population," Табиғат байланысы, Volume 8, Article number 15833, 13 June 2017
  75. ^ H Stefansson т.б., "CNVs conferring risk of autism or schizophrenia affect cognition in controls," Табиғат, volume 505, pp 361-6, 18 December 2013
  76. ^ RA Power т.б., "Polygenic risk scores for schizophrenia and bipolar disorder predict creativity," Табиғат неврологиясы (жазылу қажет), Volume 18, pp 953–955, 8 June 2015; GW Reginsson et al., "Polygenic risk scores for schizophrenia and bipolar disorder associate with addiction," Нашақорлық биологиясы, volume 23, issue 1, pp 485-492, 25 February 2017
  77. ^ Б Гуннарссон т.б., "A sequence variant associating with educational attainment also affects childhood cognition," Табиғат туралы ғылыми есептер, volume 6, article number 36189
  78. ^ A Kong et al., "Selection against variants in the genome associated with educational attainment," Ұлттық ғылым академиясының материалдары, 114 (5) E727-E732, 17 January 2017
  79. ^ LT Amundadottir т.б., "Cancer as a Complex Phenotype: Pattern of Cancer Distribution within and beyond the Nuclear Family," PLoS медицинасы, 1(3):e65, 28 December 2004; T Gudmundsson т.б., "A population-based familial aggregation analysis indicates genetic contribution in a majority of renal cell carcinomas," Халықаралық онкологиялық журнал, 100(4):476-9, 13 June 2002; S Jonsson т.б., "Familial risk of lung carcinoma in the Icelandic population," Journal of the American Medical Association (JAMA), 292(24):2977-83, 22 December 2004
  80. ^ J Gudmundsson т.б., "Genome-wide association study identifies a second prostate cancer susceptibility variant at 8q24," Табиғат генетикасы (жазылу қажет), Volume 39, pp 631–637, 1 April 2007; LA Kiemeney т.б., "Sequence variant on 8q24 confers susceptibility to urinary bladder cancer," Табиғат генетикасы, 40(11):1307-12, 14 September 2008; J Gudmundsson т.б., "A study based on whole-genome sequencing yields a rare variant at 8q24 associated with prostate cancer," Табиғат генетикасы (жазылу қажет), Volume 44, pages 1326–1329, 28 October 2012; J Gudmundsson т.б., "A common variant at 8q24.21 is associated with renal cell cancer," Табиғат байланысы, Vol 4, Article number: 2776, 13 November 2013
  81. ^ T Rafnar т.б., "Sequence variants at the TERT-CLPTM1L locus associate with many cancer types," Табиғат генетикасы, (жазылу қажет), 41(2):221-7, 18 January 2009; SN Stacey т.б., "A germline variant in the TP53 polyadenylation signal confers cancer susceptibility," Табиғат генетикасы, 43(11):1098-103, 25 September 2011; U Styrkarsdottir т.б., "Nonsense mutation in the LGR4 gene is associated with several human diseases and other traits," Табиғат (жазылу қажет), Vol 497, pp 517–520, 5 May 2013
  82. ^ LT Amundadottir т.б., "A common variant associated with prostate cancer in European and African populations," Табиғат генетикасы (жазылу қажет), 38(6):652-8, 27 May 2006; J Gudmundsson т.б., "Common sequence variants on 2p15 and Xp11.22 confer susceptibility to prostate cancer," Табиғат генетикасы (жазылу қажет), 40(3):281-3, 10 February 2008; J Gudmundsson т.б., "Genome-wide association and replication studies identify four variants associated with prostate cancer susceptibility," Табиғат генетикасы, 41(10):1122-6, 20 September 2009; J Gudmundsson т.б., "A study based on whole-genome sequencing yields a rare variant at 8q24 associated with prostate cancer," Табиғат генетикасы (жазылу қажет), Volume 44, pages 1326–1329, 28 October 2012; SN Stacey т.б., "Insertion of an SVA-E retrotransposon into the CASP8 gene is associated with protection against prostate cancer," Адам молекулалық генетикасы, 25(5):1008-18, 1 March 2016; J Gudmundsson т.б., "Genome-wide associations for benign prostatic hyperplasia reveal a genetic correlation with serum levels of PSA," Табиғат байланысы, Vol 9, Article number: 4568, 8 November 2018
  83. ^ SN Stacey т.б., "The BARD1 Cys557Ser Variant and Breast Cancer Risk in Iceland," PLoS медицинасы, 20 June 2006; SN Stacey т.б., "Common variants on chromosomes 2q35 and 16q12 confer susceptibility to estrogen receptor–positive breast cancer," Табиғат генетикасы (жазылу қажет), volume 39, pp 865–869, 27 May 2007; SN Stacey т.б., "Common variants on chromosome 5p12 confer susceptibility to estrogen receptor–positive breast cancer," Табиғат генетикасы (жазылу қажет), Volume 40, pp 703–706, 27 April 2008.
  84. ^ DF Gudbjartsson т.б., "ASIP and TYR pigmentation variants associate with cutaneous melanoma and basal cell carcinoma," Табиғат генетикасы (жазылу қажет), Volume 40, pp 886–891, 18 May 2008; SN Stacey т.б., "Common variants on 1p36 and 1q42 are associated with cutaneous basal cell carcinoma but not with melanoma or pigmentation traits," Табиғат генетикасы, Volume 40, pp 1313–1318, 12 October 2008; SN Stacey т.б., "New common variants affecting susceptibility to basal cell carcinoma," Табиғат генетикасы, Volume 41, pp 909–914, 5 July 2009; SN Stacey т.б., "Germline sequence variants in TGM3 and RGS22 confer risk of basal cell carcinoma," Адам молекулалық генетикасы, Volume 23, Issue 11, pp 3045–3053, 1 June 2014; SN Stacey т.б., "New basal cell carcinoma susceptibility loci," Табиғат байланысы volume 6, Article number 6825, 9 April 2015.
  85. ^ J Gudmundsson т.б., "Common variants on 9q22.33 and 14q13.3 predispose to thyroid cancer in European populations," Табиғат генетикасы (жазылу қажет)volume 41, pp 460–464, 6 February 2009; J Gudmundsson т.б., "Discovery of common variants associated with low TSH levels and thyroid cancer risk," Табиғат генетикасы (жазылу қажет)volume 44, pp 319–322, 22 January 2012; J Gudmundsson т.б., "A genome-wide association study yields five novel thyroid cancer risk loci," Табиғат байланысы volume 8, article number 14517, 14 February 2017
  86. ^ L Kiemney т.б., "Sequence variant on 8q24 confers susceptibility to urinary bladder cancer," Табиғат генетикасы (жазылу қажет) volume 40, pp 1307–1312, 14 September 2008; L Kiemeney т.б., "A sequence variant at 4p16.3 confers susceptibility to urinary bladder cancer," Табиғат генетикасы (жазылу қажет), volume 42, pp 415–419, 28 March 2010; T Rafnar т.б., "European genome-wide association study identifies SLC14A1 as a new urinary bladder cancer susceptibility gene," Адам молекулалық генетикасы, Volume 20, Issue 21, ppages 4268–428, 11 November 2011; T Rafnar т.б., "Genome-wide association study yields variants at 20p12.2 that associate with urinary bladder cancer," Адам молекулалық генетикасы, Volume 23, Issue 20, ppages 5545–5557, 15 October 2014.
  87. ^ T Rafnar т.б., "Mutations in BRIP1 confer high risk of ovarian cancer," Табиғат генетикасы (жазылу қажет), volume 43, pp 1104–1107, 2 October 2011
  88. ^ T Gudbjartsson т.б., "A population‐based familial aggregation analysis indicates genetic contribution in a majority of renal cell carcinomas," Халықаралық онкологиялық журнал, 13 June 2002; J Gudmundsson т.б., "A common variant at 8q24.21 is associated with renal cell cancer," Табиғат байланысы, volume 4, Article number: 2776, 13 November 2013.
  89. ^ H Helgason т.б., "Loss-of-function variants in ATM confer risk of gastric cancer," Табиғат генетикасы (жазылу қажет), volume 47, pages 906–910, 22 June 2015
  90. ^ JT Bergthorsson т.б., "A genome-wide study of allelic imbalance in human testicular germ cell tumors using microsatellite markers," Қатерлі ісік генетикасы және цитогенетика, Volume 164, Issue 1, pp 1-91, 1 January 2006
  91. ^ S Jonsson т.б., "Familial Risk of Lung Carcinoma in the Icelandic Population," Journal of the American Medical Association (JAMA), Volume 292(24), pp 2977-2983, 22 December 2004; TE Thorgeirsson т.б., "A variant associated with nicotine dependence, lung cancer and peripheral arterial disease," Табиғат, volume 452, pp 638–642, 3 April 2008
  92. ^ F Zink et al., "Clonal hematopoiesis, with and without candidate driver mutations, is common in the elderly," Қан, Volume 130, pp 742-752, February 2002
  93. ^ TE Thorgeirsson т.б., "A variant associated with nicotine dependence, lung cancer and peripheral arterial disease," Табиғат (жазылу қажет), vol 452, pp 638–6423, 3 April 2008; TE Thorgeirsson т.б., "Sequence variants at CHRNB3–CHRNA6 and CYP2A6 affect smoking behavior," Табиғат генетикасы (жазылу қажет), volume 42, pp 448–453, 25 April 2010; TE Thorgeirsson т.б., "A rare missense mutation in CHRNA4 associates with smoking behavior and its consequences," Молекулалық психиатрия, volume 21, pp 594–600, 8 March 2016. Megan Brooks, "Genes affect smoking behaviour, lung cancer risk," Reuters, 26 сәуір 2010 ж
  94. ^ DF Gudbjartsson т.б., "Variants conferring risk of atrial fibrillation on chromosome 4q25," Табиғат (жазылу қажет), Volume 448, pp 353–357, 19 July 2007; DF Gudbjartsson т.б., "A frameshift deletion in the sarcomere gene MYL4 causes early-onset familial atrial fibrillation," Еуропалық жүрек журналы, Volume 38, Issue 1, Pages 27–34, 1 January 2017; RB Thorolfsdottir т.б., "A Missense Variant in PLEC Increases Risk of Atrial Fibrillation," Американдық кардиология колледжінің журналы, Volume 70, Issue 17, pp 2157-2168, 24 October 2017; RB Thorolfsdottir т.б., "Coding variants in RPL3L and MYZAP increase risk of atrial fibrillation," Байланыс биологиясы, Volume 1, Article number 68, 12 June 2018
  95. ^ See notes 101 and 102 инфра and: A Helgadottir т.б., "Rare SCARB1 mutations associate with high-density lipoprotein cholesterol but not with coronary artery disease," Еуропалық жүрек журналы, Volume 39, Issue 23, pp 2172–2178, 14 June 2018; E Bjornsson et al., "A rare splice donor mutation in the haptoglobin gene associates with blood lipid levels and coronary artery disease," Адам молекулалық генетикасы, Volume 26, Issue 12, pp 2364–2376, 15 June 2017; S Gretarsdottir et al., "A Splice Region Variant in LDLR Lowers Non-high Density Lipoprotein Cholesterol and Protects against Coronary Artery Disease," PLoS генетикасы, 1 September 2015; E Bjornsson т.б., "Common Sequence Variants Associated With Coronary Artery Disease Correlate With the Extent of Coronary Atherosclerosis," Артериосклероз, тромбоз және қан тамырлары биологиясы, Volume 35, pp 1526–1531, 1 June 2015; A Helgadottir et al., "A Common Variant on Chromosome 9p21 Affects the Risk of Myocardial Infarction," Ғылым (жазылу қажет), Т. 316, Issue 5830, pp 1491-1493, 8 Jun 2007; A Helgadottir т.б., "The gene encoding 5-lipoxygenase activating protein confers risk of myocardial infarction and stroke," Табиғат генетикасы, Volume 36, pp 233–239, 8 February 2004
  96. ^ DF Gudbjartsson т.б., "A sequence variant in ZFHX3 on 16q22 associates with atrial fibrillation and ischemic stroke," Табиғат генетикасы (жазылу қажет)volume 41, pp 876–878, 13 July 2009; S Gretarsdottir т.б., "The gene encoding phosphodiesterase 4D confers risk of ischemic stroke," Табиғат генетикасы (жазылу қажет), 35 том, 131-138 бб, 21 қыркүйек 2003 ж .; S Gretarsdottir т.б., «5q12 дейін инсульттің жалпы формалары үшін сезімталдық генін оқшаулау,» Американдық генетика журналы, 70 том, 3 басылым, 593-603 бб, наурыз 2002 ж
  97. ^ Т.Е.Торгеирссон және басқалар, «никотинге тәуелділікпен, өкпе рагымен және перифериялық артерия ауруымен байланысты нұсқа» оп. cit.; Гудмундссон т.б., «1p31 хромосомасына дейінгі перифериялық артериялық окклюзивті аурудың генін локализациялау,» Американдық генетика журналы, 70 том, 3 басылым, 586-592 бб, наурыз 2002 ж
  98. ^ H Холм т.б., «MYH6-да сирек кездесетін ауру синус синдромының жоғары қаупімен байланысты» Табиғат генетикасы (жазылу қажет), 43 том, 316–320 бб, 6 наурыз 2011 ж
  99. ^ Гельгадоттир т.б., «9p21-дегі бірдей дәйектілік нұсқа миокард инфарктісімен, іштің қолқа аневризмасымен және интракраниальды аневризмамен байланысты» Табиғат генетикасы (жазылу қажет), 40 том, 217–224 бб, 6 қаңтар 2008 ж .; S Gretarsdottir т.б., «Жалпы геномды ассоциация зерттеуі іштің қолқа аневризмасына сезімталдықты тудыратын DAB2IP генінің кезектілік нұсқасын анықтайды» Табиғат генетикасы (жазылу қажет), 42 том, 692-697 бб, 11 шілде 2010 ж
  100. ^ П Ниои т.б., «Variant ASGR1 коронарлық артерия ауруының төмендеу қаупімен байланысты» Жаңа Англия Медицина журналы, 374 том, 2131-2141 бб, 2 маусым 2016 ж
  101. ^ Бұл жаңалық ғылыми және бұқаралық ақпарат құралдарының назарын аударды. Мысалы, Мэтт Херперді қараңыз, «Амген зерттеушілері инфаркт қаупін төмендететін ген тапты» Forbes, 18 мамыр 2016; Антонио Регаладо, «Амген инфарктқа қарсы ген тапты» MIT Technology шолуы, 18 мамыр 2016; Эуэн Кэллауэй, «Қорғаныс гені келесі блокбастерлік жүрек препаратына үміт ұсынады» Табиғат, 19 мамыр 2016 ж.
  102. ^ Гельгадоттир т.б., «Қан липидтеріне үлкен әсер ететін варианттар және коронарлық аурудағы холестерин мен триглицеридтердің рөлі» Табиғат генетикасы (жазылу қажет)48 том, 634–639 беттер, 2 мамыр 2016 ж
  103. ^ SFA гранты т.б., «7-тәрізді 2 (TCF7L2) генінің транскрипциясы факторының варианты 2 типті диабеттің қаупін тудырады» Табиғат генетикасы (жазылу қажет), 38-том, 320-323 бб, 2006 жылғы 15 қаңтар; Гельгасон және басқалар «TCF7L2 гендік варианттарының 2 типті диабетке және адаптивті эволюцияға әсерін нақтылау» Табиғат генетикасы (жазылу қажет), 39 том, 218–225 бб, 7 қаңтар 2007 ж
  104. ^ V Штейнторсдоттир т.б., «CDKAL1-дегі нұсқа инсулин реакциясы мен 2 типті қант диабетінің қаупіне әсер етеді» Табиғат генетикасы (жазылу қажет), 39 том, 770–775 бб, 26 сәуір 2007 ж .; V Штейнторсдоттир т.б., «2 типті қант диабеті қаупінің жоғарылауымен немесе төмендеуімен байланысты төмен жиілікті және сирек кездесетін варианттарды анықтау,» Табиғат генетикасы (жазылу қажет), 46 том, 294–298 бб, 26 қаңтар 2014 ж .; Е.В. Иварсдоттир және басқалар «Реттік варианттардың глюкоза деңгейіндегі дисперсияға әсері қант диабетінің екінші типін болжайды және тұқым қуалайды», Табиғат генетикасы (жазылу қажет), 49 том, 1398–1402 бб, 7 тамыз 2017 ж .; Дж. Гудмундссон және басқалар «17-хромосоманың екі нұсқасы қуықасты безі қатерлі ісігінің қаупін туғызады, ал TCF2-де 2 типті қант диабетінен қорғайды» оп. cit.
  105. ^ G Торлейфсон т.б., «CAV1 және CAV2 маңындағы жалпы нұсқалар бастапқы ашық бұрыштық глаукомамен байланысты» Табиғат генетикасы (жазылу қажет), 42 том, 906–909 бб, 12 қыркүйек 2010 жыл; G Торлейфсон т.б., «LOXL1 геніндегі жалпы реттілік нұсқалары қабыршақтану глаукомасына сезімталдықты береді» Ғылым (жазылу қажет), 317 том, 5843 шығарылым, 1397-1400 бет, 7 қыркүйек 2007 ж
  106. ^ П Сулем және басқалар, «Геном бойынша қауымдастық зерттеуі менархадағы жасқа байланысты 6q21 кезектілік нұсқаларын анықтайды» Табиғат генетикасы (жазылу қажет), 41 том, 734–738 бб, 17 мамыр 2009 ж
  107. ^ H Стефанссон және басқалар, «LINGO1 генінің варианты маңызды тремордың қаупін тудырады» Табиғат генетикасы (жазылу қажет), 41 том, 277–279 бб, 1 ақпан 2009 ж
  108. ^ G Sveinbjornsson және басқалар, «HLA класының II реттік нұсқалары еуропалық тектегі популяциялардағы туберкулез қаупіне әсер етеді» Табиғат генетикасы (жазылу қажет), 48 том, 318–322 бб, 1 ақпан 2016 ж
  109. ^ Д.Ф. Гудбярцсон т.б., «Ересек адамның бойының әртүрлілігіне әсер ететін көптеген реттілік нұсқалары» Табиғат генетикасы, 40 том, 609–615 бб, 6 сәуір 2008 ж .; S Benonisdottir т.б., «Биіктігін реттеудің эпигенетикалық және генетикалық компоненттері» Табиғат байланысы, 7 том, мақала нөмірі 13490, 16 қараша 2016 ж
  110. ^ V Эмильсон т.б., «Гендердің экспрессиясының генетикасы және оның ауруға әсері» Табиғат (жазылу қажет), 452 том, 423-428 бб, 27 наурыз 2008 ж
  111. ^ П Сулем және басқалар, «Еуропалықтарда пигментацияның жаңадан анықталған екі генетикалық детерминанты», Табиғат генетикасы (жазылу қажет), 40 том, 835–837 бб, 18 мамыр 2008 ж .; П Сулем және басқалар «Еуропалықтардағы шаштың, көздің және терінің пигментациясының генетикалық детерминанттары», Табиғат генетикасы (жазылу қажет), 39 том, 1443–1452 бет, 12 қазан 2007 ж
  112. ^ Гельгадоттир т.б., «Жалпы геномдық талдау қолқа клапанының стенозымен байланысты жаңа локустар береді» Табиғат байланысы, 9 том, мақала нөмірі 987, 7 наурыз 2018 ж
  113. ^ RP Kristjansson т.б., «ALOX15-те функцияны жоғалту нұсқасы мұрын полиптерінен және созылмалы риносинуситтен қорғайды» Табиғат генетикасы (жазылу қажет), 51 том, 267–276 бет, 14 қаңтар 2019 ж
  114. ^ Джина Колата әңгімелеген «Сирек мутация қант диабетіне жауапты генді өлтіреді». New York Times, 2 наурыз 2014 ж
  115. ^ Дж. Фланник т.б., «SLC30A8 функциясының жоғалуы мутация 2 типті қант диабетінен қорғайды» Табиғат генетикасы (жазылу қажет), 46 том, 357–363 бб, 2 наурыз 2014 ж
  116. ^ 2006 жылы бір Рейкьявик тұрғыны және deCODE зерттеулеріне қатысушы адамдардың 90% -ы фармацевтикалық компаниялар қаржыландыратын зерттеулерге қатысады деп ойлады, ал шамамен 10% -ы қарсы болды, бұл сұралғандардың қатысу коэффициентін ескерді. Майкл Д Лемомик, «Исландия тәжірибесі: кішігірім арал мемлекеті геномдық революцияның жетекшілігін қалай жеңіп алды» Уақыт, 2006 жылғы 12 ақпан. Келіспейтіндер deCODE моделінің эмуляциясы көбейген кезде де үнсіз қалады: Мысалы, Эмма Джейн Кирбиді қараңыз, «Исландияның ДНҚ-сы: әлемдегі ең қымбат гендер?» BBC News, 19 маусым 2014 ж.
  117. ^ Кэтрин Оффордтың «Генетикалық зерттеулер үшін Исландия моделінен үйрену» моделінің және Финнбогадотирдің дәйексөзінің әсер ету кеңдігі Ғалым, 1 маусым 2017 ж
  118. ^ Дэвид П Хэмилтон, «Генетикалық шежіре үлкен уақытты бастайды» VentureBeat, 17 қазан 2007 ж
  119. ^ Николас Уэйд, «Компания геномды бағалауды ұсынады» New York Times, 16 қараша 2007; Дэвид П Хэмилтон, «23andMe сізге геномды іздеуге және бөлісуге мүмкіндік береді - бүгін» VentureBeat, 17 қараша 2007 ж
  120. ^ deCODEme және 23andMe-ден басқа басқа тесттер енді ұсынылмайды, бірақ 2 типті қант диабеті және коронарлық артерия ауруы үшін расталған қауіпті зерттейтін жеке геномды сканерлеуге негіз болатын deCODE ашуларының заманауи мысалдары G Palomaki және басқалардан көрінеді. «Геномдық панельдерді пайдалану жалпы популяцияда 2 типті қант диабетінің даму қаупін анықтау: мақсатты дәлелді шолулар » Медицинадағы генетика, 15 том, 600-611 бет, тамыз 2013; Тәжірибедегі және профилактикадағы геномдық қосымшаларды бағалау (EGAPP), «EGAPP жұмыс тобының ұсыныстары: жүрек-қан тамырлары денсаулығын жақсарту үшін жүрек-қан тамырлары қаупін бағалау үшін геномдық профильдеу» Медицинадағы генетика, 12 том, 839-43 бб, желтоқсан 2010 ж
  121. ^ DeCODE тәуекелділіктің полигендік сынақтарының мысалы және компанияның баспасөз релизінде ұсынылған басқалары »deCODE простата қатерлі ісігін анықтау үшін PSA тестілеу күшін жақсартатын генетикалық маркерлерді табады, «15 желтоқсан 2010 ж
  122. ^ Амит V Хера және басқалар «Генетикалық тәуекел, салауатты өмір салтын ұстану және коронарлық ауру» Жаңа Англия Медицина журналы, 375 том, 2349-2358 бб (желтоқсан 2016 ж.); Амит V Хера, «Жалпы аурулар бойынша геномдық полигендік көрсеткіштер моногендік мутацияларға баламалы қауіпті адамдарды анықтайды» Табиғат генетикасы (жазылу қажет), 50-том, 1219–1224-бет, 13 тамыз 2018 ж. Бұл мақалалардың New York Times, Табиғат, Forbes, және MIT Technology шолуы онжылдықтағы осындай сынақтардың маңыздылығы туралы да, дәрігерлердің де, жалпы халықтың да нәтижелер нені білдіретіні туралы түсінігі туралы сөзбе-сөз пікірталастарды жандандыра түсті.
  123. ^ Стивен Д Мурды қараңыз, «Биотехникалық фирма аралды алып генетика зертханасына айналдырады», оп. cit. Термин ретінде «дәлдік медицинасы» пайда болған кезде Люк Тиммерман, «Аты-жөні не?« Дәлдік медицина »туралы сөз болғанда, көп нәрсе» Экономика, 4 ақпан 2013
  124. ^ Стефанссонның генетиканың есірткіні дамытудағы рөлі және Анн Тайердегі өсіп келе жатқан геномика индустриясы жағдайындағы көзқарасының бір мысалы: «Геномика эволюциясы: Шағын технология провайдерлері мен ірі дәрі-дәрмек өндірушілер аурудың себептерін табу, мақсатты растау үшін одақтас болады. және есірткіге реакцияны түсіну » Химиялық және инженерлік жаңалықтар, 8 желтоқсан 2003 ж
  125. ^ Рош келісімшартының негізінде, уақыттың қызып тұрған гиперболасы мен бостандығының қарапайым дозасын ғана ескере отырып, Элиот Маршаллға «Исландияның аққұба амбициясы» қараңыз. Ана Джонс, Мамыр / маусым 1998 ж
  126. ^ Эмили Сингер, «DeCODE есірткіні дамытуда» MIT Technology шолуы, 22 қаңтар 2010 ж
  127. ^ Сатып алу және оның негізін кең мағынада пайдалану, сондай-ақ оның деректерін тәуелсіз бақылауда қалдыру туралы deCODE туралы Мэтт Герперді қараңыз, «DeCode келісімімен Amgen біз 1999 жылы ойластырған сияқты есірткі табуды мақсат етеді». Forbes, 10 желтоқсан 2012 ж
  128. ^ Ғылыми беті Amgen веб-сайты көптеген deCODE басылымдары мен жобаларын ұсынады.
  129. ^ Кэмб, С Харпер және К Стефанссон, «Адам генетикасы есірткіні инновациялық дамытудың негізі ретінде» Табиғи биотехнология (жазылу қажет), 31 том, 975–978 бб, қараша 2013 ж
  130. ^ Бұл ингибиторлардың ең танымал мысалы PCSK9 сирек гиперхолестеринемиясы бар отбасыларда анықталған, содан кейін холестеринді төмендету және жүрек ауруының қаупін азайту үшін кеңірек дамыған.
  131. ^ Осы стратегиядағы прогрессті талқылау Мег Тиррелде, «Исландияның генетикалық алтын кені және оның артында тұрған адам», CNBC, 6 сәуір 2017 ж
  132. ^ Ашер Муллардтың «Аудитория ... Шон Харпермен» келтірілген. Табиғатқа шолулар Есірткінің ашылуы (жазылу қажет), 17 том, 10-11 бб, қаңтар 2018 ж
  133. ^ Компанияның баспасөз релизі Arfgerd.is веб-сайтының ашылуында (тек исландиялық), 15 мамыр 2018 ж
  134. ^ Үкіметтің жауабы болмағандықтан Энди Когланды қараңыз: «Адамдарға генетикалық денсаулыққа қауіп төндіретінін ескертіңіз, дейді deCODE басшысы» Жаңа ғалым, 25 наурыз 2015 ж
  135. ^ Статистика: «Клиникалық геномика үшін солтүстік альянс»NACG 6-шы клиникалық семинарының есебі, «21 қараша 2018 ж., 9 б
  136. ^ АҚШ Ұлттық онкологиялық институттың бағалауы BRCA2 қаупінің мутациясы бар әйелдердің 75% -ында 80 жасқа дейін сүт безі қатерлі ісігі дамиды. Простата қатерлі ісігі ауруы бар BRCA2 нұсқаларын тасымалдаушылардың кедей болжамдары туралы М.Р. Ахбариді қараңыз т.б., «BRCA2 мутациясының экранда анықталған простата қатерлі ісігінен болатын өлімге әсері» Британдық қатерлі ісік журналы, 111 том, 1238–1240 бб, 9 қыркүйек 2014 ж
  137. ^ М Дэйли, «2017 Уильям Аллан сыйлығының кіріспесі: Кари Стефанссон,» Американдық генетика журналы, 102 том, 3 шығарылым, 350 б, 1 наурыз 2018 ж
  138. ^ Американдық генетика қоғамының пресс-релизі »ASHG Кари Стефанссонды Уильям Аллан сыйлығымен марапаттайды: ASHG 2017 жыл сайынғы кездесуінде генетик марапат алады, «12 шілде 2017 жыл.
  139. ^ Пресс-релиз, Исландия университеті, «Исландия Уильям Аллан сыйлығын алды» 9 тамыз 2016
  140. ^ «Уақыт 100: Кари Стефанссон,» Уақыт, 3 мамыр 2007 ж
  141. ^ «ХХІ ғасырдың Эйнштейндері» Newsweek, 9 қазан 2007 ж
  142. ^ Боб Лангрет, «Медициналық ғажайыптар: электрондық топ», Forbes, 9 ақпан 2002 ж
  143. ^ «Еуропа жұлдыздары» Іскери апта, 12 маусым 2000 ж., Сағ Morgunblaðið, 6 маусым 2000 ж
  144. ^ Мұрағатталған басылымын қараңыз Morgunblaðið, 2000 ж., 26 қаңтар, 2-бет
  145. ^ Ескерту Morgunblaðið, 3 қаңтар 2002 ж
  146. ^ «2019 NAS сайлауы». Ұлттық ғылым академиясы. 30 сәуір, 2019.
  147. ^ «Генетикалық зерттеулердегі исландиялық ізашар мәртебелі сыйлыққа ие болды». Rigshospitalet веб-сайты. 8 қараша 2019. Алынған 11 қараша 2019.
  148. ^ «Дани Харрисонға деген сенімділік». DV (исланд тілінде). 2016-11-22. Алынған 2019-05-07.
  149. ^ «Джордж Харрисонның өмірі мен өмірінің маңыздылығы туралы». www.nutiminn.is. 2015-08-23. Алынған 2019-05-07.
  150. ^ Рейкьявик: JPV, 2016 ж.
  151. ^ Эйнар Кари Джонссон, 'Þjóð (ar) saga Sjóns: Политинского уминдина α sameiginlegum minningum Íslendinga í sögulegum skáldverkum Sjóns '(жарияланбаған магистрлік диссертация, Исландия университеті, 2018 ж.), б. 67.
  152. ^ Люси Берктегі осы сілтемелерге арналған әдеби сын, «Генетика қылмыс сахнасында: Боялған қанды кодтау», Әдеби және мәдени мүгедектерді зерттеу журналы, 6 том, 2 нөмір, 193-208 б
  153. ^ «Бобби Фишер әлемге қарсы, IMDB».
  154. ^ Фил Дайс-Нюджент. «AV / TV Club шолуы».

Сыртқы сілтемелер