JUMP РНҚ мотивін бастау - JUMPstart RNA motif

JUMP РНҚ-ны бастаңыз
JUMPstart-RNA.svg
JUMPstart РНҚ-ның екінші құрылымы
Идентификаторлар
ТаңбаJUMP РНҚ-ны бастаңыз
РфамRF01707
Басқа деректер
РНҚ түріCis- реттеуші элемент
Домен (дер)Бактериялар
PDB құрылымдарPDBe

The JUMP РНҚ мотивін бастау консервіленгенді сипаттайды РНҚ - негізделген екінші құрылым JUMPstart элементтерімен байланысты.[1] 39-негіздік жұп JUMPstart тізбегі жоғарыда сақталған элементті сипаттайды гендер қатысатындар полисахарид синтез.[2] JUMPstart элементінің РНҚ ретінде жұмыс істейтіндігі көрсетілген және ол 5 'аударылмаған аймақтар ол реттейтін гендердің[3]

JUMPstart тізбектеріне ops элементі кіреді, ол «оперон-полярлық супрессорының» аббревиатурасы болып табылады және нуклеотид консенсус GGCGGUAG.[4] Опс элементі үйлесімді әрекет етеді RfaH ақуыз жақсарту транскрипция ops элементінің төменгі ағысындағы гендер, әсіресе алыс гендер оперондар.[3][4][5][6]

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ Weinberg Z, Wang JX, Bogue J және т.б. (Наурыз 2010). «Салыстырмалы геномика бактериялардан, археялардан және олардың метагеномаларынан 104 кандидат құрылымдық РНҚ анықтайды». Геном Биол. 11 (3): R31. дои:10.1186 / gb-2010-11-3-r31. PMC  2864571. PMID  20230605.
  2. ^ Хоббс М, Ривз PR (маусым 1994). «JUMPstart тізбегі: 39 полимахаридті гендердің бірнеше кластеріне тән 39 а.к. элемент». Мол. Микробиол. 12 (5): 855–856. дои:10.1111 / j.1365-2958.1994.tb01071.x. PMID  8052136.
  3. ^ а б Маролда CL, Вальвано MA (маусым 1998). «Escherichia coli O7 спецификалық липополисахаридті ген кластерінің промотор аймағы: ағынға аударылмаған мРНҚ тізбегінің құрылымдық және функционалды сипаттамасы». Бактериол. 180 (12): 3070–3079. PMC  107806. PMID  9620955.
  4. ^ а б Nieto JM, Bailey MJ, Hughes C, Koronakis V (ақпан 1996). «Ішек таяқшасы гемолизин оперонындағы транскрипция полярлығын полисахарид пен ДНҚ беру детерминанттары бөлісетін қысқа ағынды элементтің басуы». Мол. Микробиол. 19 (4): 705–713. дои:10.1046 / j.1365-2958.1996.446951.x. PMID  8820641.
  5. ^ Лидс Дж.А., Уэлч РА (маусым 1997). «Escherichia coli гемолизин опероны арқылы транскрипцияны күшейту, hlyCABD: RfaH және ағынды JUMPStart ДНҚ тізбектері постиницитация механизмі арқылы бірге жұмыс істейді». Бактериол. 179 (11): 3519–3527. дои:10.1128 / jb.179.11.3519-3527.1997. PMC  179143. PMID  9171395.
  6. ^ Ванг Л, Дженсен С, Холман Р, Ривз PR (тамыз 1998). «O антиген гендерінің кластерінің экспрессиясын JUMPstart тізбегі арқылы RfaH реттейді». FEMS микробиол. Летт. 165 (1): 201–206. дои:10.1111 / j.1574-6968.1998.tb13147.x. PMID  9711858.

Сыртқы сілтемелер