Ішкі-делдалдық күшейту - Intron-mediated enhancement

Ішкі-делдалдық күшейту (IME) - бұл қабілеттілік интрон жақсарту үшін реттілік өрнек а ген сол интронды қамтиды. Атап айтқанда, интрон транскрипцияланған күшейтуге арналған геннің аймағы, IME-ді типтік әрекеттен ажыратады транскрипциялық күшейткіштер.[1] Бұл құбылыстың сипаттамасы алғаш рет мәдениетті түрде жарияланды жүгері 1987 ж.,[2] және кейіннен «ішкі жетілдірілген күшейту» термині 1990 жылы пайда болды.[3] Бірқатар жарияланымдар бұл құбылыстың сақталатынын көрсетті эукариоттар оның ішінде адамдар,[4] тышқандар,[5] Арабидопсис,[6] күріш,[7][8] және C. elegans.[9] Дегенмен, IME жұмыс істейтін механизм (дер) әлі толық түсінілмеген.[10]

Кез-келген берілген интрон геннің экспрессиясын күшейтетіндігін тексеру үшін, екінің өрнегін салыстыру тән құрылымдар, біреуі интронды, ал біреуі онсыз және екі нәтиже арасындағы айырмашылықты «есе ұлғайту «жақсартуда. Әрі қарай эксперименттер экспрессияны жақсартудың себебі ретінде IME-ді көрсете алады - ең кең таралғандардың бірі - транскрипцияны бастайтын жердің интронын транскрипциядан алып тастау. Егер интрон енді экспрессті күшейте алмаса, онда транскриптке интронды қосу маңызды, ал интрон IME тудыруы мүмкін.

Барлық интрондар ген экспрессиясын күшейте бермейді, бірақ интенсивті емес басқаруға қатысты экспрессияны 2–1000 есе күшейте алады.[11] Жылы Арабидопсис және басқа өсімдік түрлері, IMEter интронды реттіліктің ген экспрессиясын күшейту ықтималдығын есептеу үшін жасалған.[12] Мұны өрнектерге негізделген ұпайларды есептеу арқылы жүзеге асырады нуклеотид мақсатты реттілік шеңберіндегі тізбектер. Транскрипттегі интронның орны да маңызды - транскрипттің басталуына (5 'аяғына) интрон неғұрлым жақын болса, оның гендік экспрессиясын күшейтеді.[13]

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ Rose, A. B. (2008-01-01). «Гендердің экспрессиясының ішкі реттелуі». Микробиология мен иммунологияның өзекті тақырыптары. 326: 277–290. ISSN  0070-217X. PMID  18630758.
  2. ^ Каллис Дж .; Фромм, М .; Уолбот, В. (1987-12-01). «Интрондар өсірілген жүгері жасушаларында гендердің экспрессиясын арттырады». Гендер және даму. 1 (10): 1183–1200. дои:10.1101 / gad.1.10.1183. ISSN  0890-9369. PMID  2828168.
  3. ^ Маскаренхас, D; Меттлер, IJ; Пирс, DA; Лоу, HW (1990). «Жүгерідегі гетерологиялық гендік экспрессияның интронаналық күшеюі». Өсімдіктердің молекулалық биологиясы. 15 (6): 913–920. дои:10.1007 / BF00039430. PMID  2103480. жоқ
  4. ^ Джонсон, Джейдж; Форсман, медицина ғылымдарының докторы; Уилсон, Н; McIvor, RS (1990). «Адамның пуриндік нуклеозидті фосфорилаз генін экспрессиялауға арналған ішкі қажеттілігі». Нуклеин қышқылдарын зерттеу. 20 (12): 3191–3198. дои:10.1093 / нар / 20.12.3191. PMC  312458. PMID  1620616.
  5. ^ Palmiter, RD; Сандгрен, ЕП; Аварбок, МР; Аллен, DD; Бринстер, RL (1991). «Гетерологиялық интрондар трансгендердің тышқандардағы көрінісін күшейте алады». PNAS. 88 (2): 478–482. дои:10.1073 / pnas.88.2.478. PMC  50834. PMID  1988947. жоқ
  6. ^ Роуз, АБ; Соңғы, RL (2003). «Интрондар транскрипциядан кейін Arabidopsis thaliana триптофан жолының PAT1 генінің экспрессиясын арттыру үшін әсер етеді». Зауыт журналы. 11 (3): 455–464. дои:10.1046 / j.1365-313X.1997.11030455.x. PMID  9107035.
  7. ^ Джон, Дж.С.; Ли, С; Джунг, КХ; Джун, SH; Ким, С; An, G (2000). «Бірінші интронның делдалдығымен күріш α-тубулин генінің тіндерінің артықшылықты экспрессиясы, OsTubA1». Өсімдіктер физиологиясы. 123 (3): 1005–1014. дои:10.1104 / б.123.3.1005. PMC  59063. PMID  10889249.
  8. ^ Морелло, Л; Бардини, М; Сала, Ф; Breviario, D (2002). «Ostub16 күріш β-тубулин генінің ұзақ жетекші интроны жоғары деңгейдегі ген экспрессиясы үшін қажет және in vitro да, in vitro да транскрипцияны автономды түрде дамыта алады». Зауыт журналы. 29 (1): 33–44. дои:10.1046 / j.0960-7412.2001.01192.x. PMID  12060225.
  9. ^ Хо, SH; Сонымен, GMK; Chow, KL (2001). «Caenorhabditis elegans mab-21 постэмбриональды экспрессиясы және оның сенсорлық сәулеленудегі қажеттілігі». Даму динамикасы. 221 (4): 422–430. дои:10.1002 / dvdy.1161. PMID  11500979.
  10. ^ Галлегос, Дженна Е .; Роуз, Алан Б. (2015-08-01). «Интерронды күшейтудің тұрақты құпиясы». Өсімдік туралы ғылым. 237: 8–15. дои:10.1016 / j.plantsci.2015.04.017. ISSN  1873-2259. PMID  26089147.
  11. ^ Роза, А (2002). «Арабидопсистегі гендік экспрессияны интронимуляциялық күшейтуге қойылатын талаптар». РНҚ. 8 (11): 1444–53. дои:10.1017 / S1355838202020551. PMC  1370350. PMID  12458797.
  12. ^ Роуз, Алан Б .; Эльфери, Тали; Парра, Дженис; Корф, Ян (2008-03-01). «Arabidopsis thaliana промотор-проксимальды интрондары гендердің экспрессиясын жоғарылататын дисперсті сигналдармен байытылған». Өсімдік жасушасы. 20 (3): 543–551. дои:10.1105 / tpc.107.057190. ISSN  1532-298X. PMC  2329928. PMID  18319396.
  13. ^ Роуз, Алан Б. (2004-12-01). «Арабидопсистегі ген экспрессиясының интрон-делдалдық күшеюіне интрон орналасуының әсері». Зауыт журналы. 40 (5): 744–751. дои:10.1111 / j.1365-313X.2004.02247.x. ISSN  1365-313X. PMID  15546357.