HNRPUL1 - HNRPUL1

HNRNPUL1
Қол жетімді құрылымдар
PDB	Ортологиялық іздеу: PDBe RCSB
PDB идентификатор кодтарының тізімі
	1ZRJ
Идентификаторлар
Бүркеншік аттар	HNRNPUL1, E1B-AP5, E1BAP5, HNRPUL1, гетерогенді ядролық рибонуклеопротеин U сияқты 1
Сыртқы жеке куәліктер	OMIM: 605800 MGI: 2443517 HomoloGene: 31419 Ген-карталар: HNRNPUL1
Геннің орналасуы (адам)
Хр.	19-хромосома (адам)
Соңы	41,307,787 bp
Геннің орналасуы (тышқан)
Хр.	7-хромосома (тышқан)
Соңы	25,754,757 bp
РНҚ экспрессиясы өрнек
	; ;
	Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Гендік онтология
Молекулалық функция	• ферментті байланыстыру; • GO: 0001948 ақуыздармен байланысуы; • РНҚ байланысы;
Ұялы компонент	• жасуша ядросы; • нуклеоплазма;
Биологиялық процесс	• мРНҚ-ны бөлу, сплитеосома арқылы; • вирусқа жауап; • РНҚ өңдеу; • транскрипцияны реттеу, ДНҚ-шаблонмен; • транскрипция, ДНҚ-шаблонмен;
	Дереккөздер:Амиго / QuickGO
Ортологтар
	11100
	232989
	ENSG00000105323
	ENSMUSG00000040725
	Q9BUJ2
	Q8VDM6
NM_001301016; NM_007040; NM_144732; NM_144733; NM_144734;
	NM_001321208; NM_001321211
	NM_144922; NM_178089; NM_001360789
	NP_001287945; NP_001308137; NP_001308140; NP_008971; NP_653333
	NP_659171; NP_835190; NP_001347718
	Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеу	Тінтуірді қарау / өңдеу

Біртекті емес ядролық рибонуклеопротеин U тәрізді ақуыз 1 Бұл ақуыз адамдарда кодталған HNRNPUL1 ген.^[5]^[6]^[7]

Бұл ген гетерогенді ядролық рибонуклеопротеин (hnRNP) отбасының РНҚ-мен байланысатын ақуызын кодтайды. Бұл ақуыз аденовирус E1B-55kDa онкопротеинмен ерекше байланысады. Ол нуклеоцитоплазмалық РНҚ тасымалдауында маңызды рөл атқаруы мүмкін және оның қызметі аденовирус жұқтырған жасушаларда E1B-55kDa модуляцияланған. HNRPUL1 сонымен қатар аденовирусты инфекция кезінде ATR протеин-киназа сигнализациясына қатысады. Бұл ген үшін әртүрлі изоформаларды кодтайтын екі транскрипция нұсқасы табылды. Қосымша нұсқалары да табылды, бірақ олардың толық өлшемді табиғаты анықталмады.^[7]

Өзара әрекеттесу

HNRPUL1 көрсетілген өзара әрекеттесу бірге BRD7^[6] және PRMT2.^[8]

Әдебиеттер тізімі

^ ^а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000105323 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000040725 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ Габлер С, Шутт Н, Гроитл П, Қасқыр Н, Шенк Т, Добнер Т (қазан 1998). «E1B 55 килодальтонмен байланысты ақуыз: аденовирус пен жасушалық мРНҚ-ны нуклеоцитоплазмалық тасымалдауға қатысатын РНҚ-мен байланысатын белсенділігі бар жасушалық ақуыз». Дж Вирол. 72 (10): 7960–71. дои:10.1128 / JVI.72.10.7960-7971.1998. PMC 110131. PMID 9733834.
^ ^а ^б Kzhyshkowska J, Rusch A, Wolf H, Dobner T (сәуір 2003). «E1B-AP5 гетерогенді ядролық рибонуклеопротеинмен транскрипцияның реттелуі құрамында бромодомен бар жаңа BRD7 ақуызымен кешенді түзілу арқылы жүзеге асырылады». Биохим Дж. 371 (Pt 2): 385-93. дои:10.1042 / BJ20021281. PMC 1223277. PMID 12489984.
^ ^а ^б «Entrez Gene: HNRPUL1 гетерогенді ядролық рибонуклеопротеин U-тәрізді 1».
^ Кжышковска, Дж; Шютт Н; Liss M; Креммер Е; Stauber R; Қасқыр H; Dobner T (қыркүйек 2001). «E1B-AP5 гетерогенді ядролық рибонуклеопротеин Arg-Gly-Gly (RGG) қорабында метилденеді және адамның аргинин метилтрансферазасы HRMT1L1-мен өзара әрекеттеседі». Биохимия. Дж. 358 (Pt 2): 305–14. дои:10.1042/0264-6021:3580305. ISSN 0264-6021. PMC 1222062. PMID 11513728.

Әрі қарай оқу

Маруяма К, Сугано С (1994). «Олиго-жабу: эукариоттық мРНҚ-ның қақпақ құрылымын олигорибонуклеотидтермен ауыстырудың қарапайым әдісі». Джин. 138 (1–2): 171–4. дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Сузуки Ю, Йошитомо-Накагава К, Маруяма К және т.б. (1997). «Толық көлемде байытылған және 5-деңгеймен байытылған cDNA кітапханасының құрылысы және сипаттамасы». Джин. 200 (1–2): 149–56. дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Bachi A, Braun IC, Rodrigues JP және т.б. (2000). «БГБ-ның C-терминал домені ядролық кеуектер кешенімен өзара әрекеттеседі және құрамында CTE бар РНҚ субстраттарының экспортын қолдайды». РНҚ. 6 (1): 136–58. дои:10.1017 / S1355838200991994. PMC 1369901. PMID 10668806.
Герольд А, Суяма М, Родригес Дж.П. және т.б. (2000). «TAP (NXF1) модульдік архитектурасы сақталған, РНҚ-ның экспорттық факторларының мультигендік отбасына жатады». Мол. Ұяшық. Биол. 20 (23): 8996–9008. дои:10.1128 / MCB.20.23.8996-9008.2000. PMC 86553. PMID 11073998.
Kzhyshkowska J, Schütt H, Liss M және т.б. (2001). «E1B-AP5 гетерогенді ядролық рибонуклеопротеин Arg-Gly-Gly (RGG) қорабында метилденеді және адамның аргинин метилтрансферазасы HRMT1L1-мен өзара әрекеттеседі». Биохимия. Дж. 358 (Pt 2): 305–14. дои:10.1042/0264-6021:3580305. PMC 1222062. PMID 11513728.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH және т.б. (2003). «Адам мен тышқанның 15000-нан астам толық ұзындықтағы кДНҚ тізбектерінің генерациясы және алғашқы талдауы». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 99 (26): 16899–903. Бибкод:2002 PNAS ... 9916899M. дои:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ота Т, Сузуки Ю, Нишикава Т және т.б. (2004). «Адамның 21,243 толық ұзындықтағы кДНҚ-ның толық тізбегі және сипаттамасы». Нат. Генет. 36 (1): 40–5. дои:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Brill LM, Salomon AR, Ficarro SB және т.б. (2004). «Тирозинді фосфорлану учаскелерін иммобилизденген металға жақындық хроматографиясын және тандемдік масс-спектрометрияны қолданып, адамның Т жасушаларынан фосфопротеомдық профильді профильдеу». Анал. Хим. 76 (10): 2763–72. дои:10.1021 / ac035352d. PMID 15144186.
Colland F, Jacq X, Trouplin V және т.б. (2004). «Адамның сигналдық жолының функционалды протеомикасын картографиялау». Genome Res. 14 (7): 1324–32. дои:10.1101 / гр.2334104. PMC 442148. PMID 15231748.
Kzhyshkowska J, Kremmer E, Hofmann M және т.б. (2005). «Литикалық аденовирустық инфекция кезіндегі протеин аргининді метилдену». Биохимия. Дж. 383 (Pt 2): 259-65. дои:10.1042 / BJ20040210. PMC 1134066. PMID 15242333.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D және т.б. (2004). «HeLa жасушаларының ядролық фосфопротеидтерінің ауқымды сипаттамасы». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 101 (33): 12130–5. Бибкод:2004PNAS..10112130B. дои:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Герхард Д.С., Вагнер Л, Фейнголд Е.А. және т.б. (2004). «NIH толық ұзындықтағы cDNA жобасының мәртебесі, сапасы және кеңеюі: Сүтқоректілер гендерінің коллекциясы (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121-7. дои:10.1101 / гр.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Barral PM, Rusch A, Turnell AS және т.б. (2005). «HnRNP отбасы мүшесінің E1B-AP5 р53-пен өзара әрекеттесуі». FEBS Lett. 579 (13): 2752–8. дои:10.1016 / j.febslet.2005.03.095. PMID 15907477. S2CID 28875660.
Stelzl U, Worm U, Lalowski M және т.б. (2005). «Адамның ақуыз бен ақуыздың өзара әрекеттесу желісі: протеомға түсініктеме беретін ресурс». Ұяшық. 122 (6): 957–68. дои:10.1016 / j.cell.2005.08.029. PMID 16169070.
Rual JF, Венкатесан К, Хао Т және т.б. (2005). «Адамның протеин-протеинмен өзара әрекеттесу желісінің протеома-масштабты картасына қарай». Табиғат. 437 (7062): 1173–8. Бибкод:2005 ж.437.1173R. дои:10.1038 / табиғат04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Шифман Д, Роулэнд CM, Луи Дж.З. және т.б. (2006). «VAMP8 және HNRPUL1 гендік нұсқалары миокард инфарктісінің ерте басталуымен байланысты». Артериосклер. Тромб. Vasc. Биол. 26 (7): 1613–8. дои:10.1161 / 01.ATV.0000226543.77214.e4. PMID 16690874.
Олсен БК, Благоев Б, Гнад Ф және т.б. (2006). «Сигналдық желілердегі ғаламдық, in vivo және нақты фосфорлану динамикасы». Ұяшық. 127 (3): 635–48. дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983.
Kollers S, Musilova P, Rubes J, Rocha D (2007). «Салыстырмалы картада шошқа хромосомасы 6 мен адамның 19q13 арасындағы көптеген қайта құрылымдар анықталған». Аним. Генет. 37 (6): 595–6. дои:10.1111 / j.1365-2052.2006.01516.x. PMID 17121608.

Бұл мақала а ген қосулы адамның хромосомасы 19 Бұл бұта. Сіз Уикипедияға көмектесе аласыз оны кеңейту.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000105323 - Ансамбль, Мамыр 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000040725 - Ансамбль, Мамыр 2017

[3] «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[4] «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[pmid9733834-5] Габлер С, Шутт Н, Гроитл П, Қасқыр Н, Шенк Т, Добнер Т (қазан 1998). «E1B 55 килодальтонмен байланысты ақуыз: аденовирус пен жасушалық мРНҚ-ны нуклеоцитоплазмалық тасымалдауға қатысатын РНҚ-мен байланысатын белсенділігі бар жасушалық ақуыз». Дж Вирол. 72 (10): 7960–71. дои:10.1128 / JVI.72.10.7960-7971.1998. PMC 110131. PMID 9733834.

[pmid12489984-6] а ^б Kzhyshkowska J, Rusch A, Wolf H, Dobner T (сәуір 2003). «E1B-AP5 гетерогенді ядролық рибонуклеопротеинмен транскрипцияның реттелуі құрамында бромодомен бар жаңа BRD7 ақуызымен кешенді түзілу арқылы жүзеге асырылады». Биохим Дж. 371 (Pt 2): 385-93. дои:10.1042 / BJ20021281. PMC 1223277. PMID 12489984.

[entrez-7] а ^б «Entrez Gene: HNRPUL1 гетерогенді ядролық рибонуклеопротеин U-тәрізді 1».

[pmid11513728-8] Кжышковска, Дж; Шютт Н; Liss M; Креммер Е; Stauber R; Қасқыр H; Dobner T (қыркүйек 2001). «E1B-AP5 гетерогенді ядролық рибонуклеопротеин Arg-Gly-Gly (RGG) қорабында метилденеді және адамның аргинин метилтрансферазасы HRMT1L1-мен өзара әрекеттеседі». Биохимия. Дж. 358 (Pt 2): 305–14. дои:10.1042/0264-6021:3580305. ISSN 0264-6021. PMC 1222062. PMID 11513728.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]