АҚТҚ-ны жоюға арналған бағаналы цикл 3 (GSL3) - HIV gag stem loop 3 (GSL3) - Wikipedia

АҚТҚ-ны жоюға арналған бағаналы цикл 3 (GSL3)
RF00376.jpg
Идентификаторлар
ТаңбаHIV_GSL3
РфамRF00376
Басқа деректер
РНҚ түріCis-reg
Домен (дер)Вирустар
СОSO: 0000233
PDB құрылымдарPDBe

АҚТҚ-ны жоюға арналған бағаналы цикл 3 (GSL3) Бұл қайталама құрылымдық компонент туралы Ретровирустық Psi орамасының элементі, psi тану элементі деп те аталады. Бұл домен РНҚ орауында үлкен рөл атқарады және ВИЧ-1 геномының аударылмаған 5 ’аймағында орналасқан.[1][2][3] GSL3 ВИЧ-1 геномды РНҚ-ның арнайы орамасын бағыттайтыны белгілі. GSL3-ті жою вирустық РНҚ орамасының да, димеризациясының да төмендеуіне әкелсе, мутагендік зерттеулер оның ретровирустық РНҚ-ның инкапсуляциясын толығымен жоймайтындығын көрсетті.[4][5]

Фармацевтикалық жетістіктер

NCp7-мен өзара әрекеттесу

РНҚ инкапсуляциясы NCp7 ақуызымен psi тану элементін анықтаудан тұрады. NCp7 екі қатарынан тұрады мырыш саусақтары олар негізгі қалдықтардың созылуымен байланысты. Олардың қызметі - праймердің күйдірілуін белсендіру тРНҚ басталу орнына (кері транскрипция жүретін жерде).[6] Бұл процесс кезінде GSL3 NCp7-мен арнайы әрекеттеседі. АИТВ / ЖИТС емдеуге қолданылатын қазіргі фармацевтикалық препараттар ретровирустың репликация циклындағы іргелі процестерді тежейді. Бұл өзара әрекеттесу тежелудің потенциалды нүктесі болып табылады.

Ингибиторлық лигандтар

Қорғасын қосылысының мысалы. Қараңыз [7] қосымша ақпарат алу үшін

Ингибитордың дамуы бастапқы кезеңде қалады. Қарапайым молекулалық құрылымы мен төмен молекулалық массасы бар қосылысты синтездеу мәселесі бүйірлік өзара әрекеттесуді және зиянды потенциалды стереоизомерлерді шектеу үшін есептеу үшін де, жоғары өткізу қабілеті үшін де қажет.[7] 2 - ((5-нитроквинолин-8-ыл) тио) этанол, потенциал қорғасын қосылысы, оң жақта көрсетілген. Ол GSL3-тің циклдік құрылымы үшін екі және бір тізбекті РНҚ-дан таңдап алынады. Бұл дегеніміз, егер АИТВ-ға бағытталған жасушада шығарылса, ол діңгек циклін блоктайды және осылайша NCp7-мен өнімді өзара әрекеттесуді шектейді.[7]

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ Амарасингге Г.К., Де Гузман Р.Н., Тернер Р.Б., Канцлер К.Дж., У З.Р., Саммерс МФ (2000). «ПСИ-РНҚ орау сигналының бағаналы циклі SL2-мен байланысқан ВИЧ-1 нуклеокапсидті ақуыздың NMR құрылымы. Геномды тануға әсер». Дж.Мол. Биол. 301 (2): 491–511. дои:10.1006 / jmbi.2000.3979. PMID  10926523.
  2. ^ Дарликс, Дж .; Лападат-Тапольский, М; де Рокиньи, Н; Roques, BP (8 желтоқсан 1995). «Ретровирустардың нуклеокапсидті ақуызының құрылымдық-функционалдық байланыстарындағы алғашқы көріністер». Молекулалық биология журналы. 254 (4): 523–537. дои:10.1006 / jmbi.1995.0635. PMID  7500330.
  3. ^ Dietz J, Koch J, Kaur A, Raja C, Stein S, Grez M, Pustowka A, Mensch S, Ferner J, Möller L, Bannert N, Tampé R, Divita G, Mély Y, Schwalbe H, Dietrich U (2008) . «Геномдық РНҚ орауышының псиді лигандының Psi сигналымен АИВ-1 тежелуі». ChemMedChem. 3 (5): 749–755. дои:10.1002 / cmdc.200700194. PMID  18205165.
  4. ^ Дамгаард, CK; Андерсен, ES; Кнудсен, Б; Городкин, Дж; Kjems, J (13 ақпан, 2004). «ВИЧ-1 геномының 5 'аймағындағы РНҚ өзара әрекеттесуі». Молекулалық биология журналы. 336 (2): 369–379. дои:10.1016 / j.jmb.2003.12.010. PMID  14757051.
  5. ^ Hiv-1 құрастыру мен шығарудағы жетістіктер. Springer Verlag. ISBN  978-1-4614-7728-0.
  6. ^ Morellet N, Jullian N, De Rocquigny H, Maigret B, Darlix JL, Roques BP (1992). «Адамның 1 типті иммунитет тапшылығы вирусынан NCp7 нуклеокапсидті ақуыздың құрылымын 1H NMR бойынша анықтау». EMBO J. 11 (8): 3059–3065. PMC  556789. PMID  1639074.
  7. ^ а б в Варуи, ДМ; Барангер, AM (10 мамыр 2012). «АИТВ-1 нуклеокапсидті-діңгек-цикл 3 РНҚ кешенінің шағын молекулалық ингибиторларын анықтау». Медициналық химия журналы. 55 (9): 4132–4141. дои:10.1021 / jm2007694. PMID  22480197.