Джин дизайнері - Gene Designer

Джин дизайнері
Gene Designer Sequence View реттілік элементтерін, кодонды таңдауды және олигонуклеотидтік позицияларды басқаруға мүмкіндік береді. Тізбектелген мотивтерді, шектеу сайттарын және ашық оқу шеңберлерін жылдам іздеңіз.
Gene Designer Sequence View реттілік элементтерін манипуляциялауға мүмкіндік береді, кодонды таңдау, және олигонуклеотид позициялар. Жылдам іздеу реттілік мотивтері, шектеу сайттары, және ашық оқу шеңберлері.
ӘзірлеушілерДНҚ2.0[1]
Бастапқы шығарылым2006; 14 жыл бұрын (2006)
Тұрақты шығарылым
2.01.191 / 9 қазан 2015 ж; 5 жыл бұрын (2015-10-09)
Операциялық жүйеWindows, macOS, Linux
Платформаx86, x86-64
Қол жетімдіАғылшын
ТүріМолекулалық биология құралдар жинағы
ЛицензияТегін бағдарламалар, тіркеу қажет
Веб-сайтwww.dna20.com/ ресурстар/ genedesigner

Джин дизайнері бұл компьютер бағдарламалық жасақтама пакеті биоинформатика.[2][3] Ол қолданылады молекулалық биологтар академиядан, үкіметтен және фармацевтика, химия, ауылшаруашылық және биотехнология салаларынан жобалауға дейін,[4] клондау және генетикалық реттілікті тексеру. Бұл меншікті бағдарламалық жасақтама, ретінде шығарылды ақысыз тіркеуді қажет етеді

Ерекшеліктер

Ген-дизайнер молекулалық биологтарға жобалау құралдарын қолдана отырып, гендерді жобалаудың барлық процестерін бір бағдарламада басқаруға мүмкіндік береді.

Ген-дизайнер сүйреп апару мүмкіндігімен клондайды. Пайдаланушылар а апара алады вектор және клондау құралына салыңыз; кесу, біріктіру және клон. Gene Designer құрастырады a клон содан кейін оны тікелей жобаға тастауға болады.

Тәрбиеші мен оқушының қолдануы

Бұл тегін бағдарламалық жасақтама синтетикалық биология, жүйелік биология, биоинженерия және биоинформатика бойынша сыныптық және зертханалық оқу бағдарламаларына енгізілген. Студенттер жобалау құралдарын қолдана отырып, бір қолданбада гендерді жобалаудың толық процесін басқаратын жобалар жасайды және аяқтайды.

Оқу жоспарларында қолдану мысалдары:

  • Синтетикалық биофотоника курсы; Юта штатының университеті, инженерлік колледжі[5]
  • Gene Designer 2.0 қолданатын зертханалық жоба[6]
  • Биологиялық сабақтарға шолу[7]
  • Синтетикалық биология сабағына шолу[8]
  • Студенттік жобалар[9]

Сондай-ақ қараңыз

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ ДНҚ2.0
  2. ^ Виллалобос, Алан; Нес, Джон Э; Густафссон, Клес; Миншулл, Джереми; Говиндараджан, Шридар (2006). «Ген-дизайнер: жасанды ДНҚ сегменттерін құруға арналған синтетикалық биология құралы». BMC Биоинформатика. 7: 285. дои:10.1186/1471-2105-7-285. PMC  1523223. PMID  16756672.
  3. ^ Виллалобос, Алан; Уэлч, Марк; Миншулл, Джереми (2012). «Функционалды ДНҚ құрылымдарының силикондық дизайнында». Пекуда, Жан (ред.) Ген синтезі: әдістері мен хаттамалары. Молекулалық биологиядағы әдістер. 852. 197–213 бб. дои:10.1007/978-1-61779-564-0_15. ISBN  978-1-61779-563-3. PMID  22328435.
  4. ^ Уэлч, М; Виллалобос, А; Густафссон, С; Миншулл, Дж (2011). «Ақуыздың экспрессиясының гендерін жобалау». Фойгтта, Кристофер (ред.) Синтетикалық биология, В бөлімі: Компьютермен жобалау және ДНҚ құрастыру. Фермологиядағы әдістер. 498. 43-66 бет. дои:10.1016 / B978-0-12-385120-8.00003-6. ISBN  9780123851208. PMID  21601673.
  5. ^ http://www.engr.usu.edu/wiki/index.php/Synthetic_Biophotonics_2010[өлі сілтеме ]
  6. ^ http://www.engr.usu.edu/wiki/index.php/Synthetic_Biophotonics_2010_Systems_Biology_Laboratory[өлі сілтеме ]
  7. ^ http://www.engr.usu.edu/wiki/index.php/Synthetic_Biophotonics_2010_Systems_Biology[өлі сілтеме ]
  8. ^ http://www.engr.usu.edu/wiki/index.php/Synthetic_Biophotonics_2010_Synthetic_Biology[өлі сілтеме ]
  9. ^ http://www.engr.usu.edu/wiki/index.php/Synthetic_Biophotonics_2010_Student_Projects[өлі сілтеме ]

Сыртқы сілтемелер