Gammaproteobacteria rimP жетекшісі - Gammaproteobacteria rimP leader

Gammaproteobacteria rimP жетекшісі
Gammaproteo rimP lideri.png
Сақталған екінші құрылым канондық негіз жұптарының үлесін көрсететін rimP көшбасшысының суреті
Идентификаторлар
ТаңбаrimP
РфамRF01770
Басқа деректер
РНҚ түріCis-reg; көшбасшы
Домен (дер)Гаммапротеобактериялар
PDB құрылымдарPDBe

The γ-протеобактериялық ернеудің жетекшісі арқылы анықталған әлсірететін элемент болып табылады биоинформатика γ-протеобактериялық филум бактерияларының ішінде.[1] Ол өзеннің жоғарғы жағында орналасқан rimP-nusA-infB оперон 30S рибосомалық суббірліктің жетілуіне қатысатыны көрсетілген RimP, ақуызды кодтау,[2] NusA, тоқтатуды басқаратын транскрипциялық фактор және аударма инициациялық фактор IF-2 сәйкесінше. RimP-көшбасшы а ұсынады Ро-тәуелсіз терминатор жоғары 'GGGc (...) gCCC сәйкес келетін 3' соңында мотив. Бұл мотив кодтамайтын көшбасшы ретінде жұмыс істейді деп болжануда. Оның механизмі белгісіз болып қала береді, бірақ оның нормативтік қатысуын болжауға азғырады NusA ақуызы оперондық өрнекті төмендететін қандай өрнек көрсетілген,[3][4] және ол Trp, His және S10 операларының әлсіреуіне қатысады.[5]

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ Навилл, М; Gautheret, D (2010). «Терминаторды мерзімінен бұрын талдау бактериялардың транскрипциялық әлсіреуінің жасырын әлеміне жарық түсіреді». Геном биологиясы. 11 (9): R97. дои:10.1186 / gb-2010-11-9-r97. PMC  2965389. PMID  20920266.
  2. ^ Nord S, Bylund GO, Lövgren JM, Wikström PM (2009). «RimP ақуызы 30S рибосомалық суббірліктің жетілуі үшін маңызды». Дж Мол Биол. 386 (3): 742–753. дои:10.1016 / j.jmb.2008.12.076. PMID  19150615.
  3. ^ Плумбридж Дж., Дондон Дж, Накамура Ю, Грунберг-Манаго М (1985). «NusA ақуызының E. coli-дегі нусА, инфБ-оперон экспрессиясына әсері». Нуклеин қышқылдары. 13 (9): 3371–3388. дои:10.1093 / nar / 13.9.3371. PMC  341241. PMID  2987884.
  4. ^ Накамура Ю, Плумбридж Дж, Дондон Дж, Грунберг-Манаго М (1985). «Escherichia coli нусA-infB оперонының авторегуляциясы үшін дәлелдер». Джин. 36 (1–2): 189–193. дои:10.1016 / 0378-1119 (85) 90085-X. PMID  2998933.
  5. ^ Worbs M, Bourenkov GP, Bartunik HD, Huber R, Wahl MC (2001). «NusA транскрипция коэффициентіндегі S1 және KH домендері арқылы кеңейтілген РНҚ байланыстыратын беті». Mol Cell. 7 (6): 1177–1189. дои:10.1016 / S1097-2765 (01) 00262-3. PMID  11430821.

Сыртқы сілтемелер