Форминдер - Formins - Wikipedia

формин 1
Идентификаторлар
ТаңбаFMN1
Alt. шартты белгілерLD, FMN
NCBI гені342184
HGNC3768
OMIM136535
RefSeqNM_001103184
UniProtQ68DA7
Басқа деректер
ЛокусХр. 15 q13-q14
формин 2
Идентификаторлар
ТаңбаFMN2
NCBI гені56776
HGNC14074
OMIM606373
RefSeqXM_371352
UniProtQ9NZ56
Басқа деректер
ЛокусХр. 1 q43
Филин бойынша формин ақуыздарының домен құрылымы.[1]
Формин гомологиясы аймағы 1
Идентификаторлар
ТаңбаDrf_FH1
PfamPF06346
InterProIPR009408
Формин гомологиясы 2 домен
PDB 1ux4 EBI.jpg
формин гомологиясы-2 доменінің кристалды құрылымдары байланыстырылған-димер сәулетін ашады
Идентификаторлар
ТаңбаFH2
PfamPF02181
InterProIPR015425
SMARTFH2
SCOP21ux5 / Ауқымы / SUPFAM
Диафанозды FH3 домені
PDB 1z2c EBI.jpg
rhoc-gmppnp бар кешендегі mdia1 gbd-fh3 кристалдық құрылымы
Идентификаторлар
ТаңбаDrf_FH3
PfamPF06367
Pfam руCL0020
InterProIPR010472
DRF Авторегуляторлық домені
PDB 2bap EBI.jpg
n-терминалының mdia1 armadillo қайталанатын аймағының кристалды құрылымы және mdia1 авторегуляторлық доменімен кешендегі димеризация домені (әкесі)
Идентификаторлар
ТаңбаDrf_DAD
PfamPF06345
InterProIPR010465
Диафаналық GTPase байланыстыратын домен
PDB 1z2c EBI.jpg
rhoc-gmppnp бар кешендегі mdia1 gbd-fh3 кристалдық құрылымы
Идентификаторлар
ТаңбаDrf_GBD
PfamPF06371
Pfam руCL0020
InterProIPR010473

Форминдер (форминнің гомологиялық ақуыздары) тобы болып табылады белоктар қатысатындар полимеризация туралы актин және актинді жіпшелердің тез өсетін ұшымен (тікенді ұшымен) байланысады.[2] Форминдердің көпшілігі Rho-GTPase эффекторлы белоктар. Форминдер актинді және микротүтікше цитоскелет [3][4] сияқты әр түрлі ұялы функцияларға қатысады жасуша полярлығы, цитокинез, жасуша миграциясы және SRF транскрипциялық белсенділік.[5] Форминдер - бұл көп доменді ақуыздар өзара әрекеттесу әртүрлі сигнал беру молекулалар және цитоскелеттік ақуыздар, дегенмен кейбір форминаларға функциялары берілген ядро.

Әртүрлілік

Форминдер барлығында табылды эукариоттар оқыды.[1] Адамдарда 7 түрлі топқа жіктелген 15 түрлі формин ақуыздары бар.[6] Керісінше, ашытқылар тек 2-3 форминнен тұрады.[7]

Құрылымы және өзара әрекеттесуі

Форминдер үш формин гомологиясының болуымен сипатталады (FH) домендер (FH1, FH2 және FH3), дегенмен форминдер отбасының мүшелері міндетті түрде барлық үш доменді қамтымайды.[8][9] Сонымен қатар, әдетте басқа домендер қатысады, мысалы PDZ, ӘКЕ, WH2 немесе FHA домендері.

The пролин - бай FH1 домені әртүрлі ақуыздармен, соның ішінде өзара әрекеттесуде делдал болады актинмен байланысатын ақуыз профилин, SH3 (Src гомологиясы 3) домендік ақуыздар,[10] және WW домені белоктар. Актиннің ядро ​​түзілуіне ықпал ететін белсенділігі S. cerevisiae форминдер FH2 доменіне локализацияланған.[4] FH2 домені FH2 домендерінің бір-бірін тікелей байланыстыру қабілеті арқылы формин ақуыздарының өзін-өзі біріктіруі үшін қажет, сонымен бірге тежеу актинді полимерлеу.[11][12] FH3 домені онша жақсы емес сақталған және форминдерді дұрыс бағыттау үшін қажет жасушаішілік орналасқан жер, мысалы митозды шпиндель, немесе кезінде проекция ұшы конъюгация.[13][14] Сонымен қатар, кейбір форминаларда а болуы мүмкін GTPase -байланыстырушы домен (GBD) үшін қажет міндетті дейін Rho шағын GTPases және а C-терминалы сақталған Dia-авторегуляциялық домен (DAD). GBD - бұл активтендірілген Rho отбасы мүшелерімен өзара әрекеттесетін және оларды реттейтін екіфункционалды аутоингибиторлық домен. Сүтқоректілер Drf3 құрамында CRIB тәрізді мотив байланыстыру үшін оның GBD шегінде Ccc42, бұл Cdc42 үшін Drf3-ті іске қосу және бағыттау үшін қажет жасуша қыртысы онда актин қаңқасын қайта жасайды.[15] ӘКЕ N-терминалын GBD байланыстырады; бұл байланыс GTP-мен байланысқан Rho GBD-мен байланысып, ақуызды белсендірген кезде бұзылады. ӘКЕ-нің қосылуы сүтқоректілер жасушалар индукциялайды актиндік жіп қалыптасады, тұрақталады микротүтікшелер, және SRF медиациясын белсендіреді транскрипция.[15] Тағы бір жиі кездесетін домен - бұл армадилло қайталанатын аймақ (ARR) FH3 доменінде орналасқан.

FH2 домені көрсетілген Рентгендік кристаллография үшеуі бар ұзартылған, жарты ай пішініне ие болу спираль қосалқы домендер.[16][17]

Форминдер тікелей байланысады микротүтікшелер олардың FH2 домені арқылы. Бұл өзара әрекеттесу қоныс аударатын жасушалардың жетекші шетіне бағытталған микротүтікшелер жиынтығын ұстап тұруға және тұрақтандыруға ықпал етуде маңызды. Сондай-ақ, форминдер микротүтікшелерді алуға ықпал етеді кинетохор кезінде митоз және микротүтікшелерді актин талшықтары бойымен туралау үшін.[18][19]

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ а б Халкия Д, Николайтис Н, Макаловский В, Клейн Дж, Ней М (желтоқсан 2008). «Актин жіпшелерінің түзілуіне қатысатын форминді көпжоспарлы отбасының шығу тегі және эволюциясы». Молекулалық биология және эволюция. 25 (12): 2717–33. дои:10.1093 / molbev / msn215. PMC  2721555. PMID  18840602.
  2. ^ Evangelista M, Zigmond S, Boone C (шілде 2003). «Форминдер: актин жіптерін жинауға және поляризациялауға арналған сигналдық эффекторлар». Cell Science журналы. 116 (Pt 13): 2603–11. дои:10.1242 / jcs.00611. PMID  12775772.
  3. ^ Gunning PW, Ghoshdastider U, Whitaker S, Popp D, Робинсон RC (маусым 2015). «Композициялық және функционалды түрде ерекшеленетін актинді жіпшелердің эволюциясы». Cell Science журналы. 128 (11): 2009–19. дои:10.1242 / jcs.165563. PMID  25788699.
  4. ^ а б Goode BL, Eck MJ (2007). «Актин жиналуын бақылаудағы форминдердің механизмі мен қызметі». Биохимияның жылдық шолуы. 76: 593–627. дои:10.1146 / annurev.biochem.75.103004.142647. PMID  17373907.
  5. ^ Faix J, Grosse R (маусым 2006). «Форминдермен формада болу». Даму жасушасы. 10 (6): 693–706. дои:10.1016 / j.devcel.2006.05.001. PMID  16740473.
  6. ^ Хиггс Х.Н., Петерсон К.Дж. (қаңтар 2005). «Формин гомологиясының 2 доменін филогенетикалық талдау». Жасушаның молекулалық биологиясы. 16 (1): 1–13. дои:10.1091 / mbc.E04-07-0565. PMC  539145. PMID  15509653.
  7. ^ Kitayama C, Uyeda TQ (ақпан 2003). «ForC, FH1 домені жоқ форминдер тұқымдасының ақуызының жаңа түрі, Dictyostelium discoideum-да көпжасушалы дамуға қатысады». Cell Science журналы. 116 (Pt 4): 711-23. дои:10.1242 / jcs.00265. PMID  12538772.
  8. ^ Wallar BJ, Alberts AS (тамыз 2003). «Форминдер: цитоскелетті қайта құратын белсенді тіректер». Жасуша биологиясының тенденциялары. 13 (8): 435–46. дои:10.1016 / S0962-8924 (03) 00153-3. PMID  12888296.
  9. ^ Uetz P, Fumagalli S, James D, Zeller R (желтоқсан 1996). «Аяқтардың деформациясы ақуыздарының (форминдердің) және Src отбасылық киназалар арасындағы молекулалық өзара әрекеттесу». Биологиялық химия журналы. 271 (52): 33525–30. дои:10.1074 / jbc.271.52.33525. PMID  8969217.
  10. ^ Такея Р, Сумимото Н (қараша 2003). «Fhos, сүтқоректілер формині, N-терминалы арқылы F-актинмен FH1 доменімен тікелей байланысады және FH2 домені арқылы гоминдік кешен түзеді, актин талшығының түзілуіне ықпал етеді». Cell Science журналы. 116 (Pt 22): 4567-75. дои:10.1242 / jcs.00769. PMID  14576350.
  11. ^ Shimada A, Nyitrai M, Vetter IR, Kühmann D, Bugyi B, Narumiya S, Geeves MA, Wittinghofer A (ақпан 2004). «Диафанға жататын форминдердің негізгі FH2 домені - полимерленуді тежейтін ұзартылған актинмен байланысатын ақуыз». Молекулалық жасуша. 13 (4): 511–22. дои:10.1016 / S1097-2765 (04) 00059-0. PMID  14992721.
  12. ^ Като Т, Ватанабе Н, Моришима Ю, Фуджита А, Ишизаки Т, Нарумия С (ақпан 2001). «HeLa жасушаларында митозды шпиндельге дейін диафанозды, mDia1, сүтқоректілер гомологының локализациясы». Cell Science журналы. 114 (Pt 4): 775–84. PMID  11171383.
  13. ^ Питерсен Дж, Нильсен О, Эгел Р, Хаган И.М. (маусым 1998). «Форминдерде кездесетін домен FH3, конъюгация кезінде проекция ұшына Fus1 форминнің бөліну ашытқысын бағыттайды». Жасуша биологиясының журналы. 141 (5): 1217–28. дои:10.1083 / jcb.141.5.1217. PMC  2137179. PMID  9606213.
  14. ^ а б Peng J, Wallar BJ, Flanders A, Swiatek PJ, Alberts AS (сәуір 2003). «MDia1 кодтайтын диафанозға байланысты форминнің Drf1 генінің бұзылуы Drf3 үшін Cdc42 эффекторы ретінде рөл ашады». Қазіргі биология. 13 (7): 534–45. дои:10.1016 / S0960-9822 (03) 00170-2. PMID  12676083. S2CID  13902104.
  15. ^ Xu Y, Moseley JB, Sagot I, Poy F, Pellman D, Goode BL, Eck MJ (наурыз 2004). «Formin Homology-2 доменінің кристалдық құрылымдары байланыстырылған димер архитектурасын ашады». Ұяшық. 116 (5): 711–23. дои:10.1016 / S0092-8674 (04) 00210-7. PMID  15006353. S2CID  15855545.
  16. ^ Томпсон М.Е., Хеймсат Э.Г., Гаувин Т.Дж., Хиггс Х.Н., Калл Ф.Ж. (қаңтар 2013). «FMNL3 FH2-актин құрылымы форминмен қозғалатын актиннің ядролануы және созылуы туралы түсінік береді». Табиғат құрылымы және молекулалық биология. 20 (1): 111–8. дои:10.1038 / nsmb.2462. PMC  3876896. PMID  23222643.
  17. ^ Palazzo AF, Cook TA, Alberts AS, Gundersen GG (тамыз 2001). «mDia тұрақты микротүтікшелердің Rho-реттелетін қалыптасуы мен бағдарлануында делдалдық етеді». Табиғи жасуша биологиясы. 3 (8): 723–9. дои:10.1038/35087035. PMID  11483957. S2CID  7374170.
  18. ^ Бартолини Ф, Гундерсен Г.Г. (ақпан 2010). «Форминдер және микротүтікшелер». Biochimica et Biofhysica Acta (BBA) - молекулалық жасушаларды зерттеу. 1803 (2): 164–73. дои:10.1016 / j.bbamcr.2009.07.006. PMC  2856479. PMID  19631698.

Сыртқы сілтемелер

Бұл мақалада көпшілікке арналған мәтін енгізілген Pfam және InterPro: IPR010472
Бұл мақалада көпшілікке арналған мәтін енгізілген Pfam және InterPro: IPR015425
Бұл мақалада көпшілікке арналған мәтін енгізілген Pfam және InterPro: IPR010465
Бұл мақалада көпшілікке арналған мәтін енгізілген Pfam және InterPro: IPR010473