FluChip - FluChip - Wikipedia

The FluChip тығыздығы төмен ДНҚ микроарреясы сәйкестендіру үшін тұмау басында дамыған вирустар Боулдердегі Колорадо университеті профессор Кэти Роуленнің зертханасында[1] бірлесе отырып Ауруларды бақылау және алдын алу орталықтары (CDC) Атлантада.

Жоба 2003 жылы қаржыландырылды Ұлттық аллергия және инфекциялық аурулар институты (NIAID), бөлігі Ұлттық денсаулық сақтау институттары.Түпнұсқа FluChip [2][3]үш гендік мақсатты қолданатын А және В тұмауының екеуін де анықтауға арналған: HA (Гемагглютинин ), NA (Нейраминидаза ) және M (матрица) ген сегменттері. ДНҚ-ны ұстаудың көптеген қысқа дәйектері жасалған, [4] және генетикалық ұқсастықтар мен айырмашылықтарды пайдалану арқылы А типті тұмау вирустары типіне де, типіне де қолданылады. Жалпы талдау мыналардан тұрды RT-PCR тұмаудың РНҚ-ны күшейту, кейінгі ағынды транскрипциясы ПТР шаблон ретінде өнім және флуоресцентті таңбаланған фрагменттелген будандастыру РНҚ микроаррай бетіне Флуоресценттік интенсивтіліктің жалпы үлгісі қазіргі тұмау вирусын (типтерін) теру және кіші түрге келтіру үшін қолданылды.

MChip

тұмаудың әртүрлі кіші түрлері.

М генінің сегментінде кіші типтер туралы ақпарат беру үшін кіші типтердің арасындағы генетикалық әртүрліліктің жеткілікті екендігі анықталған кезде, келесі жұмыстар A (‘MChip’) тұмауының кіші типтік талдауы ретінде зерттеуге бағытталды. MChip адамның H1N1, H3N2 және адамдарды бөлу қабілетіне бағытталған жүздеген үлгілерді зерттеу үшін пайдаланылды. құс тұмауы (H5N1) кіші типтері және бірнеше жарияланған зерттеулерде егжей-тегжейлі көрсетілген клиникалық сезімталдығы мен ерекшелігі пайда болды.[5][6][7][8]Жақында MChip көмегімен зерттелген А тұмауының басқа қызығушылық тудыратын вирустары - 1918 ‘Испан тұмауы ’Штамм,[9]және әр түрлі пандемиялық H1N1 / 09 вирусы үлгілер.[10]InDevR Inc (Boulder, CO) FluChip технологиясын 2009 жылы Колорадо университеті мен CDC лицензиялаған,[11]және алдағы молекулалық диагностика платформасында қолдануға арналған қосымшаны әзірлеуде.

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ «» Тұмау чипі «- тұмауға диагноз қоюдың жаңа әдісі».
  2. ^ Таунсенд, Майкл Б .; Досон, Эрика Д .; Мехман, Мартин; Смагала, Джеймс А .; Данкбар, Даниэла М .; Мур, Чад Л .; Смит, Кэтрин Б .; Кокс, Нэнси Дж.; т.б. (2006). «Тұмау вирустарын қадағалауға арналған FluChip диагностикалық микроарарының эксперименттік бағасы». Клиникалық микробиология журналы. 44 (8): 2863–2871. дои:10.1128 / JCM.00134-06. PMC  1594652. PMID  16891504.
  3. ^ Мехман, Мартин; Досон, Эрика Д .; Таунсенд, Майкл Б .; Смагала, Джеймс А .; Мур, Чад Л .; Смит, Кэтрин Б .; Кокс, Нэнси Дж.; Кучта, Роберт Д .; Роулен, Кэти Л. (2006). «Тұмау вирусына арналған FluChip диагностикалық микроаррабатын жасау үшін дәйектілікті таңдаудың сенімді әдісі». Клиникалық микробиология журналы. 44 (8): 2857–2862. дои:10.1128 / JCM.00135-06. PMC  1594657. PMID  16891503.
  4. ^ Смагала, Джеймс А .; Досон, Эрика Д .; Мехман, Мартин; Таунсенд, Майкл Б .; Кучта, Роберт Д .; Роулен, Кэти Л. (2005). «ConFind: консервацияланған конвенцияны анықтауға арналған сенімді құрал». Биоинформатика. 21 (24): 4420–4422. дои:10.1093 / биоинформатика / bti719. PMID  16239306.
  5. ^ Досон, Эрика Д .; Мур, Чад Л .; Смагала, Джеймс А .; Данкбар, Даниэла М .; Мехман, Мартин; Таунсенд, Майкл Б .; Смит, Кэтрин Б .; Кокс, Нэнси Дж.; т.б. (2006). «MChip: тұмауды бақылау құралы». Аналитикалық химия. 78 (22): 7610–7615. дои:10.1021 / ac061739f. PMID  17105150.
  6. ^ Досон, Эрика Д .; Мур, Чад Л .; Данкбар, Даниэла М .; Мехман, Мартин; Таунсенд, Майкл Б .; Смагала, Джеймс А .; Смит, Кэтрин Б .; Кокс, Нэнси Дж.; т.б. (2007). «A / H5N1 тұмау вирустарын анықтау бір генді диагностикалық микроаррайды айтады». Аналитикалық химия. 79 (1): 378–384. дои:10.1021 / ac061920o. PMID  17194164.
  7. ^ Мехман, Мартин; Боннер, Алета Б .; Уильямс, Джон V .; Данкбар, Даниэла М .; Мур, Чад Л .; Кучта, Роберт Д .; Подсиад, Эми Б .; Тамериус, Джон Д .; т.б. (2007). «MChip-ті вирустық культурамен салыстыру, кері транскрипция-ПТР және QuickVue тұмауын жылдам диагностикалауға арналған A + B тұмауын сынау». Клиникалық микробиология журналы. 45 (4): 1234–1237. дои:10.1128 / JCM.02202-06. PMC  1865827. PMID  17301287.
  8. ^ Досон, Эрика Д .; Роулен, Кэти Л. (ақпан 2010). FluChip: Диагностикалық тұмаудың микроарарының дәйектілігін сенімді таңдау әдісі. Тұмауда: Молекулалық вирусология, Ванг, Q. және Tao, Y. J., eds. Норфолк, Ұлыбритания, Caister Academic Press. ISBN  978-1-904455-57-8.
  9. ^ Мур, Чад Л .; Смагала, Джеймс А .; Смит, Кэтрин Б .; Досон, Эрика Д .; Кокс, Нэнси Дж.; Кучта, Роберт Дж.; Роулен, Кэти Л. (2007). «MChip-ті H1N1 тұмау вирустың тарихи түрімен бағалау, соның ішінде 1918 ж.» Испан тұмауы «штаммы». Клиникалық микробиология журналы. 45 (11): 3807–3810. дои:10.1128 / JCM.01089-07. PMC  2168478. PMID  17855577.
  10. ^ «Пресс-релиз 5 мамыр 2009 ж.».
  11. ^ «Пресс-релиз 28.04.2009».

Сыртқы сілтемелер