Негізгі олигосахарид - Core oligosaccharide

Липополисахарид. Ядроға ішкі және сыртқы өзектер кіреді.

Негізгі олигосахарид (немесе Core-OS) ішіндегі қант қалдықтарының қысқа тізбегі Грам теріс липополисахарид (LPS). Core-OS бактериалды түрлер арасында әр түрлі, тіпті түрлердің штаммдарының ішінде де әртүрлі [1]

Құрылым

ОЖ-нің құрылымы және метаболизм жолдары: олигосахарид Ішек таяқшасы R1.[1] Ішкі ядро ​​жасыл түспен, ал сыртқы ядро ​​көк түспен көрсетілген.

Негізгі домен әрқашан тікелей байланысатын олигосахаридті компоненттен тұрады липидті А және әдетте бар қанттар сияқты гептоза және 3-дезокси-Д.-манноактулозон қышқылы (KDO немесе кето-дезоксиоктулозонат деп те аталады).[2] Көптеген бактериялардың LPS өзектерінде көмірсутекті емес компоненттер бар, мысалы фосфат, аминқышқылдары, және этаноламин орынбасарлар.

Әдебиетте көптеген негізгі құрылымдар сипатталған, бұл сипаттама келесіге негізделген дәстүрлі жалпы құрылым (анықталғандай ішек бактериялары және Псевдомонас ). Табылған құрылымға шолу үшін жоғарыдағы суретті қараңыз E. coli R1.

Ішкі өзек

Ішкі өзектің «негізі» 1–3 KDO қалдықтары болып табылады. Соңғы KDO а-мен жиі өзгертіледі фосфат немесе этаноламин топ. KDO-дан 2-3 қосымшасы бар гептозалар (яғни L-глицеро-D-манногептулоза), олар әдетте фосфорланған. Бұл KDO және гептозалар «ішкі ядроны» құрайды кетозидті байланыс KDO мен А липиді арасындағы (α2 → 6) қышқылдың бөлінуіне әсіресе сезімтал. LPS зерттеушілері LPS-тің липидті және полисахаридті бөліктерін бөлу үшін әлсіз қышқылмен емдеуді қолданады.

Тек липидті А және ішкі ядроны (немесе одан аз) қамтитын LPS молекуласы. Мысалды қараңыз ) «терең өрескел LPS» деп аталады.

Сыртқы ядро

Сыртқы ядросы жасалған гексоза ішкі ядродағы соңғы гептозаның қалдықтарына бекітілген қалдықтар. Сыртқы өзекте жиі кездесетін гексозаларға: Д.-глюкоза, Д.-маноз, Д.-галактоза, т.б.. Әдетте β1 → 3 байланысқан кем дегенде үш гексозалар болады О антиген үшінші гексозамен байланыстырылған. Басқа гексоза көбінесе негізгі олигомерден тармақталып, сыртқы өзекке бекітілген күйінде кездеседі.

Липидті А және толық ядролы олигосахаридті (ішкі және сыртқы) қамтитын LPS «өрескел LPS» деп аталады.

Биосинтез

Олигосахаридтің негізгі синтезіне қатысатын ферменттер консервіленген Ішек таяқшасы және Сальмонелла. Pseudomonas aeruginosa бірнеше ерекше ферменттері бар.[3]:273

Функция

Липополисахаридтің негізгі олигосахаридінің мембрананың жүріс-тұрысына әсер ету механизмі дұрыс зерттелмеген.

Сондай-ақ қараңыз

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ а б Генрихс Д.Е., Йетхон Дж.А., Уитфилд С (қазан 1998). «Escherichia coli және Salmonella enterica липополисахаридтерінің негізгі аймақтарындағы құрылымдық әртүрліліктің молекулалық негіздері». Молекулалық микробиология. 30 (2): 221–32. дои:10.1046 / j.1365-2958.1998.01063.x. PMID  9791168.
  2. ^ Hershberger C, Binkley SB (сәуір 1968). «3-дезокси-D-маннооктулозон қышқылының химиясы және метаболизмі. I. Стереохимиялық детерминация». Биологиялық химия журналы. 243 (7): 1578–84. PMID  4296687.
  3. ^ King JD, Kocíncová D, Westman EL, Lam JS (қазан 2009). «Шолу: Pseudomonas aeruginosa кезіндегі липополисахаридтер биосинтезі». Туа біткен иммунитет. 15 (5): 261–312. дои:10.1177/1753425909106436. PMID  19710102.