Крис Понтинг - Chris Ponting

Крис Понтинг
Крис Понтинг.jpg
Туған
Кристофер Пол Понтинг
ҰлтыБритандықтар
Алма матер
БелгіліSMART[1]
Ғылыми мансап
Өрістер
МекемелерЭдинбург университеті
ДиссертацияПлазминоген және онымен байланысты ақуыздарды құрылымдық зерттеу  (1992)
Веб-сайтwww.ed.ac.uk/ mrc-адам-генетика-бірлігі/ зерттеу/ понтинг-топ

Кристофер Пол Понтинг британдық есептеу биологы мамандандырылған эволюция және функциясы гендер және геномдар. Қазіргі уақытта ол медициналық биоинформатика кафедрасында жұмыс істейді Эдинбург университеті және топ жетекшісі MRC Адам генетикасы бөлімі. Ол сонымен қатар доцент Wellcome Trust Sanger институты, Медициналық ғылымдар академиясының мүшесі, Еуропалық молекулалық биология ұйымының мүшесі және мүшесі Эдинбург Корольдік Қоғамы.[2] Оның зерттеулері ұзақ уақыт кодталмайтын РНҚ қызметі мен эволюциясына, бір клеткалы биологияға және аурулардың геномикасына бағытталған.[3][4][5][6][7][8]

Білім

Оны алғаннан кейін Өнер бакалавры және Ғылым магистрі физикадан Оксфорд университеті және Британдық Колумбия университеті тиісінше, ол өзінің жұмысын аяқтап, Оксфордқа оралды Философия докторы жылы биофизика 1992 ж. құрылымдық зерттеулер бойынша плазминоген.[9][10]

Зерттеу

Понтинг үлес қосты Адам геномының жобасы,[11] және үшін реттілікті салыстыруға қатысты тышқан,[12] егеуқұйрық,[13] тауық,[14] ит,[15] опоссум,[16] және платипус[17][18][19] Геномдық жобалар. Ол сондай-ақ қолданды салыстырмалы геномика туралы түсінуге тікелей үлес қосу хроматин құрылымы[20] және көптеген жағдайлардың генетикасы, соның ішінде астма,[21] семіздік,[22] Альцгеймер ауруы,[23] пигментозды ретинит,[24] бұлшықет дистрофиясы,[25] және Aicardi-Goutières синдромы.[26]

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ Шульц, Дж .; Милпетц, Ф .; Борк, П.; Понтинг, C. (1998). «SMART, қарапайым модульдік архитектураны зерттеу құралы: сигналдық домендерді анықтау». Америка Құрама Штаттарының Ұлттық Ғылым Академиясының еңбектері. 95 (11): 5857–5864. Бибкод:1998 PNAS ... 95.5857S. дои:10.1073 / pnas.95.11.5857. PMC  34487. PMID  9600884.
  2. ^ «Профессор Кристофер Пол Понтинг FMedSci FRSE - Эдинбург Корольдік Қоғамы». Эдинбург корольдік қоғамы. Алынған 14 наурыз 2018.
  3. ^ Крис Понтингтің жарияланымдары индекстелген Скопус библиографиялық мәліметтер базасы. (жазылу қажет)
  4. ^ Симс, Дэвид (2014). «Тізбектелген тереңдік және қамту: геномдық талдаудағы негізгі ойлар». Табиғи шолулар Генетика. 15 (2): 121–132. дои:10.1038 / nrg3642. PMID  24434847.
  5. ^ Рэндс, Крис М. (2014). «Адам геномының 8,2% -ы шектелген: Адам шежіресіндегі функционалды элементтер кластары бойынша айналым мөлшерлемесінің өзгеруі». PLOS генетикасы. 10 (7): e1004525. дои:10.1371 / journal.pgen.1004525. PMC  4109858. PMID  25057982.
  6. ^ Гиббс, Р. А .; Вайнсток, Г.М .; Метцкер, М.Л .; Музный, Д.М .; Содергрен, Э. Дж .; Шерер, С; Скотт, Дж; Штефен, Д; Уорли, К. Берч, П. Е .; Оквуону, Г; Хайнс, S; Льюис, Л; Дерамо, С; Делгадо, О; Дуган-Роча, С; Miner, G; Морган, М; Хауес, А; Гилл, Р; Celera; Холт, Р. А .; Адамс, Д .; Аманатидс, П. Г .; Баден-Тилсон, Н; Барнстид, М; Чин, С; Эванс, C. А .; Ferriera, S; т.б. (2004). «Қоңыр Норвегия егеуқұйрығының геномдық реттілігі сүтқоректілер эволюциясы туралы түсінік береді». Табиғат. 428 (6982): 493–521. Бибкод:2004 ж. Табиғат.428..493G. дои:10.1038 / табиғат02426. PMID  15057822.
  7. ^ Дрозофила 12 геномы, консорциум; Кларк, А.Г .; Эйзен, М. Б.; Смит, Д.Р .; Бергман, К.М .; Оливер, Б; Маркоу, Т.А .; Кауфман, Т .; Келлис, М; Гельбарт, В; Айер, В.Н .; Поллард, Д.А .; Сактон, Т.Б .; Ларракуэнте, А.М .; Сингх, Н.Д .; Абад, Дж. П .; Абт, Д.Н .; Адрян, Б; Агуаде, М; Акаши, Н; Андерсон, В.В .; Аквадро, Ф.; Арделл, Д. Х .; Аргуэлло, Р; Артиери, Дж .; Барбаш, Д. А .; Баркер, Д; Барсанти, П; Баттерхэм, П; т.б. (2007). «Дрозофила филогениясы бойынша гендер мен геномдардың эволюциясы». Табиғат. 450 (7167): 203–18. Бибкод:2007 ж.450..203С. дои:10.1038 / табиғат06341. PMID  17994087.
  8. ^ Мулдер, Н. Дж .; Апвейлер, Р; Аттвуд, Т.; Байроч, А; Баррель, D; Бэтмен, А; Бинс, Д; Бисвас, М; Брэдли, П; Борк, П; Бухер, П; Копли, Р.Р .; Курсель, Е; Das, U; Дурбин, Р; Falquet, L; Флейшман, В; Гриффитс-Джонс, С; Haft, D; Харт, Н; Хуло, N; Кан, Д; Канапин, А; Крестянинова, М; Лопес, Р; Летуник, мен; Lonsdale, D; Сильвентоинен, V .; Orchard, S. E .; Пагни, М .; Пагни, Марко; Пейрук, Д .; Понтинг, C.P.; Селенгут, Дж .; Қызметші, Ф .; Сигрист, Дж. А .; Вон, Р .; Здобнов, Е.М. (2003). «InterPro дерекқоры, 2003 кеңейтілген қамту мен жаңа мүмкіндіктер ұсынады». Нуклеин қышқылдарын зерттеу. 31 (1): 315–8. дои:10.1093 / nar / gkg046. PMC  165493. PMID  12520011.
  9. ^ Понтинг, Кристофер Пол (1992). Плазминоген және онымен байланысты ақуыздарды құрылымдық зерттеу (DPhil тезисі). Оксфорд университеті. OCLC  556763136.
  10. ^ «Проф. Крис Понтинг BA магистрі DPhil». Оксфорд университеті. Архивтелген түпнұсқа 2014 жылғы 7 сәуірде.
  11. ^ Ландер, Е.С.; Линтон, М .; Биррен, Б .; Нусбаум, С .; Зоди, С .; Болдуин, Дж .; Девон, К .; Девар, К .; Дойл, М .; Фиджью, В .; Функе, Р .; Гейдж, Д .; Харрис, К .; Хефорд, А .; Хоуленд, Дж .; Канн, Л .; Лехоцкий, Дж .; Левин, Р .; Макуан, П .; МакКернан, К .; Мелдрим, Дж .; Месиров, Дж. П .; Миранда, С .; Моррис, В .; Нейлор, Дж .; Раймонд, С .; Розетти, М .; Сантос, Р .; Шеридан, А .; т.б. (Ақпан 2001). «Адам геномының алғашқы реттілігі және талдауы». Табиғат. 409 (6822): 860–921. Бибкод:2001 ж.409..860L. дои:10.1038/35057062. ISSN  0028-0836. PMID  11237011.
  12. ^ Чинвалла, А. Т .; Уотерстон, Л.Л .; Линдблад-Тох, К.Д .; Бирни, Г.А .; Роджерс, Л.А .; Абрил, Р. С .; Агарвал, Т.А .; Агарвала, Л.В .; Айнсук, Э. Р .; Александрссон, Дж. Д .; Ан, Т.Л .; Антонаракис, В. Е .; Аттвуд, Дж. О .; Баертш, М. Н .; Бэйли, К.Х .; Барлоу, С С .; Бек, Т .; Берри, Б .; Биррен, Дж .; Блум, Е .; Борк, Р. Х .; Ботчерби, М. С .; Брей, Р. К .; Брент, С.П .; Браун, П .; Браун, Э .; Булт, Б .; Бертон, Т .; Батлер, Д.Г .; т.б. (2002). «Тінтуірдің геномын алғашқы ретке келтіру және салыстырмалы талдау». Табиғат. 420 (6915): 520–562. Бибкод:2002 ж. 420..520W. дои:10.1038 / табиғат01262. PMID  12466850.
  13. ^ Амос, Джонатан (2004 ж. 31 наурыз). «Егеуқұйрықтың» өмірлік коды «ғылыммен оқылады». BBC News. Алынған 19 желтоқсан 2008.
  14. ^ «Тауық генетикалық құпиядан бас тартады». BBC News. 9 желтоқсан 2004 ж. Алынған 19 желтоқсан 2008.
  15. ^ Линдблад-Тох., К .; Уэйд, К.М .; Миккелсен, Т.С .; Карлссон, Э. К .; Джафе, Д.Б .; Камал, М .; Қысқыш, М .; Чанг, Дж. Л .; Кульбокас, Е. Дж .; Зоди, М. С .; Маукели, Э .; Xie, X .; Брин, М .; Уэйн, Р.К .; Острандер, Э. А .; Понтинг, C. П .; Галиберт, Ф .; Смит, Д.Р .; Деджонг, П.Ж .; Киркнесс, Э .; Альварес, П .; Биаги, Т .; Брокман, В .; Батлер Дж .; Чин, В.В .; Кук, А .; Манжет, Дж .; Дейли, Дж .; Декаприо, Д .; т.б. (2005). «Геномдар тізбегі, салыстырмалы талдау және үй иттерінің гаплотиптік құрылымы». Табиғат. 438 (7069): 803–819. Бибкод:2005 ж. 438..803L. дои:10.1038 / табиғат04338. PMID  16341006.
  16. ^ Миккелсен, Т.С .; Уэйкфилд, Дж .; Акен, Б .; Амемия, C. Т .; Чанг, Дж. Л .; Герцог С .; Гарбер, М .; Джентлз, А. Дж .; Гудштадт, Л .; Хегер, А .; Джурка Дж .; Камал, М .; Маукели, Э .; Серл, С.М. Дж.; Шарп, Т .; Бейкер, М.Л .; Батцер, М. А .; Бенос, П.В .; Белов, К .; Қысқыш, М .; Кук, А .; Манжет, Дж .; Дас, Р .; Дэвидов, Л .; Дэакин, Дж. Е .; Фаззари, М. Дж .; Шыны, Дж. Л .; Граберр, М .; Греалли, Дж. М .; т.б. (2007). «Monodelphis domestica марсупиалдарының геномы кодталмаған тізбектердегі инновацияларды ашады». Табиғат. 447 (7141): 167–177. Бибкод:2007 ж.447..167M. дои:10.1038 / табиғат05805. PMID  17495919.
  17. ^ Уоррен, В. Хиллиер, Л.В .; Маршалл Грэйвс, Дж. А .; Бирни, Э.; Понтинг, C. П.; Грюцнер, Ф .; Белов, К .; Миллер, В .; Кларк, Л .; Чинвалла, А. Т .; Янг, С.П .; Хегер, А .; Локк, Д.П .; Митхке, П .; Уотерс, П. Д .; Veyrunes, F. D. R .; Фултон, Л .; Фултон, Б .; Грэйвс, Т .; Уоллис, Дж .; Пуэнте, X. С .; Лопес-Отин, С .; Ордоньес, Г.Р .; Эйхлер, Э. Е .; Чен, Л .; Ченг, З .; Дэакин, Дж. Е .; Элсоп, А .; Томпсон, К .; т.б. (2008). «Платипустың геномдық анализі эволюцияның ерекше қолтаңбаларын табады». Табиғат. 453 (7192): 175–183. Бибкод:2008 ж.т.453..175W. дои:10.1038 / табиғат06936. PMC  2803040. PMID  18464734.
  18. ^ http://www.nature.com/nature/videoarchive/platypusgenome/ Платипус геномын талқылау
  19. ^ Бриггс, Хелен (7 мамыр 2008). «Платипус генетикалық коды ашылды». BBC News. Алынған 19 желтоқсан 2008.
  20. ^ Дженувейн, Т .; Эйзенхабер, С .; О'Карролл, Ф .; Страхл, Д. Н .; Sun, B. D .; Шмид, З.В .; Оправил, М .; Мехтлер, С .; Понтинг, К .; Аллис, С .; Jenuwein, C. D. (2000). «Хроматин құрылымын нақты гистон H3 метилтрансферазалар арқылы реттеу». Табиғат. 406 (6796): 593–599. Бибкод:2000 ж. Табиғаты. 406..593R. дои:10.1038/35020506. PMID  10949293.
  21. ^ Чжан, Ю .; Leaves, N. I .; Андерсон, Г.Г .; Понтинг, C. П.; Брокхольме, Дж .; Холт, Р .; Эдсер, П .; Бхаттачария, С .; Дунхем, А .; Адкок, И.М .; Поллин, Л .; Барнс, П.Ж .; Харпер, Дж. И. Абеказис, Г.А .; Кардон, Л .; Ақ, М .; Бертон, Дж .; Мэтьюз, Л .; Мотт, Р .; Росс, М .; Кокс, Р .; Моффатт, М. Ф .; Куксон, W. O. C. M. (2003). «Иммуноглобулин Е деңгейіне және демікпеге әсер ететін 13q14 хромосомасындағы сандық белгі локусын позициялық клондау». Табиғат генетикасы. 34 (2): 181–186. дои:10.1038 / ng1166. hdl:10044/1/57392. PMID  12754510.
  22. ^ Геркен, Т .; Джирард, С .; Тунг, Ю.-С. Л .; Уэбби, Дж .; Саудек, V .; Хевитсон, К.С .; Yeo, G. S. H .; Макдоно, М.А .; Канлифф, С .; МакНилл, Л.А .; Гальвановскис, Дж .; Рорсман, П.; Робинс, П .; Приур, Х .; Колл, А. П .; Ма, М .; Йованович, З .; Фаруки, И. С .; Седвик, Б .; Баррозу, I .; Линдал, Т.; Понтинг, C. П.; Эшкрофт, Ф. М.; О'Рахилли, С.; Шофилд, Дж. (2007). «Семіздікпен байланысты ФТО гені 2-оксоглутаратқа тәуелді нуклеин қышқылының деметилазасын кодтайды». Ғылым. 318 (5855): 1469–1472. Бибкод:2007Sci ... 318.1469G. дои:10.1126 / ғылым.1151710. PMC  2668859. PMID  17991826.
  23. ^ Понтинг, C. П.; Хаттон, М .; Ниборг, А .; Бейкер, М .; Янсен, К .; Golde, T. E. (2002). «Пресенилинді гомологтардың романын анықтау». Адам молекулалық генетикасы. 11 (9): 1037–1044. дои:10.1093 / hmg / 11.9.1037. PMID  11978763.
  24. ^ Абд Эль-Азиз, М.М .; Барраган, Мен .; О'Дрисколл, C. А .; Гудштадт, Л .; Пригмор, Е .; Боррего, С .; Мена, М .; Пьерас, Дж. И. Эль-Эшри, М. Ф .; Сафие, Л.А .; Шах, А .; Cheetham, M. E .; Картер, Н. П .; Чакарова, С .; Понтинг, C. П .; Бхаттачария, С.С .; Антиноло, Г. (2008). «Дрозофила космостық қондырғысының ортологын кодтайтын EYS аутосомды-рецессивті ретинит пигментозында мутацияға ұшырайды». Табиғат генетикасы. 40 (11): 1285–1287. дои:10.1038 / нг.241. PMC  2719291. PMID  18836446.
  25. ^ Диккенс, Дж .; Битсон, С .; Понтинг, C. П. (2002). «Α-дистрогликанның, α / ε-саркогликанның және ашытқы мен бактерия белоктарындағы кадеринге ұқсас домендер». Қазіргі биология. 12 (6): R197-R199. дои:10.1016 / S0960-9822 (02) 00748-0. PMID  11909544.
  26. ^ Crow, Y. J .; Лейтч, А .; Хейуорд, Б. Гарнер, А .; Пармар, Р .; Гриффит, Э .; Али, М .; Семпл, С .; Айкарди, Дж .; Бабул-Хирджи, Р .; Бауманн, С .; Бакстер, П .; Бертини, Е .; Чандлер, К.Е .; Читаят, Д .; Кау, Д .; Дери, С .; Фаззи, Е .; Гойзет, С .; Король, Д .; Клеппер, Дж .; Лакомб, Д .; Ланци, Г .; Лайалл, Х .; Мартинес-Фриас, M. A. L .; Матье, М.Л .; Маккиун, С .; Моние, А .; Оад, Ю .; Quarrell, O. W. (2006). «Рибонуклеаза H2 суббірліктерін кодтайтын гендердің мутациясы Айкарди-Гутиер синдромын тудырады және мидың туа біткен вирустық инфекциясын имитациялайды». Табиғат генетикасы. 38 (8): 910–916. дои:10.1038 / ng1842. PMID  16845400.