КГ жолын кесу - CG suppression

CpG учаскелерін метилдеу, содан кейін өздігінен дезаминдену қалай метилденген ДНҚ-да CpG алаңдарының жетіспеушілігіне әкеледі. Нәтижесінде метилдену сирек кездесетін жерлерде CpG қалдық аралдары пайда болады және CpG учаскелері жабысады.

КГ жолын кесу деген құбылыс үшін термин болып табылады CG динуклеотидтері көптеген бөліктерінде өте сирек кездеседі омыртқалы геномдар.

Ересек соматикалық тіндерде цитозиннің қалдықтары болуы мүмкін метилденген, және бұл тек қана симметриялы CpG контекстінде орын алады.[1] Метилденген С қалдықтары өздігінен дезаминденіп, Т қалдықтарын түзеді; демек CpG динуклеотидтері TpG динуклеотидтермен тұрақты мутацияға ұшырайды, бұл адам геномында CpG динуклеотидтердің аз мөлшерде пайда болуын тудырады (олар күтілетін жиіліктің тек 21% -ында кездеседі).[2] (Екінші жағынан, металданбаған С қалдықтарының өздігінен дезаминденуі U қалдықтарын тудырады, бұл мутацияны жасуша тез танып, қалпына келтіреді).

Жылы адам және тышқан, CG ең аз кездеседі динуклеотид, барлық динуклеотидтердің 1% -дан азын құрайды. ГК - бұл сирек кездесетін екінші орында, барлық динуклеотидтердің 4% -дан астамын құрайды, сондықтан КГ барлық басқа динуклеотидтерге қарағанда төрт еседен аз аз кездеседі.

Сондай-ақ қараңыз

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ Заң J, Джейкобсен SE (2010). «Өсімдіктер мен жануарлардағы ДНҚ метилдену заңдылықтарын құру, қолдау және өзгерту». Нат. Аян Генет. 11 (3): 204–220. дои:10.1038 / nrg2719. PMC  3034103. PMID  20142834.
  2. ^ Адам геномын реттейтін халықаралық консорциум; т.б. (Ақпан 2001). «Адам геномының алғашқы реттілігі және талдауы» (PDF). Табиғат. 409 (6822): 860–921. дои:10.1038/35057062. PMID  11237011.