Бромоға іргелес гомологиялық домен, құрамында 1 бар - Bromo adjacent homology domain containing 1

BAHD1
Идентификаторлар
Бүркеншік аттар	BAHD1, 1-ден тұратын бромо іргелес гомологиялық домен
Сыртқы жеке куәліктер	OMIM: 613880 MGI: 2139371 HomoloGene: 8976 Ген-карталар: BAHD1
Геннің орналасуы (адам)
Хр.	15-хромосома (адам)
Соңы	40,468,236 bp
Геннің орналасуы (тышқан)
Хр.	2-хромосома (тышқан)
Соңы	118,924,528 bp
Гендік онтология
Молекулалық функция	• хроматинді байланыстыру; • GO: 0001948 ақуыздармен байланысуы; • транскрипцияның регулятивті аймақ реттілігімен спецификалық ДНҚ байланысы;
Ұялы компонент	• хроматин; • хроматинді тыныштандыру кешені; • жасуша ядросы; • нуклеоплазма; • хромосома;
Биологиялық процесс	• хроматиннің тынышталуы; • транскрипцияның теріс реттелуі, ДНҚ-шаблонмен; • гетерохроматинді құрастыру; • транскрипцияны реттеу, ДНҚ-шаблонмен; • транскрипция, ДНҚ-шаблонмен; • хроматинді ұйымдастыру;
	Дереккөздер:Амиго / QuickGO
Ортологтар
	22893
	228536
	ENSG00000140320
	ENSMUSG00000040007
	Q8TBE0
	Q497V6
	NM_001301132; NM_014952
	NM_001045523
	NP_001288061; NP_055767
	жоқ
	Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеу	Тінтуірді қарау / өңдеу

Бромоға іргелес гомологиялық домен, құрамында 1 бар (BAHD1) Бұл ақуыз адамдарда кодталған BAHD1 ген. BAHD1 қатысады гетерохроматин қалыптастыру және транскрипциялық репрессия. ^[5]

Ашу

BAHD1 алғаш рет адамның ми cDNA кітапханасынан клонданған және кодтау тізбегі KIAA0945 деп аталды.^[6] Bierne және оның әріптестері хроматин құрылымын және ген экспрессиясын реттеудегі BAHD1 функциясын одан әрі ашты.^[7]

Функция

BAHD1 хроматиннің тығыздалуына ықпал ететін және транскрипциясын реттейтін ақуыздар жиынтығымен өзара әрекеттесу арқылы ко-репрессор рөлін атқарады.^[7]^[8] Адамның HEK293 жасушаларында BAHD1-ге байланысты ақуыз кешенінің тандем-аффинділікпен тазалануы MIER белоктарын анықтады (MIER1, MIER2, MIER3), гистон деацетилаза HDAC1 және HDAC2, гистон H3K9 метилтрансфераза EHMT2, гетерохроматин ақуызы 1 (HP1 альфа, HP1 бета, HP1 гамма), MBD1, TRIM28 және CDYL BAHD1 серіктестері ретінде.^[8] HEK293 жасушаларында BAHD1 шамадан тыс экспрессиясы ауқымды хроматин конденсациясын тудырады ^[7] және аутосомалардағы ДНҚ метилденуі.^[9] C-терминалы BAH домені BAHD1 эпигенетикалық белгі үшін оқырман ретінде әрекет етеді H3K27me3.^[10] Эктопиялық экспрессияланған BAHD1 гетерохроматикалық белсенді емеспен колокализации болады Х хромосома (Xi).^[7]^[9]

Жануарларды зерттеу

. Абляциясы Бахд1 тышқандағы ген плацентаның дамуын өзгертеді және нәтижесінде гипохолестеринемия, гипогликемия және дене майының төмендеуі байқалады.^[8] Бахд1- тышқандардағы жетіспеушілік бактериялық қоздырғышпен инфекцияның тиімділігін төмендетеді Листерия моноцитогендері.^[11]

Клиникалық маңызы

Адамның эпителий жасушаларын қоздырғышпен жұқтыру кезінде Листерия моноцитогендері, BAHD1 қуғын-сүргін интерферонмен ынталандырылған гендер.^[11] Инфекцияның нақты кезеңдерінде, а Листерия нуклеомодулин, LntA, BAHD1 ингибиторы рөлін атқарады және интерферонмен ынталандырылған гендерді белсендіреді.^[11]^[12] BAHD1 гені тышқан үлгісінде тоқ ішек тінінде реттелмеген жаралы колит.^[13]

Пайдаланылған әдебиеттер

^ ^а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000140320 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000040007 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ «Entrez Gene: BAHD1». Алынған 2016-10-22.
^ Нагасе Т, Исикава К, Суяма М, Кикуно Р, Хиросава М, Миядзима Н, Танака А, Котани Х, Номура Н, Охара О (1999). «Адамның анықталмаған гендерінің кодтау ретін болжау. XIII. Ірі протеиндерді in vitro кодтайтын мидан 100 жаңа кДНК клондарының толық тізбегі». DNA Res. 26 (6): 63–70. дои:10.1093 / dnares / 6.1.63. PMID 10231032.
^ ^а ^б ^c ^г. Bierne H, Tham TN, Batsche E, Dumay A, Leguillou M, Kernéis-Golsteyn S, Regnault B, Seeler JS, Muchardt C, Feunteun J, Cossart P (2009). «Адамның BAHD1 гетерохроматикалық гендердің тынышталуына ықпал етеді». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 106 (33): 13826–31. Бибкод:2009PNAS..10613826B. дои:10.1073 / pnas.0901259106. PMC 2728979. PMID 19666599.
^ ^а ^б ^c Lakisic G, Lebreton A, Pourpre R, Wendling O, Libertini E, Radford EJ, Le Guillou M, Champy MF, Wattenhofer-Donzé M, Soubigou G, Ait-Si-Ali S, Feunteun J, Sorg T, Coppée JY, Фергюсон -Smith AC, Cossart P, Bierne H (2016). «Плацентаның дамуы мен стероидты метаболизмді реттеудегі BAHD1 хроматин-репрессивті кешенінің рөлі». PLOS Genet. 12 (3): e1005898. дои:10.1371 / journal.pgen.1005898. PMC 4777444. PMID 26938916.
^ ^а ^б Libertini E, Lebreton A, Lakisic G, Dillies MA, Bec S, Coppée JY, Cossart P, Bierne H (2015). «HEK293 жасушаларындағы гетерохроматинизация факторының BAHD1 шамадан тыс экспрессиясы ДНҚ метиломасын автосомалар мен X хромосомаларындағы дифференциалды түрде өзгертеді». Алдыңғы генетика. 1 желтоқсан; 6: 339 (eCollection 2015): e1005898. дои:10.3389 / fgene.2015.00339. PMC 4664705. PMID 26648976.
^ Чжао Д, Чжан Х, Гуан Х, Сионг Х, Ши Х, Дэн Х, Ли Х (2016). «BAHD1 BAH домені - бұл H3K27me3 гистон оқырманы». Ақуыз жасушасы. 7 (3): 222–6. дои:10.1007 / s13238-016-0243-z. PMC 4791424. PMID 26850261.
^ ^а ^б ^c Lebreton A, Lakisic G, Job V, Fritsch L, Tham TN, Camejo A, Matteï PJ, Regnault B, Nahori MA, Cabanes D, Gautreau A, Ait-Si-Ali S, Dessen A, Cossart P, Bierne H (2011) ). «Бактериялық ақуыз интерферонның III типті реакциясын ынталандыру үшін BAHD1 хроматин кешенін мақсат етеді» (PDF). Ғылым. 331 (6022): 1319–21. Бибкод:2011Sci ... 331.1319L. дои:10.1126 / ғылым.1200120. PMID 21252314. S2CID 35405265.
^ Lebreton A, Job V, Ragon M, Le Monnier A, Dessen A, Cossart P, Bierne H (2014). «BAHD1 хроматинді репрессорының бактериялық нуклеомодулинмен тежелуінің құрылымдық негізі». mBio. 21 (5 (1): e00775-13): e00775-13. дои:10.1128 / mBio.00775-13. PMC 3903274. PMID 24449750.
^ Чжу Х, Ван Х, Ли Дж, Хан Л, Бо Х, Чен В, Лу С, Шен З, Сю С, Чен Л, Ю С, Сю Г (2015). «BAHD1-ті жаралы колиттің жаңа молекуласы ретінде есептеу және болжау». Ғылыми зерттеулер. 17 шілде (5: 12227): 12227. Бибкод:2015 Натрия ... 512227Z. дои:10.1038 / srep12227. PMC 4505333. PMID 26183847.

Әрі қарай оқу

Talmud PJ, Drenos F, Shah S, Shah T, Palmen J, Verzilli C, Gaunt TR, Pallas J, Lovering R, Li K, Casas JP, Sofat R, Kumari M, Rodriguez Rodriguez, Johnson T, Newhouse SJ, Dominiczak A , Samani NJ, Caulfield M, Sever P, Stanton A, Shields DC, Padmanabhan S, Melander O, Hastie C, Delles C, Ebrahim S, Marmot MG, Smith GD, Lawlor DA, Munroe PB, Day IN, Kivimaki M, Whittaker. Дж, Хамфрис С.Е., Хингорани АД (2009). «HumanCVD BeadChip арқылы анықталған липидтер мен аполипопротеидтер үшін гендік центрлік ассоциация сигналдары». Am. Дж. Хум. Генет. 85 (5): 628–42. дои:10.1016 / j.ajhg.2009.10.014. PMC 2775832. PMID 19913121.
Bailey SD, Xie C, Do R, Montpetit A, Diaz R, Mohan V, Keavney B, Yusuf S, Gerstein HC, Engert JC, Anand S (2010). «NFATC2 локусындағы өзгеріс рамиприл мен розиглитазонның дәрі-дәрмектерін (DREAM) зерттеуімен диабетті қайта бағалауды бағалау кезінде тиазолидиндионнан туындаған ісіну қаупін арттырады». Қант диабетіне күтім. 33 (10): 2250–3. дои:10.2337 / dc10-0452. PMC 2945168. PMID 20628086.

Бұл мақала а ген қосулы адамның хромосомасы 15 Бұл бұта. Сіз Уикипедияға көмектесе аласыз оны кеңейту.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000140320 - Ансамбль, Мамыр 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000040007 - Ансамбль, Мамыр 2017

[3] «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[4] «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[entrez-5] «Entrez Gene: BAHD1». Алынған 2016-10-22.

[pmid10231032-6] Нагасе Т, Исикава К, Суяма М, Кикуно Р, Хиросава М, Миядзима Н, Танака А, Котани Х, Номура Н, Охара О (1999). «Адамның анықталмаған гендерінің кодтау ретін болжау. XIII. Ірі протеиндерді in vitro кодтайтын мидан 100 жаңа кДНК клондарының толық тізбегі». DNA Res. 26 (6): 63–70. дои:10.1093 / dnares / 6.1.63. PMID 10231032.

[pmid19666599-7] а ^б ^c ^г. Bierne H, Tham TN, Batsche E, Dumay A, Leguillou M, Kernéis-Golsteyn S, Regnault B, Seeler JS, Muchardt C, Feunteun J, Cossart P (2009). «Адамның BAHD1 гетерохроматикалық гендердің тынышталуына ықпал етеді». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 106 (33): 13826–31. Бибкод:2009PNAS..10613826B. дои:10.1073 / pnas.0901259106. PMC 2728979. PMID 19666599.

[pmid26938916-8] а ^б ^c Lakisic G, Lebreton A, Pourpre R, Wendling O, Libertini E, Radford EJ, Le Guillou M, Champy MF, Wattenhofer-Donzé M, Soubigou G, Ait-Si-Ali S, Feunteun J, Sorg T, Coppée JY, Фергюсон -Smith AC, Cossart P, Bierne H (2016). «Плацентаның дамуы мен стероидты метаболизмді реттеудегі BAHD1 хроматин-репрессивті кешенінің рөлі». PLOS Genet. 12 (3): e1005898. дои:10.1371 / journal.pgen.1005898. PMC 4777444. PMID 26938916.

[pmid26648976-9] а ^б Libertini E, Lebreton A, Lakisic G, Dillies MA, Bec S, Coppée JY, Cossart P, Bierne H (2015). «HEK293 жасушаларындағы гетерохроматинизация факторының BAHD1 шамадан тыс экспрессиясы ДНҚ метиломасын автосомалар мен X хромосомаларындағы дифференциалды түрде өзгертеді». Алдыңғы генетика. 1 желтоқсан; 6: 339 (eCollection 2015): e1005898. дои:10.3389 / fgene.2015.00339. PMC 4664705. PMID 26648976.

[pmid26850261-10] Чжао Д, Чжан Х, Гуан Х, Сионг Х, Ши Х, Дэн Х, Ли Х (2016). «BAHD1 BAH домені - бұл H3K27me3 гистон оқырманы». Ақуыз жасушасы. 7 (3): 222–6. дои:10.1007 / s13238-016-0243-z. PMC 4791424. PMID 26850261.

[pmid21252314-11] а ^б ^c Lebreton A, Lakisic G, Job V, Fritsch L, Tham TN, Camejo A, Matteï PJ, Regnault B, Nahori MA, Cabanes D, Gautreau A, Ait-Si-Ali S, Dessen A, Cossart P, Bierne H (2011) ). «Бактериялық ақуыз интерферонның III типті реакциясын ынталандыру үшін BAHD1 хроматин кешенін мақсат етеді» (PDF). Ғылым. 331 (6022): 1319–21. Бибкод:2011Sci ... 331.1319L. дои:10.1126 / ғылым.1200120. PMID 21252314. S2CID 35405265.

[pmid24449750-12] Lebreton A, Job V, Ragon M, Le Monnier A, Dessen A, Cossart P, Bierne H (2014). «BAHD1 хроматинді репрессорының бактериялық нуклеомодулинмен тежелуінің құрылымдық негізі». mBio. 21 (5 (1): e00775-13): e00775-13. дои:10.1128 / mBio.00775-13. PMC 3903274. PMID 24449750.

[pmid26183847-13] Чжу Х, Ван Х, Ли Дж, Хан Л, Бо Х, Чен В, Лу С, Шен З, Сю С, Чен Л, Ю С, Сю Г (2015). «BAHD1-ті жаралы колиттің жаңа молекуласы ретінде есептеу және болжау». Ғылыми зерттеулер. 17 шілде (5: 12227): 12227. Бибкод:2015 Натрия ... 512227Z. дои:10.1038 / srep12227. PMC 4505333. PMID 26183847.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]