BMC домені - BMC domain

BMC
PDB 2a1b EBI.jpg
карбоксисом қабығы протеині ccmk2
Идентификаторлар
ТаңбаBMC
PfamPF00936
InterProIPR000249
PROSITEPDOC00876
CDDCD06169

Жылы молекулалық биология The Бактерияларға арналған микрокомпьютер (BMC) домені Бұл белоктық домен құрамында CsoS1A, CsoS1B және CsoS1C бар түрлі қабық ақуыздарында кездеседі Thiobacillus neapolitanus (Halothiobacillus neapolitanus) және олардың ортологтар басқа бактериялардан. Бұл қабық ақуыздары көпсалалы құрылымы карбоксисома және бактерияларда метаболикалық рөл атқаратын байланысты құрылымдар. BMC домені шамамен 90 құрайды амин қышқылы ues-α-β мотивімен сипатталатын қалдықтар, β-шаш қыстырғышымен байланысты.

Қабықша ақуыздардың көпшілігі әр суббірліктегі бір BMC доменінен тұрады, олар полиметриялық қабықтың тегіс қырларын құрайтын гексамералық құрылым түзеді.[1] Қазіргі уақытта екі қабық ақуыздарының тандемдік BMC домендерінен тұратындығы анықталды, олардың ішінен тримерлі құрылым түзіліп, псевдо-гексамерикалық көрініс береді.[2][3]

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ Керфельд Калифорния, Савая М.Р., Танака С, Нгуен С.В., Филлипс М, Биби М, Йейтс ТО (тамыз 2005). «Қарапайым бактериалды органеллалардың қабығын құрайтын ақуыздық құрылымдар». Ғылым. 309 (5736): 936–8. CiteSeerX  10.1.1.1026.896. дои:10.1126 / ғылым.1113397. PMID  16081736. S2CID  24561197.
  2. ^ Heldt D, Frank S, Seyedarabi A, Ladikis D, Parsons JB, Warren MJ, Pickersgill RW (қыркүйек 2009). «Clostridium kluyveri-де этанолды қолдануға байланысты EtuB тримерлі бактериалды микробөлшек қабығы ақуызының құрылымы». Биохимиялық журнал. 423 (2): 199–207. дои:10.1042 / BJ20090780. PMID  19635047. S2CID  22548122.
  3. ^ Панг А, Уоррен М.Ж., Пикерсгилл RW (ақпан 2011). «PduT құрылымы, 4Fe-4S кластерімен байланыстыратын орны бар тримерлі бактериалды микрокомбинат ақуызы». Acta Crystallographica D. 67 (Pt 2): 91-6. дои:10.1107 / S0907444910050201. PMID  21245529.
Бұл мақалада көпшілікке арналған мәтін енгізілген Pfam және InterPro: IPR000249