Анкикорбин - Ankycorbin
| Rai14 | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторлар | |||||||||||||||||||||||||
| Бүркеншік аттар | 1700008J19Rik1700020L11RikAnkycorbinNorpegmKIAA1334retinoic қышқылы 14 | ||||||||||||||||||||||||
| Сыртқы жеке куәліктер | HomoloGene: 9199 Ген-карталар: [1] | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| Ортологтар | |||||||||||||||||||||||||
| Түрлер | Адам | Тышқан | |||||||||||||||||||||||
| Энтрез |
| ||||||||||||||||||||||||
| Ансамбль |
| ||||||||||||||||||||||||
| UniProt |
| ||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (mRNA) |
| ||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (ақуыз) |
| ||||||||||||||||||||||||
| Орналасқан жері (UCSC) | Хр 15: 10.57 - 10.71 Мб | жоқ | |||||||||||||||||||||||
| PubMed іздеу | [1] | жоқ | |||||||||||||||||||||||
| Уикидеректер | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Анкикорбин болып табылады анкиринді қайталау және ширатылған катушка қамтитын домен ақуыз адамдарда кодталған RAI14 ген. Ол адамның әртүрлі тіндерінде көрінеді және эктоплазмалық маманданудың актиндік реттелуінде, сперматозоидтар полярлығы мен сперматозоидтардың адгезиясында маңызды рөл атқарады деп саналады. Сондай-ақ, бұл қан сынағы кедергісіндегі Сертоли жасушаларының тығыз байланысының тұтастығына ықпал етуі мүмкін.
Джин
Орналасқан жері
RAI14 құрамында 15 бар экзондар және плюс тізбегінде орналасқан хромосома нөмірі 5 5p13.2 позициясында. Ол 5 068 құрайды негізгі жұптар 34 656 328 позициядан 34 832 612-ге дейін.[2]
Гендік көршілік
TTC23L және LOC105374721 гендері 5-хромосомадағы RAI14 көршісі.
Өрнек
RAI14 адам тіндерінің кең ауқымында көрінеді. TPM көмегімен ең жоғары өрнектің кейбір аймақтарына эндометрия, тегіс бұлшықет, жатыр мойны, жатыр мойны, аталық без және көкбауыр тіндері жатады. Адам миында RAI14 экспрессиясы мидың өзегі мен аймағында өте көп медулла. Ең жоғары өрнек деңгейлері миеленцефалон, кейінірек медулла облонгатаға айналатын эмбриондық мидың аймағы.[3]
Гомология
Паралогтар
RAI14-те жоқ параллельдер.
Ортологтар
Анкорбин ақуызының барлық дәйектілігінің көп бөлігі көптеген сүтқоректілер мен арасында сақталған омыртқалылар.[4] Алысырақ байланысты ортологтар, мысалы, акулалар ұқсастықты жоғалта бастайды және аз сақталады C терминалы ақуыздың соңы. Анкикорбин омыртқасыздарда, мысалы, кораллда мүлде жақсы сақталмайды. Ақуыздың соңғы жартысы негізінен жетіспейді және консервацияның кейбір түрін сақтайтын жалғыз бөлік - бұл анкириннің қайталану доменімен байланысқан N-терминал маңындағы аймақ.
| Түр және түрлер | Жалпы аты | Дивергенция күні (бастап.) Хомо сапиендер) | NCBI-ге қосылу Нөмір | Тізбектің ұзындығы (Аминқышқылдары) | Жүйелі Жеке басын куәландыратын |
|---|---|---|---|---|---|
| Homo sapiens | Адам | NP_001138992.1 | 980 | 100% | |
| Castor canadensis | Солтүстік Америка құндызы | 88 MYA | XP_020026070.1 | 980 | 92% |
| Delphinapterus leucas | Белуга киті | 94 MYA | XP_022455298.1 | 980 | 90% |
| Пеликанус қытырлақ | Далматиялық пеликан | 320 MYA | XP_009485865.1 | 977 | 69% |
| Python bivittatus | Бирма питоны | 320 MYA | XP_007432514.1 | 992 | 66% |
| Xenopus laevis | Африкалық тырнақталған бақа | 353 MYA | XP_018100022.1 | 971 | 53% |
| Rhincodon типусы | Кит акуласы | 465 MYA | XP_020373853.1 | 719 | 46% |
| Пистиллата стилофорасы | Маржан | 685 MYA | XP_022783988.1 | 653 | 31% |
Ақуыз
Транскрипттер
Анкикорбиннің төрт айырмашылығы бар изоформалар (A, B, C және D) көбінесе изоформалардан тұрады, олардың құрамында негізінен ерекшеленетін бір немесе бірнеше қосылудың нұсқалары бар. 5 'UTR. Изоформ D - ұзындығы 983 амин қышқылындағы ең ұзын изоформ, алайда изоформ А (980 амин қышқылы) ақуыздың басым түрі болып табылады.[5]
Жалпы сипаттар
RAI14 ақуызының болжамды салмағы 110,0 кДал, изоэлектрлік нүктесі 5,87 құрайды. Сондай-ақ, 914-978 нуклеотидтер арасында глутаминге бай аймақ болады деп болжанған және глицин мен фенилаланинге кедей бола отырып, лицин, глутамат және серинге бай.[6] Бұл еритін ақуыз.[7]
Құрылым және домендер
Анкикорбин құрамында ан анкирин жанында орналасқан қайталанатын аймақ N-терминал[8] 6 анкиринді қайталаудан тұрады. Ақуыз негізінен альфа-спиральдардан және бета-парақ құрылымдары болжанбаған ширатылған домалақ домендерден тұрады.
Аударма модификацияларын жариялаңыз
RAI14 - жүздеген болжамды фосфорлану орындары бар жоғары фосфорланған ақуыз. Ол ядролық протеин деп болжанған және құрамында 3 ядролық оқшаулау сигналы бар.
Функция
RAI14 жасуша жасушаларының адгезия учаскелерінде, әсіресе жасуша жасушаларының өзара әрекеттесуінде рөл атқарады деп болжануда Сертоли жасушалары аталық бездің ішінен. Сертоли жасушалары қан тестисінің кедергісі шеңберінде мамандандырылған, қорғалатын қоршаған ортаны қамтамасыз етеді семинарлы түтікшелер аталық бездің жыныс жасушасы даму.[9]
Әдебиеттер тізімі
- ^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
- ^ «RAI14 ретиной қышқылы индукцияланған 14 [Homo sapiens (адам)]». 4 ақпан, 2018. Алынған 19 ақпан, 2018.
- ^ «Аллен ми атласы: адамның миы». Аллен Брейн Атласы.
- ^ «NCBI: ақуыздың жарылуы». Алынған 2 наурыз, 2018.
- ^ «анкикорбин изоформасы [Homo sapiens]». NCBI. 2 қазан, 2017. Алынған 19 ақпан, 2018.
- ^ «SAPS». EMBL-EBI.
- ^ Хирикава, Т .; Бун-Чиенг, С .; Митаку, С. «SOSUI: мембраналық ақуыздардың классификациясы және қайталама құрылымын болжау жүйесі».
- ^ «II ПОРТ». ПОРТОР: Аминоқышқылдар тізбегіндегі ақуыздарды сұрыптау және локализациялау орындарын болжау. Алынған 27 сәуір, 2018.
- ^ Мартин CM, Kleid JJ (2015). «Псевдофузия кардиостимулятордың істен шығуы сияқты маскарировка жасайды». Электрокардиология журналы. 7 (2): 179–81. дои:10.1016 / S0022-0736 (74) 80028-2. PMID 4822540.