Alloherpesviridae - Alloherpesviridae
| Alloherpesviridae | |
|---|---|
 | |
| TEM alloherpesvirus микрографиясы, 'Pilchard herpesvirus' | |
Вирустардың жіктелуі  | |
| (ішілмеген): | Вирус |
| Патшалық: | Дуплоднавирия |
| Корольдігі: | Хенгонгвирея |
| Филум: | Пепловирикота |
| Сынып: | Гервивирицеттер |
| Тапсырыс: | Герпес вирусы |
| Отбасы: | Alloherpesviridae |
| Ұрпақ | |
Мәтінді қараңыз | |
Alloherpesviridae - вирустардың отбасы тапсырыс Герпес вирусы. Бұл отбасына балықтар мен қосмекенділерді жұқтыратын түрлер жатады. Филогенетикалық зерттеулер бұл отбасының жарамдылығын растады және оны екі топқа бөлуге болады: біреуі ципринидті және ангиллидті иелерден, екіншісі икталурид, сальмонид, аципенсерид және ранид иелерінен тұратын вирустардан тұрады.[1] Қазіргі уақытта бұл тұқымдаста төрт түрге бөлінген 13 түр бар. Осы жанұяға байланысты ауруға каналды сом ауруы жатады.[2][3]
Таксономия
Alloherpesviridae отбасы ретінде 2005 жылы құрылды.
Ұрпақ
Отбасында келесі төрт тұқым бар:[3]
Құрылым
Вирустар Alloherpesviridae қабықпен қоршалған, олар икосаэдрлік және сфералық-плеоморфтық геометриямен және T = 16 симметриясымен. Диаметрі 150-200 нм шамасында. Геномдар сызықтық және сегменттелмеген, ұзындығы 134-248кб. [2]
| Тұқым | Құрылым | Симметрия | Капсид | Геномдық орналасу | Геномдық сегментация |
|---|---|---|---|---|---|
| Ictalurivirus | Сфералық плеоморфты | T = 16 | Қапталған | Дөңгелек | Монопартит |
| Кипринирус | Сфералық плеоморфты | T = 16 | Қапталған | Сызықтық | Монопартит |
| Батраховирус | Сфералық плеоморфты | T = 16 | Қапталған | Сызықтық | Монопартит |
| Сальмонивирус | Сфералық плеоморфты | T = 16 | Қапталған | Сызықтық | Монопартит |
Өміршеңдік кезең
Вирустық репликация ядролық және лизогендік болып табылады. Қабылдаушы жасушаға ену вирустық гликопротеидтерді эндоцитозға делдал болатын хост рецепторларына бекіту арқылы жүзеге асырылады. ДНҚ-шаблонды транскрипция - транскрипция әдісі. Балықтар табиғи иесі ретінде қызмет етеді. Тарату жолдары пассивті диффузия болып табылады.[2]
| Тұқым | Хост мәліметтері | Тіндік тропизм | Кіру туралы мәліметтер | Шығарылым туралы мәліметтер | Репликалау сайты | Жинау орны | Берілу |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Ictalurivirus | Балық | Жоқ | Гликопротиялар | Бөртпе | Ядро | Ядро | Пассивті диффузия |
| Кипринирус | Таза су жыланбалықтары | Жоқ | Гликопротиялар | Бөртпе | Цитоплазма | Цитоплазма | Пассивті диффузия |
| Батраховирус | Бақалар | Жоқ | Гликопротиялар | Бөртпе | Цитоплазма | Цитоплазма | Пассивті диффузия |
| Сальмонивирус | Salmonidae | Жоқ | Гликопротиялар | Бөртпе | Ядро | Ядро | Пассивті диффузия |
Геномика
Бірнеше геномдар тізбектелген.[4] Кипринді герпесвирустары 1, 2 және 3 (CyHV1, CyHV2 және CyHV3) сәйкесінше кәдімгі сазан, алтын балық және койда ауру тудырады. Олардың геномдары сәйкесінше 291144, 290304 және 295146 базалық жұптары. Үш ұйымға ортақ жалпы ұйым және оның соңында әрдайым қайталанатын бірегей орталық аймақ бар. 137, 150 және 155 бірегей, функционалды ақуызды кодтайтын гендер сәйкесінше бірегей аймақтарда кездеседі: осы алты, төрт және сегіз, сәйкесінше, терминалдық қайталануда қайталанады. Геномдар негізінен колинарлы орналасу кезінде 120 ортологиялық генді бөліседі. Осы гендердің 55-ке дейін басқа мүшесінде де сақталады Кипринирус; Ангиллидтік герпесвирус 1. CyHV1, CyHV2 және CyHV3 параллельді гендердің сәйкесінше бес, алты және бес отбасыға ие.
Әдебиеттер тізімі
- ^ Waltzek TB, Kelley GO, Alfaro ME, Kurobe T, Davison AJ, Hedrick RP (2009). «Alloherpesviridae отбасындағы филогенетикалық қатынастар». Дис. Акват. Org. 84 (3): 179–94. дои:10.3354 / dao02023. PMID 19565695.
- ^ а б в «Вирустық аймақ». ExPASy. Алынған 12 маусым 2015.
- ^ а б «Вирус таксономиясы: 2019 жылғы шығарылым». talk.ictvonline.org. Вирустардың таксономиясы бойынша халықаралық комитет. Алынған 9 мамыр 2020.
- ^ Дэвисон AJ, Kurobe T, Gatherer D, Cunningham C, Korf I, Fukuda H, Hedrick RP, Waltzek TB (2013). «Тұқы герпесвирусының салыстырмалы геномикасы». Дж. Вирол. 87 (5): 2908–22. дои:10.1128 / JVI.03206-12. PMC 3571366. PMID 23269803.
Әрі қарай оқу
- Иноуэ, Сага, Айкава, Кумагай, Шимада, Кавагучи, Нарусе, Моришита, Кога, Такеда (2017). «Транспозон мен герпесвирустың толық бірігуі медака балықтарында Teratorn қозғалмалы элементін жасады». Табиғат байланысы. 8 (1): 551. дои:10.1038 / s41467-017-00527-2. PMC 5601938. PMID 28916771.CS1 maint: бірнеше есімдер: авторлар тізімі (сілтеме)
