Актинобактериялы фаг холиндер тұқымдасы - Actinobacterial phage holin family
The Актинобактериялық фаг Холин (APH) отбасы (ТК № 1. Е.57 ) - бұл ұзындығы 105-тен 180-ге дейінгі аминокисил қалдықтары арасындағы белоктардың едәуір үлкен отбасы, әдетте N-терминалының жанында бір трансмембраналық сегментті (TMS) көрсетеді. APH тұқымдасына жататын ақуыздардың репрезентативті тізімін мына жерден табуға болады Транспортердің жіктелуінің мәліметтер базасы.[1]
Бұл тұқымдастағы архетип ақуыздарының бірі - Gp5 холині микобактериофаг Ms6. Микобактериофаг Ms6 - екі тізбекті ДНҚ (dsDNA) бактериофаг ол болжанған эндолизин (LysA) -холин (Gp4) лизис жүйесінен басқа, өзінің лизис модулі шеңберінде тағы үш ақуызды кодтайды: Gp1, LysB және Gp5.[2]
MS6 Gp4 (ТК № 1. Е.18.1.2 ) бұрын II класты холин тәрізді ақуыз ретінде сипатталған. Екінші болжамды холин гені (gp5) ақуызды кодтайтын (Gp5) болжамды жалғыз N-терминалмен ТМС Ms6 литикалық оперонының соңында анықталды. Холиннің болжамды класы да, бірыңғай TMS полипептиді де іске қоса алмады лизис эндолизин LysA-мен қосарланған комбинацияларда Ішек таяқшасы. Алайда, кейінгі зерттеулер Ms6-дің Gp4 және Gp5 бір-бірімен өзара әрекеттесетіндігін көрсетті. Бұл Ms6 инфекциясында лизистің дұрыс және бағдарламаланған уақытына Gp4 және Gp5 бірлескен әсерінен қол жеткізілетіндігін көрсетеді.[2]
Сондай-ақ қараңыз
Әрі қарай оқу
- Петровский, Стив; Севиор, Роберт Дж .; Тиллетт, Даниэль (2011). «Гордония-, Родококк- және Нокардиямен тұрақтандырылған көбік белсенді активтерінде биоконтролды жүргізуге мүмкіндігі бар GTE2 поливалентті литикалық бактериофаг геномының сипаттамасы». Қолданбалы және қоршаған орта микробиологиясы. 77 (12): 3923–3929. дои:10.1128 / AEM.00025-11. PMC 3131622. PMID 21498753.
- Редди, Бхаскара Л .; Saier Jr, Milton H. (2013). «Бактериялы холиндер мен суперфамилиялардың топологиялық және филогенетикалық анализдері». Biochimica et Biofhysica Acta (BBA) - Биомембраналар. 1828 (11): 2654–2671. дои:10.1016 / j.bbamem.2013.07.004. PMC 3788059. PMID 23856191.
- Сайер, Милтон Х .; Редди, Бхаскара Л. (2015). «Бактериялардағы, эукариоттардағы және архейдегі холиндер: биотехнологиялық және биомедициналық әлеуеті бар көпфункционалды ксенологтар». Бактериология журналы. 197 (1): 7–17. дои:10.1128 / JB.02046-14. PMC 4288690. PMID 25157079.
- Ванг, И. Н .; Смит, Д.Л .; Жас, Р. (2000). «Холиндер: бактериофаг инфекцияларының ақуыз сағаттары». Микробиологияға жыл сайынғы шолу. 54: 799–825. дои:10.1146 / annurev.micro.54.1.799. PMID 11018145.
Әдебиеттер тізімі
- ^ «1.E.57. Актинобактериялы фаг Холин (APH) отбасы». TCDB. Алынған 2016-03-29.
- ^ а б Каталано, Мария Джоао; Гил, Филипа; Мониз-Перейра, Хосе; Пиментель, Мадалена (2011-06-01). «Ms6 микобактериофагының холин тәрізді ақуыздарының функционалдық талдауы». Бактериология журналы. 193 (11): 2793–2803. дои:10.1128 / JB.01519-10. ISSN 1098-5530. PMC 3133122. PMID 21441511.
Жағдай бойынша бұл редакциялау, бұл мақалада «1.E.57. Актинобактериялы фаг Холин (APH) отбасы»лицензиясы лицензия негізінде қайта пайдалануға мүмкіндік береді Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 экспортталмаған лицензиясы, бірақ астында емес GFDL. Барлық сәйкес шарттар сақталуы керек.