AN1 мырыш саусағы - AN1 zinc finger
| zf-AN1 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Arabiopsis thaliana f5o11.17 ақуызынан zf-an1 доменінің ерітінді құрылымы | |||||||||
| Идентификаторлар | |||||||||
| Таңба | zf-AN1 | ||||||||
| Pfam | PF01428 | ||||||||
| InterPro | IPR000058 | ||||||||
| SMART | ZnF_AN1 | ||||||||
| |||||||||
Молекулалық биологияда AN1 типті мырыш саусақ домені, оның құрамында диметалды (мырыш) байланысқан альфа / бета бар бүктеу. Бұл домен алғаш рет AN1 С терминалында мырыш саусағы ретінде анықталды SWISSPROT, а убивитинге ұқсас ақуыз жылы Xenopus laevis.[1] AN1 типті мырыш саусағында алтау бар сақталған цистеиндер және екі гистидиндер бұл мүмкін 2 мырышты үйлестіре алады атомдар.
Белгілі бір стресске байланысты белоктар (SAP) құрамында AN1 домені бар, көбінесе A20 мырыш саусақ домендерімен (SAP8) немесе C2H2 домендерімен (SAP16) үйлеседі.[2] Мысалы, адам Znf216 ақуызында A20 бар саусақ мырыш N терминалында және AN1 мырыш саусағы С терминусында теріс әсер етеді реттеу NFkappaB белсендіру жол және өзара әрекеттесу компоненттерімен иммундық жауап RIP, IKKgamma және TRAF6 сияқты. The өзара әрекеттесу IKK-гамма және RIP бар Znf216-дің құрамында A20 мырыш-саусақ домені, ал оның TRAF6-мен өзара әрекеттесуі AN1 мырыш-саусақ домені арқылы жүзеге асырылады; сондықтан цинк-саусақ домендерінің екеуі де реттеуге қатысады иммундық жауап.[3] AN1 мырыш саусақ домені құрамында болатын увикитит тәрізді домені бар ақуыздарда да кездеседі барлық жерде жол.[1] AN1 типті мырыш саусағы бар ақуыздарға мыналар жатады:
- Асцидиялық артқы ақырғы белгі 6 (пем-6) ақуыз.[4]
- Адам AWP1 ақуызы (PRK1-мен байланысты), ол білдірді ерте кезінде эмбриогенез.[5]
- Адам иммуноглобулин му байланыстырушы ақуыз 2 (SMUBP-2), мутациялар онда 1 типті тыныс алу стрессімен бұлшықет атрофиясы пайда болады.[6]
AN1 типті мырыш саусақтарының домендері әртүрлі еврархеота және thaumarchaeota, олар көбінесе мембраналық пептидаза домендерімен біріктіріледі, мысалы ромбоидты отбасылық серин пептидаза, трансглютаминаза тәрізді тиол пептидазалар папаин бүктелген және Zn тәуелді металлопептидазалар. Archaeal AN1 домендері трансмембраналық спиральдармен және DNAJ және SCP / PR1 сияқты домендермен байланысты. Бұл термоядролар құрамында архейдегі ақуыздар бар AN1 доменіне арналған мембранамен байланысты рөлдер, мысалы, полипептидтерді протеолитикалық өңдеу кезінде және ақуыздың бүктелуін немесе тұрақтылығын реттейді. Сәулет синтаксисі прокариоттықына ұқсас В-қорапты мырыш саусақ және ЛИМ домендер.[7]
Әдебиеттер тізімі
- ^ а б Linnen JM, Bailey CP, Weeks DL (маусым 1993). «Xenopus laevis-тен алынған екі туыстық локализацияланған мРНҚ убикуитин тәрізді синтез белоктарын кодтайды». Джин. 128 (2): 181–8. дои:10.1016 / 0378-1119 (93) 90561-G. PMID 8390387.
- ^ Vij S, Tyagi AK (желтоқсан 2006). «Күріш құрамындағы A20 / AN1 мырыш саусақтары (-лары) бар стресстің байланысқан ақуызды (SAP) гендер тұқымдасына геномдық талдау және олардың Арабидопсиспен филогенетикалық байланысы». Мол. Генет. Геномика. 276 (6): 565–75. дои:10.1007 / s00438-006-0165-1. PMID 17033811. S2CID 31769652.
- ^ Хуанг Дж, Тенг Л, Ли Л, Лю Т, Ли Л, Чен Д, Сю LG, Чжай З, Шу ХБ (сәуір 2004). «ZNF216 - бұл NFkappaB активациясының A20 тәрізді және IkappaB киназа гамма-әрекеттесуші ингибиторы». Дж.Биол. Хим. 279 (16): 16847–53. дои:10.1074 / jbc.M309491200. PMID 14754897.
- ^ Satou Y, Satoh N (желтоқсан 1997). «Артқы белгі 2 (пем-2), пем-4, пем-5 және пем-6: асцидиялық эмбрионда локализацияланған мРНҚ бар аналық гендер». Dev. Биол. 192 (2): 467–81. дои:10.1006 / dbio.1997.8730. PMID 9441682.
- ^ Дуан В, Сун Б, Ли ТВ, Тан БДж, Ли МК, Тео ТС (қазан 2000). «In vivo серин / треонинкиназа PRK1-мен байланысатын жаңа ақуыз AWP1 клондау және сипаттамасы». Джин. 256 (1–2): 113–21. дои:10.1016 / S0378-1119 (00) 00365-6. PMID 11054541.
- ^ Лиепинш Е, Леончикс А, Шарипо А, Гиньяр Л, Оттинг Г (ақпан 2003). «Адамның Smubp-2-ден R3H доменінің шешім құрылымы». Дж.Мол. Биол. 326 (1): 217–23. дои:10.1016 / S0022-2836 (02) 01381-5. PMID 12547203.
- ^ Берроуз А.М., Айер Л.М., Аравинд Л (шілде 2011). «Прокариоттардағы RING саусағының және басқа бинуклеарлы үшкір домендердің функционалды әртараптандырылуы және убикитин жүйесінің ерте эволюциясы». Мол. Биосист. 7 (1): 2261–77. дои:10.1039 / C1MB05061C. PMC 5938088. PMID 21547297.