Сыртқы мембраналық рецептор - Outer membrane receptor
| TonB тәуелді рецептор | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Темір гидроксаматын сіңіру рецепторының құрылымы.[1] | |||||||||
| Идентификаторлар | |||||||||
| Таңба | TonB_dep_Rec | ||||||||
| Pfam | PF00593 | ||||||||
| Pfam ру | CL0193 | ||||||||
| InterPro | IPR000531 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00354 | ||||||||
| SCOP2 | 2 кадр / Ауқымы / SUPFAM | ||||||||
| TCDB | 1.B.14 | ||||||||
| OPM суперотбасы | 33 | ||||||||
| OPM ақуызы | 1qfg | ||||||||
| CDD | CD01347 | ||||||||
| |||||||||
Сыртқы мембраналық рецепторлар, сондай-ақ ТонБ тәуелді рецепторлар, а отбасы туралы бета баррель белоктар оларды оқшаулау үшін аталған сыртқы мембрана туралы грамтеріс бактериялар. TonB кешендері бактерия жасушаларының сыртынан сигналдарды қабылдап, оларды ішке таратып отырады цитоплазма, жетекші транскрипциялық активация мақсатты гендер.Грамтеріс бактериялардың TonB тәуелді рецепторлары темір сияқты ірі субстраттардың сіңуімен және тасымалдануымен байланысты. сидерофор кешендер және В12 дәрумені.[2]
TonB басқа ақуыздармен өзара әрекеттесуі
Жылы Ішек таяқшасы, TonB ақуызы перифлазмалық кеңістікке ерекше субстраттарды жоғары аффинентті байланыстыруды және энергияға тәуелді сіңіруді жүзеге асыратын сыртқы мембраналық рецепторлық белоктармен әрекеттеседі.[3] Бұл субстраттар арнайы емес арқылы нашар тасымалданады порин немесе өте төмен концентрацияда кездеседі. ТонБ болмаған кезде бұл рецепторлар өздерінің субстраттарын байланыстырады, бірақ белсенді тасымалдауды жүзеге асырмайды. ТонБ-қа тәуелді реттеуші жүйелер ақуыздың алты компонентінен тұрады.[4]
Қазіргі уақытта белгілі немесе TonB-мен әрекеттеседі деп болжанған ақуыздарға BtuB,[5] CirA, FatA, FcuT, FecA,[6] ФхуА,[7] Фху, FepA,[8] FptA, HemR, IrgA, IutA, PfeA, PupA, LbpA және TbpA. TonB ақуызы кейбір колициндермен әрекеттеседі. Бұл ақуыздардың көпшілігінде N терминалында қысқа консервіленген аймақ болады.[9]
TonB-ға тәуелді рецепторлық штепсельдік домен
| TonB-ға тәуелді рецепторлық штепсельдік домен | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторлар | |||||||||
| Таңба | Штепсельдік ұш | ||||||||
| Pfam | PF07715 | ||||||||
| InterPro | IPR012910 | ||||||||
| SCOP2 | 1fi1 / Ауқымы / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
ТонБ тәуелді рецепторларға а доменді қосыңыз, канал лигандпен байланысқанға дейін кеуекті жауып, арна қақпасының рөлін атқаратын дербес жиналмалы суббірлік. Осы кезде ол каналды ашып, конформациялық өзгерістерге ұшырайды.[10]
ТонБ фаг рецепторы ретінде
TonB сонымен қатар рецептор ретінде жұмыс істейді Сальмонелла бактериофаг H8. Іс жүзінде H8 инфекциясы TonB-ға тәуелді.[11]
Әдебиеттер тізімі
- ^ Ferguson AD, Welte W, Hofmann E және т.б. (Маусым 2000). «Прокариоттық және эукариоттық протеиндермен липополисахаридті танудың сақталған құрылымдық мотиві». Құрылым. 8 (6): 585–92. дои:10.1016 / S0969-2126 (00) 00143-X. PMID 10873859.
- ^ Коебник, Ральф (2000). «Бактериялардың сыртқы мембраналық ақуыздарының құрылымдары мен қызметі: қысқаша бөшкелер». MicroReview. 37 (2): 239–253.
- ^ Kadner RJ, Chimento DP, Wiener MC (2003). «Echherichia coli сыртқы мембранасы кобаламин тасымалдаушысы BtuB: кальций мен субстрат байланысының құрылымдық талдауы және дәйектілігі / құрылымын сақтау бойынша ортологиялық тасымалдаушыларды анықтау». Дж.Мол. Биол. 332 (5): 999–1014. дои:10.1016 / j.jmb.2003.07.005. PMID 14499604.
- ^ Koebnik R (2005). «TonB тәуелді транс-конверт сигнализациясы: ерекшелік пе немесе ереже ме?». Микробиолдың тенденциялары. 13 (8): 343–7. дои:10.1016 / j.tim.2005.06.005. PMID 15993072.
- ^ Kadner RJ, Chimento DP, Wiener MC, Mohanty AK (2003). «BtuB кобаламин тасымалдағышындағы субстрат индуцирленген трансмембраналық сигнал беру». Нат. Құрылым. Биол. 10 (5): 394–401. дои:10.1038 / nsb914. PMID 12652322. S2CID 24883519.
- ^ Deisenhofer J, Smith Smith, Esser L, Chakraborty R, van der Helm D, Ferguson AD (2002). «FecA сыртқы мембраналық тасымалдағыштың қақпасының құрылымдық негіздері». Ғылым. 295 (5560): 1715–1719. Бибкод:2002Sci ... 295.1715F. дои:10.1126 / ғылым.1067313. PMID 11872840. S2CID 86844549.
- ^ Moras D, Rosenbusch JP, Mitschler A, Rees B, Locher KP, Koebnik R, Moulinier L (1998). «Лигандты FhuA рецепторы арқылы трансмембраналық сигнал беру: бос және феррихроммен байланысқан күйлердің кристалдық құрылымдары аллостериялық өзгерістерді анықтайды». Ұяшық. 95 (6): 771–778. дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81700-6. PMID 9865695. S2CID 16899072.
- ^ Deisenhofer J, Xia D, Buchanan SK, Smith BS, Venkatramani L, Esser L, Palnitkar M, Chakraborty R, van der Helm D (1999). «Сыртқы мембрананың крекозалық құрылымы, ішек таяқшасынан алынған FepA белсенді тасымалдаушысы». Нат. Құрылым. Биол. 6 (1): 56–63. дои:10.1038/4931. PMID 9886293. S2CID 20231287.
- ^ Клебба PE (2003). «Темір энтеробактинді қабылдаудың үш парадоксы». Алдыңғы. Biosci. 8 (6): s1422 – s1436. дои:10.2741/1233. PMID 12957833.
- ^ Buchanan SK, Evans RW, Girlando R, Oke M, Sarra R, Farnaud S, Gorringe AR (2004). «ТонБ-ге тәуелді транспортердің неиссериалды штепсельдік домені оның трансмембраналық бета-баррелі болмаған кезде құрылымдық тұтастықты сақтайды». FEBS Lett. 564 (3): 294–300. дои:10.1016 / S0014-5793 (04) 00196-6. PMID 15111112. S2CID 20056753.
- ^ Рабщ, В .; Ма, Л .; Вили, Дж .; Наджар, Ф. З .; Касерер, В .; Schuerch, D. W .; Клебба, Дж. Е .; Ро, Б. А .; Лаверде Гомес, Дж. Л .; Шаллмей, М .; Ньютон, С.М.С .; Klebba, P. E. (2007). «FepA- және TonB-тәуелді бактериофаг H8: рецепторларды байланыстыру және геномдық реттілік». Бактериология журналы. 189 (15): 5658–5674. дои:10.1128 / JB.00437-07. PMC 1951831. PMID 17526714.
 | Бұл мембраналық ақуыз - қатысты мақала а бұта. Сіз Уикипедияға көмектесе аласыз оны кеңейту. |